MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015714	CG	3	6	148327	148332	0 %	0 %	50 %	50 %	338706106
3002	NC_015714	GCA	2	6	148337	148342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706106
3003	NC_015714	CG	3	6	148343	148348	0 %	0 %	50 %	50 %	338706106
3004	NC_015714	GTG	2	6	148431	148436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015714	TTC	2	6	148802	148807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706107
3006	NC_015714	CTTGC	2	10	148837	148846	0 %	40 %	20 %	40 %	338706107
3007	NC_015714	TTC	2	6	148974	148979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706107
3008	NC_015714	GCG	2	6	148988	148993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706107
3009	NC_015714	GC	3	6	149040	149045	0 %	0 %	50 %	50 %	338706107
3010	NC_015714	TCTT	2	8	149138	149145	0 %	75 %	0 %	25 %	338706107
3011	NC_015714	TGC	2	6	149172	149177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706108
3012	NC_015714	GGT	2	6	149221	149226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706108
3013	NC_015714	GGTG	2	8	149365	149372	0 %	25 %	75 %	0 %	338706108
3014	NC_015714	TCC	2	6	149492	149497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706108
3015	NC_015714	CAA	2	6	149525	149530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706108
3016	NC_015714	GGCTTG	2	12	149540	149551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706108
3017	NC_015714	CA	3	6	149596	149601	50 %	0 %	0 %	50 %	338706108
3018	NC_015714	T	6	6	149766	149771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015714	GC	3	6	149787	149792	0 %	0 %	50 %	50 %	338706109
3020	NC_015714	GCA	3	9	149836	149844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706109
3021	NC_015714	T	6	6	149847	149852	0 %	100 %	0 %	0 %	338706109
3022	NC_015714	GAC	2	6	149893	149898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706109
3023	NC_015714	TCC	2	6	149933	149938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706109
3024	NC_015714	CCA	2	6	149952	149957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706109
3025	NC_015714	TCTT	2	8	150043	150050	0 %	75 %	0 %	25 %	338706109
3026	NC_015714	GGCTTG	2	12	150175	150186	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3027	NC_015714	GTT	2	6	150245	150250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015714	CTGCGG	3	18	150253	150270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015714	CG	3	6	150323	150328	0 %	0 %	50 %	50 %	338706110
3030	NC_015714	CAG	2	6	150368	150373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706110
3031	NC_015714	AGC	2	6	150375	150380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706110
3032	NC_015714	CCG	2	6	150406	150411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706110
3033	NC_015714	CTG	2	6	150428	150433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706110
3034	NC_015714	AGGC	2	8	150474	150481	25 %	0 %	50 %	25 %	338706110
3035	NC_015714	TG	3	6	150498	150503	0 %	50 %	50 %	0 %	338706110
3036	NC_015714	CTT	2	6	150505	150510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706110
3037	NC_015714	CCA	2	6	150528	150533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706110
3038	NC_015714	GCGG	2	8	150719	150726	0 %	0 %	75 %	25 %	338706110
3039	NC_015714	AGCA	2	8	150887	150894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_015714	TGGTTG	2	12	150999	151010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015714	TTG	2	6	151018	151023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015714	TG	3	6	151037	151042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015714	CAC	2	6	151086	151091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_015714	TGA	2	6	151114	151119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015714	GGTG	2	8	151231	151238	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015714	GGA	2	6	151361	151366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015714	CG	3	6	151461	151466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_015714	TTC	2	6	151473	151478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_015714	TGC	2	6	151479	151484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_015714	ACC	2	6	151538	151543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_015714	ACA	2	6	151644	151649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015714	CAG	2	6	151667	151672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015714	TGA	2	6	151690	151695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015714	CCT	2	6	151818	151823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_015714	TGTTT	2	10	151841	151850	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015714	AGC	2	6	151923	151928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_015714	GTG	2	6	151989	151994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015714	AGGA	2	8	152022	152029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015714	CCGGAG	2	12	152097	152108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_015714	CA	3	6	152187	152192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_015714	GGAA	2	8	152246	152253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015714	AGA	2	6	152292	152297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015714	CAGCTG	2	12	152322	152333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015714	CGG	2	6	152362	152367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015714	GT	3	6	152452	152457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015714	TTC	2	6	152461	152466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015714	GCA	2	6	152539	152544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015714	CCTG	2	8	152579	152586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_015714	CACT	2	8	152589	152596	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_015714	CTC	2	6	152601	152606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_015714	C	9	9	152621	152629	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3072	NC_015714	TAAAAA	2	12	152653	152664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338706111
3073	NC_015714	CT	3	6	152730	152735	0 %	50 %	0 %	50 %	338706111
3074	NC_015714	CG	3	6	152795	152800	0 %	0 %	50 %	50 %	338706111
3075	NC_015714	GTG	2	6	152856	152861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706112
3076	NC_015714	TCGT	2	8	152889	152896	0 %	50 %	25 %	25 %	338706112
3077	NC_015714	GGTCT	2	10	152917	152926	0 %	40 %	40 %	20 %	338706112
3078	NC_015714	ACC	2	6	152960	152965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706112
3079	NC_015714	T	8	8	152972	152979	0 %	100 %	0 %	0 %	338706112
3080	NC_015714	TAC	2	6	153019	153024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706112
3081	NC_015714	GCT	2	6	153128	153133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706112
3082	NC_015714	CTT	2	6	153141	153146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706112
3083	NC_015714	TC	3	6	153157	153162	0 %	50 %	0 %	50 %	338706112
3084	NC_015714	TCG	2	6	153195	153200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706112
3085	NC_015714	GAA	2	6	153212	153217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706112
3086	NC_015714	TG	3	6	153256	153261	0 %	50 %	50 %	0 %	338706112
3087	NC_015714	GCT	3	9	153279	153287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706112
3088	NC_015714	TTTTC	2	10	153313	153322	0 %	80 %	0 %	20 %	338706112
3089	NC_015714	T	6	6	153335	153340	0 %	100 %	0 %	0 %	338706112
3090	NC_015714	CGT	2	6	153385	153390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706112
3091	NC_015714	CGG	2	6	153407	153412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706112
3092	NC_015714	TTC	2	6	153419	153424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706112
3093	NC_015714	CAC	2	6	153451	153456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706112
3094	NC_015714	AC	4	8	153459	153466	50 %	0 %	0 %	50 %	338706112
3095	NC_015714	TGG	2	6	153472	153477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706112
3096	NC_015714	GCAG	2	8	153502	153509	25 %	0 %	50 %	25 %	338706112
3097	NC_015714	TCAT	2	8	153513	153520	25 %	50 %	0 %	25 %	338706112
3098	NC_015714	TACTGG	2	12	153544	153555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706112
3099	NC_015714	ATC	2	6	153569	153574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706112
3100	NC_015714	AAG	2	6	153584	153589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706112
3101	NC_015714	CAGA	2	8	153649	153656	50 %	0 %	25 %	25 %	338706112
3102	NC_015714	TGC	2	6	153681	153686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706112
3103	NC_015714	GCC	2	6	153770	153775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706112
3104	NC_015714	GCCG	2	8	153838	153845	0 %	0 %	50 %	50 %	338706112
3105	NC_015714	TGG	2	6	153847	153852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706112
3106	NC_015714	CTG	2	6	153926	153931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706112
3107	NC_015714	TGG	2	6	153934	153939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706112
3108	NC_015714	GC	3	6	153999	154004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_015714	GC	3	6	154013	154018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_015714	CG	3	6	154039	154044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_015714	CATT	2	8	154072	154079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_015714	A	6	6	154113	154118	100 %	0 %	0 %	0 %	338706113
3113	NC_015714	CCT	2	6	154119	154124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706113
3114	NC_015714	GC	3	6	154142	154147	0 %	0 %	50 %	50 %	338706113
3115	NC_015714	GGT	2	6	154162	154167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706113
3116	NC_015714	A	7	7	154226	154232	100 %	0 %	0 %	0 %	338706113
3117	NC_015714	G	8	8	154253	154260	0 %	0 %	100 %	0 %	338706113
3118	NC_015714	TG	3	6	154277	154282	0 %	50 %	50 %	0 %	338706114
3119	NC_015714	A	6	6	154316	154321	100 %	0 %	0 %	0 %	338706114
3120	NC_015714	GGGT	2	8	154386	154393	0 %	25 %	75 %	0 %	338706114
3121	NC_015714	GCG	2	6	154406	154411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706114
3122	NC_015714	AGG	2	6	154419	154424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706114
3123	NC_015714	CCG	2	6	154452	154457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706114
3124	NC_015714	CGGGG	2	10	154458	154467	0 %	0 %	80 %	20 %	338706114
3125	NC_015714	CG	4	8	154471	154478	0 %	0 %	50 %	50 %	338706114
3126	NC_015714	CCGC	2	8	154527	154534	0 %	0 %	25 %	75 %	338706114
3127	NC_015714	GC	3	6	154650	154655	0 %	0 %	50 %	50 %	338706114
3128	NC_015714	ACT	2	6	154659	154664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706114
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3262	NC_015714	TG	3	6	160576	160581	0 %	50 %	50 %	0 %	338706120
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3289	NC_015714	AT	3	6	162116	162121	50 %	50 %	0 %	0 %	338706122
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3336	NC_015714	TG	3	6	163982	163987	0 %	50 %	50 %	0 %	338706123
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3340	NC_015714	CAG	3	9	164299	164307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706123
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3354	NC_015714	CG	3	6	164865	164870	0 %	0 %	50 %	50 %	338706124
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3361	NC_015714	TG	3	6	165231	165236	0 %	50 %	50 %	0 %	338706124
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3365	NC_015714	CGT	2	6	165520	165525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706124
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3370	NC_015714	TCC	2	6	165672	165677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706124
3371	NC_015714	TGAAG	2	10	165816	165825	40 %	20 %	40 %	0 %	338706124
3372	NC_015714	GGTT	2	8	165952	165959	0 %	50 %	50 %	0 %	338706124
3373	NC_015714	GTGG	2	8	165988	165995	0 %	25 %	75 %	0 %	338706124
3374	NC_015714	AAG	2	6	166018	166023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706124
3375	NC_015714	TGC	2	6	166034	166039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706124
3376	NC_015714	GTG	2	6	166040	166045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706124
3377	NC_015714	GGC	2	6	166140	166145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706124
3378	NC_015714	GAA	2	6	166216	166221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706124
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