MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015714	CGCAG	2	10	124331	124340	20 %	0 %	40 %	40 %	338706087
2502	NC_015714	AGCAC	2	10	124367	124376	40 %	0 %	20 %	40 %	338706087
2503	NC_015714	TG	3	6	124381	124386	0 %	50 %	50 %	0 %	338706087
2504	NC_015714	ATA	2	6	124453	124458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706087
2505	NC_015714	CACG	2	8	124470	124477	25 %	0 %	25 %	50 %	338706087
2506	NC_015714	TTG	2	6	124483	124488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706087
2507	NC_015714	T	6	6	124499	124504	0 %	100 %	0 %	0 %	338706087
2508	NC_015714	C	6	6	124505	124510	0 %	0 %	0 %	100 %	338706087
2509	NC_015714	GC	3	6	124539	124544	0 %	0 %	50 %	50 %	338706087
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2512	NC_015714	GCT	2	6	124638	124643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706088
2513	NC_015714	TG	3	6	124687	124692	0 %	50 %	50 %	0 %	338706088
2514	NC_015714	GCT	2	6	124722	124727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706088
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2516	NC_015714	CCTC	2	8	124838	124845	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2517	NC_015714	TG	4	8	124883	124890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2519	NC_015714	AGA	2	6	124966	124971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015714	GAG	2	6	125019	125024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_015714	GT	3	6	125109	125114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_015714	GAAC	2	8	125148	125155	50 %	0 %	25 %	25 %	338706089
2523	NC_015714	TGG	2	6	125177	125182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706089
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2525	NC_015714	AG	3	6	125311	125316	50 %	0 %	50 %	0 %	338706089
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2543	NC_015714	GT	3	6	125895	125900	0 %	50 %	50 %	0 %	338706089
2544	NC_015714	AGCA	2	8	125911	125918	50 %	0 %	25 %	25 %	338706089
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2551	NC_015714	TCT	2	6	126249	126254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706089
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2554	NC_015714	GC	3	6	126373	126378	0 %	0 %	50 %	50 %	338706089
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2559	NC_015714	CATTG	2	10	126661	126670	20 %	40 %	20 %	20 %	338706089
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2620	NC_015714	TGAG	2	8	129717	129724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_015714	TG	3	6	129752	129757	0 %	50 %	50 %	0 %	338706092
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2627	NC_015714	TTATC	2	10	130012	130021	20 %	60 %	0 %	20 %	338706093
2628	NC_015714	AAT	2	6	130121	130126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706093
2629	NC_015714	GTGG	2	8	130180	130187	0 %	25 %	75 %	0 %	338706093
2630	NC_015714	GTG	2	6	130277	130282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706093
2631	NC_015714	TGCG	2	8	130347	130354	0 %	25 %	50 %	25 %	338706093
2632	NC_015714	ATG	2	6	130361	130366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706093
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2727	NC_015714	CAG	2	6	135713	135718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2728	NC_015714	TGA	2	6	135736	135741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2734	NC_015714	CCGGAG	2	12	136143	136154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2735	NC_015714	CA	3	6	136233	136238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2736	NC_015714	GGAA	2	8	136292	136299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2737	NC_015714	AGA	2	6	136338	136343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2738	NC_015714	CAGCTG	2	12	136368	136379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2739	NC_015714	CGG	2	6	136408	136413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2740	NC_015714	GT	3	6	136498	136503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2741	NC_015714	TTC	2	6	136507	136512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2742	NC_015714	GCA	2	6	136585	136590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2743	NC_015714	CCTG	2	8	136625	136632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2744	NC_015714	CACT	2	8	136635	136642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2745	NC_015714	CTC	2	6	136647	136652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2746	NC_015714	C	9	9	136667	136675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2747	NC_015714	AGA	2	6	136684	136689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2748	NC_015714	AC	3	6	136718	136723	50 %	0 %	0 %	50 %	338706097
2749	NC_015714	GACA	2	8	136740	136747	50 %	0 %	25 %	25 %	338706097
2750	NC_015714	AG	3	6	136758	136763	50 %	0 %	50 %	0 %	338706097
2751	NC_015714	CCT	2	6	136811	136816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706097
2752	NC_015714	CTG	2	6	136866	136871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706097
2753	NC_015714	ATC	2	6	136882	136887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706097
2754	NC_015714	CA	3	6	136945	136950	50 %	0 %	0 %	50 %	338706097
2755	NC_015714	GCT	2	6	136952	136957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706097
2756	NC_015714	CTGA	2	8	136958	136965	25 %	25 %	25 %	25 %	338706097
2757	NC_015714	GTCTT	2	10	137075	137084	0 %	60 %	20 %	20 %	338706097
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2766	NC_015714	GC	3	6	137253	137258	0 %	0 %	50 %	50 %	338706097
2767	NC_015714	CTT	2	6	137267	137272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706097
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2779	NC_015714	TAC	2	6	138077	138082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706098
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2822	NC_015714	GCA	2	6	139604	139609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2824	NC_015714	GCAT	2	8	139640	139647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2825	NC_015714	TGA	2	6	139735	139740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706100
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2847	NC_015714	AGT	2	6	141393	141398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706101
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2849	NC_015714	CTG	2	6	141474	141479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706101
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2861	NC_015714	GA	3	6	142227	142232	50 %	0 %	50 %	0 %	338706101
2862	NC_015714	ATG	2	6	142376	142381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706101
2863	NC_015714	ACG	2	6	142394	142399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706101
2864	NC_015714	T	6	6	142523	142528	0 %	100 %	0 %	0 %	338706101
2865	NC_015714	CAT	2	6	142566	142571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706101
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2867	NC_015714	CG	3	6	142608	142613	0 %	0 %	50 %	50 %	338706101
2868	NC_015714	T	7	7	142657	142663	0 %	100 %	0 %	0 %	338706101
2869	NC_015714	AGCCA	2	10	142672	142681	40 %	0 %	20 %	40 %	338706101
2870	NC_015714	CCA	2	6	142686	142691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706101
2871	NC_015714	T	6	6	142717	142722	0 %	100 %	0 %	0 %	338706101
2872	NC_015714	TCT	2	6	142772	142777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706101
2873	NC_015714	CGC	2	6	142824	142829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2874	NC_015714	TGC	2	6	142846	142851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2875	NC_015714	GC	3	6	142888	142893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2876	NC_015714	TAAA	2	8	142900	142907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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