MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015714	GA	3	6	50679	50684	50 %	0 %	50 %	0 %	338706020
1002	NC_015714	CGC	2	6	50736	50741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706020
1003	NC_015714	GCGCA	2	10	50825	50834	20 %	0 %	40 %	40 %	338706020
1004	NC_015714	CA	3	6	50870	50875	50 %	0 %	0 %	50 %	338706020
1005	NC_015714	GCA	2	6	50961	50966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1006	NC_015714	CTA	2	6	51015	51020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706020
1007	NC_015714	GTT	2	6	51034	51039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706020
1008	NC_015714	TGC	2	6	51090	51095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1009	NC_015714	GA	3	6	51190	51195	50 %	0 %	50 %	0 %	338706020
1010	NC_015714	TTG	3	9	51202	51210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706020
1011	NC_015714	TC	3	6	51252	51257	0 %	50 %	0 %	50 %	338706020
1012	NC_015714	AGC	2	6	51270	51275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1013	NC_015714	GCG	2	6	51403	51408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706020
1014	NC_015714	AAG	2	6	51436	51441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706020
1015	NC_015714	GGC	2	6	51485	51490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706020
1016	NC_015714	TTCT	2	8	51549	51556	0 %	75 %	0 %	25 %	338706020
1017	NC_015714	TTG	2	6	51566	51571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706020
1018	NC_015714	CAC	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706020
1019	NC_015714	GCA	2	6	51645	51650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1020	NC_015714	CG	4	8	51714	51721	0 %	0 %	50 %	50 %	338706020
1021	NC_015714	AGA	2	6	51756	51761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706020
1022	NC_015714	GC	3	6	51766	51771	0 %	0 %	50 %	50 %	338706020
1023	NC_015714	TTC	2	6	51804	51809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706020
1024	NC_015714	TGC	2	6	51828	51833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1025	NC_015714	CA	3	6	52034	52039	50 %	0 %	0 %	50 %	338706020
1026	NC_015714	GC	3	6	52102	52107	0 %	0 %	50 %	50 %	338706020
1027	NC_015714	GAG	2	6	52189	52194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706020
1028	NC_015714	CTG	2	6	52198	52203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1029	NC_015714	TC	3	6	52247	52252	0 %	50 %	0 %	50 %	338706020
1030	NC_015714	GGGC	2	8	52253	52260	0 %	0 %	75 %	25 %	338706020
1031	NC_015714	TGA	2	6	52280	52285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706020
1032	NC_015714	TCG	2	6	52392	52397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706020
1033	NC_015714	CG	3	6	52448	52453	0 %	0 %	50 %	50 %	338706020
1034	NC_015714	A	6	6	52465	52470	100 %	0 %	0 %	0 %	338706020
1035	NC_015714	GAT	2	6	52489	52494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706020
1036	NC_015714	GGA	2	6	52538	52543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706020
1037	NC_015714	TAT	2	6	52579	52584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706020
1038	NC_015714	TGT	2	6	52602	52607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706020
1039	NC_015714	GT	3	6	52606	52611	0 %	50 %	50 %	0 %	338706020
1040	NC_015714	TCT	2	6	52664	52669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015714	TCG	3	9	52715	52723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706021
1042	NC_015714	GTG	2	6	52724	52729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706021
1043	NC_015714	GCG	2	6	52747	52752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706021
1044	NC_015714	TCA	2	6	52787	52792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706021
1045	NC_015714	CGG	2	6	52884	52889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706021
1046	NC_015714	ATGC	2	8	52910	52917	25 %	25 %	25 %	25 %	338706021
1047	NC_015714	CAA	2	6	52938	52943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706021
1048	NC_015714	TGCAG	2	10	52956	52965	20 %	20 %	40 %	20 %	338706021
1049	NC_015714	GCA	2	6	53031	53036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706021
1050	NC_015714	TG	3	6	53070	53075	0 %	50 %	50 %	0 %	338706021
1051	NC_015714	CG	3	6	53158	53163	0 %	0 %	50 %	50 %	338706021
1052	NC_015714	GT	3	6	53198	53203	0 %	50 %	50 %	0 %	338706021
1053	NC_015714	TGC	2	6	53247	53252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706021
1054	NC_015714	A	7	7	53277	53283	100 %	0 %	0 %	0 %	338706021
1055	NC_015714	CG	4	8	53319	53326	0 %	0 %	50 %	50 %	338706021
1056	NC_015714	TAC	2	6	53327	53332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706021
1057	NC_015714	AAG	2	6	53366	53371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706021
1058	NC_015714	AATC	2	8	53412	53419	50 %	25 %	0 %	25 %	338706021
1059	NC_015714	ATTA	2	8	53440	53447	50 %	50 %	0 %	0 %	338706021
1060	NC_015714	GA	3	6	53455	53460	50 %	0 %	50 %	0 %	338706021
1061	NC_015714	TA	4	8	53630	53637	50 %	50 %	0 %	0 %	338706021
1062	NC_015714	CG	3	6	53707	53712	0 %	0 %	50 %	50 %	338706021
1063	NC_015714	TTA	2	6	53714	53719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706021
1064	NC_015714	CAAA	2	8	53782	53789	75 %	0 %	0 %	25 %	338706021
1065	NC_015714	GAA	2	6	53842	53847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706021
1066	NC_015714	TAT	2	6	53862	53867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706021
1067	NC_015714	CGCTG	2	10	53880	53889	0 %	20 %	40 %	40 %	338706021
1068	NC_015714	CG	3	6	53892	53897	0 %	0 %	50 %	50 %	338706021
1069	NC_015714	ATC	2	6	53921	53926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706021
1070	NC_015714	CGA	2	6	53943	53948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706021
1071	NC_015714	AT	3	6	53952	53957	50 %	50 %	0 %	0 %	338706021
1072	NC_015714	GAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706021
1073	NC_015714	CG	3	6	54018	54023	0 %	0 %	50 %	50 %	338706021
1074	NC_015714	AGA	2	6	54101	54106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706021
1075	NC_015714	CTG	2	6	54110	54115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706021
1076	NC_015714	A	7	7	54128	54134	100 %	0 %	0 %	0 %	338706021
1077	NC_015714	CAA	2	6	54174	54179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706021
1078	NC_015714	TCGCT	2	10	54281	54290	0 %	40 %	20 %	40 %	338706021
1079	NC_015714	GGAA	2	8	54405	54412	50 %	0 %	50 %	0 %	338706021
1080	NC_015714	CG	3	6	54438	54443	0 %	0 %	50 %	50 %	338706021
1081	NC_015714	TC	3	6	54453	54458	0 %	50 %	0 %	50 %	338706021
1082	NC_015714	AGC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706021
1083	NC_015714	AGA	2	6	54593	54598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015714	GTAC	2	8	54622	54629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_015714	A	6	6	54722	54727	100 %	0 %	0 %	0 %	338706022
1086	NC_015714	CATC	2	8	54766	54773	25 %	25 %	0 %	50 %	338706022
1087	NC_015714	T	8	8	54775	54782	0 %	100 %	0 %	0 %	338706022
1088	NC_015714	TTTC	2	8	54855	54862	0 %	75 %	0 %	25 %	338706022
1089	NC_015714	CTTT	2	8	54985	54992	0 %	75 %	0 %	25 %	338706022
1090	NC_015714	T	6	6	54990	54995	0 %	100 %	0 %	0 %	338706022
1091	NC_015714	CAT	2	6	55097	55102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706022
1092	NC_015714	TTC	2	6	55232	55237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706022
1093	NC_015714	ACG	2	6	55278	55283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706022
1094	NC_015714	AAT	2	6	55373	55378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706022
1095	NC_015714	TCG	2	6	55389	55394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706022
1096	NC_015714	ACT	2	6	55428	55433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706022
1097	NC_015714	TCGT	2	8	55451	55458	0 %	50 %	25 %	25 %	338706022
1098	NC_015714	ATA	2	6	55511	55516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706022
1099	NC_015714	CTC	2	6	55524	55529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706022
1100	NC_015714	ATGCT	2	10	55572	55581	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_015714	A	6	6	55624	55629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015714	AGG	2	6	55672	55677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015714	GT	3	6	55715	55720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015714	ACG	2	6	55726	55731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_015714	CAG	2	6	55745	55750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015714	CAC	2	6	55786	55791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_015714	AC	3	6	55815	55820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_015714	GTG	2	6	55834	55839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015714	CA	3	6	55870	55875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_015714	GT	3	6	55882	55887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015714	ACA	2	6	55911	55916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706023
1112	NC_015714	CAT	2	6	55938	55943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706023
1113	NC_015714	ATA	2	6	55958	55963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706023
1114	NC_015714	T	7	7	55966	55972	0 %	100 %	0 %	0 %	338706023
1115	NC_015714	CTG	2	6	56005	56010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706023
1116	NC_015714	CAA	2	6	56020	56025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706023
1117	NC_015714	GC	4	8	56030	56037	0 %	0 %	50 %	50 %	338706023
1118	NC_015714	GCA	2	6	56040	56045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706023
1119	NC_015714	CTA	2	6	56057	56062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706023
1120	NC_015714	CTT	2	6	56069	56074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706023
1121	NC_015714	CTAA	2	8	56131	56138	50 %	25 %	0 %	25 %	338706023
1122	NC_015714	CTT	2	6	56189	56194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706023
1123	NC_015714	GCA	2	6	56269	56274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706023
1124	NC_015714	TCCT	2	8	56505	56512	0 %	50 %	0 %	50 %	338706023
1125	NC_015714	GCG	2	6	56525	56530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706023
1126	NC_015714	TCC	2	6	56646	56651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706024
1127	NC_015714	GTG	2	6	56805	56810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706024
1128	NC_015714	GCG	2	6	56862	56867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706024
1129	NC_015714	T	6	6	56889	56894	0 %	100 %	0 %	0 %	338706024
1130	NC_015714	AT	3	6	56896	56901	50 %	50 %	0 %	0 %	338706024
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1252	NC_015714	GTA	2	6	62923	62928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_015714	GCG	2	6	62956	62961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_015714	TGTC	2	8	62972	62979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1255	NC_015714	TG	3	6	62997	63002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_015714	CCT	2	6	63113	63118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706031
1257	NC_015714	GCG	2	6	63121	63126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706031
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1259	NC_015714	GCA	2	6	63174	63179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706031
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1261	NC_015714	TGCG	2	8	63219	63226	0 %	25 %	50 %	25 %	338706031
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1367	NC_015714	A	6	6	69221	69226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1368	NC_015714	AG	3	6	69248	69253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1369	NC_015714	ACTC	2	8	69273	69280	25 %	25 %	0 %	50 %	338706037
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1383	NC_015714	AAC	2	6	69826	69831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1384	NC_015714	CGA	2	6	69980	69985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706038
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1387	NC_015714	GAT	2	6	70131	70136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706038
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