MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015714	CAA	2	6	25322	25327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705999
502	NC_015714	AAAG	2	8	25344	25351	75 %	0 %	25 %	0 %	338705999
503	NC_015714	TGA	2	6	25381	25386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705999
504	NC_015714	TTAT	2	8	25397	25404	25 %	75 %	0 %	0 %	338705999
505	NC_015714	TGT	2	6	25408	25413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705999
506	NC_015714	GCT	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705999
507	NC_015714	T	10	10	25452	25461	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
508	NC_015714	AGA	2	6	25507	25512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705999
509	NC_015714	ACA	2	6	25715	25720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705999
510	NC_015714	T	6	6	25748	25753	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
511	NC_015714	TTA	2	6	25769	25774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705999
512	NC_015714	GGA	2	6	25885	25890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705999
513	NC_015714	GATT	2	8	25944	25951	25 %	50 %	25 %	0 %	338705999
514	NC_015714	CTT	2	6	25995	26000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705999
515	NC_015714	T	6	6	25999	26004	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
516	NC_015714	AGCG	2	8	26082	26089	25 %	0 %	50 %	25 %	338705999
517	NC_015714	TG	3	6	26111	26116	0 %	50 %	50 %	0 %	338705999
518	NC_015714	GTATC	2	10	26161	26170	20 %	40 %	20 %	20 %	338705999
519	NC_015714	TGG	2	6	26172	26177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705999
520	NC_015714	GCA	2	6	26183	26188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705999
521	NC_015714	TGC	2	6	26197	26202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705999
522	NC_015714	T	6	6	26206	26211	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
523	NC_015714	CTT	2	6	26214	26219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705999
524	NC_015714	TGC	2	6	26241	26246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705999
525	NC_015714	T	6	6	26280	26285	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
526	NC_015714	GTT	2	6	26332	26337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705999
527	NC_015714	GT	3	6	26338	26343	0 %	50 %	50 %	0 %	338705999
528	NC_015714	A	7	7	26531	26537	100 %	0 %	0 %	0 %	338705999
529	NC_015714	GC	3	6	26555	26560	0 %	0 %	50 %	50 %	338705999
530	NC_015714	TCT	2	6	26633	26638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705999
531	NC_015714	T	7	7	26719	26725	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
532	NC_015714	T	6	6	26783	26788	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
533	NC_015714	TGT	2	6	26808	26813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705999
534	NC_015714	CG	3	6	26824	26829	0 %	0 %	50 %	50 %	338705999
535	NC_015714	CCTT	2	8	26918	26925	0 %	50 %	0 %	50 %	338705999
536	NC_015714	GCAC	2	8	27024	27031	25 %	0 %	25 %	50 %	338705999
537	NC_015714	TGC	2	6	27034	27039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705999
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539	NC_015714	CAA	2	6	27221	27226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705999
540	NC_015714	TTC	2	6	27304	27309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705999
541	NC_015714	GA	3	6	27326	27331	50 %	0 %	50 %	0 %	338705999
542	NC_015714	T	6	6	27352	27357	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
543	NC_015714	TTGAGA	2	12	27405	27416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705999
544	NC_015714	CAGT	2	8	27428	27435	25 %	25 %	25 %	25 %	338705999
545	NC_015714	GT	4	8	27497	27504	0 %	50 %	50 %	0 %	338705999
546	NC_015714	GC	4	8	27539	27546	0 %	0 %	50 %	50 %	338705999
547	NC_015714	T	6	6	27576	27581	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
548	NC_015714	GTG	2	6	27695	27700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
549	NC_015714	GTT	2	6	27742	27747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706000
550	NC_015714	TGG	2	6	27759	27764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
551	NC_015714	TGG	2	6	27769	27774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
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554	NC_015714	TGCG	2	8	27876	27883	0 %	25 %	50 %	25 %	338706000
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558	NC_015714	GTA	2	6	28016	28021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
559	NC_015714	GT	3	6	28132	28137	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
560	NC_015714	AGTG	2	8	28138	28145	25 %	25 %	50 %	0 %	338706000
561	NC_015714	ATG	2	6	28184	28189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
562	NC_015714	T	6	6	28194	28199	0 %	100 %	0 %	0 %	338706000
563	NC_015714	TTA	2	6	28215	28220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706000
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568	NC_015714	T	6	6	28438	28443	0 %	100 %	0 %	0 %	338706000
569	NC_015714	CAG	2	6	28504	28509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706000
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571	NC_015714	TGA	2	6	28569	28574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
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573	NC_015714	TG	3	6	28593	28598	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
574	NC_015714	GTG	2	6	28775	28780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
575	NC_015714	TGA	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
576	NC_015714	GGT	2	6	28967	28972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
577	NC_015714	TGA	2	6	28981	28986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015714	AT	3	6	29020	29025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015714	CTC	2	6	29111	29116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015714	AGG	2	6	29138	29143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015714	G	6	6	29142	29147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015714	GCT	2	6	29214	29219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706001
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584	NC_015714	GC	3	6	29298	29303	0 %	0 %	50 %	50 %	338706001
585	NC_015714	GAT	2	6	29337	29342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706001
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589	NC_015714	A	7	7	29418	29424	100 %	0 %	0 %	0 %	338706001
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595	NC_015714	AG	3	6	29949	29954	50 %	0 %	50 %	0 %	338706002
596	NC_015714	ACC	2	6	30026	30031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706002
597	NC_015714	TGCGC	2	10	30048	30057	0 %	20 %	40 %	40 %	338706002
598	NC_015714	AGT	2	6	30062	30067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706002
599	NC_015714	CCG	2	6	30204	30209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706002
600	NC_015714	TCT	2	6	30243	30248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706002
601	NC_015714	CAC	2	6	30402	30407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706002
602	NC_015714	T	6	6	30420	30425	0 %	100 %	0 %	0 %	338706002
603	NC_015714	TC	3	6	30478	30483	0 %	50 %	0 %	50 %	338706002
604	NC_015714	AGC	2	6	30545	30550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706002
605	NC_015714	TGC	2	6	30575	30580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
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608	NC_015714	TG	3	6	30718	30723	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
609	NC_015714	TCCAG	2	10	30874	30883	20 %	20 %	20 %	40 %	338706002
610	NC_015714	TTC	2	6	30886	30891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706002
611	NC_015714	TGC	2	6	30901	30906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
612	NC_015714	CGT	2	6	31007	31012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
613	NC_015714	AAAG	2	8	31022	31029	75 %	0 %	25 %	0 %	338706002
614	NC_015714	CA	3	6	31044	31049	50 %	0 %	0 %	50 %	338706002
615	NC_015714	GT	3	6	31137	31142	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
616	NC_015714	CTA	2	6	31188	31193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706002
617	NC_015714	GCGG	2	8	31198	31205	0 %	0 %	75 %	25 %	338706002
618	NC_015714	ATG	2	6	31252	31257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706002
619	NC_015714	CTT	2	6	31311	31316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706002
620	NC_015714	TCGT	2	8	31364	31371	0 %	50 %	25 %	25 %	338706002
621	NC_015714	GAACAG	2	12	31389	31400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706002
622	NC_015714	A	6	6	31405	31410	100 %	0 %	0 %	0 %	338706002
623	NC_015714	TGGGG	2	10	31432	31441	0 %	20 %	80 %	0 %	338706002
624	NC_015714	GTT	2	6	31449	31454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706002
625	NC_015714	TCC	2	6	31487	31492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706002
626	NC_015714	TGTC	2	8	31504	31511	0 %	50 %	25 %	25 %	338706002
627	NC_015714	GCT	2	6	31550	31555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
628	NC_015714	TCA	2	6	31604	31609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706002
629	NC_015714	T	7	7	31612	31618	0 %	100 %	0 %	0 %	338706002
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