MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015714	CGT	2	6	293449	293454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706252
6002	NC_015714	AGC	2	6	293495	293500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706252
6003	NC_015714	GC	4	8	293505	293512	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6004	NC_015714	GC	3	6	293530	293535	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6005	NC_015714	G	7	7	293541	293547	0 %	0 %	100 %	0 %	338706252
6006	NC_015714	CTT	2	6	293582	293587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706252
6007	NC_015714	GAG	2	6	293599	293604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6008	NC_015714	CG	4	8	293619	293626	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6009	NC_015714	GAG	2	6	293651	293656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6010	NC_015714	AGG	2	6	293675	293680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6011	NC_015714	GGT	2	6	293766	293771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706252
6012	NC_015714	GGA	2	6	293835	293840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6013	NC_015714	GCC	2	6	293850	293855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706252
6014	NC_015714	AAGTT	2	10	293948	293957	40 %	40 %	20 %	0 %	338706252
6015	NC_015714	CGTC	2	8	294000	294007	0 %	25 %	25 %	50 %	338706252
6016	NC_015714	AGA	2	6	294017	294022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706252
6017	NC_015714	GAT	2	6	294051	294056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706252
6018	NC_015714	CGA	2	6	294096	294101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706252
6019	NC_015714	ACA	2	6	294179	294184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706252
6020	NC_015714	GGA	2	6	294210	294215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6021	NC_015714	GC	3	6	294229	294234	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6022	NC_015714	GAG	2	6	294235	294240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6023	NC_015714	TTC	2	6	294241	294246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706252
6024	NC_015714	CCT	2	6	294336	294341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706252
6025	NC_015714	CG	3	6	294380	294385	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6026	NC_015714	GAA	2	6	294393	294398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706252
6027	NC_015714	ATG	2	6	294518	294523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706252
6028	NC_015714	GGCGG	2	10	294702	294711	0 %	0 %	80 %	20 %	338706252
6029	NC_015714	GGA	2	6	294750	294755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
6030	NC_015714	GC	3	6	294781	294786	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6031	NC_015714	GAT	2	6	294868	294873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706252
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6033	NC_015714	GC	3	6	294964	294969	0 %	0 %	50 %	50 %	338706252
6034	NC_015714	CGA	2	6	294999	295004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706252
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6036	NC_015714	AAAG	2	8	295265	295272	75 %	0 %	25 %	0 %	338706252
6037	NC_015714	G	6	6	295313	295318	0 %	0 %	100 %	0 %	338706252
6038	NC_015714	TGA	2	6	295349	295354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706252
6039	NC_015714	AGTG	2	8	295370	295377	25 %	25 %	50 %	0 %	338706252
6040	NC_015714	GT	3	6	295383	295388	0 %	50 %	50 %	0 %	338706253
6041	NC_015714	TGG	2	6	295439	295444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706253
6042	NC_015714	CTC	3	9	295445	295453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706253
6043	NC_015714	GTT	2	6	295455	295460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706253
6044	NC_015714	TGC	2	6	295466	295471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706253
6045	NC_015714	AGGT	2	8	295494	295501	25 %	25 %	50 %	0 %	338706253
6046	NC_015714	GT	4	8	295514	295521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015714	GCT	2	6	295574	295579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_015714	G	7	7	295622	295628	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015714	AGC	2	6	295644	295649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706254
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6051	NC_015714	TCG	2	6	295713	295718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706254
6052	NC_015714	G	6	6	295727	295732	0 %	0 %	100 %	0 %	338706254
6053	NC_015714	CG	4	8	295775	295782	0 %	0 %	50 %	50 %	338706254
6054	NC_015714	ATA	2	6	295839	295844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706254
6055	NC_015714	AGG	2	6	295902	295907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706254
6056	NC_015714	GC	3	6	295919	295924	0 %	0 %	50 %	50 %	338706254
6057	NC_015714	CAG	2	6	296030	296035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706254
6058	NC_015714	TAT	2	6	296087	296092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706254
6059	NC_015714	GAG	2	6	296132	296137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706254
6060	NC_015714	CT	3	6	296196	296201	0 %	50 %	0 %	50 %	338706254
6061	NC_015714	GC	3	6	296233	296238	0 %	0 %	50 %	50 %	338706254
6062	NC_015714	GCT	3	9	296240	296248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706254
6063	NC_015714	ATGG	2	8	296289	296296	25 %	25 %	50 %	0 %	338706254
6064	NC_015714	GTGG	2	8	296333	296340	0 %	25 %	75 %	0 %	338706254
6065	NC_015714	GTGCG	2	10	296376	296385	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_015714	AG	3	6	296409	296414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015714	GAG	2	6	296439	296444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015714	TGC	2	6	296473	296478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_015714	T	6	6	296482	296487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015714	CGC	2	6	296496	296501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_015714	AAC	2	6	296511	296516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_015714	CGTG	2	8	296529	296536	0 %	25 %	50 %	25 %	338706255
6073	NC_015714	GC	4	8	296596	296603	0 %	0 %	50 %	50 %	338706255
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6075	NC_015714	TTGAT	2	10	296682	296691	20 %	60 %	20 %	0 %	338706255
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6077	NC_015714	TACG	2	8	296752	296759	25 %	25 %	25 %	25 %	338706255
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6082	NC_015714	TGA	2	6	297033	297038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6084	NC_015714	CGTGC	2	10	297243	297252	0 %	20 %	40 %	40 %	338706256
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6102	NC_015714	GT	3	6	298331	298336	0 %	50 %	50 %	0 %	338706256
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6106	NC_015714	TG	3	6	298521	298526	0 %	50 %	50 %	0 %	338706256
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6109	NC_015714	ATT	2	6	298606	298611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706256
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6115	NC_015714	GGT	2	6	298819	298824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706257
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6120	NC_015714	GCA	2	6	298964	298969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706257
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6123	NC_015714	GTACT	2	10	299208	299217	20 %	40 %	20 %	20 %	338706257
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6499	NC_015714	CTGA	2	8	315715	315722	25 %	25 %	25 %	25 %	338706271
6500	NC_015714	GGT	2	6	315814	315819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706271

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