MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 4772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015581	ATGC	2	8	587	594	25 %	25 %	25 %	25 %	334143100
2	NC_015581	ATTG	2	8	739	746	25 %	50 %	25 %	0 %	334143100
3	NC_015581	TTGG	2	8	900	907	0 %	50 %	50 %	0 %	334143100
4	NC_015581	CGTG	2	8	1039	1046	0 %	25 %	50 %	25 %	334143100
5	NC_015581	AACT	2	8	1462	1469	50 %	25 %	0 %	25 %	334143101
6	NC_015581	TTTA	2	8	1918	1925	25 %	75 %	0 %	0 %	334143101
7	NC_015581	TTGA	2	8	2169	2176	25 %	50 %	25 %	0 %	334143101
8	NC_015581	ATGA	2	8	3270	3277	50 %	25 %	25 %	0 %	334143103
9	NC_015581	TGGT	2	8	4253	4260	0 %	50 %	50 %	0 %	334143103
10	NC_015581	CGAC	2	8	4364	4371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015581	TGAT	2	8	4538	4545	25 %	50 %	25 %	0 %	334143104
12	NC_015581	TTTA	2	8	4835	4842	25 %	75 %	0 %	0 %	334143104
13	NC_015581	TCAG	2	8	4848	4855	25 %	25 %	25 %	25 %	334143104
14	NC_015581	TGAT	2	8	5231	5238	25 %	50 %	25 %	0 %	334143104
15	NC_015581	GTCG	2	8	6166	6173	0 %	25 %	50 %	25 %	334143104
16	NC_015581	TCGC	2	8	7165	7172	0 %	25 %	25 %	50 %	334143105
17	NC_015581	GCCG	2	8	7575	7582	0 %	0 %	50 %	50 %	334143106
18	NC_015581	TTGA	2	8	7648	7655	25 %	50 %	25 %	0 %	334143106
19	NC_015581	TTCG	2	8	7777	7784	0 %	50 %	25 %	25 %	334143107
20	NC_015581	TTAT	2	8	8235	8242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015581	CCGG	2	8	8625	8632	0 %	0 %	50 %	50 %	334143108
22	NC_015581	GGTG	2	8	9095	9102	0 %	25 %	75 %	0 %	334143108
23	NC_015581	GCCC	2	8	9267	9274	0 %	0 %	25 %	75 %	334143108
24	NC_015581	TACC	2	8	9525	9532	25 %	25 %	0 %	50 %	334143108
25	NC_015581	AACT	2	8	9829	9836	50 %	25 %	0 %	25 %	334143109
26	NC_015581	ATTT	2	8	10288	10295	25 %	75 %	0 %	0 %	334143110
27	NC_015581	CCCA	2	8	10751	10758	25 %	0 %	0 %	75 %	334143111
28	NC_015581	TTCC	2	8	11624	11631	0 %	50 %	0 %	50 %	334143112
29	NC_015581	TGAA	2	8	13955	13962	50 %	25 %	25 %	0 %	334143115
30	NC_015581	CAGG	2	8	13987	13994	25 %	0 %	50 %	25 %	334143115
31	NC_015581	CCAT	2	8	15280	15287	25 %	25 %	0 %	50 %	334143116
32	NC_015581	ATTG	2	8	15533	15540	25 %	50 %	25 %	0 %	334143116
33	NC_015581	CATT	2	8	15586	15593	25 %	50 %	0 %	25 %	334143116
34	NC_015581	TGTT	2	8	17785	17792	0 %	75 %	25 %	0 %	334143117
35	NC_015581	TTAA	2	8	18334	18341	50 %	50 %	0 %	0 %	334143117
36	NC_015581	ATTA	2	8	18767	18774	50 %	50 %	0 %	0 %	334143118
37	NC_015581	TAAT	2	8	19982	19989	50 %	50 %	0 %	0 %	334143120
38	NC_015581	TGCT	2	8	20446	20453	0 %	50 %	25 %	25 %	334143120
39	NC_015581	ACCG	2	8	20813	20820	25 %	0 %	25 %	50 %	334143120
40	NC_015581	AAGG	2	8	20931	20938	50 %	0 %	50 %	0 %	334143120
41	NC_015581	TTGA	2	8	21046	21053	25 %	50 %	25 %	0 %	334143120
42	NC_015581	ATTG	2	8	21095	21102	25 %	50 %	25 %	0 %	334143120
43	NC_015581	TAGA	2	8	21117	21124	50 %	25 %	25 %	0 %	334143120
44	NC_015581	AGGC	2	8	21732	21739	25 %	0 %	50 %	25 %	334143120
45	NC_015581	ACCG	2	8	22543	22550	25 %	0 %	25 %	50 %	334143121
46	NC_015581	AAAT	2	8	22662	22669	75 %	25 %	0 %	0 %	334143121
47	NC_015581	TAAT	2	8	22940	22947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015581	GATT	2	8	23314	23321	25 %	50 %	25 %	0 %	334143122
49	NC_015581	TAAC	2	8	23427	23434	50 %	25 %	0 %	25 %	334143122
50	NC_015581	TCGG	2	8	23462	23469	0 %	25 %	50 %	25 %	334143122
51	NC_015581	CAGG	2	8	23699	23706	25 %	0 %	50 %	25 %	334143122
52	NC_015581	TTTA	2	8	24483	24490	25 %	75 %	0 %	0 %	334143124
53	NC_015581	GTCG	2	8	24829	24836	0 %	25 %	50 %	25 %	334143124
54	NC_015581	AGCA	2	8	25266	25273	50 %	0 %	25 %	25 %	334143124
55	NC_015581	AGCG	2	8	25397	25404	25 %	0 %	50 %	25 %	334143124
56	NC_015581	TGGT	2	8	26107	26114	0 %	50 %	50 %	0 %	334143125
57	NC_015581	GGTT	2	8	26511	26518	0 %	50 %	50 %	0 %	334143125
58	NC_015581	ACTC	2	8	26655	26662	25 %	25 %	0 %	50 %	334143125
59	NC_015581	CGGC	2	8	26915	26922	0 %	0 %	50 %	50 %	334143125
60	NC_015581	CGTT	2	8	27374	27381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015581	GCCA	2	8	28612	28619	25 %	0 %	25 %	50 %	334143126
62	NC_015581	TGCA	2	8	28757	28764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015581	TAAA	2	8	29695	29702	75 %	25 %	0 %	0 %	334143128
64	NC_015581	AAAT	2	8	30662	30669	75 %	25 %	0 %	0 %	334143129
65	NC_015581	TTGA	2	8	30814	30821	25 %	50 %	25 %	0 %	334143130
66	NC_015581	TTTC	2	8	31177	31184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015581	CAGA	2	8	31637	31644	50 %	0 %	25 %	25 %	334143131
68	NC_015581	ACAA	2	8	32117	32124	75 %	0 %	0 %	25 %	334143131
69	NC_015581	ACAG	2	8	32183	32190	50 %	0 %	25 %	25 %	334143131
70	NC_015581	AATA	2	8	32535	32542	75 %	25 %	0 %	0 %	334143132
71	NC_015581	CAAT	2	8	32603	32610	50 %	25 %	0 %	25 %	334143132
72	NC_015581	CGGG	2	8	32916	32923	0 %	0 %	75 %	25 %	334143132
73	NC_015581	CAAA	2	8	33578	33585	75 %	0 %	0 %	25 %	334143132
74	NC_015581	CAAC	2	8	33773	33780	50 %	0 %	0 %	50 %	334143132
75	NC_015581	CTTT	2	8	34217	34224	0 %	75 %	0 %	25 %	334143133
76	NC_015581	CTAT	2	8	34901	34908	25 %	50 %	0 %	25 %	334143134
77	NC_015581	GGCT	2	8	35059	35066	0 %	25 %	50 %	25 %	334143134
78	NC_015581	TAAA	2	8	35413	35420	75 %	25 %	0 %	0 %	334143135
79	NC_015581	AAGC	2	8	35762	35769	50 %	0 %	25 %	25 %	334143135
80	NC_015581	ACTC	2	8	35829	35836	25 %	25 %	0 %	50 %	334143135
81	NC_015581	CAAT	2	8	37963	37970	50 %	25 %	0 %	25 %	334143136
82	NC_015581	TTTC	2	8	38255	38262	0 %	75 %	0 %	25 %	334143136
83	NC_015581	AAAT	2	8	38592	38599	75 %	25 %	0 %	0 %	334143136
84	NC_015581	GGAA	2	8	39005	39012	50 %	0 %	50 %	0 %	334143136
85	NC_015581	ACAA	2	8	39640	39647	75 %	0 %	0 %	25 %	334143136
86	NC_015581	TGGT	2	8	39704	39711	0 %	50 %	50 %	0 %	334143136
87	NC_015581	AACC	2	8	39799	39806	50 %	0 %	0 %	50 %	334143136
88	NC_015581	TTGG	2	8	40300	40307	0 %	50 %	50 %	0 %	334143136
89	NC_015581	CAGC	2	8	40880	40887	25 %	0 %	25 %	50 %	334143137
90	NC_015581	GCCA	2	8	41362	41369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015581	GTTG	2	8	41438	41445	0 %	50 %	50 %	0 %	334143138
92	NC_015581	TAAT	3	12	42555	42566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015581	GGCG	2	8	42798	42805	0 %	0 %	75 %	25 %	334143140
94	NC_015581	ATGG	2	8	42887	42894	25 %	25 %	50 %	0 %	334143140
95	NC_015581	AGGC	2	8	44591	44598	25 %	0 %	50 %	25 %	334143141
96	NC_015581	TTGG	2	8	45086	45093	0 %	50 %	50 %	0 %	334143141
97	NC_015581	TCAA	2	8	45204	45211	50 %	25 %	0 %	25 %	334143141
98	NC_015581	ATAA	2	8	45708	45715	75 %	25 %	0 %	0 %	334143142
99	NC_015581	ACGC	2	8	45912	45919	25 %	0 %	25 %	50 %	334143143
100	NC_015581	GCCA	2	8	46380	46387	25 %	0 %	25 %	50 %	334143143
101	NC_015581	TGAT	2	8	46545	46552	25 %	50 %	25 %	0 %	334143143
102	NC_015581	TTTC	2	8	46637	46644	0 %	75 %	0 %	25 %	334143143
103	NC_015581	TTGG	2	8	46947	46954	0 %	50 %	50 %	0 %	334143143
104	NC_015581	CATG	2	8	47012	47019	25 %	25 %	25 %	25 %	334143143
105	NC_015581	AATG	2	8	47149	47156	50 %	25 %	25 %	0 %	334143143
106	NC_015581	CAGT	2	8	47333	47340	25 %	25 %	25 %	25 %	334143143
107	NC_015581	CGAG	3	12	47984	47995	25 %	0 %	50 %	25 %	334143143
108	NC_015581	CAGC	2	8	48080	48087	25 %	0 %	25 %	50 %	334143144
109	NC_015581	CTAA	2	8	48175	48182	50 %	25 %	0 %	25 %	334143144
110	NC_015581	GGTT	2	8	48618	48625	0 %	50 %	50 %	0 %	334143145
111	NC_015581	GGTG	2	8	48693	48700	0 %	25 %	75 %	0 %	334143145
112	NC_015581	CAAA	2	8	48903	48910	75 %	0 %	0 %	25 %	334143145
113	NC_015581	GATG	2	8	49116	49123	25 %	25 %	50 %	0 %	334143145
114	NC_015581	CGCT	2	8	49148	49155	0 %	25 %	25 %	50 %	334143145
115	NC_015581	TGCC	2	8	49564	49571	0 %	25 %	25 %	50 %	334143146
116	NC_015581	CCAT	2	8	49808	49815	25 %	25 %	0 %	50 %	334143147
117	NC_015581	GCTG	2	8	49948	49955	0 %	25 %	50 %	25 %	334143147
118	NC_015581	CCAG	2	8	50654	50661	25 %	0 %	25 %	50 %	334143148
119	NC_015581	TAGG	2	8	50716	50723	25 %	25 %	50 %	0 %	334143148
120	NC_015581	TCCG	2	8	51014	51021	0 %	25 %	25 %	50 %	334143148
121	NC_015581	CAAC	2	8	51329	51336	50 %	0 %	0 %	50 %	334143148
122	NC_015581	AAAT	2	8	51634	51641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015581	GATG	2	8	51654	51661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015581	TTTA	2	8	52028	52035	25 %	75 %	0 %	0 %	334143149
125	NC_015581	TTAC	2	8	52900	52907	25 %	50 %	0 %	25 %	334143149
126	NC_015581	TTTG	2	8	53973	53980	0 %	75 %	25 %	0 %	334143150
127	NC_015581	GCCC	2	8	54431	54438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_015581	AGTT	3	12	54608	54619	25 %	50 %	25 %	0 %	334143151
129	NC_015581	ATTG	2	8	55066	55073	25 %	50 %	25 %	0 %	334143151
130	NC_015581	TCAT	2	8	55094	55101	25 %	50 %	0 %	25 %	334143151
131	NC_015581	TGGC	2	8	55777	55784	0 %	25 %	50 %	25 %	334143152
132	NC_015581	GCCG	2	8	56567	56574	0 %	0 %	50 %	50 %	334143152
133	NC_015581	CTAT	2	8	57342	57349	25 %	50 %	0 %	25 %	334143152
134	NC_015581	GCTG	2	8	57359	57366	0 %	25 %	50 %	25 %	334143152
135	NC_015581	GGTG	2	8	57596	57603	0 %	25 %	75 %	0 %	334143152
136	NC_015581	GCTG	2	8	57704	57711	0 %	25 %	50 %	25 %	334143152
137	NC_015581	GAGT	2	8	57874	57881	25 %	25 %	50 %	0 %	334143152
138	NC_015581	GCCA	2	8	57905	57912	25 %	0 %	25 %	50 %	334143153
139	NC_015581	TCAC	2	8	58459	58466	25 %	25 %	0 %	50 %	334143153
140	NC_015581	GGGC	2	8	59458	59465	0 %	0 %	75 %	25 %	334143153
141	NC_015581	TTGC	2	8	59554	59561	0 %	50 %	25 %	25 %	334143154
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