MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 24995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015581	GAT	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015581	AGC	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143100
3	NC_015581	TGA	2	6	331	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143100
4	NC_015581	GCT	2	6	389	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143100
5	NC_015581	TTG	2	6	465	470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143100
6	NC_015581	GGC	5	15	490	504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143100
7	NC_015581	GGT	2	6	557	562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143100
8	NC_015581	AGA	2	6	615	620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143100
9	NC_015581	ATA	2	6	690	695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143100
10	NC_015581	GAA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143100
11	NC_015581	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143100
12	NC_015581	AAG	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143100
13	NC_015581	TTA	2	6	812	817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143100
14	NC_015581	GCC	2	6	928	933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143100
15	NC_015581	TGA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143100
16	NC_015581	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143100
17	NC_015581	TTG	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143100
18	NC_015581	ACT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143100
19	NC_015581	ACG	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143100
20	NC_015581	TGG	2	6	1330	1335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143100
21	NC_015581	ACG	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143100
22	NC_015581	ATT	2	6	1433	1438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143100
23	NC_015581	CAG	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143101
24	NC_015581	CTC	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143101
25	NC_015581	TAG	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143101
26	NC_015581	ACC	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143101
27	NC_015581	TTG	2	6	2062	2067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143101
28	NC_015581	TAC	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143101
29	NC_015581	TGA	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143101
30	NC_015581	TCG	2	6	2195	2200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143101
31	NC_015581	AAT	2	6	2214	2219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143101
32	NC_015581	GTT	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143101
33	NC_015581	AAC	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143101
34	NC_015581	GAT	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143101
35	NC_015581	ATA	2	6	2488	2493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143101
36	NC_015581	TGT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143101
37	NC_015581	GTT	2	6	2781	2786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143102
38	NC_015581	ATG	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143102
39	NC_015581	GAA	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143102
40	NC_015581	CGT	2	6	3021	3026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143103
41	NC_015581	GGC	3	9	3041	3049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143103
42	NC_015581	TGT	2	6	3119	3124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143103
43	NC_015581	TGG	3	9	3131	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143103
44	NC_015581	TGG	3	9	3143	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143103
45	NC_015581	ACC	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143103
46	NC_015581	ATG	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143103
47	NC_015581	TGG	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143103
48	NC_015581	GGT	2	6	3546	3551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143103
49	NC_015581	CCA	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143103
50	NC_015581	CCA	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143103
51	NC_015581	ATA	2	6	3640	3645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143103
52	NC_015581	GAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143103
53	NC_015581	GAT	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143103
54	NC_015581	TGC	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143103
55	NC_015581	CAC	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143103
56	NC_015581	TGC	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143103
57	NC_015581	GGA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143103
58	NC_015581	CCG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143103
59	NC_015581	GTA	2	6	4264	4269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143103
60	NC_015581	TAA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015581	AAT	2	6	4420	4425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015581	TTG	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143104
63	NC_015581	TTA	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143104
64	NC_015581	TCA	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143104
65	NC_015581	CAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143104
66	NC_015581	GTC	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143104
67	NC_015581	TTG	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143104
68	NC_015581	GGT	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143104
69	NC_015581	CAG	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143104
70	NC_015581	ATC	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143104
71	NC_015581	AAG	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143104
72	NC_015581	AGA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143104
73	NC_015581	TAT	2	6	5391	5396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143104
74	NC_015581	CCG	2	6	5498	5503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143104
75	NC_015581	AGC	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143104
76	NC_015581	TGA	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143104
77	NC_015581	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143104
78	NC_015581	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143104
79	NC_015581	TGA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143104
80	NC_015581	GTT	2	6	6010	6015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143104
81	NC_015581	ATG	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143104
82	NC_015581	GGT	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143104
83	NC_015581	ACT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143104
84	NC_015581	GTT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143104
85	NC_015581	CTT	2	6	6304	6309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015581	TAT	2	6	6385	6390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015581	AAT	2	6	6640	6645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143105
88	NC_015581	GCG	2	6	6647	6652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143105
89	NC_015581	CGG	2	6	6688	6693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143105
90	NC_015581	TGG	2	6	6756	6761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143105
91	NC_015581	AGC	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143105
92	NC_015581	GGC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143105
93	NC_015581	TGG	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143105
94	NC_015581	TGA	2	6	6969	6974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143105
95	NC_015581	GAT	2	6	6986	6991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143105
96	NC_015581	GAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143105
97	NC_015581	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143105
98	NC_015581	ATG	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143105
99	NC_015581	AAG	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143105
100	NC_015581	GGT	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143105
101	NC_015581	ATG	3	9	7501	7509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143106
102	NC_015581	ACT	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143106
103	NC_015581	TGA	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143106
104	NC_015581	TGA	2	6	7722	7727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143106
105	NC_015581	CCA	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143106
106	NC_015581	TGA	2	6	7899	7904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143107
107	NC_015581	CCA	2	6	7977	7982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143107
108	NC_015581	ATT	2	6	8008	8013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143107
109	NC_015581	GCG	2	6	8095	8100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143107
110	NC_015581	TAT	2	6	8106	8111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143107
111	NC_015581	ATT	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143107
112	NC_015581	GAA	2	6	8142	8147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143107
113	NC_015581	TAC	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015581	GCC	2	6	8459	8464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143108
115	NC_015581	ATG	2	6	8478	8483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143108
116	NC_015581	CAG	2	6	8526	8531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143108
117	NC_015581	GGT	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143108
118	NC_015581	AAG	2	6	8653	8658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143108
119	NC_015581	CTG	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143108
120	NC_015581	TAA	2	6	8668	8673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143108
121	NC_015581	TGA	2	6	8678	8683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143108
122	NC_015581	CCG	2	6	8725	8730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143108
123	NC_015581	CAG	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143108
124	NC_015581	CGC	2	6	8803	8808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143108
125	NC_015581	TAC	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143108
126	NC_015581	TGA	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143108
127	NC_015581	CTA	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143108
128	NC_015581	ACA	2	6	8975	8980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143108
129	NC_015581	AAG	2	6	9103	9108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143108
130	NC_015581	ACA	3	9	9296	9304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143108
131	NC_015581	GCA	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143108
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257	NC_015581	ATT	2	6	19318	19323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015581	GCA	2	6	19415	19420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143119
259	NC_015581	GTA	2	6	19426	19431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143119
260	NC_015581	TGA	2	6	19454	19459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143119
261	NC_015581	ACC	2	6	19481	19486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143119
262	NC_015581	TCA	2	6	19532	19537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143119
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265	NC_015581	AAT	2	6	19777	19782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143119
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268	NC_015581	AAT	2	6	19996	20001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143120
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271	NC_015581	CGG	2	6	20231	20236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143120
272	NC_015581	ACG	2	6	20241	20246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143120
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274	NC_015581	GTA	2	6	20338	20343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143120
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375	NC_015581	ACC	2	6	29455	29460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
376	NC_015581	CAA	2	6	29543	29548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143128
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382	NC_015581	ATC	2	6	30164	30169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143129
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500	NC_015581	TCT	2	6	39160	39165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143136

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