MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 2754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015578	TCCTG	2	10	564	573	0 %	40 %	20 %	40 %	333996463
2	NC_015578	TTTAT	2	10	1844	1853	20 %	80 %	0 %	0 %	333996464
3	NC_015578	GATAA	2	10	2595	2604	60 %	20 %	20 %	0 %	333996465
4	NC_015578	GAACA	2	10	4414	4423	60 %	0 %	20 %	20 %	333996467
5	NC_015578	GGGCC	2	10	4462	4471	0 %	0 %	60 %	40 %	333996467
6	NC_015578	GATAA	2	10	8017	8026	60 %	20 %	20 %	0 %	333996471
7	NC_015578	ATATC	2	10	8900	8909	40 %	40 %	0 %	20 %	333996471
8	NC_015578	ACCTT	2	10	10542	10551	20 %	40 %	0 %	40 %	333996473
9	NC_015578	GAAGC	2	10	15025	15034	40 %	0 %	40 %	20 %	333996476
10	NC_015578	GCGGA	2	10	15774	15783	20 %	0 %	60 %	20 %	333996477
11	NC_015578	TCGGG	2	10	17037	17046	0 %	20 %	60 %	20 %	333996478
12	NC_015578	CCCGG	2	10	17847	17856	0 %	0 %	40 %	60 %	333996478
13	NC_015578	ATTTC	2	10	18101	18110	20 %	60 %	0 %	20 %	333996479
14	NC_015578	TGATC	2	10	20267	20276	20 %	40 %	20 %	20 %	333996483
15	NC_015578	TAAAC	2	10	21326	21335	60 %	20 %	0 %	20 %	333996483
16	NC_015578	ACAGA	2	10	21585	21594	60 %	0 %	20 %	20 %	333996484
17	NC_015578	CCAGG	2	10	22055	22064	20 %	0 %	40 %	40 %	333996484
18	NC_015578	CCTGG	2	10	22805	22814	0 %	20 %	40 %	40 %	333996485
19	NC_015578	TTGGC	2	10	27902	27911	0 %	40 %	40 %	20 %	333996490
20	NC_015578	CGGGA	2	10	28925	28934	20 %	0 %	60 %	20 %	333996491
21	NC_015578	AAACG	2	10	29429	29438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015578	TGAGC	2	10	29824	29833	20 %	20 %	40 %	20 %	333996492
23	NC_015578	AAGCG	2	10	30758	30767	40 %	0 %	40 %	20 %	333996492
24	NC_015578	TGGTT	2	10	31287	31296	0 %	60 %	40 %	0 %	333996493
25	NC_015578	GACGA	2	10	31600	31609	40 %	0 %	40 %	20 %	333996493
26	NC_015578	TCCCG	2	10	38114	38123	0 %	20 %	20 %	60 %	333996498
27	NC_015578	TTGAT	2	10	39569	39578	20 %	60 %	20 %	0 %	333996499
28	NC_015578	GCTCA	2	10	39909	39918	20 %	20 %	20 %	40 %	333996499
29	NC_015578	CTTGG	2	10	40704	40713	0 %	40 %	40 %	20 %	333996499
30	NC_015578	CCCCA	2	10	41445	41454	20 %	0 %	0 %	80 %	333996499
31	NC_015578	GGTGT	2	10	42169	42178	0 %	40 %	60 %	0 %	333996500
32	NC_015578	ATTTG	2	10	43663	43672	20 %	60 %	20 %	0 %	333996501
33	NC_015578	TCCGC	2	10	45037	45046	0 %	20 %	20 %	60 %	333996503
34	NC_015578	CCCCT	2	10	46642	46651	0 %	20 %	0 %	80 %	333996504
35	NC_015578	ATGCT	2	10	46713	46722	20 %	40 %	20 %	20 %	333996504
36	NC_015578	CCGTA	2	10	46958	46967	20 %	20 %	20 %	40 %	333996505
37	NC_015578	CGGGG	2	10	48242	48251	0 %	0 %	80 %	20 %	333996505
38	NC_015578	TTCCG	2	10	48260	48269	0 %	40 %	20 %	40 %	333996505
39	NC_015578	CAGGA	2	10	52573	52582	40 %	0 %	40 %	20 %	333996510
40	NC_015578	AAAGC	2	10	53924	53933	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015578	GGCAG	2	10	55026	55035	20 %	0 %	60 %	20 %	333996512
42	NC_015578	TGTAT	2	10	57856	57865	20 %	60 %	20 %	0 %	333996514
43	NC_015578	ATTTT	2	10	58439	58448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015578	TGGCC	2	10	60982	60991	0 %	20 %	40 %	40 %	333996518
45	NC_015578	AGGAC	2	10	61636	61645	40 %	0 %	40 %	20 %	333996518
46	NC_015578	CATCT	2	10	61739	61748	20 %	40 %	0 %	40 %	333996518
47	NC_015578	CGGAA	2	10	61778	61787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015578	GCCTG	2	10	65938	65947	0 %	20 %	40 %	40 %	333996521
49	NC_015578	CCGGC	2	10	67441	67450	0 %	0 %	40 %	60 %	333996524
50	NC_015578	CAATA	2	10	69034	69043	60 %	20 %	0 %	20 %	333996526
51	NC_015578	ATAAC	2	10	70472	70481	60 %	20 %	0 %	20 %	333996529
52	NC_015578	AAAAG	2	10	70728	70737	80 %	0 %	20 %	0 %	333996529
53	NC_015578	TTTAT	2	10	71173	71182	20 %	80 %	0 %	0 %	333996530
54	NC_015578	ATATT	2	10	71230	71239	40 %	60 %	0 %	0 %	333996530
55	NC_015578	ATTTA	2	10	73664	73673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015578	ATTAT	2	10	73713	73722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015578	CTGGT	2	10	74873	74882	0 %	40 %	40 %	20 %	333996532
58	NC_015578	ATGTT	2	10	74919	74928	20 %	60 %	20 %	0 %	333996532
59	NC_015578	TGAAT	2	10	75319	75328	40 %	40 %	20 %	0 %	333996533
60	NC_015578	TAATG	2	10	75856	75865	40 %	40 %	20 %	0 %	333996533
61	NC_015578	CATAT	2	10	77029	77038	40 %	40 %	0 %	20 %	333996534
62	NC_015578	AAGTT	2	10	77169	77178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015578	TGATA	2	10	77529	77538	40 %	40 %	20 %	0 %	333996535
64	NC_015578	TAAAT	2	10	80289	80298	60 %	40 %	0 %	0 %	333996538
65	NC_015578	GGAAC	2	10	82769	82778	40 %	0 %	40 %	20 %	333996540
66	NC_015578	CGGTT	2	10	84114	84123	0 %	40 %	40 %	20 %	333996541
67	NC_015578	GGAAC	2	10	84427	84436	40 %	0 %	40 %	20 %	333996541
68	NC_015578	ATTAT	2	10	84538	84547	40 %	60 %	0 %	0 %	333996541
69	NC_015578	ACATT	2	10	85922	85931	40 %	40 %	0 %	20 %	333996543
70	NC_015578	AAATA	2	10	86403	86412	80 %	20 %	0 %	0 %	333996543
71	NC_015578	GTTTA	2	10	87417	87426	20 %	60 %	20 %	0 %	333996544
72	NC_015578	GATTT	2	10	91157	91166	20 %	60 %	20 %	0 %	333996549
73	NC_015578	TATAT	2	10	93463	93472	40 %	60 %	0 %	0 %	333996552
74	NC_015578	ACCGG	2	10	94758	94767	20 %	0 %	40 %	40 %	333996553
75	NC_015578	CAGGC	2	10	95456	95465	20 %	0 %	40 %	40 %	333996553
76	NC_015578	GGAGC	2	10	96457	96466	20 %	0 %	60 %	20 %	333996553
77	NC_015578	GGTTC	2	10	97209	97218	0 %	40 %	40 %	20 %	333996553
78	NC_015578	GCCCT	3	15	98000	98014	0 %	20 %	20 %	60 %	333996554
79	NC_015578	CATAC	2	10	100016	100025	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015578	GGAAG	2	10	104873	104882	40 %	0 %	60 %	0 %	333996559
81	NC_015578	GATTC	2	10	105602	105611	20 %	40 %	20 %	20 %	333996560
82	NC_015578	TTACC	2	10	107347	107356	20 %	40 %	0 %	40 %	333996561
83	NC_015578	TACCC	2	10	108197	108206	20 %	20 %	0 %	60 %	333996562
84	NC_015578	TGGTA	2	10	108910	108919	20 %	40 %	40 %	0 %	333996563
85	NC_015578	GCAGC	2	10	112236	112245	20 %	0 %	40 %	40 %	333996567
86	NC_015578	TGATC	2	10	115325	115334	20 %	40 %	20 %	20 %	333996569
87	NC_015578	AGCAA	2	10	118281	118290	60 %	0 %	20 %	20 %	333996571
88	NC_015578	CCCTT	2	10	120528	120537	0 %	40 %	0 %	60 %	333996575
89	NC_015578	TATAA	2	10	125994	126003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015578	TGCTT	2	10	126686	126695	0 %	60 %	20 %	20 %	333996581
91	NC_015578	GGGGC	2	10	127687	127696	0 %	0 %	80 %	20 %	333996582
92	NC_015578	TAAAT	2	10	129616	129625	60 %	40 %	0 %	0 %	333996585
93	NC_015578	CCCGG	2	10	132388	132397	0 %	0 %	40 %	60 %	333996588
94	NC_015578	TTTTC	2	10	132808	132817	0 %	80 %	0 %	20 %	333996589
95	NC_015578	AGCCG	2	10	132946	132955	20 %	0 %	40 %	40 %	333996589
96	NC_015578	TGAGC	2	10	137251	137260	20 %	20 %	40 %	20 %	333996593
97	NC_015578	CGGGG	2	10	137635	137644	0 %	0 %	80 %	20 %	333996593
98	NC_015578	ATATT	2	10	140128	140137	40 %	60 %	0 %	0 %	333996595
99	NC_015578	GGTAT	2	10	141013	141022	20 %	40 %	40 %	0 %	333996596
100	NC_015578	AACGG	2	10	144273	144282	40 %	0 %	40 %	20 %	333996599
101	NC_015578	CCCGC	2	10	144767	144776	0 %	0 %	20 %	80 %	333996600
102	NC_015578	GCTCA	2	10	144859	144868	20 %	20 %	20 %	40 %	333996600
103	NC_015578	CCTGG	2	10	144969	144978	0 %	20 %	40 %	40 %	333996600
104	NC_015578	TACTA	2	10	145613	145622	40 %	40 %	0 %	20 %	333996601
105	NC_015578	GGAAA	2	10	146220	146229	60 %	0 %	40 %	0 %	333996602
106	NC_015578	TCTTT	2	10	146310	146319	0 %	80 %	0 %	20 %	333996602
107	NC_015578	CCCAG	2	10	149742	149751	20 %	0 %	20 %	60 %	333996605
108	NC_015578	CCGGC	2	10	153466	153475	0 %	0 %	40 %	60 %	333996607
109	NC_015578	CGGGC	2	10	153778	153787	0 %	0 %	60 %	40 %	333996607
110	NC_015578	GGGAA	2	10	156168	156177	40 %	0 %	60 %	0 %	333996608
111	NC_015578	CGCTT	2	10	157103	157112	0 %	40 %	20 %	40 %	333996608
112	NC_015578	AGATC	2	10	157955	157964	40 %	20 %	20 %	20 %	333996609
113	NC_015578	AAAAC	2	10	158695	158704	80 %	0 %	0 %	20 %	333996609
114	NC_015578	GGGCT	2	10	161624	161633	0 %	20 %	60 %	20 %	333996612
115	NC_015578	TTCTG	2	10	162577	162586	0 %	60 %	20 %	20 %	333996613
116	NC_015578	CTCGC	2	10	162716	162725	0 %	20 %	20 %	60 %	333996613
117	NC_015578	AGTCC	2	10	162850	162859	20 %	20 %	20 %	40 %	333996613
118	NC_015578	GCCCT	2	10	163377	163386	0 %	20 %	20 %	60 %	333996613
119	NC_015578	CTGGG	2	10	165214	165223	0 %	20 %	60 %	20 %	333996615
120	NC_015578	CGTTC	2	10	169029	169038	0 %	40 %	20 %	40 %	333996618
121	NC_015578	TCTGC	2	10	172752	172761	0 %	40 %	20 %	40 %	333996622
122	NC_015578	TATCT	2	10	173261	173270	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015578	ATCTT	2	10	175202	175211	20 %	60 %	0 %	20 %	333996626
124	NC_015578	AACAA	2	10	176069	176078	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015578	CCTCC	2	10	176620	176629	0 %	20 %	0 %	80 %	333996627
126	NC_015578	ACCGC	2	10	178198	178207	20 %	0 %	20 %	60 %	333996629
127	NC_015578	AATAA	2	10	178866	178875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015578	AAGCG	2	10	180623	180632	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015578	ACCGT	2	10	182958	182967	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015578	TTCCG	2	10	184303	184312	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015578	GTTCC	2	10	185705	185714	0 %	40 %	20 %	40 %	333996631
132	NC_015578	CCAGG	2	10	187604	187613	20 %	0 %	40 %	40 %	333996633
133	NC_015578	TCAAT	2	10	187663	187672	40 %	40 %	0 %	20 %	333996633
134	NC_015578	CAGGG	2	10	188227	188236	20 %	0 %	60 %	20 %	333996634
135	NC_015578	ATGAA	2	10	190797	190806	60 %	20 %	20 %	0 %	333996636
136	NC_015578	TGAAG	2	10	191423	191432	40 %	20 %	40 %	0 %	333996637
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