MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 80300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015578	TGA	2	6	26487	26492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996489
502	NC_015578	T	6	6	26519	26524	0 %	100 %	0 %	0 %	333996489
503	NC_015578	CCT	2	6	26566	26571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996489
504	NC_015578	CTG	2	6	26632	26637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996489
505	NC_015578	CCA	2	6	26687	26692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996489
506	NC_015578	TATT	2	8	26697	26704	25 %	75 %	0 %	0 %	333996489
507	NC_015578	ATT	2	6	26794	26799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996489
508	NC_015578	CCGG	2	8	26843	26850	0 %	0 %	50 %	50 %	333996489
509	NC_015578	AAC	2	6	26918	26923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996490
510	NC_015578	TTA	2	6	26962	26967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996490
511	NC_015578	A	8	8	27069	27076	100 %	0 %	0 %	0 %	333996490
512	NC_015578	GGA	2	6	27116	27121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996490
513	NC_015578	T	6	6	27162	27167	0 %	100 %	0 %	0 %	333996490
514	NC_015578	TAT	2	6	27188	27193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996490
515	NC_015578	GGC	2	6	27257	27262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996490
516	NC_015578	CCT	3	9	27317	27325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996490
517	NC_015578	CTCC	2	8	27326	27333	0 %	25 %	0 %	75 %	333996490
518	NC_015578	GTG	2	6	27357	27362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996490
519	NC_015578	A	6	6	27411	27416	100 %	0 %	0 %	0 %	333996490
520	NC_015578	T	6	6	27591	27596	0 %	100 %	0 %	0 %	333996490
521	NC_015578	CAATGA	2	12	27629	27640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333996490
522	NC_015578	CGG	2	6	27645	27650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996490
523	NC_015578	G	6	6	27829	27834	0 %	0 %	100 %	0 %	333996490
524	NC_015578	CCG	2	6	27850	27855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996490
525	NC_015578	CCG	2	6	27874	27879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996490
526	NC_015578	TTGGC	2	10	27902	27911	0 %	40 %	40 %	20 %	333996490
527	NC_015578	CCG	2	6	28034	28039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996490
528	NC_015578	T	7	7	28094	28100	0 %	100 %	0 %	0 %	333996490
529	NC_015578	CGC	2	6	28145	28150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996490
530	NC_015578	CGG	2	6	28151	28156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996490
531	NC_015578	CGG	2	6	28229	28234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996490
532	NC_015578	G	6	6	28233	28238	0 %	0 %	100 %	0 %	333996490
533	NC_015578	GCT	2	6	28259	28264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996490
534	NC_015578	GAA	2	6	28265	28270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996490
535	NC_015578	ATG	2	6	28292	28297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996490
536	NC_015578	TTG	2	6	28394	28399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015578	ATT	2	6	28403	28408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015578	TAA	2	6	28452	28457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015578	ATA	3	9	28465	28473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015578	GAAT	2	8	28663	28670	50 %	25 %	25 %	0 %	333996491
541	NC_015578	GAT	2	6	28721	28726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996491
542	NC_015578	CGG	2	6	28768	28773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996491
543	NC_015578	TGC	2	6	28827	28832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996491
544	NC_015578	CGGGA	2	10	28925	28934	20 %	0 %	60 %	20 %	333996491
545	NC_015578	ACCG	2	8	28937	28944	25 %	0 %	25 %	50 %	333996491
546	NC_015578	TGC	2	6	28984	28989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996491
547	NC_015578	AAT	2	6	28991	28996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996491
548	NC_015578	G	6	6	29044	29049	0 %	0 %	100 %	0 %	333996491
549	NC_015578	CAT	2	6	29050	29055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996491
550	NC_015578	CGG	2	6	29070	29075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996491
551	NC_015578	CAT	2	6	29089	29094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996491
552	NC_015578	CGA	2	6	29095	29100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996491
553	NC_015578	GTT	2	6	29153	29158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996491
554	NC_015578	GCA	2	6	29361	29366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996491
555	NC_015578	AG	3	6	29423	29428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015578	AAACG	2	10	29429	29438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
557	NC_015578	ATA	2	6	29546	29551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996492
558	NC_015578	ATG	2	6	29580	29585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996492
559	NC_015578	GGT	2	6	29587	29592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996492
560	NC_015578	ACC	2	6	29666	29671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996492
561	NC_015578	TGAA	2	8	29676	29683	50 %	25 %	25 %	0 %	333996492
562	NC_015578	GCT	2	6	29720	29725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996492
563	NC_015578	ATC	2	6	29748	29753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996492
564	NC_015578	ATC	2	6	29768	29773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996492
565	NC_015578	CAT	2	6	29782	29787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996492
566	NC_015578	CAAT	2	8	29790	29797	50 %	25 %	0 %	25 %	333996492
567	NC_015578	ATG	3	9	29799	29807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996492
568	NC_015578	GGT	2	6	29815	29820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996492
569	NC_015578	TGAGC	2	10	29824	29833	20 %	20 %	40 %	20 %	333996492
570	NC_015578	ATT	2	6	29852	29857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996492
571	NC_015578	TA	3	6	29858	29863	50 %	50 %	0 %	0 %	333996492
572	NC_015578	A	6	6	29884	29889	100 %	0 %	0 %	0 %	333996492
573	NC_015578	ATG	2	6	29904	29909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996492
574	NC_015578	TGG	2	6	29937	29942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996492
575	NC_015578	AT	3	6	30142	30147	50 %	50 %	0 %	0 %	333996492
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577	NC_015578	A	7	7	30233	30239	100 %	0 %	0 %	0 %	333996492
578	NC_015578	GCC	2	6	30242	30247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996492
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580	NC_015578	ATTG	2	8	30388	30395	25 %	50 %	25 %	0 %	333996492
581	NC_015578	G	6	6	30403	30408	0 %	0 %	100 %	0 %	333996492
582	NC_015578	GCA	2	6	30514	30519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996492
583	NC_015578	CGG	2	6	30552	30557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996492
584	NC_015578	TA	3	6	30563	30568	50 %	50 %	0 %	0 %	333996492
585	NC_015578	CTGCGG	2	12	30582	30593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333996492
586	NC_015578	TAT	2	6	30638	30643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996492
587	NC_015578	AAT	2	6	30695	30700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996492
588	NC_015578	AAGCG	2	10	30758	30767	40 %	0 %	40 %	20 %	333996492
589	NC_015578	CATG	2	8	30801	30808	25 %	25 %	25 %	25 %	333996493
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591	NC_015578	GAA	2	6	30865	30870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996493
592	NC_015578	GCG	2	6	30883	30888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996493
593	NC_015578	TG	3	6	30910	30915	0 %	50 %	50 %	0 %	333996493
594	NC_015578	ATT	2	6	30923	30928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996493
595	NC_015578	CTGG	2	8	30949	30956	0 %	25 %	50 %	25 %	333996493
596	NC_015578	CGG	2	6	31017	31022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996493
597	NC_015578	GAA	2	6	31039	31044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996493
598	NC_015578	ATC	2	6	31084	31089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996493
599	NC_015578	TGG	2	6	31112	31117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996493
600	NC_015578	GAT	2	6	31120	31125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996493
601	NC_015578	GGC	2	6	31128	31133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996493
602	NC_015578	T	6	6	31172	31177	0 %	100 %	0 %	0 %	333996493
603	NC_015578	CAG	2	6	31243	31248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996493
604	NC_015578	A	6	6	31277	31282	100 %	0 %	0 %	0 %	333996493
605	NC_015578	TGGTT	2	10	31287	31296	0 %	60 %	40 %	0 %	333996493
606	NC_015578	T	7	7	31395	31401	0 %	100 %	0 %	0 %	333996493
607	NC_015578	T	6	6	31525	31530	0 %	100 %	0 %	0 %	333996493
608	NC_015578	GACGA	2	10	31600	31609	40 %	0 %	40 %	20 %	333996493
609	NC_015578	GAA	3	9	31633	31641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996493
610	NC_015578	TGG	2	6	31712	31717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996493
611	NC_015578	CAG	2	6	31784	31789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996493
612	NC_015578	TA	3	6	31802	31807	50 %	50 %	0 %	0 %	333996493
613	NC_015578	GAA	2	6	31819	31824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996493
614	NC_015578	TGC	2	6	31950	31955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996493
615	NC_015578	TCT	2	6	32052	32057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996493
616	NC_015578	GGA	2	6	32103	32108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996493
617	NC_015578	T	6	6	32118	32123	0 %	100 %	0 %	0 %	333996493
618	NC_015578	CTT	2	6	32200	32205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996494
619	NC_015578	CAC	2	6	32278	32283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996494
620	NC_015578	AAG	2	6	32366	32371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996494
621	NC_015578	GGC	2	6	32487	32492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996494
622	NC_015578	AC	3	6	32500	32505	50 %	0 %	0 %	50 %	333996494
623	NC_015578	CGT	2	6	32605	32610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996494
624	NC_015578	GAT	2	6	32648	32653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996494
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626	NC_015578	CAC	2	6	32720	32725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996494
627	NC_015578	GAT	2	6	32804	32809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996494
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