MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 48835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	GGC	2	6	16	21	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015577	GAA	3	9	367	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
3	NC_015577	AGA	2	6	575	580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
4	NC_015577	GCC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992988
5	NC_015577	GCT	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992988
6	NC_015577	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992988
7	NC_015577	AAC	2	6	868	873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992988
8	NC_015577	TCG	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992988
9	NC_015577	AAG	3	9	961	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
10	NC_015577	GAC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992988
11	NC_015577	AGG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992988
12	NC_015577	AGA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
13	NC_015577	CAA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992988
14	NC_015577	TTC	2	6	1398	1403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992988
15	NC_015577	TAC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015577	TGC	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992989
17	NC_015577	GAC	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992989
18	NC_015577	AGC	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992989
19	NC_015577	CCG	3	9	2316	2324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992989
20	NC_015577	GCC	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992989
21	NC_015577	ATC	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992989
22	NC_015577	TGA	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992989
23	NC_015577	CGA	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992989
24	NC_015577	ATC	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992989
25	NC_015577	TCT	2	6	2651	2656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992989
26	NC_015577	TGG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992989
27	NC_015577	GAG	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992989
28	NC_015577	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992989
29	NC_015577	CTT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992989
30	NC_015577	CTG	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992990
31	NC_015577	CTG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992990
32	NC_015577	CTC	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992990
33	NC_015577	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992990
34	NC_015577	GGC	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992990
35	NC_015577	GTG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992990
36	NC_015577	GGA	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992990
37	NC_015577	GCA	4	12	4295	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992991
38	NC_015577	TTG	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333992991
39	NC_015577	AGC	3	9	4555	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992991
40	NC_015577	GAT	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992991
41	NC_015577	AAG	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992991
42	NC_015577	CAT	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992992
43	NC_015577	GCG	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992992
44	NC_015577	CAG	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992992
45	NC_015577	GCG	2	6	5068	5073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992992
46	NC_015577	TAT	2	6	5114	5119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992992
47	NC_015577	ATG	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992992
48	NC_015577	TTC	2	6	5227	5232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992992
49	NC_015577	CGG	2	6	5261	5266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992992
50	NC_015577	CCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992992
51	NC_015577	TAA	2	6	5589	5594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333992992
52	NC_015577	TCT	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992993
53	NC_015577	TGA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992993
54	NC_015577	TTC	2	6	5843	5848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992993
55	NC_015577	AAG	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992993
56	NC_015577	CGG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992993
57	NC_015577	CTT	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992993
58	NC_015577	TGT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333992993
59	NC_015577	GGC	2	6	6220	6225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992993
60	NC_015577	CAC	2	6	6283	6288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333992993
61	NC_015577	TAT	2	6	6314	6319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992993
62	NC_015577	GCC	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992993
63	NC_015577	TGG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992993
64	NC_015577	TCA	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992993
65	NC_015577	GAA	2	6	6673	6678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992993
66	NC_015577	AAG	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
67	NC_015577	CGG	2	6	6828	6833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
68	NC_015577	ATG	2	6	6989	6994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992994
69	NC_015577	CGC	2	6	7015	7020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992994
70	NC_015577	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992994
71	NC_015577	TTA	2	6	7196	7201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992994
72	NC_015577	TAC	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992994
73	NC_015577	AAG	2	6	7225	7230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
74	NC_015577	TGG	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992994
75	NC_015577	CAA	2	6	7272	7277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992994
76	NC_015577	GGC	2	6	7494	7499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
77	NC_015577	CCT	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992994
78	NC_015577	TGC	2	6	7634	7639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992994
79	NC_015577	CAT	2	6	7701	7706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992994
80	NC_015577	GAG	2	6	7726	7731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992994
81	NC_015577	GAG	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992994
82	NC_015577	CGG	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
83	NC_015577	GAA	2	6	7807	7812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
84	NC_015577	GAA	3	9	7825	7833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
85	NC_015577	AGA	3	9	7848	7856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
86	NC_015577	CTC	2	6	7956	7961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992994
87	NC_015577	GCA	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992994
88	NC_015577	TTC	2	6	8083	8088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992994
89	NC_015577	CAT	2	6	8166	8171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992994
90	NC_015577	ATT	2	6	8183	8188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992994
91	NC_015577	CCG	2	6	8258	8263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992994
92	NC_015577	TTA	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992994
93	NC_015577	CCG	2	6	8418	8423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992994
94	NC_015577	AGG	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992994
95	NC_015577	CCT	2	6	8568	8573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992994
96	NC_015577	AAC	2	6	8590	8595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992994
97	NC_015577	ACC	2	6	8639	8644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333992994
98	NC_015577	GCA	2	6	8699	8704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992994
99	NC_015577	GGC	2	6	8707	8712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
100	NC_015577	GGC	2	6	8772	8777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
101	NC_015577	AGC	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992994
102	NC_015577	CAG	2	6	8900	8905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992995
103	NC_015577	GAT	2	6	9128	9133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992995
104	NC_015577	TGA	2	6	9235	9240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992995
105	NC_015577	CAG	2	6	9514	9519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992995
106	NC_015577	GAA	2	6	9569	9574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992995
107	NC_015577	ATT	2	6	9636	9641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992995
108	NC_015577	TAA	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333992995
109	NC_015577	TGA	2	6	9832	9837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992995
110	NC_015577	GAA	2	6	10020	10025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992996
111	NC_015577	ATA	2	6	10044	10049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333992996
112	NC_015577	GCA	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992996
113	NC_015577	CCG	2	6	10114	10119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992996
114	NC_015577	CCG	2	6	10132	10137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992996
115	NC_015577	CTC	2	6	10415	10420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992996
116	NC_015577	CGG	2	6	10471	10476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992996
117	NC_015577	GCC	2	6	10521	10526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992996
118	NC_015577	GCT	2	6	10545	10550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992996
119	NC_015577	TAT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015577	GGC	2	6	10963	10968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992997
121	NC_015577	GCA	2	6	10990	10995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992997
122	NC_015577	TGC	2	6	10997	11002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992997
123	NC_015577	TGC	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992997
124	NC_015577	GCC	2	6	11094	11099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992997
125	NC_015577	GCG	2	6	11155	11160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992997
126	NC_015577	ATT	2	6	11182	11187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992997
127	NC_015577	GAA	2	6	11224	11229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992997
128	NC_015577	GCA	2	6	11305	11310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992998
129	NC_015577	GGC	2	6	11350	11355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992998
130	NC_015577	ATC	2	6	11555	11560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992998
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255	NC_015577	CCG	2	6	21235	21240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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