MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 58930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015555	GAA	3	9	197599	197607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896043
4502	NC_015555	GAT	2	6	197616	197621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896043
4503	NC_015555	AGA	2	6	197778	197783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896043
4504	NC_015555	TGAA	2	8	197798	197805	50 %	25 %	25 %	0 %	333896043
4505	NC_015555	A	7	7	197811	197817	100 %	0 %	0 %	0 %	333896043
4506	NC_015555	AG	3	6	197865	197870	50 %	0 %	50 %	0 %	333896043
4507	NC_015555	TGGA	2	8	197905	197912	25 %	25 %	50 %	0 %	333896043
4508	NC_015555	AAGA	2	8	197920	197927	75 %	0 %	25 %	0 %	333896043
4509	NC_015555	TTTC	2	8	197951	197958	0 %	75 %	0 %	25 %	333896043
4510	NC_015555	GAT	2	6	197992	197997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896043
4511	NC_015555	TGC	2	6	198078	198083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896043
4512	NC_015555	ATC	2	6	198227	198232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896043
4513	NC_015555	ACT	2	6	198404	198409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896043
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4515	NC_015555	ATG	2	6	198485	198490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896043
4516	NC_015555	TAA	2	6	198507	198512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896043
4517	NC_015555	AAT	2	6	198585	198590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896043
4518	NC_015555	AAG	2	6	198609	198614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896043
4519	NC_015555	TGA	2	6	198650	198655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015555	TAG	2	6	198687	198692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015555	A	6	6	198693	198698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015555	T	6	6	198711	198716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015555	ATA	2	6	198717	198722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015555	ATA	2	6	198748	198753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015555	A	7	7	198892	198898	100 %	0 %	0 %	0 %	333896044
4526	NC_015555	GATT	2	8	198906	198913	25 %	50 %	25 %	0 %	333896044
4527	NC_015555	A	6	6	198920	198925	100 %	0 %	0 %	0 %	333896044
4528	NC_015555	TCT	2	6	198970	198975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896044
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4530	NC_015555	GTT	2	6	199024	199029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896044
4531	NC_015555	AT	3	6	199102	199107	50 %	50 %	0 %	0 %	333896045
4532	NC_015555	GAA	2	6	199147	199152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896045
4533	NC_015555	AAG	2	6	199344	199349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896045
4534	NC_015555	AGG	2	6	199467	199472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896045
4535	NC_015555	TAT	2	6	199531	199536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015555	ATA	2	6	199543	199548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015555	T	7	7	199674	199680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015555	AGG	2	6	199706	199711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015555	T	6	6	199739	199744	0 %	100 %	0 %	0 %	333896046
4540	NC_015555	ATA	2	6	199780	199785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896046
4541	NC_015555	TGC	2	6	199800	199805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896046
4542	NC_015555	TA	3	6	199900	199905	50 %	50 %	0 %	0 %	333896046
4543	NC_015555	GCCA	2	8	199941	199948	25 %	0 %	25 %	50 %	333896046
4544	NC_015555	TGT	2	6	200049	200054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896046
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4547	NC_015555	TCT	3	9	200192	200200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896046
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4549	NC_015555	TAG	2	6	200264	200269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896046
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4551	NC_015555	TAT	2	6	200301	200306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896046
4552	NC_015555	GAT	2	6	200331	200336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896046
4553	NC_015555	A	6	6	200341	200346	100 %	0 %	0 %	0 %	333896046
4554	NC_015555	GAAG	2	8	200503	200510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015555	CAG	2	6	200745	200750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015555	AAGG	2	8	200783	200790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015555	AGG	2	6	200801	200806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015555	CAA	2	6	200856	200861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896047
4559	NC_015555	TCAA	2	8	200875	200882	50 %	25 %	0 %	25 %	333896047
4560	NC_015555	AG	4	8	200897	200904	50 %	0 %	50 %	0 %	333896047
4561	NC_015555	ATC	2	6	200921	200926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896047
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4563	NC_015555	AAG	2	6	201007	201012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896047
4564	NC_015555	AGT	2	6	201023	201028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896047
4565	NC_015555	GATGG	2	10	201054	201063	20 %	20 %	60 %	0 %	333896047
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4573	NC_015555	GTA	2	6	201366	201371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896047
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4578	NC_015555	GAT	2	6	201633	201638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896047
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4580	NC_015555	TAGA	2	8	201748	201755	50 %	25 %	25 %	0 %	333896047
4581	NC_015555	GAAAA	2	10	201761	201770	80 %	0 %	20 %	0 %	333896047
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4586	NC_015555	GTAC	2	8	202255	202262	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_015555	GGT	2	6	202263	202268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_015555	CGG	2	6	202278	202283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_015555	CCT	2	6	202294	202299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_015555	AAATAA	2	12	202354	202365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015555	ATTTA	2	10	202406	202415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015555	ATAAA	2	10	202472	202481	80 %	20 %	0 %	0 %	333896048
4593	NC_015555	A	7	7	202539	202545	100 %	0 %	0 %	0 %	333896048
4594	NC_015555	A	6	6	202553	202558	100 %	0 %	0 %	0 %	333896048
4595	NC_015555	AGAT	2	8	202904	202911	50 %	25 %	25 %	0 %	333896048
4596	NC_015555	TTG	2	6	202919	202924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896048
4597	NC_015555	GA	3	6	202931	202936	50 %	0 %	50 %	0 %	333896048
4598	NC_015555	AAAT	2	8	202976	202983	75 %	25 %	0 %	0 %	333896048
4599	NC_015555	TGA	2	6	203001	203006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896048
4600	NC_015555	A	6	6	203020	203025	100 %	0 %	0 %	0 %	333896048
4601	NC_015555	ATGAG	2	10	203033	203042	40 %	20 %	40 %	0 %	333896048
4602	NC_015555	TAGA	2	8	203063	203070	50 %	25 %	25 %	0 %	333896048
4603	NC_015555	TGGTGA	2	12	203075	203086	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333896048
4604	NC_015555	TGGACT	2	12	203094	203105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333896048
4605	NC_015555	A	7	7	203115	203121	100 %	0 %	0 %	0 %	333896048
4606	NC_015555	GAT	2	6	203215	203220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896048
4607	NC_015555	GCT	2	6	203269	203274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896048
4608	NC_015555	GTG	2	6	203294	203299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896048
4609	NC_015555	AAG	2	6	203366	203371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896048
4610	NC_015555	AG	3	6	203370	203375	50 %	0 %	50 %	0 %	333896048
4611	NC_015555	AGAT	2	8	203474	203481	50 %	25 %	25 %	0 %	333896048
4612	NC_015555	GGA	2	6	203499	203504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896048
4613	NC_015555	CAG	2	6	203522	203527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896048
4614	NC_015555	ATA	2	6	203552	203557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896048
4615	NC_015555	ATG	2	6	203564	203569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896048
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4620	NC_015555	AGG	2	6	203710	203715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896049
4621	NC_015555	TGC	2	6	203742	203747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896049
4622	NC_015555	TTTG	2	8	203752	203759	0 %	75 %	25 %	0 %	333896049
4623	NC_015555	AGC	2	6	203765	203770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896049
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