MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 37345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	GTT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015519	TAT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015519	TTA	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015519	TTC	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015519	GAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015519	GCA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
7	NC_015519	CAA	2	6	185	190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798024
8	NC_015519	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
9	NC_015519	TGT	2	6	321	326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798024
10	NC_015519	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
11	NC_015519	AGA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
12	NC_015519	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798024
13	NC_015519	TGG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798024
14	NC_015519	GCA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
15	NC_015519	CAG	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
16	NC_015519	TAA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
17	NC_015519	TGA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
18	NC_015519	TTC	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798024
19	NC_015519	ATG	2	6	815	820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
20	NC_015519	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798024
21	NC_015519	ATG	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
22	NC_015519	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
23	NC_015519	TCA	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798024
24	NC_015519	TTC	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798024
25	NC_015519	GAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
26	NC_015519	GAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
27	NC_015519	GAA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
28	NC_015519	TAA	2	6	1450	1455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
29	NC_015519	CAT	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015519	TTA	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015519	TAC	5	15	1626	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015519	ATG	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
33	NC_015519	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798025
34	NC_015519	GAT	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
35	NC_015519	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
36	NC_015519	TAA	2	6	2430	2435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798025
37	NC_015519	GAC	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798025
38	NC_015519	AAT	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798025
39	NC_015519	GCA	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798025
40	NC_015519	TAT	2	6	2782	2787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798025
41	NC_015519	CGG	2	6	2937	2942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798026
42	NC_015519	GCT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798026
43	NC_015519	GGA	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798027
44	NC_015519	TGC	2	6	3675	3680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798027
45	NC_015519	ATC	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798027
46	NC_015519	ATT	2	6	3705	3710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798027
47	NC_015519	GAT	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798027
48	NC_015519	GAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798027
49	NC_015519	ATC	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798027
50	NC_015519	GGA	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798027
51	NC_015519	CTG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798028
52	NC_015519	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798028
53	NC_015519	ACA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798028
54	NC_015519	AGA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798028
55	NC_015519	GAT	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
56	NC_015519	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
57	NC_015519	AAG	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798028
58	NC_015519	TGA	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
59	NC_015519	AGT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798029
60	NC_015519	GAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798029
61	NC_015519	CAG	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798029
62	NC_015519	AAG	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798029
63	NC_015519	ATT	2	6	4854	4859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798029
64	NC_015519	ATG	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
65	NC_015519	CAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798030
66	NC_015519	TGA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
67	NC_015519	GAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
68	NC_015519	TGC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
69	NC_015519	CGG	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
70	NC_015519	TCT	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798030
71	NC_015519	GAA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
72	NC_015519	TGA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
73	NC_015519	GGT	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798030
74	NC_015519	TGC	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
75	NC_015519	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
76	NC_015519	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798030
77	NC_015519	TTG	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798030
78	NC_015519	GTA	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
79	NC_015519	AGC	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
80	NC_015519	TGG	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798030
81	NC_015519	GAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
82	NC_015519	GAG	2	6	6382	6387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798030
83	NC_015519	GCC	2	6	6534	6539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798030
84	NC_015519	TGA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
85	NC_015519	CAG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
86	NC_015519	GGC	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
87	NC_015519	AGC	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
88	NC_015519	AGA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
89	NC_015519	GCT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
90	NC_015519	GGC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
91	NC_015519	AGG	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798030
92	NC_015519	GAA	3	9	6905	6913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798031
93	NC_015519	ATT	2	6	6933	6938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798031
94	NC_015519	CCA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332798031
95	NC_015519	CTG	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798031
96	NC_015519	ATG	2	6	7311	7316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
97	NC_015519	TGC	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798031
98	NC_015519	TTC	2	6	7375	7380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798031
99	NC_015519	CCG	2	6	7412	7417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798031
100	NC_015519	ATG	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
101	NC_015519	AGA	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798031
102	NC_015519	TTA	2	6	7497	7502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798031
103	NC_015519	AAT	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798031
104	NC_015519	ACA	2	6	7565	7570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798031
105	NC_015519	TGT	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798031
106	NC_015519	TGG	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798031
107	NC_015519	ATA	2	6	7878	7883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798031
108	NC_015519	GAT	2	6	7909	7914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
109	NC_015519	TTA	2	6	7915	7920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798031
110	NC_015519	AAG	2	6	7951	7956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798031
111	NC_015519	TGA	2	6	8182	8187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
112	NC_015519	ACT	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798031
113	NC_015519	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
114	NC_015519	AGA	2	6	8350	8355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798031
115	NC_015519	GAG	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798031
116	NC_015519	GAA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798031
117	NC_015519	TCA	2	6	8518	8523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798031
118	NC_015519	TGT	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798031
119	NC_015519	CTG	2	6	8624	8629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798031
120	NC_015519	GAT	2	6	8659	8664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
121	NC_015519	TGA	2	6	8680	8685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
122	NC_015519	GCT	2	6	8734	8739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798031
123	NC_015519	ACG	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798031
124	NC_015519	GAT	3	9	8792	8800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
125	NC_015519	GAG	2	6	8834	8839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798031
126	NC_015519	ATG	2	6	8886	8891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
127	NC_015519	GTG	2	6	8954	8959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798031
128	NC_015519	ATG	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
129	NC_015519	TAA	2	6	9072	9077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798031
130	NC_015519	GTT	2	6	9122	9127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798031
131	NC_015519	ATG	2	6	9135	9140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798031
132	NC_015519	AGC	2	6	9467	9472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798032
133	NC_015519	TCA	2	6	9548	9553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798032
134	NC_015519	ATG	2	6	9657	9662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798032
135	NC_015519	GAT	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798032
136	NC_015519	GGC	2	6	9748	9753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798032
137	NC_015519	CTG	2	6	9861	9866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798032
138	NC_015519	GCA	3	9	9925	9933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798032
139	NC_015519	CAA	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798032
140	NC_015519	TTC	2	6	10390	10395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798032
141	NC_015519	TAA	2	6	10450	10455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798032
142	NC_015519	TAA	2	6	10463	10468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798032
143	NC_015519	CAG	2	6	10469	10474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798032
144	NC_015519	TAA	2	6	10562	10567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798032
145	NC_015519	TAA	2	6	10639	10644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798032
146	NC_015519	TCC	2	6	10664	10669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332798032
147	NC_015519	ATA	2	6	10830	10835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015519	CTG	3	9	11029	11037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798033
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152	NC_015519	ATA	2	6	11496	11501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798033
153	NC_015519	GGT	2	6	11585	11590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798034
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158	NC_015519	CTG	2	6	11800	11805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798034
159	NC_015519	TAG	2	6	11836	11841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798034
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161	NC_015519	ACT	2	6	12153	12158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798035
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163	NC_015519	GCT	2	6	12238	12243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798035
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165	NC_015519	GGT	2	6	12323	12328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015519	GAA	2	6	12374	12379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798036
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189	NC_015519	AGG	2	6	14018	14023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_015519	AGT	2	6	18913	18918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_015519	ATT	2	6	18981	18986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015519	AGG	2	6	19212	19217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_015519	GCA	2	6	19610	19615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798042
257	NC_015519	ACT	2	6	19732	19737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798042
258	NC_015519	CGG	2	6	19740	19745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798042
259	NC_015519	TTA	2	6	19746	19751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798042
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261	NC_015519	GCA	2	6	19802	19807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798042
262	NC_015519	GCA	2	6	19870	19875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798042
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