MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 61443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015519	ATTG	2	8	9	16	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015519	GTT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015519	TAT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015519	TTA	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015519	TTC	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015519	GAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015519	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015519	GCA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
10	NC_015519	CAA	2	6	185	190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798024
11	NC_015519	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
12	NC_015519	AAAAC	2	10	306	315	80 %	0 %	0 %	20 %	332798024
13	NC_015519	TGT	2	6	321	326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798024
14	NC_015519	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
15	NC_015519	AGA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
16	NC_015519	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798024
17	NC_015519	TGG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798024
18	NC_015519	TCGCT	2	10	483	492	0 %	40 %	20 %	40 %	332798024
19	NC_015519	GCA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
20	NC_015519	T	6	6	543	548	0 %	100 %	0 %	0 %	332798024
21	NC_015519	CATG	2	8	585	592	25 %	25 %	25 %	25 %	332798024
22	NC_015519	TA	3	6	604	609	50 %	50 %	0 %	0 %	332798024
23	NC_015519	CAG	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
24	NC_015519	TCTT	2	8	642	649	0 %	75 %	0 %	25 %	332798024
25	NC_015519	TAA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
26	NC_015519	TGA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
27	NC_015519	TTC	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798024
28	NC_015519	ATG	2	6	815	820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
29	NC_015519	CCGC	2	8	849	856	0 %	0 %	25 %	75 %	332798024
30	NC_015519	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798024
31	NC_015519	A	8	8	962	969	100 %	0 %	0 %	0 %	332798024
32	NC_015519	ATG	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
33	NC_015519	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
34	NC_015519	TCA	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798024
35	NC_015519	TTC	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798024
36	NC_015519	GAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
37	NC_015519	GAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
38	NC_015519	GAA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
39	NC_015519	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	332798024
40	NC_015519	TAA	2	6	1450	1455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
41	NC_015519	CAT	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015519	AT	3	6	1580	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015519	TTA	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015519	TAC	5	15	1626	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015519	AT	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015519	ATG	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
47	NC_015519	GAAT	2	8	1885	1892	50 %	25 %	25 %	0 %	332798025
48	NC_015519	AT	4	8	2011	2018	50 %	50 %	0 %	0 %	332798025
49	NC_015519	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798025
50	NC_015519	GAT	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
51	NC_015519	TGGA	2	8	2238	2245	25 %	25 %	50 %	0 %	332798025
52	NC_015519	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
53	NC_015519	TAA	2	6	2430	2435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798025
54	NC_015519	GAC	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798025
55	NC_015519	AAT	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798025
56	NC_015519	GCA	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798025
57	NC_015519	T	6	6	2708	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	332798025
58	NC_015519	TAAAA	2	10	2743	2752	80 %	20 %	0 %	0 %	332798025
59	NC_015519	TAT	2	6	2782	2787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798025
60	NC_015519	ATTTT	2	10	2817	2826	20 %	80 %	0 %	0 %	332798025
61	NC_015519	GAAA	2	8	2865	2872	75 %	0 %	25 %	0 %	332798026
62	NC_015519	T	6	6	2927	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	332798026
63	NC_015519	CGG	2	6	2937	2942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798026
64	NC_015519	GCT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798026
65	NC_015519	T	6	6	3159	3164	0 %	100 %	0 %	0 %	332798027
66	NC_015519	TATT	2	8	3205	3212	25 %	75 %	0 %	0 %	332798027
67	NC_015519	AG	3	6	3245	3250	50 %	0 %	50 %	0 %	332798027
68	NC_015519	T	6	6	3283	3288	0 %	100 %	0 %	0 %	332798027
69	NC_015519	GACA	2	8	3323	3330	50 %	0 %	25 %	25 %	332798027
70	NC_015519	TA	3	6	3337	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	332798027
71	NC_015519	A	7	7	3351	3357	100 %	0 %	0 %	0 %	332798027
72	NC_015519	A	7	7	3380	3386	100 %	0 %	0 %	0 %	332798027
73	NC_015519	GGA	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798027
74	NC_015519	TGC	2	6	3675	3680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798027
75	NC_015519	ATC	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798027
76	NC_015519	ATT	2	6	3705	3710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798027
77	NC_015519	GATT	2	8	3763	3770	25 %	50 %	25 %	0 %	332798027
78	NC_015519	GAT	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798027
79	NC_015519	T	7	7	3883	3889	0 %	100 %	0 %	0 %	332798027
80	NC_015519	GAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798027
81	NC_015519	ACAT	2	8	4038	4045	50 %	25 %	0 %	25 %	332798027
82	NC_015519	GCAG	2	8	4047	4054	25 %	0 %	50 %	25 %	332798027
83	NC_015519	ATC	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798027
84	NC_015519	TATT	2	8	4083	4090	25 %	75 %	0 %	0 %	332798027
85	NC_015519	ATTC	2	8	4108	4115	25 %	50 %	0 %	25 %	332798027
86	NC_015519	GGA	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798027
87	NC_015519	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	332798027
88	NC_015519	CTG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798028
89	NC_015519	A	8	8	4216	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
90	NC_015519	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798028
91	NC_015519	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
92	NC_015519	ACA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798028
93	NC_015519	TTTA	2	8	4374	4381	25 %	75 %	0 %	0 %	332798028
94	NC_015519	A	7	7	4465	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
95	NC_015519	AGA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798028
96	NC_015519	GAT	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
97	NC_015519	AT	3	6	4550	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	332798028
98	NC_015519	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
99	NC_015519	AAG	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798028
100	NC_015519	TGA	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
101	NC_015519	ATAAA	2	10	4629	4638	80 %	20 %	0 %	0 %	332798028
102	NC_015519	A	6	6	4636	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
103	NC_015519	AGT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798029
104	NC_015519	GAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798029
105	NC_015519	TA	3	6	4799	4804	50 %	50 %	0 %	0 %	332798029
106	NC_015519	A	7	7	4822	4828	100 %	0 %	0 %	0 %	332798029
107	NC_015519	CAG	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798029
108	NC_015519	AAG	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798029
109	NC_015519	ATT	2	6	4854	4859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798029
110	NC_015519	TG	3	6	4927	4932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015519	A	7	7	4949	4955	100 %	0 %	0 %	0 %	332798030
112	NC_015519	ATG	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
113	NC_015519	AAAAT	2	10	4970	4979	80 %	20 %	0 %	0 %	332798030
114	NC_015519	TA	3	6	5026	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	332798030
115	NC_015519	CAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798030
116	NC_015519	TGA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
117	NC_015519	GAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
118	NC_015519	TGC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
119	NC_015519	CGG	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
120	NC_015519	TGGA	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	332798030
121	NC_015519	TCT	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798030
122	NC_015519	GAA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
123	NC_015519	AT	3	6	5498	5503	50 %	50 %	0 %	0 %	332798030
124	NC_015519	AG	3	6	5518	5523	50 %	0 %	50 %	0 %	332798030
125	NC_015519	TGA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
126	NC_015519	GGT	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798030
127	NC_015519	TGC	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
128	NC_015519	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
129	NC_015519	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798030
130	NC_015519	ATGA	2	8	5821	5828	50 %	25 %	25 %	0 %	332798030
131	NC_015519	AAGGG	2	10	5889	5898	40 %	0 %	60 %	0 %	332798030
132	NC_015519	CAAA	2	8	5947	5954	75 %	0 %	0 %	25 %	332798030
133	NC_015519	TTG	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798030
134	NC_015519	GTA	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
135	NC_015519	AGC	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
136	NC_015519	TGG	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798030
137	NC_015519	GAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
138	NC_015519	GAG	2	6	6382	6387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798030
139	NC_015519	GCTGAT	2	12	6430	6441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798030
140	NC_015519	T	7	7	6478	6484	0 %	100 %	0 %	0 %	332798030
141	NC_015519	GCC	2	6	6534	6539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798030
142	NC_015519	TGA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
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147	NC_015519	GCT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
148	NC_015519	GGC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
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152	NC_015519	A	6	6	6917	6922	100 %	0 %	0 %	0 %	332798031
153	NC_015519	AT	3	6	6925	6930	50 %	50 %	0 %	0 %	332798031
154	NC_015519	ATT	2	6	6933	6938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798031
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156	NC_015519	CT	4	8	7028	7035	0 %	50 %	0 %	50 %	332798031
157	NC_015519	AT	3	6	7118	7123	50 %	50 %	0 %	0 %	332798031
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162	NC_015519	TTC	2	6	7375	7380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798031
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173	NC_015519	A	7	7	7712	7718	100 %	0 %	0 %	0 %	332798031
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179	NC_015519	AAG	2	6	7951	7956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798031
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183	NC_015519	A	6	6	8244	8249	100 %	0 %	0 %	0 %	332798031
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209	NC_015519	TA	3	6	9351	9356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_015519	TAA	2	6	10639	10644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798032
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234	NC_015519	ATA	2	6	10830	10835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_015519	A	7	7	11540	11546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_015519	TTG	2	6	12299	12304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798035
267	NC_015519	GGT	2	6	12323	12328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015519	T	7	7	12357	12363	0 %	100 %	0 %	0 %	332798036
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