MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	AAAT	2	8	976	983	75 %	25 %	0 %	0 %	331746792
2	NC_015471	TGTT	2	8	1440	1447	0 %	75 %	25 %	0 %	331746792
3	NC_015471	GAAT	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	331746792
4	NC_015471	ATCC	2	8	2137	2144	25 %	25 %	0 %	50 %	331746792
5	NC_015471	CTTT	2	8	2414	2421	0 %	75 %	0 %	25 %	331746792
6	NC_015471	ACCC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	0 %	75 %	331746792
7	NC_015471	AATC	2	8	3462	3469	50 %	25 %	0 %	25 %	331746792
8	NC_015471	ATCT	2	8	3819	3826	25 %	50 %	0 %	25 %	331746792
9	NC_015471	TTGA	2	8	3945	3952	25 %	50 %	25 %	0 %	331746792
10	NC_015471	ATTT	2	8	4272	4279	25 %	75 %	0 %	0 %	331746792
11	NC_015471	TTGG	2	8	4920	4927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015471	CTTT	2	8	5222	5229	0 %	75 %	0 %	25 %	331746793
13	NC_015471	GGCT	2	8	6187	6194	0 %	25 %	50 %	25 %	331746793
14	NC_015471	GAGC	2	8	6338	6345	25 %	0 %	50 %	25 %	331746793
15	NC_015471	CTTT	2	8	6447	6454	0 %	75 %	0 %	25 %	331746793
16	NC_015471	TACC	2	8	6887	6894	25 %	25 %	0 %	50 %	331746795
17	NC_015471	TAAT	2	8	6915	6922	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
18	NC_015471	ACCC	2	8	7465	7472	25 %	0 %	0 %	75 %	331746795
19	NC_015471	TTTC	2	8	7581	7588	0 %	75 %	0 %	25 %	331746795
20	NC_015471	AATC	2	8	7722	7729	50 %	25 %	0 %	25 %	331746795
21	NC_015471	TATC	2	8	8860	8867	25 %	50 %	0 %	25 %	331746796
22	NC_015471	GAGG	2	8	9708	9715	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015471	CTTT	2	8	10186	10193	0 %	75 %	0 %	25 %	331746798
24	NC_015471	TTTG	2	8	10971	10978	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015471	TCCT	2	8	11453	11460	0 %	50 %	0 %	50 %	331746802
26	NC_015471	TAAT	2	8	11514	11521	50 %	50 %	0 %	0 %	331746802
27	NC_015471	CCTT	2	8	11858	11865	0 %	50 %	0 %	50 %	331746803
28	NC_015471	ATCT	2	8	11875	11882	25 %	50 %	0 %	25 %	331746803
29	NC_015471	CTTT	2	8	12149	12156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015471	ATTA	2	8	12598	12605	50 %	50 %	0 %	0 %	331746804
31	NC_015471	TAAT	2	8	12684	12691	50 %	50 %	0 %	0 %	331746804
32	NC_015471	AATG	2	8	13116	13123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015471	TTTG	2	8	13273	13280	0 %	75 %	25 %	0 %	331746805
34	NC_015471	ACAT	2	8	13760	13767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015471	TCAT	2	8	14228	14235	25 %	50 %	0 %	25 %	331746806
36	NC_015471	TAGA	2	8	15214	15221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015471	AATA	2	8	15418	15425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015471	CTCA	2	8	15938	15945	25 %	25 %	0 %	50 %	331746808
39	NC_015471	ATTA	2	8	16102	16109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015471	CGTA	2	8	16581	16588	25 %	25 %	25 %	25 %	331746809
41	NC_015471	CCCA	2	8	16811	16818	25 %	0 %	0 %	75 %	331746809
42	NC_015471	TATC	2	8	17097	17104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015471	CTTT	2	8	17392	17399	0 %	75 %	0 %	25 %	331746810
44	NC_015471	CTTT	2	8	17556	17563	0 %	75 %	0 %	25 %	331746810
45	NC_015471	CGGA	2	8	18273	18280	25 %	0 %	50 %	25 %	331746810
46	NC_015471	ATCT	2	8	18793	18800	25 %	50 %	0 %	25 %	331746810
47	NC_015471	GGAA	2	8	19242	19249	50 %	0 %	50 %	0 %	331746810
48	NC_015471	CCCT	2	8	19431	19438	0 %	25 %	0 %	75 %	331746810
49	NC_015471	TCCT	2	8	19664	19671	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
50	NC_015471	GGTT	2	8	20536	20543	0 %	50 %	50 %	0 %	331746811
51	NC_015471	ACTT	2	8	21109	21116	25 %	50 %	0 %	25 %	331746811
52	NC_015471	GGAA	2	8	21710	21717	50 %	0 %	50 %	0 %	331746811
53	NC_015471	TCCC	2	8	21754	21761	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_015471	AGTG	2	8	22623	22630	25 %	25 %	50 %	0 %	331746812
55	NC_015471	AAGG	2	8	24514	24521	50 %	0 %	50 %	0 %	331746815
56	NC_015471	GCTC	2	8	25116	25123	0 %	25 %	25 %	50 %	331746816
57	NC_015471	TATC	2	8	25608	25615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015471	CCAT	2	8	26401	26408	25 %	25 %	0 %	50 %	331746817
59	NC_015471	TCTA	2	8	26806	26813	25 %	50 %	0 %	25 %	331746817
60	NC_015471	ATAG	2	8	28432	28439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015471	CTTT	2	8	29019	29026	0 %	75 %	0 %	25 %	331746819
62	NC_015471	ATTA	2	8	29204	29211	50 %	50 %	0 %	0 %	331746819
63	NC_015471	ATCA	2	8	30104	30111	50 %	25 %	0 %	25 %	331746820
64	NC_015471	CAAA	2	8	30433	30440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015471	TCAA	2	8	31343	31350	50 %	25 %	0 %	25 %	331746822
66	NC_015471	CTTT	2	8	31687	31694	0 %	75 %	0 %	25 %	331746823
67	NC_015471	ATCT	2	8	32024	32031	25 %	50 %	0 %	25 %	331746823
68	NC_015471	GCAT	2	8	32106	32113	25 %	25 %	25 %	25 %	331746823
69	NC_015471	TAAA	2	8	32136	32143	75 %	25 %	0 %	0 %	331746823
70	NC_015471	CCCT	2	8	32154	32161	0 %	25 %	0 %	75 %	331746823
71	NC_015471	TCCT	2	8	32966	32973	0 %	50 %	0 %	50 %	331746823
72	NC_015471	AAAG	2	8	33458	33465	75 %	0 %	25 %	0 %	331746824
73	NC_015471	TGGT	2	8	33609	33616	0 %	50 %	50 %	0 %	331746825
74	NC_015471	CAGG	2	8	33744	33751	25 %	0 %	50 %	25 %	331746825
75	NC_015471	CTGC	2	8	34091	34098	0 %	25 %	25 %	50 %	331746825
76	NC_015471	AAGA	2	8	34171	34178	75 %	0 %	25 %	0 %	331746825
77	NC_015471	CACC	2	8	35270	35277	25 %	0 %	0 %	75 %	331746826
78	NC_015471	CTTC	2	8	35550	35557	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
79	NC_015471	TGAG	2	8	36127	36134	25 %	25 %	50 %	0 %	331746826
80	NC_015471	TGGT	2	8	36281	36288	0 %	50 %	50 %	0 %	331746826
81	NC_015471	TTTG	2	8	36455	36462	0 %	75 %	25 %	0 %	331746826
82	NC_015471	TTCA	2	8	36697	36704	25 %	50 %	0 %	25 %	331746827
83	NC_015471	TTTG	2	8	37919	37926	0 %	75 %	25 %	0 %	331746828
84	NC_015471	TAGA	2	8	39903	39910	50 %	25 %	25 %	0 %	331746830
85	NC_015471	TAAT	2	8	40131	40138	50 %	50 %	0 %	0 %	331746831
86	NC_015471	CTAC	2	8	40177	40184	25 %	25 %	0 %	50 %	331746831
87	NC_015471	CGGA	2	8	41022	41029	25 %	0 %	50 %	25 %	331746831
88	NC_015471	ACAT	2	8	41485	41492	50 %	25 %	0 %	25 %	331746832
89	NC_015471	TTGT	2	8	41915	41922	0 %	75 %	25 %	0 %	331746832
90	NC_015471	GGTA	2	8	42129	42136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015471	TAAT	2	8	42165	42172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015471	TGTT	2	8	42247	42254	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015471	AAGG	2	8	42291	42298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015471	TTTA	2	8	42344	42351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015471	AATT	2	8	42458	42465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015471	TGCT	2	8	42963	42970	0 %	50 %	25 %	25 %	331746833
97	NC_015471	TTGC	2	8	42979	42986	0 %	50 %	25 %	25 %	331746833
98	NC_015471	AACC	2	8	43329	43336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015471	TTTG	2	8	43914	43921	0 %	75 %	25 %	0 %	331746834
100	NC_015471	CTGT	2	8	44012	44019	0 %	50 %	25 %	25 %	331746834
101	NC_015471	TAAA	2	8	44435	44442	75 %	25 %	0 %	0 %	331746834
102	NC_015471	TGTT	2	8	44510	44517	0 %	75 %	25 %	0 %	331746834
103	NC_015471	ATAA	2	8	44594	44601	75 %	25 %	0 %	0 %	331746834
104	NC_015471	AATA	2	8	45126	45133	75 %	25 %	0 %	0 %	331746834
105	NC_015471	ATAA	2	8	45508	45515	75 %	25 %	0 %	0 %	331746834
106	NC_015471	GATC	2	8	45740	45747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015471	CCTC	2	8	46216	46223	0 %	25 %	0 %	75 %	331746835
108	NC_015471	AAGA	2	8	46316	46323	75 %	0 %	25 %	0 %	331746835
109	NC_015471	TGCC	2	8	46693	46700	0 %	25 %	25 %	50 %	331746835
110	NC_015471	TGAT	2	8	46773	46780	25 %	50 %	25 %	0 %	331746835
111	NC_015471	TCGC	2	8	47317	47324	0 %	25 %	25 %	50 %	331746836
112	NC_015471	CAGA	2	8	47866	47873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015471	GAAT	2	8	48218	48225	50 %	25 %	25 %	0 %	331746838
114	NC_015471	TAAC	2	8	49360	49367	50 %	25 %	0 %	25 %	331746840
115	NC_015471	TAGT	2	8	49529	49536	25 %	50 %	25 %	0 %	331746841
116	NC_015471	AATT	2	8	49632	49639	50 %	50 %	0 %	0 %	331746841
117	NC_015471	ATAC	2	8	49957	49964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015471	GAAG	2	8	50325	50332	50 %	0 %	50 %	0 %	331746842
119	NC_015471	CAAA	2	8	50587	50594	75 %	0 %	0 %	25 %	331746842
120	NC_015471	GCTC	2	8	50784	50791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015471	AAGA	2	8	51488	51495	75 %	0 %	25 %	0 %	331746843
122	NC_015471	TGAT	2	8	51937	51944	25 %	50 %	25 %	0 %	331746845
123	NC_015471	ATTT	2	8	52131	52138	25 %	75 %	0 %	0 %	331746845
124	NC_015471	CAAT	2	8	52565	52572	50 %	25 %	0 %	25 %	331746846
125	NC_015471	CTTC	2	8	52657	52664	0 %	50 %	0 %	50 %	331746846
126	NC_015471	CATG	2	8	52747	52754	25 %	25 %	25 %	25 %	331746846
127	NC_015471	TGAA	2	8	52851	52858	50 %	25 %	25 %	0 %	331746846
128	NC_015471	CTTT	2	8	53235	53242	0 %	75 %	0 %	25 %	331746847
129	NC_015471	CTAA	2	8	53258	53265	50 %	25 %	0 %	25 %	331746847
130	NC_015471	CTTT	2	8	53480	53487	0 %	75 %	0 %	25 %	331746847
131	NC_015471	TTTG	2	8	54134	54141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.