MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TCT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746791
2	NC_015471	ATT	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746791
3	NC_015471	TCT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746791
4	NC_015471	ACG	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746791
5	NC_015471	AGA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746791
6	NC_015471	CAA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746791
7	NC_015471	TCA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746791
8	NC_015471	TCT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
9	NC_015471	TCG	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
10	NC_015471	TTA	2	6	910	915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
11	NC_015471	GTA	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
12	NC_015471	AGT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
13	NC_015471	ATC	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746792
14	NC_015471	CAG	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746792
15	NC_015471	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
16	NC_015471	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
17	NC_015471	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
18	NC_015471	TCT	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
19	NC_015471	AGT	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
20	NC_015471	TTG	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
21	NC_015471	CAA	2	6	1430	1435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
22	NC_015471	TTG	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
23	NC_015471	CAT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746792
24	NC_015471	TAT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
25	NC_015471	AAG	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746792
26	NC_015471	CCA	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746792
27	NC_015471	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
28	NC_015471	TAT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
29	NC_015471	ATA	2	6	2078	2083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
30	NC_015471	TGG	2	6	2094	2099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331746792
31	NC_015471	TAT	3	9	2106	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
32	NC_015471	CTT	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
33	NC_015471	TCG	2	6	2182	2187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
34	NC_015471	TCT	2	6	2201	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
35	NC_015471	TAA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
36	NC_015471	CTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
37	NC_015471	GTT	2	6	2328	2333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
38	NC_015471	GAG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746792
39	NC_015471	TTC	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
40	NC_015471	CTT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
41	NC_015471	GAG	2	6	2775	2780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746792
42	NC_015471	CAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
43	NC_015471	CTT	2	6	2969	2974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
44	NC_015471	CTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
45	NC_015471	ACA	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
46	NC_015471	CTT	2	6	3029	3034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
47	NC_015471	TAG	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
48	NC_015471	TTA	2	6	3086	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
49	NC_015471	TTC	2	6	3132	3137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
50	NC_015471	TGA	2	6	3182	3187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
51	NC_015471	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
52	NC_015471	ACC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746792
53	NC_015471	TCT	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
54	NC_015471	GAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746792
55	NC_015471	GTA	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
56	NC_015471	AAC	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
57	NC_015471	TCT	3	9	3502	3510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
58	NC_015471	GTT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
59	NC_015471	GTC	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
60	NC_015471	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
61	NC_015471	TAT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
62	NC_015471	TAT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
63	NC_015471	ATA	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
64	NC_015471	AAG	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746792
65	NC_015471	TCT	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
66	NC_015471	CAC	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746792
67	NC_015471	GTT	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
68	NC_015471	CTA	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746792
69	NC_015471	TGC	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
70	NC_015471	TCT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
71	NC_015471	TCA	2	6	4368	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015471	CCT	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015471	AGC	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015471	TGT	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015471	ATA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015471	ATT	2	6	4747	4752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015471	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015471	TAA	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015471	CCT	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015471	AAC	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746793
81	NC_015471	TCT	2	6	5273	5278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
82	NC_015471	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
83	NC_015471	CAT	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
84	NC_015471	CTT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
85	NC_015471	AAG	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
86	NC_015471	TCA	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
87	NC_015471	AAG	3	9	5700	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
88	NC_015471	GTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746793
89	NC_015471	AAT	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746793
90	NC_015471	GAG	2	6	5931	5936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746793
91	NC_015471	CTC	2	6	5961	5966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746793
92	NC_015471	CTT	2	6	6030	6035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
93	NC_015471	GAA	2	6	6076	6081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
94	NC_015471	TCA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
95	NC_015471	TCA	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
96	NC_015471	GAA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
97	NC_015471	TGG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331746793
98	NC_015471	TTC	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
99	NC_015471	TCC	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746793
100	NC_015471	GAA	2	6	6646	6651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746794
101	NC_015471	GTT	2	6	6658	6663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746794
102	NC_015471	ATT	2	6	6673	6678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746794
103	NC_015471	ATC	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746794
104	NC_015471	ATT	2	6	6818	6823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746795
105	NC_015471	TGT	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746795
106	NC_015471	ACC	2	6	6981	6986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746795
107	NC_015471	GCA	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746795
108	NC_015471	AGC	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746795
109	NC_015471	GTC	2	6	7282	7287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746795
110	NC_015471	ATG	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746795
111	NC_015471	ATT	2	6	7429	7434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746795
112	NC_015471	TTC	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746795
113	NC_015471	TAA	2	6	7560	7565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746795
114	NC_015471	GGA	2	6	7799	7804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746795
115	NC_015471	GCA	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746795
116	NC_015471	TTC	2	6	7867	7872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746795
117	NC_015471	AGT	3	9	7948	7956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746795
118	NC_015471	AAG	2	6	8116	8121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015471	TTA	2	6	8168	8173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015471	ATT	2	6	8175	8180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015471	TAA	2	6	8190	8195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015471	ATT	2	6	8240	8245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015471	ATC	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746796
124	NC_015471	TCT	2	6	8599	8604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
125	NC_015471	CTT	2	6	8642	8647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
126	NC_015471	AGG	2	6	8652	8657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746796
127	NC_015471	ATA	2	6	8735	8740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746796
128	NC_015471	TCT	2	6	8748	8753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
129	NC_015471	TTC	3	9	8981	8989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
130	NC_015471	GAG	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746796
131	NC_015471	TGG	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331746796
132	NC_015471	ATT	2	6	9108	9113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746796
133	NC_015471	AGA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746796
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135	NC_015471	CTT	2	6	9403	9408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
136	NC_015471	ATC	2	6	9482	9487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_015471	TTC	2	6	18966	18971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746810
261	NC_015471	ATC	2	6	18980	18985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746810
262	NC_015471	CTC	2	6	19013	19018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746810
263	NC_015471	ATG	2	6	19041	19046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746810
264	NC_015471	TCT	2	6	19047	19052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746810
265	NC_015471	CTT	2	6	19054	19059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746810
266	NC_015471	TGT	3	9	19104	19112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746810
267	NC_015471	AGG	2	6	19125	19130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746810
268	NC_015471	TAA	2	6	19150	19155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746810
269	NC_015471	GAA	2	6	19396	19401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746810
270	NC_015471	CAT	2	6	19483	19488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746810
271	NC_015471	ATA	3	9	19562	19570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746810
272	NC_015471	CCA	2	6	19598	19603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746810
273	NC_015471	CAA	2	6	19814	19819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746810
274	NC_015471	TTG	2	6	19842	19847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746810
275	NC_015471	TCA	2	6	19872	19877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746810
276	NC_015471	TCC	2	6	20050	20055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746810
277	NC_015471	TCA	2	6	20066	20071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_015471	AAT	2	6	20132	20137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746811
279	NC_015471	CAC	2	6	20233	20238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746811
280	NC_015471	CAA	2	6	20364	20369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746811
281	NC_015471	TTC	2	6	20409	20414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746811
282	NC_015471	TAA	2	6	20474	20479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746811
283	NC_015471	CAA	2	6	20544	20549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746811
284	NC_015471	TCC	2	6	20588	20593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746811
285	NC_015471	GAA	2	6	20602	20607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746811
286	NC_015471	AAG	2	6	20734	20739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746811
287	NC_015471	CAT	2	6	20778	20783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746811
288	NC_015471	GCA	2	6	20891	20896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746811
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291	NC_015471	TTC	2	6	21133	21138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746811
292	NC_015471	CAA	2	6	21144	21149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746811
293	NC_015471	TTC	2	6	21175	21180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746811
294	NC_015471	TTC	2	6	21256	21261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746811
295	NC_015471	TAT	2	6	21643	21648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746811
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301	NC_015471	TTC	2	6	22062	22067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
302	NC_015471	AGT	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746812
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315	NC_015471	ATT	2	6	22848	22853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746812
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352	NC_015471	CAG	2	6	25024	25029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746816
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361	NC_015471	ACT	2	6	25625	25630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746817
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372	NC_015471	ATG	2	6	26486	26491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746817
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378	NC_015471	TTC	2	6	27140	27145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746818
379	NC_015471	GGA	2	6	27161	27166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746818
380	NC_015471	CAA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746818
381	NC_015471	TTA	2	6	27610	27615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746818
382	NC_015471	TGA	2	6	27640	27645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746818
383	NC_015471	TCT	2	6	27786	27791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746818
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385	NC_015471	GAT	2	6	27818	27823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746818
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