MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 34640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015315	GGC	2	6	23	28	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015315	CCG	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015315	CGC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015315	GAC	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309923
5	NC_015315	ACG	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309923
6	NC_015315	CGG	2	6	224	229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309923
7	NC_015315	GAG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309923
8	NC_015315	CGG	2	6	301	306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309923
9	NC_015315	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015315	CAG	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015315	CGG	2	6	467	472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015315	GGC	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015315	GCG	2	6	572	577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015315	TGG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309924
15	NC_015315	GAG	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
16	NC_015315	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309924
17	NC_015315	AGG	2	6	834	839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
18	NC_015315	AGG	3	9	921	929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
19	NC_015315	CGA	2	6	952	957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309924
20	NC_015315	GAG	2	6	961	966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
21	NC_015315	GTC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309924
22	NC_015315	AGA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309924
23	NC_015315	AGG	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
24	NC_015315	AAC	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309924
25	NC_015315	CGC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309925
26	NC_015315	CGT	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309925
27	NC_015315	CCG	2	6	1376	1381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015315	GCC	2	6	1387	1392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015315	CGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015315	CGA	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015315	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015315	CGC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015315	TCG	2	6	1494	1499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
34	NC_015315	CTC	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
35	NC_015315	GTC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
36	NC_015315	GAA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309926
37	NC_015315	CCT	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
38	NC_015315	GAC	3	9	1795	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309926
39	NC_015315	CGC	2	6	1834	1839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
40	NC_015315	AGA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309926
41	NC_015315	GGC	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309926
42	NC_015315	TCC	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
43	NC_015315	CGC	3	9	1954	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
44	NC_015315	TCG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
45	NC_015315	GCC	2	6	1988	1993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
46	NC_015315	GGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
47	NC_015315	GTC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309927
48	NC_015315	CCT	3	9	2331	2339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
49	NC_015315	ATC	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309927
50	NC_015315	CCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
51	NC_015315	GAC	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
52	NC_015315	TAG	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309927
53	NC_015315	CCA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
54	NC_015315	CGA	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
55	NC_015315	TCG	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309927
56	NC_015315	GTG	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309927
57	NC_015315	CCA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
58	NC_015315	CCA	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
59	NC_015315	CCT	3	9	2852	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
60	NC_015315	CGG	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
61	NC_015315	GCC	2	6	2936	2941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309927
62	NC_015315	AAG	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309927
63	NC_015315	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
64	NC_015315	CGG	2	6	2997	3002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
65	NC_015315	CAC	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
66	NC_015315	ACG	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
67	NC_015315	CGC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309927
68	NC_015315	CCG	2	6	3410	3415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015315	GAC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015315	GTT	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309928
71	NC_015315	GCG	2	6	3665	3670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309928
72	NC_015315	GAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309928
73	NC_015315	CCG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309928
74	NC_015315	AGA	2	6	3814	3819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309929
75	NC_015315	AGA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309929
76	NC_015315	ACC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
77	NC_015315	ACA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
78	NC_015315	TGT	2	6	4159	4164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309929
79	NC_015315	GCC	2	6	4262	4267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309929
80	NC_015315	TGA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309929
81	NC_015315	CAT	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
82	NC_015315	ACC	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
83	NC_015315	CTA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
84	NC_015315	CCA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
85	NC_015315	ACA	2	6	4614	4619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
86	NC_015315	ATC	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
87	NC_015315	CTC	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309929
88	NC_015315	CTC	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309929
89	NC_015315	ACT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
90	NC_015315	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309929
91	NC_015315	GCC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309929
92	NC_015315	ACC	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
93	NC_015315	ACA	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
94	NC_015315	CTA	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015315	CGC	2	6	5138	5143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015315	GCG	2	6	5260	5265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015315	GAA	3	9	5319	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015315	GGA	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015315	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015315	CAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015315	CCG	2	6	5810	5815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015315	TGG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015315	CGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015315	CTG	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015315	TAT	2	6	5968	5973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015315	GAG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015315	GGC	2	6	6025	6030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015315	TCG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015315	TGG	2	6	6058	6063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015315	CTT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015315	TCG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015315	GGC	3	9	6154	6162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015315	GCG	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015315	GCG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015315	ATG	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015315	TGG	2	6	6381	6386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015315	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015315	AGC	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015315	CAC	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015315	TTA	2	6	6550	6555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015315	AAG	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015315	CTT	2	6	6716	6721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309930
123	NC_015315	TCT	2	6	6734	6739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309930
124	NC_015315	AAT	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309930
125	NC_015315	TTA	2	6	6984	6989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309930
126	NC_015315	ACA	2	6	7313	7318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309930
127	NC_015315	TTG	2	6	7362	7367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309930
128	NC_015315	CAT	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309930
129	NC_015315	GAA	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309930
130	NC_015315	ATC	2	6	7577	7582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309930
131	NC_015315	TAT	2	6	7586	7591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309930
132	NC_015315	CCT	2	6	7603	7608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309930
133	NC_015315	TGT	2	6	7648	7653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309930
134	NC_015315	GTT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015315	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015315	CGC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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