MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014964	A	6	6	41690	41695	100 %	0 %	0 %	0 %	320114901
1002	NC_014964	AAG	2	6	41698	41703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114901
1003	NC_014964	T	6	6	41712	41717	0 %	100 %	0 %	0 %	320114901
1004	NC_014964	GAT	2	6	41793	41798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114901
1005	NC_014964	A	6	6	41819	41824	100 %	0 %	0 %	0 %	320114901
1006	NC_014964	A	7	7	41875	41881	100 %	0 %	0 %	0 %	320114901
1007	NC_014964	AAG	2	6	41890	41895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114901
1008	NC_014964	GATG	2	8	41906	41913	25 %	25 %	50 %	0 %	320114901
1009	NC_014964	T	6	6	42005	42010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014964	AGG	2	6	42030	42035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014964	GGATAT	2	12	42071	42082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114902
1012	NC_014964	GAA	2	6	42105	42110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114902
1013	NC_014964	TTCC	2	8	42120	42127	0 %	50 %	0 %	50 %	320114902
1014	NC_014964	AAC	2	6	42182	42187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114902
1015	NC_014964	AGA	2	6	42226	42231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114902
1016	NC_014964	AGG	2	6	42234	42239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114902
1017	NC_014964	AAG	2	6	42262	42267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114902
1018	NC_014964	TGA	2	6	42295	42300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114902
1019	NC_014964	AATAA	2	10	42302	42311	80 %	20 %	0 %	0 %	320114902
1020	NC_014964	ATC	2	6	42312	42317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114902
1021	NC_014964	ATG	2	6	42369	42374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114902
1022	NC_014964	CCTT	2	8	42397	42404	0 %	50 %	0 %	50 %	320114902
1023	NC_014964	CATC	2	8	42415	42422	25 %	25 %	0 %	50 %	320114902
1024	NC_014964	TTG	2	6	42465	42470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114902
1025	NC_014964	ACA	2	6	42483	42488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114902
1026	NC_014964	AAC	2	6	42625	42630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114902
1027	NC_014964	TA	3	6	42635	42640	50 %	50 %	0 %	0 %	320114902
1028	NC_014964	TGT	2	6	42646	42651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114902
1029	NC_014964	GA	3	6	42670	42675	50 %	0 %	50 %	0 %	320114902
1030	NC_014964	TGC	2	6	42721	42726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114902
1031	NC_014964	ATT	2	6	42733	42738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114902
1032	NC_014964	AGA	2	6	42744	42749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114902
1033	NC_014964	TGAA	2	8	42789	42796	50 %	25 %	25 %	0 %	320114902
1034	NC_014964	AAGC	2	8	42904	42911	50 %	0 %	25 %	25 %	320114902
1035	NC_014964	CTT	2	6	42916	42921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114902
1036	NC_014964	GGA	2	6	43054	43059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114902
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1038	NC_014964	AAAG	2	8	43087	43094	75 %	0 %	25 %	0 %	320114903
1039	NC_014964	ACT	2	6	43142	43147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114903
1040	NC_014964	GA	3	6	43176	43181	50 %	0 %	50 %	0 %	320114903
1041	NC_014964	CAT	2	6	43191	43196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114903
1042	NC_014964	AGG	2	6	43251	43256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114903
1043	NC_014964	GAT	2	6	43265	43270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114904
1044	NC_014964	GAAA	2	8	43301	43308	75 %	0 %	25 %	0 %	320114904
1045	NC_014964	TTA	2	6	43420	43425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114904
1046	NC_014964	AAAC	2	8	43427	43434	75 %	0 %	0 %	25 %	320114904
1047	NC_014964	AGA	2	6	43490	43495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114904
1048	NC_014964	GAT	2	6	43506	43511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114904
1049	NC_014964	AGA	2	6	43517	43522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114904
1050	NC_014964	TCTTTT	2	12	43536	43547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1051	NC_014964	T	6	6	43544	43549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014964	TAA	2	6	43568	43573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014964	AAGCA	2	10	43607	43616	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_014964	TTATTT	2	12	43622	43633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014964	A	6	6	43682	43687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014964	CCT	2	6	43773	43778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_014964	AGA	2	6	43865	43870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114905
1058	NC_014964	GAG	2	6	43881	43886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114905
1059	NC_014964	CTT	2	6	43887	43892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114905
1060	NC_014964	ACC	2	6	44024	44029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114905
1061	NC_014964	GAT	2	6	44073	44078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114905
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1063	NC_014964	GAA	2	6	44149	44154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114906
1064	NC_014964	TGG	2	6	44186	44191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114906
1065	NC_014964	ATG	2	6	44193	44198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114906
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1067	NC_014964	A	7	7	44208	44214	100 %	0 %	0 %	0 %	320114906
1068	NC_014964	A	6	6	44224	44229	100 %	0 %	0 %	0 %	320114906
1069	NC_014964	AT	3	6	44308	44313	50 %	50 %	0 %	0 %	320114906
1070	NC_014964	TAAAA	2	10	44326	44335	80 %	20 %	0 %	0 %	320114906
1071	NC_014964	A	7	7	44332	44338	100 %	0 %	0 %	0 %	320114906
1072	NC_014964	GA	3	6	44348	44353	50 %	0 %	50 %	0 %	320114906
1073	NC_014964	AT	3	6	44356	44361	50 %	50 %	0 %	0 %	320114906
1074	NC_014964	GAA	2	6	44415	44420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114906
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1078	NC_014964	A	6	6	44498	44503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014964	TCA	2	6	44564	44569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114907
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1081	NC_014964	AGA	2	6	44639	44644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114907
1082	NC_014964	T	6	6	44671	44676	0 %	100 %	0 %	0 %	320114907
1083	NC_014964	GAA	2	6	44682	44687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114907
1084	NC_014964	TAT	2	6	44733	44738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114907
1085	NC_014964	A	7	7	44786	44792	100 %	0 %	0 %	0 %	320114907
1086	NC_014964	GAA	2	6	44805	44810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114907
1087	NC_014964	AGGA	2	8	44837	44844	50 %	0 %	50 %	0 %	320114907
1088	NC_014964	TTTGT	2	10	44932	44941	0 %	80 %	20 %	0 %	320114907
1089	NC_014964	A	6	6	44982	44987	100 %	0 %	0 %	0 %	320114907
1090	NC_014964	TAA	2	6	45002	45007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114907
1091	NC_014964	ATG	2	6	45010	45015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114907
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1093	NC_014964	CAA	2	6	45071	45076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114907
1094	NC_014964	ACC	2	6	45169	45174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_014964	GAAG	2	8	45306	45313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014964	TGA	2	6	45334	45339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014964	GATG	2	8	45368	45375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014964	AT	3	6	45435	45440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014964	CAG	2	6	45548	45553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014964	AAGG	2	8	45586	45593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014964	AGG	2	6	45604	45609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014964	CAA	2	6	45659	45664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114908
1103	NC_014964	ATC	2	6	45724	45729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114908
1104	NC_014964	AGA	2	6	45743	45748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114908
1105	NC_014964	TAG	2	6	45789	45794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114908
1106	NC_014964	AGC	2	6	45811	45816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114908
1107	NC_014964	GTT	2	6	45827	45832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114908
1108	NC_014964	GATGG	2	10	45857	45866	20 %	20 %	60 %	0 %	320114908
1109	NC_014964	ACA	2	6	45916	45921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114908
1110	NC_014964	CTG	2	6	45923	45928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114908
1111	NC_014964	GGA	2	6	45983	45988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114908
1112	NC_014964	ACT	2	6	45994	45999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114908
1113	NC_014964	ACA	2	6	46030	46035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114908
1114	NC_014964	AT	3	6	46144	46149	50 %	50 %	0 %	0 %	320114908
1115	NC_014964	ATA	2	6	46217	46222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114908
1116	NC_014964	TAA	2	6	46269	46274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114908
1117	NC_014964	AGA	2	6	46324	46329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114908
1118	NC_014964	AGG	2	6	46342	46347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114908
1119	NC_014964	AG	3	6	46407	46412	50 %	0 %	50 %	0 %	320114908
1120	NC_014964	AT	3	6	46448	46453	50 %	50 %	0 %	0 %	320114908
1121	NC_014964	TAGA	2	8	46551	46558	50 %	25 %	25 %	0 %	320114908
1122	NC_014964	GAA	2	6	46566	46571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114908
1123	NC_014964	TAAGAA	2	12	46611	46622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	320114908
1124	NC_014964	AAC	2	6	46726	46731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114908
1125	NC_014964	GAA	2	6	46834	46839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114908
1126	NC_014964	AGA	2	6	46879	46884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114908
1127	NC_014964	AAAT	2	8	46966	46973	75 %	25 %	0 %	0 %	320114908
1128	NC_014964	CCG	2	6	47040	47045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_014964	GTAC	2	8	47057	47064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_014964	GGT	2	6	47065	47070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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