MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermaerobacter marianensis DSM 12885 chromosome

Total Repeats: 3194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014831	TCCCA	2	10	275	284	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014831	CGACG	2	10	433	442	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014831	CCGTG	2	10	506	515	0 %	20 %	40 %	40 %	317120850
4	NC_014831	CCGGC	2	10	1972	1981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014831	CCCGG	2	10	2387	2396	0 %	0 %	40 %	60 %	317120851
6	NC_014831	AGGCC	2	10	4721	4730	20 %	0 %	40 %	40 %	317120853
7	NC_014831	CCCGG	2	10	5231	5240	0 %	0 %	40 %	60 %	317120853
8	NC_014831	GCGCC	2	10	5512	5521	0 %	0 %	40 %	60 %	317120853
9	NC_014831	GCCGC	2	10	5638	5647	0 %	0 %	40 %	60 %	317120853
10	NC_014831	CGGCG	2	10	8855	8864	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014831	CCCGG	2	10	8915	8924	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_014831	GCCGC	2	10	11006	11015	0 %	0 %	40 %	60 %	317120856
13	NC_014831	GCCGC	2	10	11309	11318	0 %	0 %	40 %	60 %	317120856
14	NC_014831	AGGGG	2	10	11509	11518	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014831	GGCGC	2	10	13776	13785	0 %	0 %	60 %	40 %	317120858
16	NC_014831	CGGGC	2	10	14056	14065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014831	GCCGG	2	10	15667	15676	0 %	0 %	60 %	40 %	317120860
18	NC_014831	CCGGC	2	10	18613	18622	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014831	GGCGC	2	10	21910	21919	0 %	0 %	60 %	40 %	317120871
20	NC_014831	CGCCC	2	10	22808	22817	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_014831	TGGCG	2	10	25368	25377	0 %	20 %	60 %	20 %	317120877
22	NC_014831	AGACG	2	10	25558	25567	40 %	0 %	40 %	20 %	317120878
23	NC_014831	GCCCG	2	10	26244	26253	0 %	0 %	40 %	60 %	317120878
24	NC_014831	ACCGG	2	10	30681	30690	20 %	0 %	40 %	40 %	317120885
25	NC_014831	CCGGC	2	10	32083	32092	0 %	0 %	40 %	60 %	317120886
26	NC_014831	GGCAG	2	10	33545	33554	20 %	0 %	60 %	20 %	317120887
27	NC_014831	GGCCG	2	10	34324	34333	0 %	0 %	60 %	40 %	317120887
28	NC_014831	GCTCC	2	10	35826	35835	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014831	GCCGG	2	10	36300	36309	0 %	0 %	60 %	40 %	317120889
30	NC_014831	TGCAG	2	10	36532	36541	20 %	20 %	40 %	20 %	317120889
31	NC_014831	CGACG	2	10	38090	38099	20 %	0 %	40 %	40 %	317120894
32	NC_014831	GAAGG	2	10	39103	39112	40 %	0 %	60 %	0 %	317120896
33	NC_014831	GCGAT	2	10	40025	40034	20 %	20 %	40 %	20 %	317120897
34	NC_014831	GGTTG	2	10	40344	40353	0 %	40 %	60 %	0 %	317120897
35	NC_014831	CGGCG	2	10	43661	43670	0 %	0 %	60 %	40 %	317120898
36	NC_014831	GTGGA	2	10	44412	44421	20 %	20 %	60 %	0 %	317120899
37	NC_014831	CGGAC	2	10	44924	44933	20 %	0 %	40 %	40 %	317120899
38	NC_014831	GCCCG	2	10	47809	47818	0 %	0 %	40 %	60 %	317120902
39	NC_014831	CCGGT	2	10	48273	48282	0 %	20 %	40 %	40 %	317120902
40	NC_014831	GAGGG	2	10	49958	49967	20 %	0 %	80 %	0 %	317120902
41	NC_014831	TCCCG	2	10	54976	54985	0 %	20 %	20 %	60 %	317120907
42	NC_014831	GCCCG	2	10	55012	55021	0 %	0 %	40 %	60 %	317120907
43	NC_014831	GCCGG	2	10	56913	56922	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014831	TAAAA	2	10	58738	58747	80 %	20 %	0 %	0 %	317120913
45	NC_014831	TTTGC	2	10	59375	59384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014831	AGGCC	2	10	59554	59563	20 %	0 %	40 %	40 %	317120915
47	NC_014831	GCGAG	2	10	62196	62205	20 %	0 %	60 %	20 %	317120916
48	NC_014831	GCCCG	2	10	66001	66010	0 %	0 %	40 %	60 %	317120920
49	NC_014831	GCCCG	2	10	66209	66218	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_014831	GTCCG	2	10	66293	66302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014831	GCCGG	2	10	66723	66732	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014831	GGGGA	2	10	67598	67607	20 %	0 %	80 %	0 %	317120921
53	NC_014831	CGGGC	2	10	67748	67757	0 %	0 %	60 %	40 %	317120921
54	NC_014831	GGCCG	2	10	70478	70487	0 %	0 %	60 %	40 %	317120924
55	NC_014831	TGGCG	2	10	70984	70993	0 %	20 %	60 %	20 %	317120925
56	NC_014831	CGTGC	2	10	71467	71476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014831	CCGCG	2	10	71903	71912	0 %	0 %	40 %	60 %	317120926
58	NC_014831	CTGGG	2	10	72231	72240	0 %	20 %	60 %	20 %	317120926
59	NC_014831	CGGGG	2	10	73077	73086	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014831	GCCTG	2	10	74649	74658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014831	TCGTG	2	10	74987	74996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014831	GGGAA	2	10	76137	76146	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014831	GGGAG	2	10	76535	76544	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014831	GACGC	2	10	77565	77574	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014831	GCGAG	2	10	77673	77682	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014831	AGGGG	2	10	77903	77912	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014831	CCGAA	2	10	77934	77943	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014831	GCGCG	2	10	79523	79532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014831	CTGGG	2	10	80042	80051	0 %	20 %	60 %	20 %	317120927
70	NC_014831	GGGAT	2	10	80899	80908	20 %	20 %	60 %	0 %	317120929
71	NC_014831	GCTGG	2	10	81527	81536	0 %	20 %	60 %	20 %	317120929
72	NC_014831	GCGCC	2	10	83580	83589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_014831	CCGGC	2	10	84756	84765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014831	TGGCG	2	10	85974	85983	0 %	20 %	60 %	20 %	317120932
75	NC_014831	GCGCC	2	10	89385	89394	0 %	0 %	40 %	60 %	317120936
76	NC_014831	TCCGA	2	10	90334	90343	20 %	20 %	20 %	40 %	317120938
77	NC_014831	CCTGG	2	10	90425	90434	0 %	20 %	40 %	40 %	317120938
78	NC_014831	CGGGG	2	10	90512	90521	0 %	0 %	80 %	20 %	317120938
79	NC_014831	GGCCG	2	10	90860	90869	0 %	0 %	60 %	40 %	317120938
80	NC_014831	GGCGG	2	10	91293	91302	0 %	0 %	80 %	20 %	317120939
81	NC_014831	GACGG	2	10	92816	92825	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014831	GCCGG	2	10	94435	94444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014831	CGGTC	2	10	95296	95305	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014831	CCGGC	2	10	99558	99567	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014831	TCGCC	2	10	102492	102501	0 %	20 %	20 %	60 %	317120949
86	NC_014831	CCCGG	2	10	104159	104168	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_014831	GCCCG	2	10	104587	104596	0 %	0 %	40 %	60 %	317120950
88	NC_014831	CAGCG	2	10	105424	105433	20 %	0 %	40 %	40 %	317120951
89	NC_014831	GAGGG	2	10	105976	105985	20 %	0 %	80 %	0 %	317120951
90	NC_014831	GCCGC	2	10	107459	107468	0 %	0 %	40 %	60 %	317120954
91	NC_014831	CGCGG	2	10	109233	109242	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014831	GGGCC	2	10	110051	110060	0 %	0 %	60 %	40 %	317120958
93	NC_014831	GGCAC	2	10	110776	110785	20 %	0 %	40 %	40 %	317120958
94	NC_014831	GCCGC	2	10	111242	111251	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_014831	CCATG	2	10	112538	112547	20 %	20 %	20 %	40 %	317120961
96	NC_014831	CCTGG	2	10	113045	113054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014831	GGCCG	2	10	113429	113438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014831	GAACC	2	10	113449	113458	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014831	GGGGC	2	10	114317	114326	0 %	0 %	80 %	20 %	317120963
100	NC_014831	GCGTA	2	10	114368	114377	20 %	20 %	40 %	20 %	317120963
101	NC_014831	GTCGC	2	10	116087	116096	0 %	20 %	40 %	40 %	317120964
102	NC_014831	GCAGC	2	10	117636	117645	20 %	0 %	40 %	40 %	317120965
103	NC_014831	CGGGC	2	10	117858	117867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014831	CCGGC	2	10	118494	118503	0 %	0 %	40 %	60 %	317120966
105	NC_014831	CCCGG	2	10	119192	119201	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_014831	CTTTT	2	10	119317	119326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014831	CGGCG	2	10	119429	119438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014831	GCCGG	2	10	123065	123074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014831	CCAGC	2	10	123285	123294	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_014831	CCCGT	2	10	123429	123438	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_014831	CCGGC	2	10	123771	123780	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014831	GGCGC	2	10	124225	124234	0 %	0 %	60 %	40 %	317120971
113	NC_014831	GGCCC	2	10	124883	124892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014831	CGTGC	2	10	126029	126038	0 %	20 %	40 %	40 %	317120972
115	NC_014831	ACGGC	2	10	126208	126217	20 %	0 %	40 %	40 %	317120972
116	NC_014831	GGCCC	2	10	127108	127117	0 %	0 %	40 %	60 %	317120973
117	NC_014831	GGCCC	2	10	128259	128268	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_014831	CTTGC	2	10	128371	128380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014831	CGGGA	2	10	128697	128706	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014831	TGGCC	2	10	129743	129752	0 %	20 %	40 %	40 %	317120974
121	NC_014831	GCCCC	2	10	132223	132232	0 %	0 %	20 %	80 %	317120976
122	NC_014831	CCCGG	2	10	133660	133669	0 %	0 %	40 %	60 %	317120978
123	NC_014831	GCCGG	2	10	133931	133940	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014831	GTCCT	2	10	134657	134666	0 %	40 %	20 %	40 %	317120979
125	NC_014831	CCGGG	2	10	134770	134779	0 %	0 %	60 %	40 %	317120979
126	NC_014831	CGGGC	2	10	135111	135120	0 %	0 %	60 %	40 %	317120980
127	NC_014831	CGGCC	2	10	135238	135247	0 %	0 %	40 %	60 %	317120980
128	NC_014831	CGGCG	2	10	136077	136086	0 %	0 %	60 %	40 %	317120980
129	NC_014831	GCCGG	2	10	136303	136312	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014831	CTGGG	2	10	136869	136878	0 %	20 %	60 %	20 %	317120981
131	NC_014831	CTGGG	2	10	137286	137295	0 %	20 %	60 %	20 %	317120981
132	NC_014831	GCGCC	2	10	138964	138973	0 %	0 %	40 %	60 %	317120981
133	NC_014831	CCGCG	2	10	139191	139200	0 %	0 %	40 %	60 %	317120981
134	NC_014831	GCGCC	2	10	139229	139238	0 %	0 %	40 %	60 %	317120981
135	NC_014831	CCCCG	2	10	139418	139427	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
136	NC_014831	GCTAC	2	10	139535	139544	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014831	CGGCC	2	10	139803	139812	0 %	0 %	40 %	60 %	317120982
138	NC_014831	CCGCC	2	10	141330	141339	0 %	0 %	20 %	80 %	317120982
139	NC_014831	CGGCC	2	10	141625	141634	0 %	0 %	40 %	60 %	317120982
140	NC_014831	GCGCG	2	10	142773	142782	0 %	0 %	60 %	40 %	317120983
141	NC_014831	CGGCC	2	10	142921	142930	0 %	0 %	40 %	60 %	317120983
142	NC_014831	GGCGG	2	10	143409	143418	0 %	0 %	80 %	20 %	317120983
143	NC_014831	GCCCG	2	10	144783	144792	0 %	0 %	40 %	60 %	317120984
144	NC_014831	GGGCC	2	10	145866	145875	0 %	0 %	60 %	40 %	317120984
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155	NC_014831	TCCGG	2	10	155595	155604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_014831	CGACC	2	10	156136	156145	20 %	0 %	20 %	60 %	317120993
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212	NC_014831	CGTGG	2	10	209379	209388	0 %	20 %	60 %	20 %	317121034
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216	NC_014831	CGGCG	2	10	213927	213936	0 %	0 %	60 %	40 %	317121038
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222	NC_014831	GGGGA	2	10	220504	220513	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_014831	CCGGC	3	15	250928	250942	0 %	0 %	40 %	60 %	317121062
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251	NC_014831	CCCGT	2	10	253620	253629	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
252	NC_014831	GATGC	2	10	255684	255693	20 %	20 %	40 %	20 %	317121066
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254	NC_014831	GCCCA	2	10	256210	256219	20 %	0 %	20 %	60 %	317121066
255	NC_014831	CGGCG	2	10	256399	256408	0 %	0 %	60 %	40 %	317121067
256	NC_014831	GGCCG	2	10	257479	257488	0 %	0 %	60 %	40 %	317121067
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259	NC_014831	GCCGC	2	10	258692	258701	0 %	0 %	40 %	60 %	317121068
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261	NC_014831	CGCGC	2	10	264043	264052	0 %	0 %	40 %	60 %	317121073
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268	NC_014831	GGCCG	2	10	265569	265578	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
269	NC_014831	CCGGC	2	10	265642	265651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
270	NC_014831	GCCGG	2	10	266016	266025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
271	NC_014831	GTCAG	2	10	266028	266037	20 %	20 %	40 %	20 %	317121074
272	NC_014831	ACCCG	2	10	266523	266532	20 %	0 %	20 %	60 %	317121074
273	NC_014831	CCCCG	2	10	267745	267754	0 %	0 %	20 %	80 %	317121076
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497	NC_014831	GCCGG	2	10	467503	467512	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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