MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014410	T	6	6	250953	250958	0 %	100 %	0 %	0 %	304315763
6002	NC_014410	TA	3	6	251074	251079	50 %	50 %	0 %	0 %	304315763
6003	NC_014410	AT	4	8	251106	251113	50 %	50 %	0 %	0 %	304315763
6004	NC_014410	TAT	2	6	251131	251136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315763
6005	NC_014410	TCA	2	6	251147	251152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315763
6006	NC_014410	TCT	2	6	251155	251160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315763
6007	NC_014410	TGC	2	6	251167	251172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315763
6008	NC_014410	GCC	2	6	251182	251187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304315763
6009	NC_014410	CAA	2	6	251199	251204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315763
6010	NC_014410	TCC	2	6	251224	251229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_014410	TAT	3	9	251235	251243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_014410	AT	3	6	251258	251263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_014410	AAT	2	6	251277	251282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_014410	T	6	6	251296	251301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_014410	A	6	6	251342	251347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_014410	CTT	2	6	251378	251383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315764
6017	NC_014410	CAG	2	6	251401	251406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315764
6018	NC_014410	ATA	2	6	251480	251485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315764
6019	NC_014410	CCA	2	6	251487	251492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315764
6020	NC_014410	AAG	2	6	251541	251546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315764
6021	NC_014410	CAA	2	6	251575	251580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315764
6022	NC_014410	TTA	2	6	251596	251601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315764
6023	NC_014410	T	7	7	251678	251684	0 %	100 %	0 %	0 %	304315764
6024	NC_014410	AT	3	6	251708	251713	50 %	50 %	0 %	0 %	304315764
6025	NC_014410	GAT	2	6	251780	251785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315764
6026	NC_014410	TGC	2	6	251816	251821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315764
6027	NC_014410	GCA	2	6	251832	251837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315764
6028	NC_014410	ACA	2	6	251871	251876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315764
6029	NC_014410	ATT	2	6	251895	251900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315764
6030	NC_014410	TGCCA	2	10	251921	251930	20 %	20 %	20 %	40 %	304315764
6031	NC_014410	ATG	2	6	251940	251945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315764
6032	NC_014410	TTATAA	2	12	252041	252052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014410	ATCTA	2	10	252088	252097	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6034	NC_014410	T	8	8	252138	252145	0 %	100 %	0 %	0 %	304315765
6035	NC_014410	T	6	6	252222	252227	0 %	100 %	0 %	0 %	304315765
6036	NC_014410	TCT	2	6	252233	252238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315765
6037	NC_014410	GAT	2	6	252243	252248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315765
6038	NC_014410	TCT	2	6	252251	252256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315765
6039	NC_014410	TAT	2	6	252280	252285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315765
6040	NC_014410	T	6	6	252308	252313	0 %	100 %	0 %	0 %	304315765
6041	NC_014410	AAG	2	6	252350	252355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315765
6042	NC_014410	AAT	2	6	252466	252471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014410	TCC	2	6	252489	252494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_014410	CTG	2	6	252526	252531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014410	AGG	2	6	252672	252677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315766
6046	NC_014410	TA	3	6	252740	252745	50 %	50 %	0 %	0 %	304315766
6047	NC_014410	T	6	6	252792	252797	0 %	100 %	0 %	0 %	304315766
6048	NC_014410	ATT	2	6	252825	252830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315766
6049	NC_014410	CTT	2	6	252843	252848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_014410	AAT	2	6	252863	252868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014410	ATTTTA	2	12	252895	252906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014410	GAA	2	6	252960	252965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315767
6053	NC_014410	GCAA	2	8	252997	253004	50 %	0 %	25 %	25 %	304315767
6054	NC_014410	A	6	6	253006	253011	100 %	0 %	0 %	0 %	304315767
6055	NC_014410	ATT	2	6	253019	253024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315767
6056	NC_014410	TA	3	6	253090	253095	50 %	50 %	0 %	0 %	304315767
6057	NC_014410	GCG	2	6	253124	253129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315767
6058	NC_014410	T	7	7	253187	253193	0 %	100 %	0 %	0 %	304315767
6059	NC_014410	A	6	6	253230	253235	100 %	0 %	0 %	0 %	304315767
6060	NC_014410	TG	3	6	253247	253252	0 %	50 %	50 %	0 %	304315767
6061	NC_014410	TGC	2	6	253305	253310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315767
6062	NC_014410	CTA	2	6	253316	253321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315767
6063	NC_014410	GTG	2	6	253340	253345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315767
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6065	NC_014410	ATT	2	6	253393	253398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315767
6066	NC_014410	ATT	2	6	253450	253455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315767
6067	NC_014410	A	6	6	253712	253717	100 %	0 %	0 %	0 %	304315767
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6070	NC_014410	AAG	2	6	253796	253801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315767
6071	NC_014410	ATC	2	6	253893	253898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315767
6072	NC_014410	CTG	2	6	253913	253918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315767
6073	NC_014410	ATGG	2	8	253945	253952	25 %	25 %	50 %	0 %	304315767
6074	NC_014410	TTA	2	6	253955	253960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315767
6075	NC_014410	ATTT	2	8	253975	253982	25 %	75 %	0 %	0 %	304315767
6076	NC_014410	TAA	2	6	254111	254116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315767
6077	NC_014410	A	6	6	254122	254127	100 %	0 %	0 %	0 %	304315767
6078	NC_014410	CAAA	2	8	254147	254154	75 %	0 %	0 %	25 %	304315767
6079	NC_014410	GTGGG	2	10	254170	254179	0 %	20 %	80 %	0 %	304315767
6080	NC_014410	TCATT	2	10	254195	254204	20 %	60 %	0 %	20 %	304315767
6081	NC_014410	TGTAA	2	10	254238	254247	40 %	40 %	20 %	0 %	304315767
6082	NC_014410	GAA	3	9	254250	254258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014410	GTT	2	6	254306	254311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014410	AGG	2	6	254321	254326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014410	AT	4	8	254452	254459	50 %	50 %	0 %	0 %	304315768
6086	NC_014410	TTGC	2	8	254581	254588	0 %	50 %	25 %	25 %	304315768
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6088	NC_014410	ATTA	2	8	254735	254742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014410	ATA	2	6	254748	254753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014410	TA	3	6	254790	254795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014410	TAT	2	6	254821	254826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014410	AAT	2	6	254827	254832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014410	AT	3	6	254858	254863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014410	ATG	2	6	254868	254873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014410	A	6	6	254916	254921	100 %	0 %	0 %	0 %	304315769
6096	NC_014410	AT	3	6	254953	254958	50 %	50 %	0 %	0 %	304315769
6097	NC_014410	GAT	2	6	254969	254974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315769
6098	NC_014410	AT	3	6	255018	255023	50 %	50 %	0 %	0 %	304315769
6099	NC_014410	TTA	2	6	255048	255053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315769
6100	NC_014410	GCTG	2	8	255058	255065	0 %	25 %	50 %	25 %	304315769
6101	NC_014410	A	7	7	255070	255076	100 %	0 %	0 %	0 %	304315769
6102	NC_014410	A	7	7	255116	255122	100 %	0 %	0 %	0 %	304315769
6103	NC_014410	ATT	2	6	255137	255142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315769
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6105	NC_014410	TTG	2	6	255186	255191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315769
6106	NC_014410	GGC	2	6	255203	255208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315769
6107	NC_014410	A	6	6	255278	255283	100 %	0 %	0 %	0 %	304315769
6108	NC_014410	TATAG	2	10	255290	255299	40 %	40 %	20 %	0 %	304315769
6109	NC_014410	ATG	2	6	255339	255344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315769
6110	NC_014410	AGC	2	6	255367	255372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315769
6111	NC_014410	AGA	2	6	255436	255441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315769
6112	NC_014410	AGAT	2	8	255544	255551	50 %	25 %	25 %	0 %	304315769
6113	NC_014410	GGA	2	6	255552	255557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315769
6114	NC_014410	TA	3	6	255558	255563	50 %	50 %	0 %	0 %	304315769
6115	NC_014410	AGA	2	6	255568	255573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315769
6116	NC_014410	AGG	2	6	255595	255600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315769
6117	NC_014410	CTG	2	6	255603	255608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315769
6118	NC_014410	GA	3	6	255664	255669	50 %	0 %	50 %	0 %	304315769
6119	NC_014410	ATG	2	6	255704	255709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315769
6120	NC_014410	ATG	2	6	255726	255731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315769
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6122	NC_014410	CTA	2	6	255768	255773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315769
6123	NC_014410	TCA	2	6	255777	255782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315769
6124	NC_014410	GTC	2	6	255808	255813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315769
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6126	NC_014410	CTT	2	6	256037	256042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315769
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6236	NC_014410	TTTA	2	8	260251	260258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6237	NC_014410	TAA	2	6	260265	260270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6238	NC_014410	TAAGT	2	10	260275	260284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6240	NC_014410	GT	3	6	260307	260312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_014410	T	7	7	260322	260328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_014410	TCAAT	2	10	260332	260341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6243	NC_014410	TATAA	2	10	260344	260353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_014410	AAT	2	6	260359	260364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_014410	ATA	2	6	260583	260588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315773
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