MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 4564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014377	CTTT	2	8	71	78	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014377	AATA	2	8	711	718	75 %	25 %	0 %	0 %	302388600
3	NC_014377	ATAC	2	8	2341	2348	50 %	25 %	0 %	25 %	302388601
4	NC_014377	AGGG	2	8	2518	2525	25 %	0 %	75 %	0 %	302388601
5	NC_014377	ATCC	2	8	3741	3748	25 %	25 %	0 %	50 %	302388603
6	NC_014377	TGAG	2	8	6961	6968	25 %	25 %	50 %	0 %	302388607
7	NC_014377	TACC	2	8	8011	8018	25 %	25 %	0 %	50 %	302388607
8	NC_014377	ACAT	2	8	8331	8338	50 %	25 %	0 %	25 %	302388607
9	NC_014377	CCGC	2	8	8851	8858	0 %	0 %	25 %	75 %	302388607
10	NC_014377	GATG	2	8	8903	8910	25 %	25 %	50 %	0 %	302388607
11	NC_014377	CGGA	2	8	9432	9439	25 %	0 %	50 %	25 %	302388608
12	NC_014377	TTTA	2	8	9492	9499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014377	AATT	2	8	9593	9600	50 %	50 %	0 %	0 %	302388609
14	NC_014377	CCCG	2	8	10708	10715	0 %	0 %	25 %	75 %	302388609
15	NC_014377	AAGG	2	8	11152	11159	50 %	0 %	50 %	0 %	302388610
16	NC_014377	GAAG	2	8	11174	11181	50 %	0 %	50 %	0 %	302388610
17	NC_014377	GGCG	2	8	11608	11615	0 %	0 %	75 %	25 %	302388610
18	NC_014377	CCGA	2	8	11846	11853	25 %	0 %	25 %	50 %	302388611
19	NC_014377	AGGG	2	8	12549	12556	25 %	0 %	75 %	0 %	302388613
20	NC_014377	CAGC	2	8	12748	12755	25 %	0 %	25 %	50 %	302388613
21	NC_014377	GGCG	2	8	12986	12993	0 %	0 %	75 %	25 %	302388613
22	NC_014377	CTGG	2	8	14510	14517	0 %	25 %	50 %	25 %	302388615
23	NC_014377	GAAG	2	8	15714	15721	50 %	0 %	50 %	0 %	302388616
24	NC_014377	GGCT	2	8	16122	16129	0 %	25 %	50 %	25 %	302388617
25	NC_014377	CCGC	2	8	16293	16300	0 %	0 %	25 %	75 %	302388617
26	NC_014377	GCGG	2	8	16757	16764	0 %	0 %	75 %	25 %	302388617
27	NC_014377	AAGG	2	8	17781	17788	50 %	0 %	50 %	0 %	302388618
28	NC_014377	CTCC	2	8	18315	18322	0 %	25 %	0 %	75 %	302388619
29	NC_014377	AAAT	2	8	19295	19302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014377	CTCC	2	8	19675	19682	0 %	25 %	0 %	75 %	302388621
31	NC_014377	TTTA	2	8	19751	19758	25 %	75 %	0 %	0 %	302388621
32	NC_014377	AAGA	2	8	20236	20243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014377	CTTT	2	8	20304	20311	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014377	TTGC	2	8	20368	20375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014377	AAAG	2	8	20380	20387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014377	TTAT	2	8	20887	20894	25 %	75 %	0 %	0 %	302388622
37	NC_014377	TCGA	2	8	21009	21016	25 %	25 %	25 %	25 %	302388622
38	NC_014377	TGGA	2	8	21849	21856	25 %	25 %	50 %	0 %	302388623
39	NC_014377	GAAG	2	8	24760	24767	50 %	0 %	50 %	0 %	302388626
40	NC_014377	GGGA	2	8	25833	25840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014377	ACTC	2	8	27726	27733	25 %	25 %	0 %	50 %	302388627
42	NC_014377	AAAG	2	8	29450	29457	75 %	0 %	25 %	0 %	302388630
43	NC_014377	AGGA	2	8	30228	30235	50 %	0 %	50 %	0 %	302388631
44	NC_014377	GGGT	2	8	30589	30596	0 %	25 %	75 %	0 %	302388631
45	NC_014377	TTCT	2	8	30761	30768	0 %	75 %	0 %	25 %	302388632
46	NC_014377	AATA	2	8	31086	31093	75 %	25 %	0 %	0 %	302388632
47	NC_014377	GAAG	2	8	33721	33728	50 %	0 %	50 %	0 %	302388634
48	NC_014377	AGAA	2	8	34277	34284	75 %	0 %	25 %	0 %	302388635
49	NC_014377	CCTG	2	8	34350	34357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014377	GAAA	2	8	34436	34443	75 %	0 %	25 %	0 %	302388636
51	NC_014377	TTTG	2	8	35329	35336	0 %	75 %	25 %	0 %	302388636
52	NC_014377	CGGC	2	8	35666	35673	0 %	0 %	50 %	50 %	302388637
53	NC_014377	GCCG	2	8	36607	36614	0 %	0 %	50 %	50 %	302388638
54	NC_014377	GTCC	2	8	37961	37968	0 %	25 %	25 %	50 %	302388639
55	NC_014377	TGTA	2	8	38180	38187	25 %	50 %	25 %	0 %	302388639
56	NC_014377	GAGG	2	8	39601	39608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014377	AATG	2	8	39611	39618	50 %	25 %	25 %	0 %	302388641
58	NC_014377	CGGG	2	8	39903	39910	0 %	0 %	75 %	25 %	302388641
59	NC_014377	GCTG	2	8	41676	41683	0 %	25 %	50 %	25 %	302388641
60	NC_014377	AGCC	2	8	41901	41908	25 %	0 %	25 %	50 %	302388641
61	NC_014377	GGCG	2	8	42622	42629	0 %	0 %	75 %	25 %	302388642
62	NC_014377	GAAC	2	8	42664	42671	50 %	0 %	25 %	25 %	302388642
63	NC_014377	GAAG	2	8	42691	42698	50 %	0 %	50 %	0 %	302388642
64	NC_014377	GAGG	2	8	43261	43268	25 %	0 %	75 %	0 %	302388643
65	NC_014377	GCTG	2	8	43801	43808	0 %	25 %	50 %	25 %	302388643
66	NC_014377	GGAA	2	8	46515	46522	50 %	0 %	50 %	0 %	302388647
67	NC_014377	CATC	2	8	47836	47843	25 %	25 %	0 %	50 %	302388648
68	NC_014377	GATA	2	8	47942	47949	50 %	25 %	25 %	0 %	302388648
69	NC_014377	ACCC	2	8	48021	48028	25 %	0 %	0 %	75 %	302388648
70	NC_014377	TGAT	2	8	48212	48219	25 %	50 %	25 %	0 %	302388648
71	NC_014377	GAAC	2	8	48338	48345	50 %	0 %	25 %	25 %	302388649
72	NC_014377	AAAT	2	8	49581	49588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014377	GAGG	2	8	49717	49724	25 %	0 %	75 %	0 %	302388651
74	NC_014377	CCCG	2	8	50436	50443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_014377	CTTC	2	8	50712	50719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014377	CTGG	2	8	50763	50770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014377	GGGC	2	8	50933	50940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014377	TCCT	2	8	51046	51053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014377	CGGC	2	8	51166	51173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014377	GACC	2	8	51566	51573	25 %	0 %	25 %	50 %	302388652
81	NC_014377	CCGG	2	8	52079	52086	0 %	0 %	50 %	50 %	302388652
82	NC_014377	GATG	2	8	52275	52282	25 %	25 %	50 %	0 %	302388652
83	NC_014377	AGCC	2	8	52577	52584	25 %	0 %	25 %	50 %	302388652
84	NC_014377	AAAG	2	8	52639	52646	75 %	0 %	25 %	0 %	302388652
85	NC_014377	CCGG	2	8	53084	53091	0 %	0 %	50 %	50 %	302388652
86	NC_014377	ATGG	2	8	53386	53393	25 %	25 %	50 %	0 %	302388652
87	NC_014377	GGCG	2	8	53508	53515	0 %	0 %	75 %	25 %	302388652
88	NC_014377	TAAA	2	8	55138	55145	75 %	25 %	0 %	0 %	302388653
89	NC_014377	GCAA	2	8	55474	55481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014377	CAAA	2	8	55910	55917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014377	GGAG	2	8	55933	55940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014377	TACT	2	8	56027	56034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014377	GTTT	2	8	56057	56064	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014377	ATAC	2	8	56177	56184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014377	CCTG	2	8	57138	57145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014377	AGGA	2	8	57394	57401	50 %	0 %	50 %	0 %	302388655
97	NC_014377	AGGG	2	8	57538	57545	25 %	0 %	75 %	0 %	302388655
98	NC_014377	CCGC	2	8	58004	58011	0 %	0 %	25 %	75 %	302388655
99	NC_014377	GCTG	2	8	58363	58370	0 %	25 %	50 %	25 %	302388656
100	NC_014377	ATCT	2	8	58949	58956	25 %	50 %	0 %	25 %	302388657
101	NC_014377	CAGG	2	8	59636	59643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014377	AAGG	2	8	60314	60321	50 %	0 %	50 %	0 %	302388658
103	NC_014377	CGGC	2	8	60715	60722	0 %	0 %	50 %	50 %	302388659
104	NC_014377	GCGG	2	8	60938	60945	0 %	0 %	75 %	25 %	302388659
105	NC_014377	ATTT	2	8	62706	62713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014377	ATGT	2	8	62771	62778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014377	GAGG	2	8	63010	63017	25 %	0 %	75 %	0 %	302388662
108	NC_014377	AGCC	2	8	63390	63397	25 %	0 %	25 %	50 %	302388662
109	NC_014377	GATA	2	8	63630	63637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014377	AAAC	2	8	64376	64383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014377	TTAG	2	8	64791	64798	25 %	50 %	25 %	0 %	302388664
112	NC_014377	TTCT	2	8	65478	65485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014377	AGAT	2	8	65788	65795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014377	CTTC	2	8	66491	66498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014377	AGAA	2	8	66692	66699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014377	GGCT	2	8	67083	67090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014377	ATTT	2	8	67209	67216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014377	AAAG	2	8	67673	67680	75 %	0 %	25 %	0 %	302388665
119	NC_014377	CAGG	2	8	67939	67946	25 %	0 %	50 %	25 %	302388665
120	NC_014377	TGGA	2	8	68423	68430	25 %	25 %	50 %	0 %	302388666
121	NC_014377	TCAA	2	8	69336	69343	50 %	25 %	0 %	25 %	302388667
122	NC_014377	GATA	2	8	69506	69513	50 %	25 %	25 %	0 %	302388667
123	NC_014377	GCTG	2	8	70436	70443	0 %	25 %	50 %	25 %	302388667
124	NC_014377	GGAA	2	8	71606	71613	50 %	0 %	50 %	0 %	302388668
125	NC_014377	ATAA	2	8	72143	72150	75 %	25 %	0 %	0 %	302388669
126	NC_014377	AAAT	2	8	73397	73404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014377	TAAA	2	8	73414	73421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014377	CCGA	2	8	74261	74268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014377	CATT	2	8	75454	75461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014377	TCCT	2	8	75809	75816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014377	AGAT	2	8	76396	76403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014377	CTCC	2	8	76959	76966	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_014377	AAAC	2	8	77277	77284	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014377	GGTG	2	8	78586	78593	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014377	ATAC	2	8	79022	79029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014377	ACCT	2	8	79688	79695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014377	CATA	2	8	79741	79748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014377	TAAT	2	8	80400	80407	50 %	50 %	0 %	0 %	302388672
139	NC_014377	AGAA	2	8	80839	80846	75 %	0 %	25 %	0 %	302388672
140	NC_014377	GTCT	2	8	81149	81156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014377	TGAT	2	8	81507	81514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014377	GCTG	2	8	81869	81876	0 %	25 %	50 %	25 %	302388673
143	NC_014377	GATG	2	8	82228	82235	25 %	25 %	50 %	0 %	302388673
144	NC_014377	ATTC	2	8	82531	82538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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146	NC_014377	CGGT	2	8	83860	83867	0 %	25 %	50 %	25 %	302388675
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