MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_014209	CTTT	2	8	2304131	2304138	0 %	75 %	0 %	25 %	297545653
56002	NC_014209	TC	3	6	2304236	2304241	0 %	50 %	0 %	50 %	297545653
56003	NC_014209	GCAAG	2	10	2304258	2304267	40 %	0 %	40 %	20 %	297545653
56004	NC_014209	CTT	2	6	2304276	2304281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545653
56005	NC_014209	TC	4	8	2304343	2304350	0 %	50 %	0 %	50 %	297545654
56006	NC_014209	CTG	2	6	2304362	2304367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545654
56007	NC_014209	AT	3	6	2304379	2304384	50 %	50 %	0 %	0 %	297545654
56008	NC_014209	AT	3	6	2304398	2304403	50 %	50 %	0 %	0 %	297545654
56009	NC_014209	ATCC	2	8	2304432	2304439	25 %	25 %	0 %	50 %	297545654
56010	NC_014209	CAT	2	6	2304452	2304457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545654
56011	NC_014209	AGA	2	6	2304500	2304505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545654
56012	NC_014209	TA	3	6	2304506	2304511	50 %	50 %	0 %	0 %	297545654
56013	NC_014209	AGT	2	6	2304512	2304517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545654
56014	NC_014209	TA	3	6	2304539	2304544	50 %	50 %	0 %	0 %	297545654
56015	NC_014209	A	6	6	2304579	2304584	100 %	0 %	0 %	0 %	297545654
56016	NC_014209	CCA	2	6	2304669	2304674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545654
56017	NC_014209	T	6	6	2304686	2304691	0 %	100 %	0 %	0 %	297545654
56018	NC_014209	CTT	2	6	2304746	2304751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545654
56019	NC_014209	TTTC	2	8	2304778	2304785	0 %	75 %	0 %	25 %	297545654
56020	NC_014209	TGC	2	6	2304807	2304812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545654
56021	NC_014209	AGT	2	6	2304828	2304833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545654
56022	NC_014209	AAT	2	6	2304854	2304859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545654
56023	NC_014209	TA	4	8	2304889	2304896	50 %	50 %	0 %	0 %	297545654
56024	NC_014209	TAA	2	6	2304902	2304907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545654
56025	NC_014209	TTG	2	6	2304928	2304933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545654
56026	NC_014209	ATA	2	6	2304936	2304941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545654
56027	NC_014209	ATTT	2	8	2304953	2304960	25 %	75 %	0 %	0 %	297545655
56028	NC_014209	C	6	6	2304974	2304979	0 %	0 %	0 %	100 %	297545655
56029	NC_014209	AT	3	6	2305118	2305123	50 %	50 %	0 %	0 %	297545655
56030	NC_014209	TTAA	2	8	2305136	2305143	50 %	50 %	0 %	0 %	297545655
56031	NC_014209	A	7	7	2305142	2305148	100 %	0 %	0 %	0 %	297545655
56032	NC_014209	TAA	2	6	2305149	2305154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545655
56033	NC_014209	TAAT	2	8	2305196	2305203	50 %	50 %	0 %	0 %	297545656
56034	NC_014209	CAA	2	6	2305241	2305246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545656
56035	NC_014209	T	7	7	2305281	2305287	0 %	100 %	0 %	0 %	297545656
56036	NC_014209	T	7	7	2305361	2305367	0 %	100 %	0 %	0 %	297545656
56037	NC_014209	ATT	2	6	2305401	2305406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545656
56038	NC_014209	ATA	2	6	2305413	2305418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545656
56039	NC_014209	ACA	2	6	2305423	2305428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545656
56040	NC_014209	TTA	2	6	2305501	2305506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545656
56041	NC_014209	A	6	6	2305529	2305534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56042	NC_014209	TCT	3	9	2305578	2305586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545657
56043	NC_014209	T	7	7	2305641	2305647	0 %	100 %	0 %	0 %	297545657
56044	NC_014209	T	7	7	2305655	2305661	0 %	100 %	0 %	0 %	297545657
56045	NC_014209	CCT	2	6	2305690	2305695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56046	NC_014209	CAA	2	6	2305744	2305749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56047	NC_014209	A	7	7	2305762	2305768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56048	NC_014209	CAA	2	6	2305773	2305778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56049	NC_014209	ATT	2	6	2305812	2305817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56050	NC_014209	TTA	2	6	2305847	2305852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56051	NC_014209	TAAA	2	8	2305875	2305882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56052	NC_014209	AAC	2	6	2305899	2305904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56053	NC_014209	GTT	2	6	2305915	2305920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56054	NC_014209	GTT	2	6	2305938	2305943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56055	NC_014209	T	7	7	2305995	2306001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56056	NC_014209	T	8	8	2306007	2306014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56057	NC_014209	CAA	2	6	2306032	2306037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56058	NC_014209	TA	3	6	2306054	2306059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56059	NC_014209	A	6	6	2306074	2306079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.