MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014159	CG	3	6	439	444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014159	TA	3	6	1412	1417	50 %	50 %	0 %	0 %	296141909
3	NC_014159	CG	4	8	1965	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	296141910
4	NC_014159	CG	3	6	2638	2643	0 %	0 %	50 %	50 %	296141911
5	NC_014159	CG	3	6	3073	3078	0 %	0 %	50 %	50 %	296141911
6	NC_014159	CG	3	6	3211	3216	0 %	0 %	50 %	50 %	296141911
7	NC_014159	TG	4	8	3455	3462	0 %	50 %	50 %	0 %	296141912
8	NC_014159	CG	3	6	3566	3571	0 %	0 %	50 %	50 %	296141912
9	NC_014159	CG	3	6	3823	3828	0 %	0 %	50 %	50 %	296141913
10	NC_014159	GC	3	6	4302	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	296141914
11	NC_014159	CG	3	6	4328	4333	0 %	0 %	50 %	50 %	296141914
12	NC_014159	GC	3	6	4515	4520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014159	AC	3	6	4939	4944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014159	TG	3	6	5244	5249	0 %	50 %	50 %	0 %	296141915
15	NC_014159	GC	3	6	5779	5784	0 %	0 %	50 %	50 %	296141916
16	NC_014159	GC	4	8	5789	5796	0 %	0 %	50 %	50 %	296141916
17	NC_014159	CG	3	6	6125	6130	0 %	0 %	50 %	50 %	296141917
18	NC_014159	GC	4	8	6413	6420	0 %	0 %	50 %	50 %	296141917
19	NC_014159	CG	3	6	6778	6783	0 %	0 %	50 %	50 %	296141918
20	NC_014159	GC	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	296141918
21	NC_014159	CG	3	6	7225	7230	0 %	0 %	50 %	50 %	296141918
22	NC_014159	CT	3	6	8003	8008	0 %	50 %	0 %	50 %	296141919
23	NC_014159	CG	3	6	8445	8450	0 %	0 %	50 %	50 %	296141920
24	NC_014159	CG	3	6	8921	8926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014159	CG	3	6	8972	8977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014159	CT	3	6	9003	9008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014159	AC	3	6	9238	9243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014159	GC	3	6	9587	9592	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
29	NC_014159	GC	3	6	9797	9802	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
30	NC_014159	GC	3	6	9884	9889	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
31	NC_014159	GC	3	6	10469	10474	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
32	NC_014159	CG	3	6	10715	10720	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
33	NC_014159	AC	3	6	11699	11704	50 %	0 %	0 %	50 %	296141921
34	NC_014159	CA	3	6	11783	11788	50 %	0 %	0 %	50 %	296141921
35	NC_014159	GC	3	6	12302	12307	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
36	NC_014159	AC	3	6	12524	12529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014159	CG	5	10	12939	12948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014159	CT	3	6	13344	13349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014159	AT	4	8	13370	13377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014159	CA	3	6	14707	14712	50 %	0 %	0 %	50 %	296141924
41	NC_014159	CG	3	6	14772	14777	0 %	0 %	50 %	50 %	296141924
42	NC_014159	CG	3	6	15890	15895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014159	CG	3	6	16475	16480	0 %	0 %	50 %	50 %	296141928
44	NC_014159	CG	4	8	17421	17428	0 %	0 %	50 %	50 %	296141929
45	NC_014159	AG	3	6	17474	17479	50 %	0 %	50 %	0 %	296141929
46	NC_014159	CG	3	6	17628	17633	0 %	0 %	50 %	50 %	296141929
47	NC_014159	GA	3	6	17789	17794	50 %	0 %	50 %	0 %	296141930
48	NC_014159	CG	3	6	18257	18262	0 %	0 %	50 %	50 %	296141931
49	NC_014159	GC	3	6	18304	18309	0 %	0 %	50 %	50 %	296141931
50	NC_014159	CG	3	6	20162	20167	0 %	0 %	50 %	50 %	296141932
51	NC_014159	GC	3	6	20407	20412	0 %	0 %	50 %	50 %	296141932
52	NC_014159	CG	3	6	21309	21314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014159	TG	3	6	21349	21354	0 %	50 %	50 %	0 %	296141933
54	NC_014159	GC	3	6	21716	21721	0 %	0 %	50 %	50 %	296141933
55	NC_014159	CG	3	6	21916	21921	0 %	0 %	50 %	50 %	296141933
56	NC_014159	CG	3	6	22045	22050	0 %	0 %	50 %	50 %	296141933
57	NC_014159	GC	4	8	22480	22487	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
58	NC_014159	CA	3	6	22754	22759	50 %	0 %	0 %	50 %	296141934
59	NC_014159	GC	3	6	23068	23073	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
60	NC_014159	GC	4	8	23732	23739	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
61	NC_014159	GC	3	6	24256	24261	0 %	0 %	50 %	50 %	296141935
62	NC_014159	CG	3	6	25140	25145	0 %	0 %	50 %	50 %	296141935
63	NC_014159	AC	4	8	26876	26883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014159	GC	3	6	26944	26949	0 %	0 %	50 %	50 %	296141938
65	NC_014159	GC	3	6	27137	27142	0 %	0 %	50 %	50 %	296141938
66	NC_014159	GT	3	6	27667	27672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014159	TG	3	6	28293	28298	0 %	50 %	50 %	0 %	296141939
68	NC_014159	GT	3	6	28342	28347	0 %	50 %	50 %	0 %	296141939
69	NC_014159	GC	3	6	28499	28504	0 %	0 %	50 %	50 %	296141939
70	NC_014159	CG	3	6	28677	28682	0 %	0 %	50 %	50 %	296141939
71	NC_014159	GC	3	6	28929	28934	0 %	0 %	50 %	50 %	296141939
72	NC_014159	CG	3	6	29177	29182	0 %	0 %	50 %	50 %	296141940
73	NC_014159	AC	3	6	30145	30150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014159	GC	3	6	30733	30738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014159	CG	3	6	30832	30837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014159	GT	3	6	31059	31064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014159	TG	3	6	31085	31090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014159	GC	4	8	31135	31142	0 %	0 %	50 %	50 %	296141941
79	NC_014159	GC	3	6	32136	32141	0 %	0 %	50 %	50 %	296141942
80	NC_014159	CG	3	6	32737	32742	0 %	0 %	50 %	50 %	296141943
81	NC_014159	GC	4	8	33135	33142	0 %	0 %	50 %	50 %	296141944
82	NC_014159	GC	3	6	33595	33600	0 %	0 %	50 %	50 %	296141944
83	NC_014159	AC	3	6	33764	33769	50 %	0 %	0 %	50 %	296141944
84	NC_014159	CA	4	8	33881	33888	50 %	0 %	0 %	50 %	296141944
85	NC_014159	CA	3	6	34181	34186	50 %	0 %	0 %	50 %	296141944
86	NC_014159	GC	4	8	34612	34619	0 %	0 %	50 %	50 %	296141945
87	NC_014159	GC	3	6	34973	34978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014159	TG	3	6	35182	35187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014159	GT	3	6	35544	35549	0 %	50 %	50 %	0 %	296141946
90	NC_014159	GC	3	6	35972	35977	0 %	0 %	50 %	50 %	296141946
91	NC_014159	CG	3	6	36239	36244	0 %	0 %	50 %	50 %	296141946
92	NC_014159	CG	3	6	36336	36341	0 %	0 %	50 %	50 %	296141946
93	NC_014159	CG	3	6	36401	36406	0 %	0 %	50 %	50 %	296141946
94	NC_014159	AC	3	6	36736	36741	50 %	0 %	0 %	50 %	296141946
95	NC_014159	CG	3	6	37222	37227	0 %	0 %	50 %	50 %	296141946
96	NC_014159	CG	3	6	37771	37776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014159	AG	3	6	37905	37910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014159	GC	3	6	38029	38034	0 %	0 %	50 %	50 %	296141947
99	NC_014159	CG	3	6	38215	38220	0 %	0 %	50 %	50 %	296141947
100	NC_014159	CG	4	8	39639	39646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014159	GA	3	6	39727	39732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014159	GC	3	6	40771	40776	0 %	0 %	50 %	50 %	296141949
103	NC_014159	CG	3	6	41023	41028	0 %	0 %	50 %	50 %	296141949
104	NC_014159	GC	3	6	41201	41206	0 %	0 %	50 %	50 %	296141949
105	NC_014159	AC	3	6	41358	41363	50 %	0 %	0 %	50 %	296141949
106	NC_014159	CA	3	6	41407	41412	50 %	0 %	0 %	50 %	296141949
107	NC_014159	AC	3	6	42033	42038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014159	GC	3	6	43258	43263	0 %	0 %	50 %	50 %	296141950
109	NC_014159	CG	3	6	43305	43310	0 %	0 %	50 %	50 %	296141950
110	NC_014159	CG	3	6	43763	43768	0 %	0 %	50 %	50 %	296141951
111	NC_014159	GC	3	6	44080	44085	0 %	0 %	50 %	50 %	296141951
112	NC_014159	GA	3	6	44155	44160	50 %	0 %	50 %	0 %	296141951
113	NC_014159	CG	4	8	44937	44944	0 %	0 %	50 %	50 %	296141952
114	NC_014159	GC	3	6	45503	45508	0 %	0 %	50 %	50 %	296141953
115	NC_014159	GT	3	6	45867	45872	0 %	50 %	50 %	0 %	296141953
116	NC_014159	GC	3	6	46596	46601	0 %	0 %	50 %	50 %	296141953
117	NC_014159	CG	3	6	46839	46844	0 %	0 %	50 %	50 %	296141954
118	NC_014159	TG	3	6	47987	47992	0 %	50 %	50 %	0 %	296141954
119	NC_014159	CA	3	6	48057	48062	50 %	0 %	0 %	50 %	296141954
120	NC_014159	CG	3	6	48969	48974	0 %	0 %	50 %	50 %	296141955
121	NC_014159	GA	3	6	49023	49028	50 %	0 %	50 %	0 %	296141955
122	NC_014159	GC	3	6	49077	49082	0 %	0 %	50 %	50 %	296141955
123	NC_014159	GC	3	6	49087	49092	0 %	0 %	50 %	50 %	296141955
124	NC_014159	GT	3	6	49454	49459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014159	GT	3	6	50181	50186	0 %	50 %	50 %	0 %	296141956
126	NC_014159	CG	3	6	50754	50759	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
127	NC_014159	CG	3	6	50979	50984	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
128	NC_014159	CG	3	6	51372	51377	0 %	0 %	50 %	50 %	296141957
129	NC_014159	GA	3	6	52567	52572	50 %	0 %	50 %	0 %	296141958
130	NC_014159	GC	3	6	52667	52672	0 %	0 %	50 %	50 %	296141958
131	NC_014159	CT	3	6	53215	53220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014159	CG	3	6	53787	53792	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
133	NC_014159	GC	3	6	53970	53975	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
134	NC_014159	CG	3	6	54316	54321	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
135	NC_014159	GC	3	6	54675	54680	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
136	NC_014159	GC	3	6	54713	54718	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
137	NC_014159	GC	3	6	54908	54913	0 %	0 %	50 %	50 %	296141961
138	NC_014159	GC	3	6	55418	55423	0 %	0 %	50 %	50 %	296141961
139	NC_014159	GC	3	6	55543	55548	0 %	0 %	50 %	50 %	296141961
140	NC_014159	AC	3	6	55566	55571	50 %	0 %	0 %	50 %	296141961
141	NC_014159	CG	3	6	55736	55741	0 %	0 %	50 %	50 %	296141961
142	NC_014159	GC	3	6	55873	55878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014159	GA	3	6	55974	55979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014159	GC	3	6	56334	56339	0 %	0 %	50 %	50 %	296141962
145	NC_014159	GC	3	6	56518	56523	0 %	0 %	50 %	50 %	296141963
146	NC_014159	CT	3	6	56590	56595	0 %	50 %	0 %	50 %	296141963
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.