MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014159	GTCA	2	8	1546	1553	25 %	25 %	25 %	25 %	296141909
2	NC_014159	ATTG	2	8	2851	2858	25 %	50 %	25 %	0 %	296141911
3	NC_014159	GAAT	2	8	3725	3732	50 %	25 %	25 %	0 %	296141912
4	NC_014159	CGAG	2	8	3994	4001	25 %	0 %	50 %	25 %	296141913
5	NC_014159	ACCG	2	8	4538	4545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014159	ACTG	2	8	4863	4870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014159	GGAC	2	8	4928	4935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014159	CTGG	2	8	5056	5063	0 %	25 %	50 %	25 %	296141915
9	NC_014159	GCAG	2	8	5278	5285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014159	CGAC	2	8	5402	5409	25 %	0 %	25 %	50 %	296141916
11	NC_014159	CGCC	2	8	5800	5807	0 %	0 %	25 %	75 %	296141916
12	NC_014159	GGCA	2	8	5841	5848	25 %	0 %	50 %	25 %	296141916
13	NC_014159	GCCA	2	8	6371	6378	25 %	0 %	25 %	50 %	296141917
14	NC_014159	GCCG	2	8	6646	6653	0 %	0 %	50 %	50 %	296141917
15	NC_014159	CGGC	2	8	6845	6852	0 %	0 %	50 %	50 %	296141918
16	NC_014159	GAAG	2	8	6861	6868	50 %	0 %	50 %	0 %	296141918
17	NC_014159	TGGT	2	8	7117	7124	0 %	50 %	50 %	0 %	296141918
18	NC_014159	CACC	2	8	7446	7453	25 %	0 %	0 %	75 %	296141918
19	NC_014159	CTGC	2	8	7526	7533	0 %	25 %	25 %	50 %	296141918
20	NC_014159	TCGC	2	8	7652	7659	0 %	25 %	25 %	50 %	296141918
21	NC_014159	CTAC	2	8	7831	7838	25 %	25 %	0 %	50 %	296141919
22	NC_014159	GCCG	2	8	7845	7852	0 %	0 %	50 %	50 %	296141919
23	NC_014159	GCCG	2	8	8019	8026	0 %	0 %	50 %	50 %	296141919
24	NC_014159	CTCG	2	8	8216	8223	0 %	25 %	25 %	50 %	296141920
25	NC_014159	TGGT	2	8	8568	8575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014159	GCTC	2	8	8680	8687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014159	ACGT	2	8	9290	9297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014159	ACCT	2	8	9396	9403	25 %	25 %	0 %	50 %	296141921
29	NC_014159	CCCG	2	8	9482	9489	0 %	0 %	25 %	75 %	296141921
30	NC_014159	CGAG	2	8	9847	9854	25 %	0 %	50 %	25 %	296141921
31	NC_014159	CCGC	2	8	10252	10259	0 %	0 %	25 %	75 %	296141921
32	NC_014159	ACCG	2	8	10287	10294	25 %	0 %	25 %	50 %	296141921
33	NC_014159	GCCG	2	8	10389	10396	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
34	NC_014159	GACC	2	8	12071	12078	25 %	0 %	25 %	50 %	296141921
35	NC_014159	ACCG	2	8	12081	12088	25 %	0 %	25 %	50 %	296141921
36	NC_014159	CCGC	2	8	12250	12257	0 %	0 %	25 %	75 %	296141921
37	NC_014159	GAGC	2	8	12418	12425	25 %	0 %	50 %	25 %	296141921
38	NC_014159	CGCT	2	8	12614	12621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014159	GGAC	2	8	12644	12651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014159	TCAC	2	8	12817	12824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014159	GGCC	2	8	12965	12972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014159	CTTC	2	8	13286	13293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014159	GGCC	2	8	14146	14153	0 %	0 %	50 %	50 %	296141923
44	NC_014159	ACAT	2	8	14332	14339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014159	ATCT	2	8	14397	14404	25 %	50 %	0 %	25 %	296141924
46	NC_014159	CCGT	2	8	14521	14528	0 %	25 %	25 %	50 %	296141924
47	NC_014159	CCCG	2	8	14588	14595	0 %	0 %	25 %	75 %	296141924
48	NC_014159	ACAT	2	8	15154	15161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014159	GAGC	2	8	15296	15303	25 %	0 %	50 %	25 %	296141926
50	NC_014159	CTGC	2	8	15783	15790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014159	CGCA	2	8	16926	16933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014159	GGCC	2	8	17053	17060	0 %	0 %	50 %	50 %	296141929
53	NC_014159	TCGG	2	8	17142	17149	0 %	25 %	50 %	25 %	296141929
54	NC_014159	ACGG	2	8	17515	17522	25 %	0 %	50 %	25 %	296141929
55	NC_014159	GCGG	2	8	17530	17537	0 %	0 %	75 %	25 %	296141929
56	NC_014159	CGAC	2	8	17674	17681	25 %	0 %	25 %	50 %	296141929
57	NC_014159	CACC	2	8	17879	17886	25 %	0 %	0 %	75 %	296141930
58	NC_014159	CCTC	2	8	18074	18081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_014159	TGGT	2	8	18172	18179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014159	GGCA	2	8	18225	18232	25 %	0 %	50 %	25 %	296141931
61	NC_014159	GCAG	2	8	19325	19332	25 %	0 %	50 %	25 %	296141931
62	NC_014159	TCCG	2	8	19370	19377	0 %	25 %	25 %	50 %	296141931
63	NC_014159	CCCA	2	8	19512	19519	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_014159	GCCT	2	8	19784	19791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014159	GGCA	2	8	20172	20179	25 %	0 %	50 %	25 %	296141932
66	NC_014159	GGCC	2	8	20824	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	296141932
67	NC_014159	GAAA	2	8	20991	20998	75 %	0 %	25 %	0 %	296141932
68	NC_014159	GCTC	2	8	21228	21235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014159	GCCG	2	8	21412	21419	0 %	0 %	50 %	50 %	296141933
70	NC_014159	CCCG	2	8	22147	22154	0 %	0 %	25 %	75 %	296141933
71	NC_014159	CCAC	2	8	22268	22275	25 %	0 %	0 %	75 %	296141933
72	NC_014159	GTGA	2	8	22330	22337	25 %	25 %	50 %	0 %	296141933
73	NC_014159	CGGC	2	8	22388	22395	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
74	NC_014159	CGCC	2	8	22402	22409	0 %	0 %	25 %	75 %	296141934
75	NC_014159	GCAG	2	8	22491	22498	25 %	0 %	50 %	25 %	296141934
76	NC_014159	GCCG	2	8	22575	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
77	NC_014159	GCAC	2	8	23038	23045	25 %	0 %	25 %	50 %	296141934
78	NC_014159	GGCG	3	12	23135	23146	0 %	0 %	75 %	25 %	296141934
79	NC_014159	GCCG	2	8	23228	23235	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
80	NC_014159	CTCG	2	8	23514	23521	0 %	25 %	25 %	50 %	296141934
81	NC_014159	TGGG	2	8	24130	24137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014159	CCGG	2	8	24546	24553	0 %	0 %	50 %	50 %	296141935
83	NC_014159	CGAT	2	8	24717	24724	25 %	25 %	25 %	25 %	296141935
84	NC_014159	CCGC	2	8	25491	25498	0 %	0 %	25 %	75 %	296141935
85	NC_014159	ATCC	2	8	25537	25544	25 %	25 %	0 %	50 %	296141935
86	NC_014159	TGCT	2	8	25856	25863	0 %	50 %	25 %	25 %	296141936
87	NC_014159	GGGA	2	8	25876	25883	25 %	0 %	75 %	0 %	296141936
88	NC_014159	GCCT	2	8	26656	26663	0 %	25 %	25 %	50 %	296141937
89	NC_014159	CACC	2	8	27100	27107	25 %	0 %	0 %	75 %	296141938
90	NC_014159	TGGC	2	8	27728	27735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014159	CTGC	2	8	28075	28082	0 %	25 %	25 %	50 %	296141939
92	NC_014159	GTGC	2	8	28366	28373	0 %	25 %	50 %	25 %	296141939
93	NC_014159	CGGT	2	8	28487	28494	0 %	25 %	50 %	25 %	296141939
94	NC_014159	GCCG	2	8	29158	29165	0 %	0 %	50 %	50 %	296141940
95	NC_014159	GGCA	2	8	29613	29620	25 %	0 %	50 %	25 %	296141940
96	NC_014159	GCAC	2	8	29852	29859	25 %	0 %	25 %	50 %	296141940
97	NC_014159	CCGC	2	8	30015	30022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014159	CCGC	2	8	30042	30049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014159	GCCG	2	8	30137	30144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014159	CCAA	2	8	30847	30854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014159	CACT	2	8	30919	30926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014159	TTGA	2	8	31026	31033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014159	TCGC	2	8	31450	31457	0 %	25 %	25 %	50 %	296141941
104	NC_014159	CGCA	2	8	32407	32414	25 %	0 %	25 %	50 %	296141943
105	NC_014159	CGGC	2	8	33045	33052	0 %	0 %	50 %	50 %	296141943
106	NC_014159	CTGC	2	8	33285	33292	0 %	25 %	25 %	50 %	296141944
107	NC_014159	CGCC	2	8	33448	33455	0 %	0 %	25 %	75 %	296141944
108	NC_014159	GTGC	2	8	34606	34613	0 %	25 %	50 %	25 %	296141945
109	NC_014159	GCAA	2	8	35294	35301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014159	CTGA	2	8	35561	35568	25 %	25 %	25 %	25 %	296141946
111	NC_014159	TGGG	2	8	35750	35757	0 %	25 %	75 %	0 %	296141946
112	NC_014159	CGCC	2	8	36472	36479	0 %	0 %	25 %	75 %	296141946
113	NC_014159	TGAT	2	8	37176	37183	25 %	50 %	25 %	0 %	296141946
114	NC_014159	CGTG	2	8	37357	37364	0 %	25 %	50 %	25 %	296141946
115	NC_014159	TGCG	2	8	37500	37507	0 %	25 %	50 %	25 %	296141946
116	NC_014159	GTTC	2	8	38230	38237	0 %	50 %	25 %	25 %	296141947
117	NC_014159	CCGA	2	8	39042	39049	25 %	0 %	25 %	50 %	296141947
118	NC_014159	GGCG	2	8	39363	39370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014159	AGCG	2	8	39465	39472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014159	GGTC	2	8	39546	39553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014159	GTGC	2	8	39846	39853	0 %	25 %	50 %	25 %	296141948
122	NC_014159	TGCC	2	8	40085	40092	0 %	25 %	25 %	50 %	296141948
123	NC_014159	CGGC	2	8	40540	40547	0 %	0 %	50 %	50 %	296141948
124	NC_014159	ACCG	2	8	41211	41218	25 %	0 %	25 %	50 %	296141949
125	NC_014159	GCAC	2	8	41332	41339	25 %	0 %	25 %	50 %	296141949
126	NC_014159	GCAG	2	8	41623	41630	25 %	0 %	50 %	25 %	296141949
127	NC_014159	GCCA	2	8	41970	41977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014159	CGGA	2	8	42190	42197	25 %	0 %	50 %	25 %	296141950
129	NC_014159	CTGC	2	8	42235	42242	0 %	25 %	25 %	50 %	296141950
130	NC_014159	TCGG	2	8	42243	42250	0 %	25 %	50 %	25 %	296141950
131	NC_014159	GTTG	2	8	43329	43336	0 %	50 %	50 %	0 %	296141950
132	NC_014159	ACCA	2	8	43388	43395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014159	ATCG	2	8	43605	43612	25 %	25 %	25 %	25 %	296141951
134	NC_014159	GCCA	2	8	44280	44287	25 %	0 %	25 %	50 %	296141951
135	NC_014159	CGGA	2	8	44338	44345	25 %	0 %	50 %	25 %	296141951
136	NC_014159	CGGG	2	8	44367	44374	0 %	0 %	75 %	25 %	296141951
137	NC_014159	CGCC	2	8	44740	44747	0 %	0 %	25 %	75 %	296141952
138	NC_014159	CACT	2	8	44879	44886	25 %	25 %	0 %	50 %	296141952
139	NC_014159	CGGT	2	8	45019	45026	0 %	25 %	50 %	25 %	296141952
140	NC_014159	CAGC	2	8	46230	46237	25 %	0 %	25 %	50 %	296141953
141	NC_014159	GCGA	2	8	46396	46403	25 %	0 %	50 %	25 %	296141953
142	NC_014159	GCGG	2	8	47017	47024	0 %	0 %	75 %	25 %	296141954
143	NC_014159	CGGG	2	8	47177	47184	0 %	0 %	75 %	25 %	296141954
144	NC_014159	GTCT	2	8	47385	47392	0 %	50 %	25 %	25 %	296141954
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293	NC_014159	ATCG	2	8	94523	94530	25 %	25 %	25 %	25 %	296141988
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303	NC_014159	CGAG	2	8	96888	96895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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306	NC_014159	TGAC	2	8	97651	97658	25 %	25 %	25 %	25 %	296141992
307	NC_014159	GCCA	2	8	97999	98006	25 %	0 %	25 %	50 %	296141992

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.