MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 1928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014159	CGA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014159	CTT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014159	GTC	2	6	197	202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014159	TTC	2	6	249	254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014159	CAG	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014159	GCA	2	6	399	404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014159	AGT	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014159	TAA	2	6	451	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014159	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014159	AAT	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014159	CAC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014159	GTA	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014159	GCG	3	9	646	654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014159	GTC	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014159	CCT	2	6	688	693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014159	TTC	2	6	697	702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014159	CCT	2	6	895	900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141909
18	NC_014159	GCG	2	6	934	939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141909
19	NC_014159	CTT	2	6	963	968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141909
20	NC_014159	AGA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141909
21	NC_014159	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296141909
22	NC_014159	TAG	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141909
23	NC_014159	AGT	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141909
24	NC_014159	GAC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
25	NC_014159	AAG	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141909
26	NC_014159	GGA	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141909
27	NC_014159	CGA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
28	NC_014159	GCA	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
29	NC_014159	AGC	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
30	NC_014159	TGA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141909
31	NC_014159	CGA	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
32	NC_014159	CCG	2	6	2136	2141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141910
33	NC_014159	TGC	2	6	2259	2264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141910
34	NC_014159	TCC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141910
35	NC_014159	TGC	3	9	2415	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141910
36	NC_014159	CAC	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141910
37	NC_014159	GCC	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141910
38	NC_014159	ATG	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141910
39	NC_014159	GAC	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141910
40	NC_014159	GCG	2	6	2542	2547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141910
41	NC_014159	GCC	2	6	2556	2561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141910
42	NC_014159	GCC	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
43	NC_014159	GTT	2	6	2726	2731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141911
44	NC_014159	TGG	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141911
45	NC_014159	CGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141911
46	NC_014159	CAG	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141911
47	NC_014159	GAG	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141911
48	NC_014159	CAG	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141911
49	NC_014159	GGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141911
50	NC_014159	CGC	2	6	3090	3095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
51	NC_014159	CCG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
52	NC_014159	GCC	2	6	3173	3178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
53	NC_014159	TGC	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141911
54	NC_014159	GTT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141911
55	NC_014159	CGC	2	6	3274	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014159	CGT	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014159	CGC	2	6	3397	3402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014159	AGG	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014159	TCA	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141912
60	NC_014159	CCG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141912
61	NC_014159	GAA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141912
62	NC_014159	TGA	3	9	3739	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141912
63	NC_014159	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141913
64	NC_014159	GCC	2	6	3852	3857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141913
65	NC_014159	CGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141913
66	NC_014159	GCC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141913
67	NC_014159	ACC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141913
68	NC_014159	ATC	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014159	GCT	2	6	4116	4121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141914
70	NC_014159	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141914
71	NC_014159	TTC	2	6	4170	4175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141914
72	NC_014159	TCG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141914
73	NC_014159	GGC	2	6	4298	4303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141914
74	NC_014159	GCG	4	12	4331	4342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141914
75	NC_014159	TTC	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141914
76	NC_014159	AGA	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141914
77	NC_014159	CTT	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014159	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014159	GAA	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014159	CGC	2	6	4671	4676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014159	GTT	2	6	4690	4695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014159	TGG	2	6	4701	4706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014159	GGT	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014159	CAA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014159	AGC	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014159	AGC	2	6	4908	4913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014159	GCA	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014159	ATC	2	6	4981	4986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141915
89	NC_014159	GTG	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141915
90	NC_014159	CGT	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141915
91	NC_014159	ACC	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141915
92	NC_014159	GCC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141915
93	NC_014159	CAG	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141915
94	NC_014159	ACA	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141915
95	NC_014159	CAC	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141916
96	NC_014159	CGG	2	6	5419	5424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141916
97	NC_014159	CGA	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141916
98	NC_014159	TGT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141916
99	NC_014159	GTG	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141916
100	NC_014159	CGG	2	6	5570	5575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141916
101	NC_014159	TGG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141916
102	NC_014159	GCC	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141916
103	NC_014159	GGC	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141916
104	NC_014159	CGC	2	6	5819	5824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141916
105	NC_014159	CTG	2	6	5902	5907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141916
106	NC_014159	TCA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141916
107	NC_014159	GCC	3	9	5926	5934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014159	CCG	2	6	5973	5978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141917
109	NC_014159	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141917
110	NC_014159	CGA	2	6	6082	6087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
111	NC_014159	CCG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141917
112	NC_014159	TCG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141917
113	NC_014159	GCC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141917
114	NC_014159	CGA	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
115	NC_014159	GTC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141917
116	NC_014159	TGG	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141917
117	NC_014159	ACG	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
118	NC_014159	ATG	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141917
119	NC_014159	CAC	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141917
120	NC_014159	CGG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141917
121	NC_014159	CAG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
122	NC_014159	GCG	2	6	6614	6619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141917
123	NC_014159	CGA	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
124	NC_014159	CGA	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
125	NC_014159	GCC	3	9	6913	6921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
126	NC_014159	GCG	3	9	6922	6930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141918
127	NC_014159	ACC	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141918
128	NC_014159	AGC	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
129	NC_014159	CCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141918
130	NC_014159	CAG	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
131	NC_014159	CCG	2	6	7187	7192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
132	NC_014159	GCG	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141918
133	NC_014159	CCG	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
134	NC_014159	CCG	2	6	7292	7297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
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257	NC_014159	CCG	2	6	13178	13183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_014159	CAC	2	6	13350	13355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_014159	GTC	2	6	13398	13403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141922
263	NC_014159	ACG	2	6	13421	13426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141922
264	NC_014159	AGA	2	6	13469	13474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141922
265	NC_014159	CTC	2	6	13642	13647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141922
266	NC_014159	ACG	2	6	13655	13660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141922
267	NC_014159	CAT	2	6	13662	13667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141922
268	NC_014159	GTC	2	6	13675	13680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141922
269	NC_014159	ATG	2	6	13690	13695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141922
270	NC_014159	GCC	2	6	13708	13713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141922
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273	NC_014159	CTC	2	6	13772	13777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141922
274	NC_014159	GGC	2	6	13824	13829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141922
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277	NC_014159	GTC	2	6	13888	13893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141922
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280	NC_014159	ATG	2	6	13994	13999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014159	CGC	2	6	14085	14090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141923
282	NC_014159	CGT	2	6	14104	14109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141923
283	NC_014159	CGG	2	6	14232	14237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141923
284	NC_014159	CGC	2	6	14289	14294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141923
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287	NC_014159	CGA	2	6	14483	14488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141924
288	NC_014159	CAT	2	6	14576	14581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141924
289	NC_014159	GTG	2	6	14640	14645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141924
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291	NC_014159	CGC	2	6	14676	14681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141924
292	NC_014159	GTT	2	6	14726	14731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141924
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500	NC_014159	GGT	2	6	27759	27764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141939

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