MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 2666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014159	GTG	2	6	40099	40104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141948
1002	NC_014159	GAG	2	6	40116	40121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141948
1003	NC_014159	G	6	6	40177	40182	0 %	0 %	100 %	0 %	296141948
1004	NC_014159	AGC	2	6	40240	40245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141948
1005	NC_014159	CGG	2	6	40367	40372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141948
1006	NC_014159	AGC	2	6	40396	40401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141948
1007	NC_014159	GCA	2	6	40415	40420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141948
1008	NC_014159	TGG	2	6	40451	40456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141948
1009	NC_014159	CGC	2	6	40520	40525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141948
1010	NC_014159	CGGC	2	8	40540	40547	0 %	0 %	50 %	50 %	296141948
1011	NC_014159	GTC	2	6	40566	40571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141948
1012	NC_014159	GCCACG	2	12	40634	40645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_014159	GGC	2	6	40653	40658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141949
1014	NC_014159	CGT	2	6	40661	40666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1015	NC_014159	GTG	2	6	40687	40692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141949
1016	NC_014159	GCG	2	6	40693	40698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141949
1017	NC_014159	GGTGC	2	10	40754	40763	0 %	20 %	60 %	20 %	296141949
1018	NC_014159	GC	3	6	40771	40776	0 %	0 %	50 %	50 %	296141949
1019	NC_014159	GGC	2	6	40788	40793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141949
1020	NC_014159	CGC	2	6	40824	40829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141949
1021	NC_014159	TCG	2	6	40898	40903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1022	NC_014159	CGG	2	6	40925	40930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141949
1023	NC_014159	CAG	2	6	40947	40952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1024	NC_014159	TCG	2	6	40963	40968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1025	NC_014159	GCG	2	6	40999	41004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141949
1026	NC_014159	CGA	2	6	41012	41017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1027	NC_014159	CG	3	6	41023	41028	0 %	0 %	50 %	50 %	296141949
1028	NC_014159	CGCTG	2	10	41087	41096	0 %	20 %	40 %	40 %	296141949
1029	NC_014159	GCT	2	6	41150	41155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1030	NC_014159	GCC	2	6	41185	41190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141949
1031	NC_014159	GC	3	6	41201	41206	0 %	0 %	50 %	50 %	296141949
1032	NC_014159	ACCG	2	8	41211	41218	25 %	0 %	25 %	50 %	296141949
1033	NC_014159	GCAC	2	8	41332	41339	25 %	0 %	25 %	50 %	296141949
1034	NC_014159	CAG	2	6	41352	41357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1035	NC_014159	AC	3	6	41358	41363	50 %	0 %	0 %	50 %	296141949
1036	NC_014159	CA	3	6	41407	41412	50 %	0 %	0 %	50 %	296141949
1037	NC_014159	GCT	3	9	41452	41460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1038	NC_014159	CAG	2	6	41577	41582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1039	NC_014159	GCAG	2	8	41623	41630	25 %	0 %	50 %	25 %	296141949
1040	NC_014159	CGA	2	6	41634	41639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141949
1041	NC_014159	CGC	3	9	41647	41655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141949
1042	NC_014159	CAC	2	6	41727	41732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141949
1043	NC_014159	ATG	2	6	41745	41750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141949
1044	NC_014159	ACC	2	6	41761	41766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141949
1045	NC_014159	GCC	3	9	41768	41776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141949
1046	NC_014159	TCA	2	6	41782	41787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141949
1047	NC_014159	CGC	3	9	41835	41843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141949
1048	NC_014159	CCG	2	6	41850	41855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141949
1049	NC_014159	CAA	2	6	41880	41885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141949
1050	NC_014159	CCA	2	6	41939	41944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141949
1051	NC_014159	GCCA	2	8	41970	41977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_014159	ATC	2	6	42017	42022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014159	AC	3	6	42033	42038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014159	GTT	2	6	42082	42087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141950
1055	NC_014159	GCC	2	6	42165	42170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1056	NC_014159	CGGA	2	8	42190	42197	25 %	0 %	50 %	25 %	296141950
1057	NC_014159	CTGC	2	8	42235	42242	0 %	25 %	25 %	50 %	296141950
1058	NC_014159	TCGG	2	8	42243	42250	0 %	25 %	50 %	25 %	296141950
1059	NC_014159	CCG	2	6	42275	42280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1060	NC_014159	TGG	2	6	42310	42315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141950
1061	NC_014159	CCG	2	6	42326	42331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1062	NC_014159	TGT	2	6	42340	42345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141950
1063	NC_014159	ATC	2	6	42393	42398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141950
1064	NC_014159	GTC	2	6	42422	42427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1065	NC_014159	GCG	2	6	42450	42455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141950
1066	NC_014159	GCA	2	6	42541	42546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1067	NC_014159	GAA	2	6	42632	42637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141950
1068	NC_014159	CGT	2	6	42640	42645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1069	NC_014159	CGC	2	6	42649	42654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1070	NC_014159	GCT	2	6	42665	42670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1071	NC_014159	CGC	2	6	42703	42708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1072	NC_014159	CGC	2	6	42764	42769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1073	NC_014159	CGA	2	6	42883	42888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1074	NC_014159	CGA	2	6	42955	42960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1075	NC_014159	CGC	2	6	42964	42969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141950
1076	NC_014159	TCA	2	6	43005	43010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141950
1077	NC_014159	GAC	2	6	43021	43026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1078	NC_014159	CGA	2	6	43039	43044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1079	NC_014159	GCA	2	6	43246	43251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1080	NC_014159	GC	3	6	43258	43263	0 %	0 %	50 %	50 %	296141950
1081	NC_014159	CGA	2	6	43294	43299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
1082	NC_014159	CG	3	6	43305	43310	0 %	0 %	50 %	50 %	296141950
1083	NC_014159	GTTG	2	8	43329	43336	0 %	50 %	50 %	0 %	296141950
1084	NC_014159	TCA	2	6	43369	43374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141950
1085	NC_014159	ACCA	2	8	43388	43395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_014159	TCG	2	6	43473	43478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_014159	CCT	2	6	43555	43560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141951
1088	NC_014159	ATCG	2	8	43605	43612	25 %	25 %	25 %	25 %	296141951
1089	NC_014159	GCTCG	2	10	43616	43625	0 %	20 %	40 %	40 %	296141951
1090	NC_014159	CGA	2	6	43667	43672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141951
1091	NC_014159	TCG	2	6	43686	43691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141951
1092	NC_014159	CG	3	6	43763	43768	0 %	0 %	50 %	50 %	296141951
1093	NC_014159	CGA	2	6	43781	43786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141951
1094	NC_014159	GTT	2	6	43830	43835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141951
1095	NC_014159	GGC	2	6	43836	43841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141951
1096	NC_014159	GTT	2	6	43874	43879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141951
1097	NC_014159	CCG	2	6	43885	43890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141951
1098	NC_014159	GCG	2	6	43945	43950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141951
1099	NC_014159	GGT	2	6	43982	43987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141951
1100	NC_014159	CCG	2	6	44019	44024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141951
1101	NC_014159	TCA	2	6	44036	44041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141951
1102	NC_014159	TGG	2	6	44051	44056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141951
1103	NC_014159	GAT	2	6	44067	44072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141951
1104	NC_014159	CGC	2	6	44076	44081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141951
1105	NC_014159	GC	3	6	44080	44085	0 %	0 %	50 %	50 %	296141951
1106	NC_014159	GGT	2	6	44147	44152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141951
1107	NC_014159	GA	3	6	44155	44160	50 %	0 %	50 %	0 %	296141951
1108	NC_014159	GAT	2	6	44181	44186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141951
1109	NC_014159	GCG	2	6	44227	44232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141951
1110	NC_014159	GGC	2	6	44247	44252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141951
1111	NC_014159	GCCA	2	8	44280	44287	25 %	0 %	25 %	50 %	296141951
1112	NC_014159	CGGA	2	8	44338	44345	25 %	0 %	50 %	25 %	296141951
1113	NC_014159	CGGG	2	8	44367	44374	0 %	0 %	75 %	25 %	296141951
1114	NC_014159	CCA	2	6	44391	44396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141951
1115	NC_014159	GCG	3	9	44425	44433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141951
1116	NC_014159	AAG	2	6	44454	44459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141951
1117	NC_014159	ACC	2	6	44500	44505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141951
1118	NC_014159	GCG	2	6	44578	44583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141952
1119	NC_014159	TGC	2	6	44621	44626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141952
1120	NC_014159	CGC	2	6	44637	44642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141952
1121	NC_014159	AGC	2	6	44647	44652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141952
1122	NC_014159	GGC	2	6	44653	44658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141952
1123	NC_014159	GCC	2	6	44664	44669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141952
1124	NC_014159	GCA	2	6	44686	44691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141952
1125	NC_014159	G	6	6	44704	44709	0 %	0 %	100 %	0 %	296141952
1126	NC_014159	GCC	2	6	44725	44730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141952
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1129	NC_014159	ACC	2	6	44752	44757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141952
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1131	NC_014159	GCC	2	6	44796	44801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141952
1132	NC_014159	GGC	3	9	44826	44834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141952
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1135	NC_014159	GCG	2	6	44986	44991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141952
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1251	NC_014159	CTG	2	6	50087	50092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1252	NC_014159	CCA	2	6	50104	50109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141956
1253	NC_014159	TGA	2	6	50140	50145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141956
1254	NC_014159	GCC	2	6	50172	50177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1255	NC_014159	GT	3	6	50181	50186	0 %	50 %	50 %	0 %	296141956
1256	NC_014159	CACGC	2	10	50264	50273	20 %	0 %	20 %	60 %	296141956
1257	NC_014159	TGC	2	6	50274	50279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1258	NC_014159	CGC	2	6	50300	50305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1259	NC_014159	TCA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141956
1260	NC_014159	TTG	2	6	50367	50372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141956
1261	NC_014159	TCG	2	6	50386	50391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1262	NC_014159	GGCC	2	8	50395	50402	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
1263	NC_014159	CTG	2	6	50489	50494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1264	NC_014159	TCG	2	6	50499	50504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1265	NC_014159	ACC	2	6	50511	50516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141956
1266	NC_014159	CCG	2	6	50520	50525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1267	NC_014159	GCT	2	6	50530	50535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1268	NC_014159	CCCCTC	2	12	50594	50605	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	296141956
1269	NC_014159	CCG	2	6	50638	50643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1270	NC_014159	CCGC	2	8	50737	50744	0 %	0 %	25 %	75 %	296141956
1271	NC_014159	CG	3	6	50754	50759	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
1272	NC_014159	CTG	2	6	50816	50821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1273	NC_014159	CG	3	6	50979	50984	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
1274	NC_014159	ACC	2	6	51025	51030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1275	NC_014159	AGAT	2	8	51035	51042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_014159	ACA	2	6	51098	51103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1277	NC_014159	GAC	2	6	51241	51246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1278	NC_014159	CCGCC	2	10	51309	51318	0 %	0 %	20 %	80 %	296141957
1279	NC_014159	CGC	2	6	51362	51367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141957
1280	NC_014159	CG	3	6	51372	51377	0 %	0 %	50 %	50 %	296141957
1281	NC_014159	ATGG	2	8	51429	51436	25 %	25 %	50 %	0 %	296141957
1282	NC_014159	GCC	2	6	51454	51459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141957
1283	NC_014159	TCA	2	6	51478	51483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141957
1284	NC_014159	GCGGT	2	10	51725	51734	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1285	NC_014159	CGT	2	6	51806	51811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1286	NC_014159	TCACA	2	10	51858	51867	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1287	NC_014159	CATG	2	8	51902	51909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1288	NC_014159	GCACT	2	10	51955	51964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1289	NC_014159	GCG	2	6	52042	52047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141958
1290	NC_014159	CGCA	2	8	52090	52097	25 %	0 %	25 %	50 %	296141958
1291	NC_014159	CTC	2	6	52110	52115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141958
1292	NC_014159	GTCGAG	2	12	52158	52169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296141958
1293	NC_014159	CCT	2	6	52193	52198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141958
1294	NC_014159	GGCTC	2	10	52215	52224	0 %	20 %	40 %	40 %	296141958
1295	NC_014159	CCT	2	6	52262	52267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141958
1296	NC_014159	ACG	2	6	52366	52371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141958
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1302	NC_014159	GGT	2	6	52635	52640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141958
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1315	NC_014159	ACTGC	2	10	53179	53188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1316	NC_014159	CT	3	6	53215	53220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1317	NC_014159	CCG	2	6	53222	53227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1318	NC_014159	CAG	2	6	53248	53253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1319	NC_014159	CGC	2	6	53256	53261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1320	NC_014159	ATC	2	6	53263	53268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1321	NC_014159	CGG	2	6	53295	53300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1322	NC_014159	TTA	2	6	53385	53390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1323	NC_014159	TGGTT	2	10	53395	53404	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1324	NC_014159	GCC	2	6	53515	53520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1325	NC_014159	GCC	3	9	53522	53530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1326	NC_014159	GCG	2	6	53531	53536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1328	NC_014159	GCC	2	6	53631	53636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1329	NC_014159	CGG	2	6	53683	53688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1330	NC_014159	GAC	2	6	53710	53715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141960
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1332	NC_014159	GCA	2	6	53744	53749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1333	NC_014159	GCC	2	6	53772	53777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
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1374	NC_014159	CGCA	2	8	55020	55027	25 %	0 %	25 %	50 %	296141961
1375	NC_014159	CGC	2	6	55029	55034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141961
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1377	NC_014159	CCGC	2	8	55076	55083	0 %	0 %	25 %	75 %	296141961
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1379	NC_014159	CGG	3	9	55134	55142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141961
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