MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 1006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014154	GCA	2	6	23371	23376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014154	CGT	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014154	CAT	2	6	23514	23519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014154	ACT	2	6	23569	23574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_014154	GCA	2	6	23579	23584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014154	GTCAC	2	10	23590	23599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
507	NC_014154	TGC	2	6	23653	23658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014154	GGT	2	6	23683	23688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014154	GTG	2	6	23693	23698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014154	GTCG	2	8	23701	23708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_014154	AAG	2	6	23741	23746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014154	GAC	2	6	23807	23812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014154	AAG	2	6	23816	23821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014154	GTG	2	6	23828	23833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014154	GC	3	6	23854	23859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_014154	GAT	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014154	CCA	2	6	23889	23894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_014154	GTG	2	6	23921	23926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014154	AGC	2	6	23976	23981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014154	TTCG	2	8	23989	23996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_014154	CAA	2	6	24046	24051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014154	GGA	2	6	24073	24078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014154	CCGA	2	8	24105	24112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_014154	CG	3	6	24128	24133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_014154	CTG	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014154	AAG	2	6	24161	24166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014154	TGA	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014154	ACG	2	6	24225	24230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014154	GCACA	2	10	24245	24254	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
530	NC_014154	TCA	2	6	24255	24260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014154	AGA	2	6	24333	24338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014154	AGA	2	6	24450	24455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014154	TCG	2	6	24459	24464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_014154	TTC	2	6	24479	24484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014154	GCT	2	6	24572	24577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_014154	CGGCAC	2	12	24640	24651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
537	NC_014154	TGC	2	6	24741	24746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014154	CTA	2	6	24751	24756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_014154	GAGC	2	8	24853	24860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
540	NC_014154	CGA	2	6	24877	24882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_014154	GCGG	2	8	24904	24911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
542	NC_014154	GC	3	6	24923	24928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_014154	ACA	2	6	24987	24992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014154	GCG	2	6	25043	25048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014154	A	6	6	25274	25279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014154	GTA	2	6	25311	25316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014154	TTG	2	6	25331	25336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014154	TCGAT	2	10	25367	25376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
549	NC_014154	CG	3	6	25401	25406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_014154	CAC	2	6	25481	25486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_014154	CCT	2	6	25653	25658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_014154	GCTC	2	8	25692	25699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
553	NC_014154	TGG	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014154	TCA	2	6	25755	25760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014154	CCA	2	6	25899	25904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_014154	GCCGGG	2	12	25948	25959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014154	CTG	2	6	26012	26017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014154	CGG	2	6	26020	26025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_014154	GGTCA	2	10	26069	26078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
560	NC_014154	CGC	2	6	26092	26097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_014154	ACG	2	6	26124	26129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014154	CATC	2	8	26178	26185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_014154	TCT	3	9	26199	26207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014154	AAG	2	6	26264	26269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014154	TGC	2	6	26271	26276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014154	GCG	2	6	26333	26338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014154	AGA	2	6	26380	26385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014154	CTA	2	6	26419	26424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_014154	GCC	2	6	26588	26593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_014154	GTG	2	6	26632	26637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014154	TCG	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_014154	GCCT	2	8	26724	26731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NC_014154	GGA	2	6	26802	26807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014154	GC	3	6	26847	26852	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
575	NC_014154	GGC	2	6	26915	26920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137633
576	NC_014154	GCT	2	6	26932	26937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137633
577	NC_014154	CG	3	6	27030	27035	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
578	NC_014154	GCA	2	6	27118	27123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
579	NC_014154	TCT	2	6	27151	27156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137633
580	NC_014154	A	6	6	27274	27279	100 %	0 %	0 %	0 %	296137633
581	NC_014154	TG	3	6	27292	27297	0 %	50 %	50 %	0 %	296137633
582	NC_014154	TGC	2	6	27381	27386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137633
583	NC_014154	GAT	2	6	27395	27400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137633
584	NC_014154	TCA	2	6	27429	27434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137633
585	NC_014154	GGA	2	6	27457	27462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137633
586	NC_014154	AGC	2	6	27468	27473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
587	NC_014154	TCA	2	6	27489	27494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137633
588	NC_014154	CAG	2	6	27569	27574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
589	NC_014154	GGCG	2	8	27613	27620	0 %	0 %	75 %	25 %	296137633
590	NC_014154	ACC	2	6	27654	27659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137633
591	NC_014154	GGC	2	6	27674	27679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137633
592	NC_014154	CCA	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137633
593	NC_014154	ATC	2	6	27773	27778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137633
594	NC_014154	AGT	2	6	27820	27825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137633
595	NC_014154	GCC	2	6	27877	27882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137633
596	NC_014154	ATGG	2	8	27896	27903	25 %	25 %	50 %	0 %	296137633
597	NC_014154	CG	3	6	27924	27929	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
598	NC_014154	TGC	2	6	27933	27938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137633
599	NC_014154	CTTC	2	8	28018	28025	0 %	50 %	0 %	50 %	296137633
600	NC_014154	CAG	2	6	28085	28090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
601	NC_014154	CGA	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
602	NC_014154	AGC	2	6	28161	28166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
603	NC_014154	TGA	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137633
604	NC_014154	CG	4	8	28222	28229	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
605	NC_014154	GA	3	6	28233	28238	50 %	0 %	50 %	0 %	296137633
606	NC_014154	TCA	2	6	28320	28325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137633
607	NC_014154	ACG	2	6	28379	28384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
608	NC_014154	TGGA	2	8	28386	28393	25 %	25 %	50 %	0 %	296137633
609	NC_014154	CTTG	2	8	28435	28442	0 %	50 %	25 %	25 %	296137633
610	NC_014154	CAC	2	6	28462	28467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137633
611	NC_014154	GCA	2	6	28483	28488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
612	NC_014154	CTG	2	6	28545	28550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137633
613	NC_014154	AGG	2	6	28563	28568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137633
614	NC_014154	TGCG	2	8	28704	28711	0 %	25 %	50 %	25 %	296137633
615	NC_014154	GAA	2	6	28741	28746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137633
616	NC_014154	TGA	2	6	28812	28817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137633
617	NC_014154	CTG	2	6	28823	28828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137633
618	NC_014154	TGG	2	6	28965	28970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137633
619	NC_014154	GTC	2	6	28993	28998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137633
620	NC_014154	TGGAGC	2	12	29022	29033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296137633
621	NC_014154	CAA	2	6	29095	29100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137633
622	NC_014154	CAG	2	6	29114	29119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137633
623	NC_014154	GGA	2	6	29182	29187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137633
624	NC_014154	GATCG	2	10	29213	29222	20 %	20 %	40 %	20 %	296137633
625	NC_014154	GAGG	2	8	29233	29240	25 %	0 %	75 %	0 %	296137633
626	NC_014154	AC	3	6	29270	29275	50 %	0 %	0 %	50 %	296137633
627	NC_014154	GGCG	2	8	29417	29424	0 %	0 %	75 %	25 %	296137633
628	NC_014154	TGCCC	2	10	29465	29474	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
629	NC_014154	GCG	2	6	29507	29512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014154	TCC	2	6	29516	29521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_014154	GGC	2	6	29559	29564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014154	TTTC	2	8	29565	29572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_014154	GTC	2	6	29640	29645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137634
634	NC_014154	AGG	2	6	29659	29664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137634
635	NC_014154	CGC	2	6	29669	29674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137634
636	NC_014154	GGC	2	6	29734	29739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137634
637	NC_014154	CGT	2	6	29747	29752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137634
638	NC_014154	CAG	2	6	29760	29765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137634
639	NC_014154	CCGG	2	8	29799	29806	0 %	0 %	50 %	50 %	296137634
640	NC_014154	GGCT	2	8	29886	29893	0 %	25 %	50 %	25 %	296137634
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642	NC_014154	TGA	2	6	29949	29954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137635
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648	NC_014154	CGC	2	6	30202	30207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_014154	C	8	8	30232	30239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
650	NC_014154	GTAT	2	8	30256	30263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
651	NC_014154	TAGG	2	8	30265	30272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
652	NC_014154	TA	5	10	30273	30282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_014154	CCTA	2	8	30283	30290	25 %	25 %	0 %	50 %	296137636
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658	NC_014154	TCGC	2	8	30480	30487	0 %	25 %	25 %	50 %	296137636
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675	NC_014154	GATCC	2	10	31277	31286	20 %	20 %	20 %	40 %	296137637
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682	NC_014154	TA	3	6	31411	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_014154	GCCA	2	8	31456	31463	25 %	0 %	25 %	50 %	296137638
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703	NC_014154	GGTA	2	8	32272	32279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
704	NC_014154	TA	5	10	32278	32287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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735	NC_014154	TA	5	10	33355	33364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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746	NC_014154	GA	3	6	33804	33809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
747	NC_014154	GACT	2	8	33954	33961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
748	NC_014154	GC	3	6	33991	33996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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750	NC_014154	GTT	2	6	34143	34148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137643
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753	NC_014154	GCTG	2	8	34236	34243	0 %	25 %	50 %	25 %	296137643
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759	NC_014154	TGG	2	6	34496	34501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137643
760	NC_014154	CGA	2	6	34600	34605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137643
761	NC_014154	GAGCGC	2	12	34676	34687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137643
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764	NC_014154	CGC	3	9	34909	34917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137643
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795	NC_014154	GTAG	2	8	36195	36202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
796	NC_014154	TA	5	10	36204	36213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
797	NC_014154	TG	3	6	36239	36244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
798	NC_014154	TGG	2	6	36271	36276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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