MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 2170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	CTGAT	2	10	279	288	20 %	40 %	20 %	20 %	296131551
2	NC_014152	TATCT	2	10	1728	1737	20 %	60 %	0 %	20 %	296131552
3	NC_014152	AATTG	2	10	2909	2918	40 %	40 %	20 %	0 %	296131553
4	NC_014152	ATTAA	2	10	3300	3309	60 %	40 %	0 %	0 %	296131554
5	NC_014152	TTTTC	2	10	4328	4337	0 %	80 %	0 %	20 %	296131555
6	NC_014152	AGGCA	2	10	5025	5034	40 %	0 %	40 %	20 %	296131557
7	NC_014152	GAAAA	2	10	5600	5609	80 %	0 %	20 %	0 %	296131557
8	NC_014152	TCGAC	2	10	5895	5904	20 %	20 %	20 %	40 %	296131557
9	NC_014152	TCTTT	2	10	7153	7162	0 %	80 %	0 %	20 %	296131558
10	NC_014152	ATGAA	2	10	8486	8495	60 %	20 %	20 %	0 %	296131559
11	NC_014152	AAGGC	2	10	10436	10445	40 %	0 %	40 %	20 %	296131559
12	NC_014152	GGGCA	2	10	10479	10488	20 %	0 %	60 %	20 %	296131559
13	NC_014152	ATGCC	2	10	14390	14399	20 %	20 %	20 %	40 %	296131562
14	NC_014152	AGGAG	2	10	14495	14504	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014152	ATTTA	2	10	18045	18054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014152	AAAAT	2	10	18861	18870	80 %	20 %	0 %	0 %	296131565
17	NC_014152	CTCGA	2	10	18968	18977	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014152	TTTTA	2	10	21259	21268	20 %	80 %	0 %	0 %	296131568
19	NC_014152	AAGGT	2	10	23568	23577	40 %	20 %	40 %	0 %	296131569
20	NC_014152	ATACT	2	10	24092	24101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014152	AGGGG	2	10	26853	26862	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014152	TTGAT	2	10	30891	30900	20 %	60 %	20 %	0 %	296131575
23	NC_014152	TCTTT	2	10	32597	32606	0 %	80 %	0 %	20 %	296131578
24	NC_014152	GCTTT	2	10	34408	34417	0 %	60 %	20 %	20 %	296131579
25	NC_014152	AGGGA	2	10	36778	36787	40 %	0 %	60 %	0 %	296131580
26	NC_014152	GGATG	2	10	37590	37599	20 %	20 %	60 %	0 %	296131581
27	NC_014152	AATTA	2	10	39459	39468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014152	TATAT	2	10	42484	42493	40 %	60 %	0 %	0 %	296131585
29	NC_014152	AAAAG	2	10	43110	43119	80 %	0 %	20 %	0 %	296131586
30	NC_014152	ATTTA	2	10	44839	44848	40 %	60 %	0 %	0 %	296131587
31	NC_014152	TCTGG	2	10	48586	48595	0 %	40 %	40 %	20 %	296131593
32	NC_014152	ACGGC	2	10	48711	48720	20 %	0 %	40 %	40 %	296131593
33	NC_014152	CAGCT	2	10	52194	52203	20 %	20 %	20 %	40 %	296131597
34	NC_014152	AACAG	2	10	52339	52348	60 %	0 %	20 %	20 %	296131598
35	NC_014152	CAGGC	2	10	54344	54353	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014152	AAAGA	2	10	54713	54722	80 %	0 %	20 %	0 %	296131600
37	NC_014152	GCAAA	2	10	58740	58749	60 %	0 %	20 %	20 %	296131605
38	NC_014152	GTTAA	2	10	60846	60855	40 %	40 %	20 %	0 %	296131606
39	NC_014152	CAGTT	2	10	61413	61422	20 %	40 %	20 %	20 %	296131607
40	NC_014152	CCCGG	2	10	62336	62345	0 %	0 %	40 %	60 %	296131607
41	NC_014152	AAAGA	2	10	62882	62891	80 %	0 %	20 %	0 %	296131608
42	NC_014152	CCGGC	2	10	65762	65771	0 %	0 %	40 %	60 %	296131611
43	NC_014152	TTATC	2	10	65945	65954	20 %	60 %	0 %	20 %	296131611
44	NC_014152	TGGTT	2	10	67555	67564	0 %	60 %	40 %	0 %	296131613
45	NC_014152	TGGAT	2	10	68156	68165	20 %	40 %	40 %	0 %	296131614
46	NC_014152	GGCCG	2	10	69739	69748	0 %	0 %	60 %	40 %	296131615
47	NC_014152	GGTGA	2	10	69867	69876	20 %	20 %	60 %	0 %	296131615
48	NC_014152	GCAAA	2	10	74192	74201	60 %	0 %	20 %	20 %	296131620
49	NC_014152	TAAAA	2	10	74410	74419	80 %	20 %	0 %	0 %	296131620
50	NC_014152	GGCCG	2	10	75443	75452	0 %	0 %	60 %	40 %	296131621
51	NC_014152	GCCAC	2	10	75961	75970	20 %	0 %	20 %	60 %	296131621
52	NC_014152	TTAAC	2	10	76818	76827	40 %	40 %	0 %	20 %	296131622
53	NC_014152	TAAAT	2	10	81430	81439	60 %	40 %	0 %	0 %	296131629
54	NC_014152	TAATA	2	10	81679	81688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014152	AGCTG	2	10	82017	82026	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014152	AGGAG	2	10	83057	83066	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014152	TCGTG	2	10	83476	83485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014152	AGTTA	2	10	84297	84306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014152	GGGAG	2	10	85622	85631	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014152	AGAGG	2	10	87020	87029	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014152	GACAG	2	10	87317	87326	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014152	TTTCA	2	10	91075	91084	20 %	60 %	0 %	20 %	296131634
63	NC_014152	GCCAG	2	10	91392	91401	20 %	0 %	40 %	40 %	296131634
64	NC_014152	ACCGA	2	10	92655	92664	40 %	0 %	20 %	40 %	296131635
65	NC_014152	GTGAT	2	10	94275	94284	20 %	40 %	40 %	0 %	296131637
66	NC_014152	GGGTT	2	10	95079	95088	0 %	40 %	60 %	0 %	296131638
67	NC_014152	TGACC	2	10	95378	95387	20 %	20 %	20 %	40 %	296131638
68	NC_014152	CGACC	2	10	97869	97878	20 %	0 %	20 %	60 %	296131642
69	NC_014152	AGGCA	2	10	98622	98631	40 %	0 %	40 %	20 %	296131643
70	NC_014152	GAAAA	2	10	99197	99206	80 %	0 %	20 %	0 %	296131643
71	NC_014152	TCGAC	2	10	99492	99501	20 %	20 %	20 %	40 %	296131643
72	NC_014152	TTTAA	2	10	103501	103510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014152	ATAAA	2	10	104109	104118	80 %	20 %	0 %	0 %	296131646
74	NC_014152	ATTTA	2	10	104138	104147	40 %	60 %	0 %	0 %	296131647
75	NC_014152	TAAAA	2	10	104471	104480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014152	GATAG	2	10	104934	104943	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014152	ACAGG	2	10	113824	113833	40 %	0 %	40 %	20 %	296131655
78	NC_014152	TTGGT	2	10	113969	113978	0 %	60 %	40 %	0 %	296131655
79	NC_014152	CCATG	2	10	116168	116177	20 %	20 %	20 %	40 %	296131658
80	NC_014152	CAAGC	2	10	117435	117444	40 %	0 %	20 %	40 %	296131658
81	NC_014152	GAAAA	2	10	120533	120542	80 %	0 %	20 %	0 %	296131662
82	NC_014152	GAAAA	2	10	124343	124352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014152	GACCG	2	10	126290	126299	20 %	0 %	40 %	40 %	296131667
84	NC_014152	CCAAT	2	10	127927	127936	40 %	20 %	0 %	40 %	296131668
85	NC_014152	GGCCA	2	10	130151	130160	20 %	0 %	40 %	40 %	296131670
86	NC_014152	TTGAT	2	10	133437	133446	20 %	60 %	20 %	0 %	296131672
87	NC_014152	GGTGG	2	10	134179	134188	0 %	20 %	80 %	0 %	296131673
88	NC_014152	TTTTG	2	10	134583	134592	0 %	80 %	20 %	0 %	296131673
89	NC_014152	CAGGC	2	10	135521	135530	20 %	0 %	40 %	40 %	296131673
90	NC_014152	CAGCG	2	10	137052	137061	20 %	0 %	40 %	40 %	296131674
91	NC_014152	GGAGA	2	10	137182	137191	40 %	0 %	60 %	0 %	296131675
92	NC_014152	CCCAT	2	10	139126	139135	20 %	20 %	0 %	60 %	296131677
93	NC_014152	AAAGT	2	10	142299	142308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014152	GCTTT	2	10	142864	142873	0 %	60 %	20 %	20 %	296131680
95	NC_014152	AATTA	2	10	143335	143344	60 %	40 %	0 %	0 %	296131681
96	NC_014152	TTAAT	2	10	143995	144004	40 %	60 %	0 %	0 %	296131683
97	NC_014152	ACGGG	2	10	144656	144665	20 %	0 %	60 %	20 %	296131684
98	NC_014152	TGGGC	2	10	147917	147926	0 %	20 %	60 %	20 %	296131686
99	NC_014152	CAGTC	2	10	149683	149692	20 %	20 %	20 %	40 %	296131688
100	NC_014152	TGGGT	2	10	149923	149932	0 %	40 %	60 %	0 %	296131688
101	NC_014152	TACTT	2	10	153747	153756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014152	TCCGG	2	10	156060	156069	0 %	20 %	40 %	40 %	296131694
103	NC_014152	GGACA	2	10	156362	156371	40 %	0 %	40 %	20 %	296131694
104	NC_014152	ACCTT	2	10	156606	156615	20 %	40 %	0 %	40 %	296131695
105	NC_014152	ACAAT	2	10	158304	158313	60 %	20 %	0 %	20 %	296131696
106	NC_014152	TTCAT	2	10	161252	161261	20 %	60 %	0 %	20 %	296131698
107	NC_014152	CCTGA	2	10	164344	164353	20 %	20 %	20 %	40 %	296131698
108	NC_014152	TAACA	2	10	166233	166242	60 %	20 %	0 %	20 %	296131699
109	NC_014152	AACTG	2	10	167610	167619	40 %	20 %	20 %	20 %	296131701
110	NC_014152	GGGTT	2	10	168052	168061	0 %	40 %	60 %	0 %	296131702
111	NC_014152	TACAA	2	10	168707	168716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014152	ACCGT	2	10	170034	170043	20 %	20 %	20 %	40 %	296131703
113	NC_014152	ATTAC	2	10	171988	171997	40 %	40 %	0 %	20 %	296131705
114	NC_014152	ACCTT	2	10	174147	174156	20 %	40 %	0 %	40 %	296131707
115	NC_014152	GTTAA	2	10	176009	176018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014152	ACCTG	2	10	177367	177376	20 %	20 %	20 %	40 %	296131710
117	NC_014152	AAGTG	2	10	177817	177826	40 %	20 %	40 %	0 %	296131711
118	NC_014152	CCAAG	2	10	181793	181802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014152	ATTTA	2	10	181848	181857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014152	TTTTC	2	10	181914	181923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014152	CCGTT	2	10	182603	182612	0 %	40 %	20 %	40 %	296131716
122	NC_014152	ACTGG	2	10	184116	184125	20 %	20 %	40 %	20 %	296131717
123	NC_014152	AACCG	2	10	185080	185089	40 %	0 %	20 %	40 %	296131718
124	NC_014152	CGGTT	2	10	185454	185463	0 %	40 %	40 %	20 %	296131719
125	NC_014152	CCGGA	2	10	185637	185646	20 %	0 %	40 %	40 %	296131719
126	NC_014152	CATTA	2	10	186141	186150	40 %	40 %	0 %	20 %	296131720
127	NC_014152	CCTGG	2	10	186173	186182	0 %	20 %	40 %	40 %	296131720
128	NC_014152	TTTTA	2	10	186222	186231	20 %	80 %	0 %	0 %	296131720
129	NC_014152	AATTC	2	10	186467	186476	40 %	40 %	0 %	20 %	296131721
130	NC_014152	AAATT	2	10	187835	187844	60 %	40 %	0 %	0 %	296131721
131	NC_014152	ATAAA	2	10	194498	194507	80 %	20 %	0 %	0 %	296131725
132	NC_014152	AATAA	2	10	197069	197078	80 %	20 %	0 %	0 %	296131727
133	NC_014152	AGGCA	2	10	202189	202198	40 %	0 %	40 %	20 %	296131735
134	NC_014152	GAAAA	2	10	202764	202773	80 %	0 %	20 %	0 %	296131735
135	NC_014152	TCGAC	2	10	203059	203068	20 %	20 %	20 %	40 %	296131735
136	NC_014152	AGGGG	2	10	204413	204422	20 %	0 %	80 %	0 %	296131737
137	NC_014152	CTTTT	2	10	204734	204743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014152	AATTT	2	10	209037	209046	40 %	60 %	0 %	0 %	296131740
139	NC_014152	GATTC	2	10	210541	210550	20 %	40 %	20 %	20 %	296131743
140	NC_014152	TCTGT	2	10	210996	211005	0 %	60 %	20 %	20 %	296131744
141	NC_014152	GAAAG	2	10	217835	217844	60 %	0 %	40 %	0 %	296131748
142	NC_014152	TTTAC	2	10	218145	218154	20 %	60 %	0 %	20 %	296131748
143	NC_014152	AGTCA	2	10	218586	218595	40 %	20 %	20 %	20 %	296131749
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146	NC_014152	GGGTT	2	10	220770	220779	0 %	40 %	60 %	0 %	296131750
147	NC_014152	CGGCC	2	10	224603	224612	0 %	0 %	40 %	60 %	296131755
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149	NC_014152	AAATA	2	10	228245	228254	80 %	20 %	0 %	0 %	296131759
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151	NC_014152	GGTTT	2	10	229460	229469	0 %	60 %	40 %	0 %	296131760
152	NC_014152	CCCTG	2	10	229817	229826	0 %	20 %	20 %	60 %	296131760
153	NC_014152	AGCGG	2	10	230057	230066	20 %	0 %	60 %	20 %	296131761
154	NC_014152	TTATA	2	10	236550	236559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014152	AGCTG	2	10	243905	243914	20 %	20 %	40 %	20 %	296131773
156	NC_014152	AGGAG	2	10	244945	244954	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014152	TCGTG	2	10	245364	245373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_014152	AGTTA	2	10	246185	246194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014152	GGGAG	2	10	247338	247347	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014152	AGAGG	2	10	248736	248745	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014152	GACAG	2	10	249033	249042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_014152	TGGAA	2	10	251797	251806	40 %	20 %	40 %	0 %	296131776
163	NC_014152	TTTGT	2	10	253822	253831	0 %	80 %	20 %	0 %	296131777
164	NC_014152	GCAAG	2	10	254927	254936	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_014152	TGTTT	2	10	255755	255764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014152	ACTCA	2	10	256016	256025	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
167	NC_014152	TTCAA	2	10	256289	256298	40 %	40 %	0 %	20 %	296131780
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174	NC_014152	GAAGA	2	10	263874	263883	60 %	0 %	40 %	0 %	296131785
175	NC_014152	GAAGA	2	10	265471	265480	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014152	TGAGT	2	10	267256	267265	20 %	40 %	40 %	0 %	296131787
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181	NC_014152	GTTCC	2	10	277861	277870	0 %	40 %	20 %	40 %	296131799
182	NC_014152	ATTTT	2	10	279974	279983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014152	GAACG	2	10	280874	280883	40 %	0 %	40 %	20 %	296131803
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186	NC_014152	TGCGT	2	10	286326	286335	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_014152	CCTCA	2	10	286940	286949	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_014152	TCAGG	2	10	290396	290405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_014152	GGAAA	2	10	290952	290961	60 %	0 %	40 %	0 %	296131810
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195	NC_014152	CGGTA	2	10	293053	293062	20 %	20 %	40 %	20 %	296131812
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204	NC_014152	TTGGG	2	10	308592	308601	0 %	40 %	60 %	0 %	296131828
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213	NC_014152	TTAGG	2	10	326519	326528	20 %	40 %	40 %	0 %	296131853
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215	NC_014152	TGAAA	2	10	329829	329838	60 %	20 %	20 %	0 %	296131860
216	NC_014152	ATCAA	2	10	330450	330459	60 %	20 %	0 %	20 %	296131862
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223	NC_014152	AAGGA	2	10	337132	337141	60 %	0 %	40 %	0 %	296131872
224	NC_014152	AATAG	2	10	337323	337332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
225	NC_014152	ATTAG	2	10	337333	337342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
226	NC_014152	GTTAT	2	10	337417	337426	20 %	60 %	20 %	0 %	296131873
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232	NC_014152	TATGG	2	10	341908	341917	20 %	40 %	40 %	0 %	296131877
233	NC_014152	CTGCG	2	10	341995	342004	0 %	20 %	40 %	40 %	296131877
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236	NC_014152	GGCAG	2	10	346091	346100	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
237	NC_014152	TCAAG	2	10	346453	346462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
238	NC_014152	AACCC	2	10	347233	347242	40 %	0 %	0 %	60 %	296131883
239	NC_014152	CTTAC	2	10	348150	348159	20 %	40 %	0 %	40 %	296131884
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243	NC_014152	GCTTT	2	10	352540	352549	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
244	NC_014152	TACCC	2	10	352962	352971	20 %	20 %	0 %	60 %	296131888
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247	NC_014152	GCCTT	2	10	354104	354113	0 %	40 %	20 %	40 %	296131890
248	NC_014152	GCCCA	2	10	355548	355557	20 %	0 %	20 %	60 %	296131891
249	NC_014152	CCTTT	2	10	356285	356294	0 %	60 %	0 %	40 %	296131891
250	NC_014152	AAAAG	2	10	358212	358221	80 %	0 %	20 %	0 %	296131892
251	NC_014152	GGGCG	2	10	364099	364108	0 %	0 %	80 %	20 %	296131897
252	NC_014152	ACTGG	2	10	364402	364411	20 %	20 %	40 %	20 %	296131897
253	NC_014152	CAATA	2	10	367002	367011	60 %	20 %	0 %	20 %	296131899
254	NC_014152	GGGGT	2	10	368619	368628	0 %	20 %	80 %	0 %	296131900
255	NC_014152	ACCAA	2	10	373872	373881	60 %	0 %	0 %	40 %	296131904
256	NC_014152	GAAAA	2	10	375219	375228	80 %	0 %	20 %	0 %	296131906
257	NC_014152	TTAAA	2	10	376643	376652	60 %	40 %	0 %	0 %	296131907
258	NC_014152	CGGTC	2	10	377193	377202	0 %	20 %	40 %	40 %	296131907
259	NC_014152	TAGCT	2	10	377721	377730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
260	NC_014152	GTTCC	2	10	379249	379258	0 %	40 %	20 %	40 %	296131908
261	NC_014152	TCAAG	2	10	380065	380074	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_014152	TACCG	2	10	382586	382595	20 %	20 %	20 %	40 %	296131910
263	NC_014152	TTTTG	2	10	385649	385658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014152	CAGTG	2	10	386131	386140	20 %	20 %	40 %	20 %	296131912
265	NC_014152	TATAA	2	10	388569	388578	60 %	40 %	0 %	0 %	296131915
266	NC_014152	TTTTG	2	10	388749	388758	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014152	GGTTT	2	10	389339	389348	0 %	60 %	40 %	0 %	296131916
268	NC_014152	GGTTT	2	10	396313	396322	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014152	CTTTG	2	10	396958	396967	0 %	60 %	20 %	20 %	296131921
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403	NC_014152	TTAAA	2	10	582294	582303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_014152	GGGAG	2	10	582447	582456	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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