MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014152	AATT	2	8	196500	196507	50 %	50 %	0 %	0 %	296131727
4002	NC_014152	ATA	2	6	196680	196685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131727
4003	NC_014152	GCA	2	6	196741	196746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4004	NC_014152	AGG	2	6	196764	196769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131727
4005	NC_014152	ATTA	2	8	196798	196805	50 %	50 %	0 %	0 %	296131727
4006	NC_014152	GGC	2	6	196855	196860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131727
4007	NC_014152	CGA	2	6	196930	196935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4008	NC_014152	GC	3	6	196947	196952	0 %	0 %	50 %	50 %	296131727
4009	NC_014152	A	6	6	196974	196979	100 %	0 %	0 %	0 %	296131727
4010	NC_014152	AAG	2	6	196983	196988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131727
4011	NC_014152	ACT	2	6	197021	197026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131727
4012	NC_014152	AATAA	2	10	197069	197078	80 %	20 %	0 %	0 %	296131727
4013	NC_014152	GCA	2	6	197098	197103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4014	NC_014152	AAT	2	6	197113	197118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131727
4015	NC_014152	TGA	2	6	197128	197133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131727
4016	NC_014152	AACC	2	8	197146	197153	50 %	0 %	0 %	50 %	296131727
4017	NC_014152	GGC	2	6	197179	197184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131727
4018	NC_014152	CGGG	2	8	197186	197193	0 %	0 %	75 %	25 %	296131727
4019	NC_014152	CGA	2	6	197224	197229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4020	NC_014152	AAG	2	6	197248	197253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131727
4021	NC_014152	CGG	2	6	197307	197312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131727
4022	NC_014152	GTAGAA	2	12	197342	197353	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296131727
4023	NC_014152	CAG	2	6	197426	197431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4024	NC_014152	A	6	6	197436	197441	100 %	0 %	0 %	0 %	296131727
4025	NC_014152	CAG	2	6	197470	197475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4026	NC_014152	TAA	2	6	197497	197502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131727
4027	NC_014152	GAG	2	6	197519	197524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131727
4028	NC_014152	AGA	2	6	197602	197607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131727
4029	NC_014152	GCT	2	6	197615	197620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131727
4030	NC_014152	GAA	2	6	197645	197650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131727
4031	NC_014152	GAT	2	6	197759	197764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014152	GCGG	2	8	197841	197848	0 %	0 %	75 %	25 %	296131728
4033	NC_014152	AACG	2	8	197858	197865	50 %	0 %	25 %	25 %	296131728
4034	NC_014152	AAT	2	6	198016	198021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131728
4035	NC_014152	ATACTG	2	12	198121	198132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4036	NC_014152	A	6	6	198161	198166	100 %	0 %	0 %	0 %	296131729
4037	NC_014152	T	6	6	198204	198209	0 %	100 %	0 %	0 %	296131729
4038	NC_014152	A	6	6	198230	198235	100 %	0 %	0 %	0 %	296131729
4039	NC_014152	A	6	6	198248	198253	100 %	0 %	0 %	0 %	296131729
4040	NC_014152	TA	4	8	198279	198286	50 %	50 %	0 %	0 %	296131729
4041	NC_014152	AGA	2	6	198319	198324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131729
4042	NC_014152	AT	3	6	198325	198330	50 %	50 %	0 %	0 %	296131729
4043	NC_014152	GCA	2	6	198448	198453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131729
4044	NC_014152	GGA	2	6	198478	198483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131729
4045	NC_014152	ATG	2	6	198495	198500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131729
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4047	NC_014152	AT	3	6	198574	198579	50 %	50 %	0 %	0 %	296131729
4048	NC_014152	CCG	2	6	198621	198626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131729
4049	NC_014152	A	6	6	198651	198656	100 %	0 %	0 %	0 %	296131729
4050	NC_014152	AT	3	6	198661	198666	50 %	50 %	0 %	0 %	296131729
4051	NC_014152	AAAT	2	8	198712	198719	75 %	25 %	0 %	0 %	296131729
4052	NC_014152	G	6	6	198753	198758	0 %	0 %	100 %	0 %	296131729
4053	NC_014152	AAG	2	6	198765	198770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131729
4054	NC_014152	CAG	2	6	198799	198804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131729
4055	NC_014152	GGGC	2	8	198836	198843	0 %	0 %	75 %	25 %	296131729
4056	NC_014152	TC	3	6	198848	198853	0 %	50 %	0 %	50 %	296131729
4057	NC_014152	TAA	2	6	198952	198957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131729
4058	NC_014152	T	6	6	199150	199155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014152	CGC	2	6	199171	199176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_014152	AGT	2	6	199191	199196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_014152	GAT	2	6	199259	199264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131730
4062	NC_014152	GAA	3	9	199317	199325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131730
4063	NC_014152	CTG	3	9	199353	199361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131730
4064	NC_014152	GAAG	2	8	199401	199408	50 %	0 %	50 %	0 %	296131730
4065	NC_014152	GAA	2	6	199449	199454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131730
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4074	NC_014152	AGT	2	6	199943	199948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131731
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4078	NC_014152	TA	3	6	200086	200091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014152	CAGG	2	8	200094	200101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_014152	ATAA	2	8	200194	200201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_014152	GTT	2	6	200318	200323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131732
4082	NC_014152	AGT	2	6	200381	200386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131732
4083	NC_014152	GTTATT	2	12	200435	200446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296131732
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4090	NC_014152	TGG	2	6	200595	200600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131733
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4093	NC_014152	GAG	2	6	200734	200739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131733
4094	NC_014152	A	6	6	200743	200748	100 %	0 %	0 %	0 %	296131733
4095	NC_014152	TAA	2	6	200754	200759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131733
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4097	NC_014152	A	6	6	200883	200888	100 %	0 %	0 %	0 %	296131733
4098	NC_014152	CTA	2	6	200944	200949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_014152	TG	3	6	200952	200957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014152	T	6	6	200981	200986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014152	TGT	2	6	200990	200995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014152	AGG	2	6	201005	201010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014152	GGA	2	6	201101	201106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131734
4104	NC_014152	AAAGAC	2	12	201173	201184	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296131734
4105	NC_014152	GCA	2	6	201331	201336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131734
4106	NC_014152	AGA	2	6	201380	201385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131734
4107	NC_014152	AAG	2	6	201390	201395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131734
4108	NC_014152	TATT	2	8	201416	201423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014152	TTA	2	6	201427	201432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014152	TTCC	2	8	201445	201452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_014152	T	6	6	201454	201459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014152	ATT	2	6	201540	201545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014152	TAA	2	6	201699	201704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014152	AAG	2	6	201723	201728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014152	AG	3	6	201732	201737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014152	AAAT	2	8	201760	201767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014152	A	6	6	201776	201781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014152	GTT	2	6	201797	201802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014152	TAG	2	6	201868	201873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014152	TA	3	6	201886	201891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014152	AGG	2	6	201901	201906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014152	TAT	2	6	201922	201927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131735
4123	NC_014152	GAAA	2	8	201952	201959	75 %	0 %	25 %	0 %	296131735
4124	NC_014152	GAA	2	6	201962	201967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131735
4125	NC_014152	GAA	2	6	202016	202021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131735
4126	NC_014152	ATA	2	6	202119	202124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131735
4127	NC_014152	CGG	2	6	202139	202144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131735
4128	NC_014152	AGGCA	2	10	202189	202198	40 %	0 %	40 %	20 %	296131735
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4130	NC_014152	GAA	2	6	202253	202258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131735
4131	NC_014152	GAG	2	6	202286	202291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131735
4132	NC_014152	A	6	6	202421	202426	100 %	0 %	0 %	0 %	296131735
4133	NC_014152	A	6	6	202675	202680	100 %	0 %	0 %	0 %	296131735
4134	NC_014152	GA	3	6	202732	202737	50 %	0 %	50 %	0 %	296131735
4135	NC_014152	GAA	2	6	202742	202747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131735
4136	NC_014152	GAAAA	2	10	202764	202773	80 %	0 %	20 %	0 %	296131735
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4141	NC_014152	ACA	2	6	203025	203030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131735
4142	NC_014152	TCGAC	2	10	203059	203068	20 %	20 %	20 %	40 %	296131735
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4146	NC_014152	GAAA	2	8	203254	203261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_014152	T	6	6	203303	203308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_014152	A	6	6	203406	203411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_014152	GGCT	2	8	203492	203499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4150	NC_014152	GAGC	2	8	203513	203520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4156	NC_014152	GGA	2	6	203929	203934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131736
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4238	NC_014152	TTC	2	6	208589	208594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131740
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4245	NC_014152	CCAT	2	8	209021	209028	25 %	25 %	0 %	50 %	296131740
4246	NC_014152	AATTT	2	10	209037	209046	40 %	60 %	0 %	0 %	296131740
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4248	NC_014152	TTTC	2	8	209077	209084	0 %	75 %	0 %	25 %	296131741
4249	NC_014152	T	8	8	209173	209180	0 %	100 %	0 %	0 %	296131741
4250	NC_014152	CTT	2	6	209185	209190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131741
4251	NC_014152	TTTC	2	8	209259	209266	0 %	75 %	0 %	25 %	296131741
4252	NC_014152	CTTG	2	8	209309	209316	0 %	50 %	25 %	25 %	296131741
4253	NC_014152	TGT	2	6	209335	209340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131741
4254	NC_014152	TCC	2	6	209400	209405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_014152	TATG	2	8	209424	209431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_014152	A	7	7	209508	209514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_014152	TAA	2	6	209523	209528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_014152	AAGG	2	8	209561	209568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_014152	TGA	2	6	209620	209625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131742
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4261	NC_014152	TA	3	6	209702	209707	50 %	50 %	0 %	0 %	296131742
4262	NC_014152	TGGC	2	8	209745	209752	0 %	25 %	50 %	25 %	296131742
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4271	NC_014152	AAG	2	6	210110	210115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131742
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4273	NC_014152	GTG	2	6	210152	210157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131742
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4278	NC_014152	AGG	2	6	210320	210325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131743
4279	NC_014152	TCT	2	6	210418	210423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131743
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4283	NC_014152	T	6	6	210752	210757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_014152	GA	3	6	210769	210774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_014152	T	9	9	210798	210806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4286	NC_014152	GCA	2	6	210833	210838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4288	NC_014152	A	6	6	210885	210890	100 %	0 %	0 %	0 %	296131744
4289	NC_014152	TCTGT	2	10	210996	211005	0 %	60 %	20 %	20 %	296131744
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4357	NC_014152	CATA	2	8	214438	214445	50 %	25 %	0 %	25 %	296131746
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4364	NC_014152	GGA	2	6	215032	215037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131746
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4366	NC_014152	AGA	2	6	215099	215104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131746
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4368	NC_014152	CAT	2	6	215149	215154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131746
4369	NC_014152	A	6	6	215241	215246	100 %	0 %	0 %	0 %	296131746
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4371	NC_014152	CCGG	2	8	215319	215326	0 %	0 %	50 %	50 %	296131746
4372	NC_014152	CAAA	2	8	215368	215375	75 %	0 %	0 %	25 %	296131746
4373	NC_014152	ACA	2	6	215385	215390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131746
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4375	NC_014152	GTC	2	6	215622	215627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131746
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4499	NC_014152	GCA	2	6	221274	221279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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