MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014152	GAA	2	6	172074	172079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131705
3502	NC_014152	ATG	2	6	172122	172127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131705
3503	NC_014152	GACA	2	8	172128	172135	50 %	0 %	25 %	25 %	296131705
3504	NC_014152	ATCA	2	8	172263	172270	50 %	25 %	0 %	25 %	296131705
3505	NC_014152	T	6	6	172375	172380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014152	TAT	2	6	172409	172414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014152	AGG	2	6	172427	172432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_014152	TGA	2	6	172441	172446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131706
3509	NC_014152	TAG	2	6	172474	172479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131706
3510	NC_014152	ATGG	2	8	172583	172590	25 %	25 %	50 %	0 %	296131706
3511	NC_014152	ACA	2	6	172633	172638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131706
3512	NC_014152	GAA	2	6	172695	172700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131706
3513	NC_014152	AGG	2	6	172707	172712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131706
3514	NC_014152	ATG	2	6	172753	172758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131706
3515	NC_014152	CGG	2	6	172819	172824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131706
3516	NC_014152	A	6	6	172841	172846	100 %	0 %	0 %	0 %	296131706
3517	NC_014152	GA	3	6	172886	172891	50 %	0 %	50 %	0 %	296131706
3518	NC_014152	AAT	2	6	172908	172913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131706
3519	NC_014152	A	6	6	173006	173011	100 %	0 %	0 %	0 %	296131706
3520	NC_014152	TGA	2	6	173090	173095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131706
3521	NC_014152	GAG	2	6	173244	173249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014152	TAA	2	6	173272	173277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131707
3523	NC_014152	GGGA	2	8	173282	173289	25 %	0 %	75 %	0 %	296131707
3524	NC_014152	TTG	2	6	173296	173301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131707
3525	NC_014152	TAT	2	6	173342	173347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131707
3526	NC_014152	TGC	3	9	173348	173356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131707
3527	NC_014152	TTA	2	6	173377	173382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131707
3528	NC_014152	ATGTAA	2	12	173407	173418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296131707
3529	NC_014152	AAG	2	6	173529	173534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131707
3530	NC_014152	TTG	2	6	173553	173558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131707
3531	NC_014152	CAGG	2	8	173573	173580	25 %	0 %	50 %	25 %	296131707
3532	NC_014152	TAA	2	6	173692	173697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131707
3533	NC_014152	ATG	2	6	173772	173777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131707
3534	NC_014152	GAG	2	6	173881	173886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131707
3535	NC_014152	TGC	2	6	173984	173989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131707
3536	NC_014152	CCT	2	6	174008	174013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131707
3537	NC_014152	ACC	2	6	174030	174035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131707
3538	NC_014152	GGA	2	6	174086	174091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131707
3539	NC_014152	ACCTT	2	10	174147	174156	20 %	40 %	0 %	40 %	296131707
3540	NC_014152	GAT	2	6	174188	174193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131707
3541	NC_014152	ACC	2	6	174204	174209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131707
3542	NC_014152	TAT	2	6	174317	174322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131707
3543	NC_014152	GGGCGG	2	12	174373	174384	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	296131707
3544	NC_014152	TA	3	6	174441	174446	50 %	50 %	0 %	0 %	296131707
3545	NC_014152	A	6	6	174548	174553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014152	T	7	7	174702	174708	0 %	100 %	0 %	0 %	296131708
3547	NC_014152	AAC	2	6	174744	174749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131708
3548	NC_014152	CTT	2	6	174788	174793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131708
3549	NC_014152	TTC	2	6	174840	174845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131708
3550	NC_014152	AT	3	6	174887	174892	50 %	50 %	0 %	0 %	296131708
3551	NC_014152	CAA	2	6	174934	174939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131708
3552	NC_014152	CAG	2	6	174968	174973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3553	NC_014152	AAT	2	6	174989	174994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131708
3554	NC_014152	CAG	2	6	175010	175015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3555	NC_014152	ATG	2	6	175020	175025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131708
3556	NC_014152	GCT	2	6	175043	175048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3557	NC_014152	GCA	2	6	175051	175056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3558	NC_014152	CTG	2	6	175062	175067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3559	NC_014152	AAT	2	6	175078	175083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131708
3560	NC_014152	GGT	2	6	175085	175090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131708
3561	NC_014152	ACA	2	6	175156	175161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131708
3562	NC_014152	GGT	2	6	175297	175302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131708
3563	NC_014152	GGC	2	6	175405	175410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131708
3564	NC_014152	GCT	2	6	175487	175492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3565	NC_014152	CAG	2	6	175493	175498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3566	NC_014152	GTT	2	6	175556	175561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131708
3567	NC_014152	AAG	2	6	175569	175574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131708
3568	NC_014152	AGT	2	6	175585	175590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131708
3569	NC_014152	TTG	2	6	175626	175631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131708
3570	NC_014152	CGG	2	6	175674	175679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131708
3571	NC_014152	CAG	2	6	175692	175697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3572	NC_014152	GTT	2	6	175709	175714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131708
3573	NC_014152	TAA	2	6	175732	175737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131708
3574	NC_014152	CGG	2	6	175758	175763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131708
3575	NC_014152	CGG	2	6	175776	175781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131708
3576	NC_014152	CAG	3	9	175787	175795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131708
3577	NC_014152	GAG	2	6	175850	175855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131708
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3579	NC_014152	GTTAA	2	10	176009	176018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014152	AT	3	6	176028	176033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014152	TGG	2	6	176035	176040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131709
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3588	NC_014152	T	6	6	176476	176481	0 %	100 %	0 %	0 %	296131709
3589	NC_014152	GAA	2	6	176568	176573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131709
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3592	NC_014152	TAA	2	6	176856	176861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131710
3593	NC_014152	A	6	6	176937	176942	100 %	0 %	0 %	0 %	296131710
3594	NC_014152	CAG	2	6	176984	176989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131710
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3601	NC_014152	A	6	6	177242	177247	100 %	0 %	0 %	0 %	296131710
3602	NC_014152	ATA	2	6	177360	177365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131710
3603	NC_014152	ACCTG	2	10	177367	177376	20 %	20 %	20 %	40 %	296131710
3604	NC_014152	TTG	2	6	177517	177522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014152	AAT	2	6	177537	177542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014152	TAT	2	6	177577	177582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014152	CG	3	6	177594	177599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_014152	ATT	2	6	177605	177610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014152	AAT	2	6	177695	177700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131711
3610	NC_014152	A	6	6	177754	177759	100 %	0 %	0 %	0 %	296131711
3611	NC_014152	TGA	2	6	177780	177785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131711
3612	NC_014152	AAGTG	2	10	177817	177826	40 %	20 %	40 %	0 %	296131711
3613	NC_014152	GAAG	2	8	177838	177845	50 %	0 %	50 %	0 %	296131711
3614	NC_014152	GCAA	2	8	177853	177860	50 %	0 %	25 %	25 %	296131711
3615	NC_014152	GAC	2	6	177932	177937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131711
3616	NC_014152	TTCC	2	8	177957	177964	0 %	50 %	0 %	50 %	296131712
3617	NC_014152	TA	3	6	177999	178004	50 %	50 %	0 %	0 %	296131712
3618	NC_014152	GGC	2	6	178028	178033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131712
3619	NC_014152	CTG	2	6	178041	178046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131712
3620	NC_014152	CA	3	6	178093	178098	50 %	0 %	0 %	50 %	296131712
3621	NC_014152	T	6	6	178165	178170	0 %	100 %	0 %	0 %	296131712
3622	NC_014152	GTT	2	6	178173	178178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131712
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3624	NC_014152	T	7	7	178232	178238	0 %	100 %	0 %	0 %	296131712
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3748	NC_014152	CT	3	6	184185	184190	0 %	50 %	0 %	50 %	296131717
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