MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014152	CGG	2	6	147847	147852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131686
3002	NC_014152	TGGGC	2	10	147917	147926	0 %	20 %	60 %	20 %	296131686
3003	NC_014152	TGG	2	6	147948	147953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131686
3004	NC_014152	TCG	2	6	147991	147996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131686
3005	NC_014152	CA	3	6	148132	148137	50 %	0 %	0 %	50 %	296131686
3006	NC_014152	CAGG	2	8	148221	148228	25 %	0 %	50 %	25 %	296131686
3007	NC_014152	GGC	2	6	148250	148255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131686
3008	NC_014152	GTCC	2	8	148285	148292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_014152	ATA	2	6	148430	148435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014152	TTAC	2	8	148489	148496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_014152	TGT	2	6	148510	148515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014152	TCA	2	6	148544	148549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131687
3013	NC_014152	GGC	2	6	148588	148593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131687
3014	NC_014152	ATG	2	6	148603	148608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131687
3015	NC_014152	GGC	2	6	148646	148651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131687
3016	NC_014152	TGA	2	6	148668	148673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131687
3017	NC_014152	CTC	2	6	148707	148712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131687
3018	NC_014152	T	6	6	148741	148746	0 %	100 %	0 %	0 %	296131687
3019	NC_014152	AAAG	2	8	148794	148801	75 %	0 %	25 %	0 %	296131687
3020	NC_014152	AT	3	6	148804	148809	50 %	50 %	0 %	0 %	296131687
3021	NC_014152	CCT	2	6	148822	148827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_014152	TTCA	2	8	148931	148938	25 %	50 %	0 %	25 %	296131688
3023	NC_014152	T	6	6	149005	149010	0 %	100 %	0 %	0 %	296131688
3024	NC_014152	ATT	2	6	149063	149068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131688
3025	NC_014152	CTG	2	6	149074	149079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131688
3026	NC_014152	CAA	2	6	149083	149088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131688
3027	NC_014152	ACA	2	6	149154	149159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131688
3028	NC_014152	T	6	6	149163	149168	0 %	100 %	0 %	0 %	296131688
3029	NC_014152	ACC	2	6	149205	149210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131688
3030	NC_014152	TCCTGA	2	12	149228	149239	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296131688
3031	NC_014152	CAG	2	6	149246	149251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131688
3032	NC_014152	ATAGCC	2	12	149262	149273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296131688
3033	NC_014152	TGA	2	6	149308	149313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131688
3034	NC_014152	CGTT	2	8	149316	149323	0 %	50 %	25 %	25 %	296131688
3035	NC_014152	CTG	2	6	149381	149386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131688
3036	NC_014152	T	6	6	149411	149416	0 %	100 %	0 %	0 %	296131688
3037	NC_014152	CGT	2	6	149440	149445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131688
3038	NC_014152	CTT	2	6	149482	149487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131688
3039	NC_014152	CTT	2	6	149504	149509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131688
3040	NC_014152	GGCC	2	8	149578	149585	0 %	0 %	50 %	50 %	296131688
3041	NC_014152	ATCA	2	8	149651	149658	50 %	25 %	0 %	25 %	296131688
3042	NC_014152	CG	3	6	149660	149665	0 %	0 %	50 %	50 %	296131688
3043	NC_014152	TCC	2	6	149673	149678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131688
3044	NC_014152	CAGTC	2	10	149683	149692	20 %	20 %	20 %	40 %	296131688
3045	NC_014152	CCG	2	6	149721	149726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131688
3046	NC_014152	GTTAAA	2	12	149882	149893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296131688
3047	NC_014152	TGGGT	2	10	149923	149932	0 %	40 %	60 %	0 %	296131688
3048	NC_014152	CTG	2	6	149993	149998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131688
3049	NC_014152	CT	3	6	150014	150019	0 %	50 %	0 %	50 %	296131688
3050	NC_014152	CGG	2	6	150029	150034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131688
3051	NC_014152	CAT	2	6	150095	150100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131688
3052	NC_014152	AAC	2	6	150116	150121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131688
3053	NC_014152	A	6	6	150180	150185	100 %	0 %	0 %	0 %	296131688
3054	NC_014152	GTA	2	6	150213	150218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131688
3055	NC_014152	TCT	2	6	150288	150293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131688
3056	NC_014152	CTT	2	6	150367	150372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131688
3057	NC_014152	ACC	2	6	150474	150479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131688
3058	NC_014152	CCG	2	6	150486	150491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131688
3059	NC_014152	TTTGGC	2	12	150512	150523	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296131688
3060	NC_014152	C	6	6	150564	150569	0 %	0 %	0 %	100 %	296131688
3061	NC_014152	TCA	2	6	150586	150591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131688
3062	NC_014152	CAC	2	6	150752	150757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_014152	TTA	2	6	150759	150764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014152	AAT	2	6	150769	150774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014152	A	6	6	150801	150806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_014152	T	6	6	150847	150852	0 %	100 %	0 %	0 %	296131689
3067	NC_014152	GAT	2	6	150866	150871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131689
3068	NC_014152	T	6	6	150898	150903	0 %	100 %	0 %	0 %	296131689
3069	NC_014152	ATC	2	6	150908	150913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131689
3070	NC_014152	CTT	2	6	150961	150966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131689
3071	NC_014152	ACA	2	6	151107	151112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131689
3072	NC_014152	CTTTAG	2	12	151153	151164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296131689
3073	NC_014152	AATG	2	8	151281	151288	50 %	25 %	25 %	0 %	296131689
3074	NC_014152	AT	3	6	151302	151307	50 %	50 %	0 %	0 %	296131689
3075	NC_014152	A	7	7	151327	151333	100 %	0 %	0 %	0 %	296131689
3076	NC_014152	TGG	2	6	151344	151349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131689
3077	NC_014152	ATC	2	6	151355	151360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131689
3078	NC_014152	AT	3	6	151404	151409	50 %	50 %	0 %	0 %	296131689
3079	NC_014152	CTA	2	6	151420	151425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131689
3080	NC_014152	TCC	2	6	151482	151487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131689
3081	NC_014152	TGC	2	6	151501	151506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131689
3082	NC_014152	GCA	2	6	151507	151512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131689
3083	NC_014152	A	7	7	151673	151679	100 %	0 %	0 %	0 %	296131689
3084	NC_014152	ATC	2	6	151727	151732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131689
3085	NC_014152	GA	3	6	151886	151891	50 %	0 %	50 %	0 %	296131689
3086	NC_014152	ATCA	2	8	151904	151911	50 %	25 %	0 %	25 %	296131689
3087	NC_014152	AAT	2	6	151937	151942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131689
3088	NC_014152	GCC	2	6	152089	152094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131690
3089	NC_014152	CTG	2	6	152096	152101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131690
3090	NC_014152	ATG	2	6	152110	152115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131690
3091	NC_014152	CTG	2	6	152138	152143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131690
3092	NC_014152	CAA	2	6	152153	152158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131690
3093	NC_014152	CTGA	2	8	152199	152206	25 %	25 %	25 %	25 %	296131690
3094	NC_014152	ATA	2	6	152373	152378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131690
3095	NC_014152	ATC	2	6	152386	152391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131690
3096	NC_014152	GCG	2	6	152446	152451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131690
3097	NC_014152	TCT	2	6	152485	152490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131690
3098	NC_014152	GCCA	2	8	152556	152563	25 %	0 %	25 %	50 %	296131690
3099	NC_014152	GGCCTC	2	12	152568	152579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296131690
3100	NC_014152	TAAA	2	8	152591	152598	75 %	25 %	0 %	0 %	296131690
3101	NC_014152	ATG	2	6	152662	152667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131690
3102	NC_014152	T	6	6	152691	152696	0 %	100 %	0 %	0 %	296131690
3103	NC_014152	TTTA	2	8	152703	152710	25 %	75 %	0 %	0 %	296131690
3104	NC_014152	CCA	2	6	152717	152722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131690
3105	NC_014152	CG	3	6	152730	152735	0 %	0 %	50 %	50 %	296131690
3106	NC_014152	TAT	2	6	152838	152843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131690
3107	NC_014152	TCC	2	6	152887	152892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_014152	T	7	7	152908	152914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_014152	A	6	6	152919	152924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014152	CAA	2	6	152994	152999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_014152	TCC	2	6	153003	153008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_014152	GAT	2	6	153033	153038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131691
3113	NC_014152	AAC	2	6	153077	153082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131691
3114	NC_014152	AG	3	6	153131	153136	50 %	0 %	50 %	0 %	296131691
3115	NC_014152	TTTG	2	8	153162	153169	0 %	75 %	25 %	0 %	296131691
3116	NC_014152	CAC	2	6	153195	153200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131691
3117	NC_014152	AGG	2	6	153202	153207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131691
3118	NC_014152	CCA	2	6	153268	153273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131691
3119	NC_014152	CCCA	2	8	153328	153335	25 %	0 %	0 %	75 %	296131691
3120	NC_014152	AAT	2	6	153374	153379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131691
3121	NC_014152	TGC	2	6	153415	153420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131691
3122	NC_014152	GAA	2	6	153449	153454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131691
3123	NC_014152	TAA	2	6	153531	153536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131691
3124	NC_014152	AAC	2	6	153554	153559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_014152	AT	3	6	153680	153685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014152	TAT	2	6	153693	153698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014152	ATT	2	6	153706	153711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014152	TAA	2	6	153725	153730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014152	TACTT	2	10	153747	153756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3146	NC_014152	ATAA	2	8	154592	154599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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