MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014152	ACA	2	6	49247	49252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131594
1002	NC_014152	AAG	2	6	49271	49276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131594
1003	NC_014152	AGA	2	6	49303	49308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131594
1004	NC_014152	TCC	2	6	49312	49317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131594
1005	NC_014152	A	6	6	49340	49345	100 %	0 %	0 %	0 %	296131594
1006	NC_014152	AG	3	6	49391	49396	50 %	0 %	50 %	0 %	296131594
1007	NC_014152	ATGGAA	2	12	49535	49546	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296131594
1008	NC_014152	ACC	2	6	49724	49729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131594
1009	NC_014152	CAT	2	6	49775	49780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014152	A	6	6	49800	49805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014152	AGG	2	6	49817	49822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014152	GCA	2	6	49875	49880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131595
1013	NC_014152	GCT	2	6	49908	49913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131595
1014	NC_014152	CGG	3	9	49943	49951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131595
1015	NC_014152	GCT	2	6	49995	50000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131595
1016	NC_014152	GCT	3	9	50013	50021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131595
1017	NC_014152	A	7	7	50102	50108	100 %	0 %	0 %	0 %	296131595
1018	NC_014152	GCT	2	6	50214	50219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131596
1019	NC_014152	TTA	2	6	50227	50232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131596
1020	NC_014152	TA	3	6	50270	50275	50 %	50 %	0 %	0 %	296131596
1021	NC_014152	GCA	2	6	50286	50291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131596
1022	NC_014152	GCT	3	9	50316	50324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131596
1023	NC_014152	GCC	2	6	50325	50330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131596
1024	NC_014152	GC	3	6	50350	50355	0 %	0 %	50 %	50 %	296131596
1025	NC_014152	GAA	2	6	50412	50417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131596
1026	NC_014152	GAA	2	6	50484	50489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131596
1027	NC_014152	AAG	2	6	50500	50505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131596
1028	NC_014152	TAA	2	6	50522	50527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131596
1029	NC_014152	GAA	3	9	50538	50546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131596
1030	NC_014152	AGA	2	6	50663	50668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131596
1031	NC_014152	CAA	2	6	50732	50737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131596
1032	NC_014152	AGG	2	6	50816	50821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014152	CAAAGC	2	12	50887	50898	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	296131597
1034	NC_014152	GCT	2	6	50951	50956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131597
1035	NC_014152	AT	3	6	51079	51084	50 %	50 %	0 %	0 %	296131597
1036	NC_014152	ATT	2	6	51173	51178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131597
1037	NC_014152	CCA	3	9	51198	51206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131597
1038	NC_014152	TA	3	6	51207	51212	50 %	50 %	0 %	0 %	296131597
1039	NC_014152	CATG	2	8	51301	51308	25 %	25 %	25 %	25 %	296131597
1040	NC_014152	GGC	2	6	51310	51315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131597
1041	NC_014152	ACC	2	6	51362	51367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131597
1042	NC_014152	GCT	2	6	51371	51376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131597
1043	NC_014152	ATG	2	6	51396	51401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131597
1044	NC_014152	GAT	2	6	51409	51414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131597
1045	NC_014152	CGG	2	6	51424	51429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131597
1046	NC_014152	AAGC	2	8	51527	51534	50 %	0 %	25 %	25 %	296131597
1047	NC_014152	CAT	2	6	51544	51549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131597
1048	NC_014152	AGA	2	6	51673	51678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131597
1049	NC_014152	CAG	2	6	51691	51696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131597
1050	NC_014152	GGC	2	6	51716	51721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131597
1051	NC_014152	ATG	2	6	51897	51902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131597
1052	NC_014152	CCTG	2	8	51903	51910	0 %	25 %	25 %	50 %	296131597
1053	NC_014152	CTG	2	6	51923	51928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131597
1054	NC_014152	ACA	2	6	52058	52063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131597
1055	NC_014152	AGC	2	6	52109	52114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131597
1056	NC_014152	GGCA	2	8	52176	52183	25 %	0 %	50 %	25 %	296131597
1057	NC_014152	CAGCT	2	10	52194	52203	20 %	20 %	20 %	40 %	296131597
1058	NC_014152	AGA	2	6	52228	52233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131597
1059	NC_014152	GAA	2	6	52319	52324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131598
1060	NC_014152	AACAG	2	10	52339	52348	60 %	0 %	20 %	20 %	296131598
1061	NC_014152	A	7	7	52403	52409	100 %	0 %	0 %	0 %	296131598
1062	NC_014152	AGA	2	6	52450	52455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131598
1063	NC_014152	TGG	2	6	52548	52553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131598
1064	NC_014152	AAGA	2	8	52597	52604	75 %	0 %	25 %	0 %	296131598
1065	NC_014152	AATTTC	2	12	52618	52629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296131598
1066	NC_014152	GGT	2	6	52702	52707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131598
1067	NC_014152	TGC	2	6	52750	52755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131598
1068	NC_014152	TGCCGA	2	12	52777	52788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296131598
1069	NC_014152	ATA	2	6	52847	52852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131598
1070	NC_014152	GCT	2	6	52925	52930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131598
1071	NC_014152	CA	3	6	52974	52979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_014152	TG	3	6	52990	52995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014152	GCC	2	6	52996	53001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_014152	GAAG	2	8	53013	53020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014152	TAAT	2	8	53041	53048	50 %	50 %	0 %	0 %	296131599
1076	NC_014152	TCA	2	6	53058	53063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131599
1077	NC_014152	GAAA	2	8	53087	53094	75 %	0 %	25 %	0 %	296131599
1078	NC_014152	ATT	2	6	53223	53228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131599
1079	NC_014152	ACA	2	6	53266	53271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131599
1080	NC_014152	GGA	2	6	53310	53315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131599
1081	NC_014152	GA	3	6	53314	53319	50 %	0 %	50 %	0 %	296131599
1082	NC_014152	TGG	2	6	53338	53343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131599
1083	NC_014152	ATG	2	6	53344	53349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131599
1084	NC_014152	AGG	2	6	53356	53361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131599
1085	NC_014152	GGC	2	6	53368	53373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131599
1086	NC_014152	CAGG	2	8	53450	53457	25 %	0 %	50 %	25 %	296131599
1087	NC_014152	TCA	2	6	53480	53485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131599
1088	NC_014152	CA	3	6	53484	53489	50 %	0 %	0 %	50 %	296131599
1089	NC_014152	GATA	2	8	53696	53703	50 %	25 %	25 %	0 %	296131599
1090	NC_014152	AAG	2	6	53747	53752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131599
1091	NC_014152	CAA	2	6	53819	53824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131599
1092	NC_014152	AGC	2	6	53868	53873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131599
1093	NC_014152	GCT	3	9	53895	53903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131599
1094	NC_014152	TTTG	2	8	53936	53943	0 %	75 %	25 %	0 %	296131599
1095	NC_014152	A	7	7	53954	53960	100 %	0 %	0 %	0 %	296131599
1096	NC_014152	GA	3	6	54025	54030	50 %	0 %	50 %	0 %	296131599
1097	NC_014152	AT	3	6	54127	54132	50 %	50 %	0 %	0 %	296131599
1098	NC_014152	GAA	2	6	54177	54182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131599
1099	NC_014152	AATT	2	8	54216	54223	50 %	50 %	0 %	0 %	296131599
1100	NC_014152	CAGGC	2	10	54344	54353	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1101	NC_014152	AAAG	2	8	54360	54367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014152	AG	3	6	54366	54371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014152	GGAA	2	8	54373	54380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014152	GTT	2	6	54392	54397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131600
1105	NC_014152	GAA	2	6	54443	54448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131600
1106	NC_014152	AAG	2	6	54455	54460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131600
1107	NC_014152	AGAAAC	2	12	54508	54519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296131600
1108	NC_014152	GAT	2	6	54572	54577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131600
1109	NC_014152	AAAGA	2	10	54713	54722	80 %	0 %	20 %	0 %	296131600
1110	NC_014152	GCC	2	6	54814	54819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131600
1111	NC_014152	TAA	2	6	54941	54946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131600
1112	NC_014152	GGGA	2	8	54960	54967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014152	CAT	2	6	54997	55002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131601
1114	NC_014152	ATC	2	6	55032	55037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131601
1115	NC_014152	ATT	2	6	55066	55071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131601
1116	NC_014152	GCT	2	6	55092	55097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131601
1117	NC_014152	ATT	2	6	55135	55140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131601
1118	NC_014152	TAA	2	6	55161	55166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131601
1119	NC_014152	GGC	2	6	55200	55205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131601
1120	NC_014152	TAT	2	6	55296	55301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131601
1121	NC_014152	CTT	2	6	55335	55340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131601
1122	NC_014152	GAA	2	6	55345	55350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131601
1123	NC_014152	CCG	2	6	55364	55369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131601
1124	NC_014152	TAA	2	6	55394	55399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131601
1125	NC_014152	TGT	2	6	55464	55469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131601
1126	NC_014152	AGT	2	6	55489	55494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131601
1127	NC_014152	CAG	2	6	55507	55512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131601
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1130	NC_014152	GGC	2	6	55647	55652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131601
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1254	NC_014152	ATG	2	6	61945	61950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131607
1255	NC_014152	ACC	2	6	61980	61985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131607
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1260	NC_014152	CTG	2	6	62218	62223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131607
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1262	NC_014152	CCCGG	2	10	62336	62345	0 %	0 %	40 %	60 %	296131607
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