MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014152	CAT	2	6	23462	23467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131569
502	NC_014152	AGA	2	6	23506	23511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131569
503	NC_014152	AAGGT	2	10	23568	23577	40 %	20 %	40 %	0 %	296131569
504	NC_014152	ATT	2	6	23591	23596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131569
505	NC_014152	CAA	2	6	23607	23612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131569
506	NC_014152	TAT	2	6	23651	23656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131569
507	NC_014152	AAT	2	6	23740	23745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131569
508	NC_014152	AGA	2	6	23793	23798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131569
509	NC_014152	AGC	2	6	23859	23864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131569
510	NC_014152	AAAG	2	8	23923	23930	75 %	0 %	25 %	0 %	296131569
511	NC_014152	AT	3	6	23942	23947	50 %	50 %	0 %	0 %	296131569
512	NC_014152	CAGG	2	8	24036	24043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_014152	T	7	7	24049	24055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014152	CAGG	2	8	24063	24070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_014152	ATACT	2	10	24092	24101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
516	NC_014152	TGC	2	6	24123	24128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014152	A	7	7	24136	24142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014152	TTAT	2	8	24186	24193	25 %	75 %	0 %	0 %	296131570
519	NC_014152	T	7	7	24410	24416	0 %	100 %	0 %	0 %	296131570
520	NC_014152	CGA	2	6	24512	24517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131570
521	NC_014152	TCTT	2	8	24575	24582	0 %	75 %	0 %	25 %	296131570
522	NC_014152	GAAATT	2	12	24690	24701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296131570
523	NC_014152	TTAT	2	8	24709	24716	25 %	75 %	0 %	0 %	296131570
524	NC_014152	CAAATA	2	12	24763	24774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296131570
525	NC_014152	T	6	6	24779	24784	0 %	100 %	0 %	0 %	296131570
526	NC_014152	A	7	7	24819	24825	100 %	0 %	0 %	0 %	296131570
527	NC_014152	TGCC	2	8	24895	24902	0 %	25 %	25 %	50 %	296131570
528	NC_014152	ACA	2	6	24938	24943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131570
529	NC_014152	ATT	2	6	24955	24960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131570
530	NC_014152	A	6	6	24975	24980	100 %	0 %	0 %	0 %	296131570
531	NC_014152	TAG	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131570
532	NC_014152	CAG	2	6	25104	25109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131570
533	NC_014152	A	6	6	25149	25154	100 %	0 %	0 %	0 %	296131570
534	NC_014152	TA	3	6	25156	25161	50 %	50 %	0 %	0 %	296131570
535	NC_014152	GAT	2	6	25218	25223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131570
536	NC_014152	GCG	2	6	25405	25410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131570
537	NC_014152	TA	3	6	25414	25419	50 %	50 %	0 %	0 %	296131570
538	NC_014152	A	6	6	25426	25431	100 %	0 %	0 %	0 %	296131570
539	NC_014152	CAG	2	6	25560	25565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131570
540	NC_014152	TGAA	2	8	25570	25577	50 %	25 %	25 %	0 %	296131570
541	NC_014152	ATA	2	6	25590	25595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131570
542	NC_014152	ATT	2	6	25631	25636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131570
543	NC_014152	AAAT	2	8	25641	25648	75 %	25 %	0 %	0 %	296131570
544	NC_014152	A	6	6	25659	25664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014152	T	7	7	25702	25708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014152	TGAC	2	8	25730	25737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_014152	GAC	2	6	25750	25755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014152	TTA	2	6	25760	25765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014152	CAA	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014152	TGGT	2	8	25850	25857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014152	AAT	2	6	25877	25882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014152	G	6	6	25888	25893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014152	AGG	2	6	25970	25975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014152	CAA	2	6	26095	26100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131571
555	NC_014152	AG	3	6	26149	26154	50 %	0 %	50 %	0 %	296131571
556	NC_014152	TCA	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131571
557	NC_014152	TGA	2	6	26283	26288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131571
558	NC_014152	CTGG	2	8	26313	26320	0 %	25 %	50 %	25 %	296131571
559	NC_014152	CCA	2	6	26517	26522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131571
560	NC_014152	CTT	2	6	26540	26545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131571
561	NC_014152	TAA	2	6	26624	26629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131571
562	NC_014152	ATT	2	6	26689	26694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131571
563	NC_014152	GAA	2	6	26774	26779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131571
564	NC_014152	CT	3	6	26782	26787	0 %	50 %	0 %	50 %	296131571
565	NC_014152	AT	3	6	26810	26815	50 %	50 %	0 %	0 %	296131571
566	NC_014152	T	6	6	26847	26852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014152	AGGGG	2	10	26853	26862	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014152	TGT	2	6	26889	26894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014152	A	7	7	26918	26924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014152	GA	3	6	26939	26944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014152	T	6	6	27034	27039	0 %	100 %	0 %	0 %	296131572
572	NC_014152	A	7	7	27044	27050	100 %	0 %	0 %	0 %	296131572
573	NC_014152	CGGG	2	8	27080	27087	0 %	0 %	75 %	25 %	296131572
574	NC_014152	TAAC	2	8	27089	27096	50 %	25 %	0 %	25 %	296131572
575	NC_014152	AAT	2	6	27118	27123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131572
576	NC_014152	GAA	2	6	27160	27165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131572
577	NC_014152	A	6	6	27248	27253	100 %	0 %	0 %	0 %	296131572
578	NC_014152	AT	3	6	27321	27326	50 %	50 %	0 %	0 %	296131572
579	NC_014152	A	6	6	27328	27333	100 %	0 %	0 %	0 %	296131572
580	NC_014152	A	6	6	27349	27354	100 %	0 %	0 %	0 %	296131572
581	NC_014152	TCAG	2	8	27360	27367	25 %	25 %	25 %	25 %	296131572
582	NC_014152	GAAA	2	8	27399	27406	75 %	0 %	25 %	0 %	296131572
583	NC_014152	A	6	6	27476	27481	100 %	0 %	0 %	0 %	296131572
584	NC_014152	GAA	2	6	27484	27489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131572
585	NC_014152	GA	3	6	27492	27497	50 %	0 %	50 %	0 %	296131572
586	NC_014152	TCC	2	6	27513	27518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131572
587	NC_014152	GAT	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131572
588	NC_014152	ATGA	2	8	27610	27617	50 %	25 %	25 %	0 %	296131572
589	NC_014152	GGC	2	6	27633	27638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131572
590	NC_014152	TGC	2	6	27680	27685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131572
591	NC_014152	CGG	2	6	27699	27704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131572
592	NC_014152	ATT	2	6	27736	27741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131572
593	NC_014152	GAA	2	6	27811	27816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131572
594	NC_014152	AGC	2	6	27891	27896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131572
595	NC_014152	A	6	6	27962	27967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014152	CT	3	6	28015	28020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_014152	AAAT	2	8	28023	28030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014152	GTCT	2	8	28118	28125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_014152	GTT	2	6	28158	28163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014152	TAAAAG	2	12	28164	28175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014152	GAT	2	6	28217	28222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131573
602	NC_014152	AT	3	6	28221	28226	50 %	50 %	0 %	0 %	296131573
603	NC_014152	AT	3	6	28271	28276	50 %	50 %	0 %	0 %	296131573
604	NC_014152	CAA	2	6	28354	28359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131573
605	NC_014152	TAA	2	6	28402	28407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131573
606	NC_014152	TGTA	2	8	28418	28425	25 %	50 %	25 %	0 %	296131573
607	NC_014152	GAA	2	6	28655	28660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131573
608	NC_014152	AAT	2	6	28736	28741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131573
609	NC_014152	A	7	7	28776	28782	100 %	0 %	0 %	0 %	296131573
610	NC_014152	GAA	2	6	28814	28819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131573
611	NC_014152	TC	3	6	28865	28870	0 %	50 %	0 %	50 %	296131573
612	NC_014152	AATG	2	8	28876	28883	50 %	25 %	25 %	0 %	296131573
613	NC_014152	TGA	2	6	28908	28913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131573
614	NC_014152	GTT	2	6	28955	28960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131573
615	NC_014152	ATT	2	6	28975	28980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131573
616	NC_014152	ATT	2	6	28982	28987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131573
617	NC_014152	GATT	2	8	29016	29023	25 %	50 %	25 %	0 %	296131573
618	NC_014152	AAT	2	6	29098	29103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131573
619	NC_014152	GT	3	6	29127	29132	0 %	50 %	50 %	0 %	296131573
620	NC_014152	AGT	2	6	29174	29179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131573
621	NC_014152	GAT	2	6	29225	29230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131573
622	NC_014152	A	7	7	29286	29292	100 %	0 %	0 %	0 %	296131574
623	NC_014152	AGG	2	6	29309	29314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131574
624	NC_014152	TGAT	2	8	29374	29381	25 %	50 %	25 %	0 %	296131574
625	NC_014152	CTG	2	6	29398	29403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131574
626	NC_014152	TG	3	6	29410	29415	0 %	50 %	50 %	0 %	296131574
627	NC_014152	TAAA	2	8	29467	29474	75 %	25 %	0 %	0 %	296131574
628	NC_014152	AAG	2	6	29506	29511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131574
629	NC_014152	TCT	2	6	29522	29527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131574
630	NC_014152	TTC	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131574
631	NC_014152	GTT	2	6	29753	29758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131574
632	NC_014152	ACC	2	6	29767	29772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131574
633	NC_014152	ATGG	2	8	29871	29878	25 %	25 %	50 %	0 %	296131574
634	NC_014152	A	7	7	29930	29936	100 %	0 %	0 %	0 %	296131574
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751	NC_014152	A	6	6	36034	36039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
752	NC_014152	TAA	2	6	36122	36127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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989	NC_014152	ACGGC	2	10	48711	48720	20 %	0 %	40 %	40 %	296131593
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