MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 62102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014152	ACAG	2	8	246254	246261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_014152	GGT	2	6	246337	246342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014152	CCA	2	6	246359	246364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_014152	TAA	2	6	246421	246426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014152	CCA	2	6	246529	246534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_014152	AAG	2	6	246535	246540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014152	AGT	2	6	246558	246563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014152	GCGAGA	2	12	246653	246664	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5009	NC_014152	GAA	2	6	246666	246671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014152	TGT	2	6	246699	246704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014152	ACA	2	6	246708	246713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_014152	AGGT	2	8	246717	246724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014152	GAA	2	6	246769	246774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014152	CGG	2	6	246850	246855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014152	AGG	2	6	246897	246902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014152	GGA	2	6	246934	246939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014152	ACA	2	6	246947	246952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_014152	GCG	2	6	246968	246973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_014152	GGA	2	6	246983	246988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014152	CCT	2	6	246997	247002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_014152	AAG	2	6	247036	247041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014152	AGG	2	6	247101	247106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014152	GA	3	6	247207	247212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014152	ACC	2	6	247262	247267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_014152	GGGAG	2	10	247338	247347	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014152	TAGC	2	8	247442	247449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_014152	GAG	2	6	247503	247508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014152	TGG	2	6	247573	247578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014152	ACCG	2	8	247587	247594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_014152	CGG	2	6	247607	247612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_014152	AGC	2	6	247919	247924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_014152	CAT	2	6	247925	247930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_014152	AG	3	6	248038	248043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014152	AGT	2	6	248140	248145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014152	GAG	2	6	248200	248205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014152	AGA	2	6	248219	248224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014152	GA	3	6	248223	248228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_014152	CCG	2	6	248270	248275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_014152	CCAC	2	8	248380	248387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5040	NC_014152	AGG	2	6	248412	248417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014152	CA	3	6	248483	248488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_014152	AGT	2	6	248522	248527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014152	AGGT	2	8	248601	248608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014152	GA	3	6	248612	248617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014152	GC	3	6	248626	248631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_014152	GA	3	6	248632	248637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014152	AGT	2	6	248695	248700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014152	AGAGG	2	10	248736	248745	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014152	ACG	2	6	248793	248798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_014152	AGG	2	6	248837	248842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014152	CGG	2	6	248887	248892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_014152	CAA	2	6	248981	248986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_014152	GACAG	2	10	249033	249042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5054	NC_014152	GTC	2	6	249144	249149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_014152	ACC	2	6	249158	249163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_014152	GGT	2	6	249381	249386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014152	CGT	2	6	249576	249581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_014152	CGCAGG	2	12	249605	249616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_014152	GAG	2	6	249625	249630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014152	AGG	2	6	249899	249904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014152	GA	3	6	249946	249951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014152	TAA	2	6	250010	250015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014152	TAA	2	6	250024	250029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014152	TAA	2	6	250038	250043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014152	TAA	2	6	250052	250057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014152	TAA	2	6	250080	250085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014152	TAA	2	6	250094	250099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014152	TAA	2	6	250108	250113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014152	AAT	2	6	250118	250123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014152	AC	3	6	250148	250153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_014152	TA	3	6	250244	250249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_014152	TCTT	2	8	250277	250284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_014152	CGGG	2	8	250305	250312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_014152	TTA	2	6	250389	250394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014152	ATG	2	6	250503	250508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014152	GAAT	2	8	250510	250517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014152	TTC	2	6	250531	250536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_014152	AGG	2	6	250544	250549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014152	CTT	2	6	250725	250730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131775
5080	NC_014152	T	6	6	250743	250748	0 %	100 %	0 %	0 %	296131775
5081	NC_014152	TAT	2	6	250750	250755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131775
5082	NC_014152	TA	3	6	250837	250842	50 %	50 %	0 %	0 %	296131775
5083	NC_014152	TAA	2	6	250955	250960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131775
5084	NC_014152	ATA	2	6	250967	250972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131775
5085	NC_014152	ATTT	2	8	251098	251105	25 %	75 %	0 %	0 %	296131775
5086	NC_014152	TCC	2	6	251134	251139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_014152	T	7	7	251140	251146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014152	TGT	2	6	251172	251177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014152	TAA	2	6	251183	251188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_014152	T	6	6	251203	251208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_014152	AAC	2	6	251299	251304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_014152	TCG	2	6	251341	251346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_014152	GTT	2	6	251384	251389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014152	T	7	7	251388	251394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014152	AAAT	2	8	251422	251429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014152	AAAT	2	8	251458	251465	75 %	25 %	0 %	0 %	296131776
5097	NC_014152	GGT	2	6	251513	251518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131776
5098	NC_014152	GT	3	6	251517	251522	0 %	50 %	50 %	0 %	296131776
5099	NC_014152	CAC	2	6	251637	251642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131776
5100	NC_014152	CCG	2	6	251645	251650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131776
5101	NC_014152	TG	3	6	251721	251726	0 %	50 %	50 %	0 %	296131776
5102	NC_014152	CTG	2	6	251727	251732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131776
5103	NC_014152	CAG	2	6	251736	251741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131776
5104	NC_014152	AGT	2	6	251758	251763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131776
5105	NC_014152	TGGAA	2	10	251797	251806	40 %	20 %	40 %	0 %	296131776
5106	NC_014152	GTG	2	6	251943	251948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131776
5107	NC_014152	CTGG	2	8	251959	251966	0 %	25 %	50 %	25 %	296131776
5108	NC_014152	CAAG	2	8	252156	252163	50 %	0 %	25 %	25 %	296131776
5109	NC_014152	AGA	2	6	252248	252253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131776
5110	NC_014152	AAT	2	6	252320	252325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131776
5111	NC_014152	A	6	6	252338	252343	100 %	0 %	0 %	0 %	296131776
5112	NC_014152	CAT	2	6	252351	252356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131776
5113	NC_014152	AT	4	8	252361	252368	50 %	50 %	0 %	0 %	296131776
5114	NC_014152	C	6	6	252383	252388	0 %	0 %	0 %	100 %	296131776
5115	NC_014152	ATG	2	6	252413	252418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131776
5116	NC_014152	GCA	2	6	252434	252439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131776
5117	NC_014152	CCG	2	6	252449	252454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131776
5118	NC_014152	GCCT	2	8	252489	252496	0 %	25 %	25 %	50 %	296131776
5119	NC_014152	ACCT	2	8	252576	252583	25 %	25 %	0 %	50 %	296131776
5120	NC_014152	GCA	2	6	252610	252615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131776
5121	NC_014152	AAG	2	6	252663	252668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131776
5122	NC_014152	GAA	2	6	252779	252784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131776
5123	NC_014152	CTG	2	6	252807	252812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131776
5124	NC_014152	TTG	2	6	252947	252952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131776
5125	NC_014152	GCA	2	6	253031	253036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131776
5126	NC_014152	A	6	6	253132	253137	100 %	0 %	0 %	0 %	296131776
5127	NC_014152	TA	3	6	253198	253203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014152	TAAT	2	8	253255	253262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014152	TA	3	6	253286	253291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014152	ACC	2	6	253327	253332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131777
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5132	NC_014152	AGC	2	6	253384	253389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131777
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