MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 59504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013921	TGGA	2	8	145412	145419	25 %	25 %	50 %	0 %	289577391
3502	NC_013921	ATA	3	9	145429	145437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577391
3503	NC_013921	GTT	2	6	145501	145506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577391
3504	NC_013921	AAG	2	6	145541	145546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577391
3505	NC_013921	A	6	6	145581	145586	100 %	0 %	0 %	0 %	289577391
3506	NC_013921	TA	3	6	145657	145662	50 %	50 %	0 %	0 %	289577391
3507	NC_013921	A	8	8	145689	145696	100 %	0 %	0 %	0 %	289577391
3508	NC_013921	AGA	2	6	145710	145715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577391
3509	NC_013921	A	6	6	145732	145737	100 %	0 %	0 %	0 %	289577391
3510	NC_013921	A	6	6	145777	145782	100 %	0 %	0 %	0 %	289577391
3511	NC_013921	ATT	2	6	145789	145794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577391
3512	NC_013921	TAT	2	6	145923	145928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577391
3513	NC_013921	GCT	2	6	145945	145950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577391
3514	NC_013921	TAT	2	6	145993	145998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577392
3515	NC_013921	TG	3	6	146000	146005	0 %	50 %	50 %	0 %	289577392
3516	NC_013921	CAA	2	6	146130	146135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577392
3517	NC_013921	A	6	6	146189	146194	100 %	0 %	0 %	0 %	289577392
3518	NC_013921	AGA	2	6	146213	146218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577392
3519	NC_013921	AATTT	2	10	146223	146232	40 %	60 %	0 %	0 %	289577392
3520	NC_013921	TA	3	6	146365	146370	50 %	50 %	0 %	0 %	289577392
3521	NC_013921	AGA	2	6	146426	146431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577392
3522	NC_013921	AAGG	2	8	146432	146439	50 %	0 %	50 %	0 %	289577392
3523	NC_013921	A	6	6	146442	146447	100 %	0 %	0 %	0 %	289577392
3524	NC_013921	TGG	2	6	146471	146476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289577392
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3526	NC_013921	A	7	7	146498	146504	100 %	0 %	0 %	0 %	289577392
3527	NC_013921	GCT	2	6	146691	146696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577392
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3529	NC_013921	GCT	2	6	146724	146729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577392
3530	NC_013921	AAT	2	6	146739	146744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577392
3531	NC_013921	AGG	2	6	146762	146767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577392
3532	NC_013921	TGA	2	6	146794	146799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577392
3533	NC_013921	TGG	2	6	146800	146805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289577392
3534	NC_013921	AGG	2	6	146831	146836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577392
3535	NC_013921	AGA	2	6	146847	146852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577392
3536	NC_013921	GA	3	6	146874	146879	50 %	0 %	50 %	0 %	289577392
3537	NC_013921	GAAA	2	8	146911	146918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013921	AGG	2	6	146931	146936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013921	A	6	6	146938	146943	100 %	0 %	0 %	0 %	289577393
3540	NC_013921	ACA	2	6	146981	146986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577393
3541	NC_013921	TAG	2	6	147040	147045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577393
3542	NC_013921	GA	3	6	147080	147085	50 %	0 %	50 %	0 %	289577393
3543	NC_013921	TGGCAA	2	12	147121	147132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289577393
3544	NC_013921	A	7	7	147152	147158	100 %	0 %	0 %	0 %	289577393
3545	NC_013921	AAT	2	6	147164	147169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577393
3546	NC_013921	CTG	2	6	147223	147228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577393
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3548	NC_013921	GTA	2	6	147330	147335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577393
3549	NC_013921	AGG	2	6	147353	147358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577393
3550	NC_013921	TGC	2	6	147368	147373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577393
3551	NC_013921	AAAG	2	8	147387	147394	75 %	0 %	25 %	0 %	289577393
3552	NC_013921	GC	3	6	147397	147402	0 %	0 %	50 %	50 %	289577393
3553	NC_013921	GCT	2	6	147429	147434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577393
3554	NC_013921	TAGC	2	8	147487	147494	25 %	25 %	25 %	25 %	289577393
3555	NC_013921	AAT	2	6	147571	147576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577393
3556	NC_013921	TAG	2	6	147698	147703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577394
3557	NC_013921	TCC	2	6	147738	147743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577394
3558	NC_013921	GAA	2	6	147763	147768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577394
3559	NC_013921	GTT	2	6	147773	147778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577394
3560	NC_013921	GA	3	6	147780	147785	50 %	0 %	50 %	0 %	289577394
3561	NC_013921	GCA	2	6	147862	147867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577394
3562	NC_013921	TG	3	6	147926	147931	0 %	50 %	50 %	0 %	289577394
3563	NC_013921	TTAA	2	8	147940	147947	50 %	50 %	0 %	0 %	289577394
3564	NC_013921	GAA	2	6	147973	147978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577394
3565	NC_013921	GA	3	6	148042	148047	50 %	0 %	50 %	0 %	289577394
3566	NC_013921	ATA	2	6	148052	148057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013921	TCAA	2	8	148064	148071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_013921	A	6	6	148103	148108	100 %	0 %	0 %	0 %	289577395
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3570	NC_013921	CATA	2	8	148227	148234	50 %	25 %	0 %	25 %	289577395
3571	NC_013921	T	7	7	148298	148304	0 %	100 %	0 %	0 %	289577395
3572	NC_013921	GCA	2	6	148354	148359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577395
3573	NC_013921	GAC	2	6	148372	148377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577395
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3578	NC_013921	GTTG	2	8	148505	148512	0 %	50 %	50 %	0 %	289577395
3579	NC_013921	T	6	6	148529	148534	0 %	100 %	0 %	0 %	289577395
3580	NC_013921	GGT	2	6	148536	148541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289577395
3581	NC_013921	GCA	2	6	148588	148593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577395
3582	NC_013921	ATC	2	6	148608	148613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577395
3583	NC_013921	CTG	2	6	148658	148663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577395
3584	NC_013921	TGC	2	6	148686	148691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577395
3585	NC_013921	TAC	2	6	148863	148868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577395
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3587	NC_013921	TGC	2	6	149000	149005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577395
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3589	NC_013921	ATT	2	6	149056	149061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577395
3590	NC_013921	TTTG	2	8	149076	149083	0 %	75 %	25 %	0 %	289577395
3591	NC_013921	A	7	7	149123	149129	100 %	0 %	0 %	0 %	289577395
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3594	NC_013921	CAT	2	6	149355	149360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577396
3595	NC_013921	GAAA	2	8	149361	149368	75 %	0 %	25 %	0 %	289577396
3596	NC_013921	AACA	2	8	149369	149376	75 %	0 %	0 %	25 %	289577396
3597	NC_013921	TAC	2	6	149388	149393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577396
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3601	NC_013921	AATCT	2	10	149636	149645	40 %	40 %	0 %	20 %	289577396
3602	NC_013921	AAG	2	6	149651	149656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577396
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3604	NC_013921	TA	3	6	149711	149716	50 %	50 %	0 %	0 %	289577396
3605	NC_013921	AG	3	6	149723	149728	50 %	0 %	50 %	0 %	289577396
3606	NC_013921	AAT	2	6	149770	149775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577396
3607	NC_013921	A	6	6	149776	149781	100 %	0 %	0 %	0 %	289577396
3608	NC_013921	TTG	2	6	149786	149791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577396
3609	NC_013921	AT	3	6	149834	149839	50 %	50 %	0 %	0 %	289577396
3610	NC_013921	TA	3	6	149881	149886	50 %	50 %	0 %	0 %	289577396
3611	NC_013921	GTA	2	6	149911	149916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577396
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3613	NC_013921	TGA	2	6	150020	150025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577396
3614	NC_013921	GAA	2	6	150046	150051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577396
3615	NC_013921	GA	3	6	150084	150089	50 %	0 %	50 %	0 %	289577396
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3619	NC_013921	AAT	2	6	150255	150260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577396
3620	NC_013921	TGAC	2	8	150287	150294	25 %	25 %	25 %	25 %	289577396
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3622	NC_013921	TATT	2	8	150346	150353	25 %	75 %	0 %	0 %	289577397
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