MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 59504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013921	TTC	2	6	206068	206073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577450
5002	NC_013921	AGA	2	6	206158	206163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577450
5003	NC_013921	GTA	2	6	206219	206224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577450
5004	NC_013921	A	6	6	206244	206249	100 %	0 %	0 %	0 %	289577450
5005	NC_013921	TAA	2	6	206259	206264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577450
5006	NC_013921	TA	3	6	206357	206362	50 %	50 %	0 %	0 %	289577450
5007	NC_013921	GAT	2	6	206411	206416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577450
5008	NC_013921	TA	3	6	206475	206480	50 %	50 %	0 %	0 %	289577450
5009	NC_013921	CTC	2	6	206481	206486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577450
5010	NC_013921	A	7	7	206520	206526	100 %	0 %	0 %	0 %	289577450
5011	NC_013921	TGC	2	6	206563	206568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577450
5012	NC_013921	CTTA	2	8	206635	206642	25 %	50 %	0 %	25 %	289577450
5013	NC_013921	AGC	2	6	206675	206680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577450
5014	NC_013921	TAA	2	6	206691	206696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577450
5015	NC_013921	CAA	2	6	206703	206708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577450
5016	NC_013921	AGA	2	6	206761	206766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577450
5017	NC_013921	ATT	2	6	206812	206817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577450
5018	NC_013921	TGA	2	6	206842	206847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577450
5019	NC_013921	AAG	2	6	206904	206909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577450
5020	NC_013921	TAA	2	6	206910	206915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577450
5021	NC_013921	GAAT	2	8	206928	206935	50 %	25 %	25 %	0 %	289577450
5022	NC_013921	ACC	2	6	206977	206982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577450
5023	NC_013921	GTT	2	6	207002	207007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577450
5024	NC_013921	GAA	2	6	207110	207115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577450
5025	NC_013921	CTT	2	6	207205	207210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577450
5026	NC_013921	GT	3	6	207267	207272	0 %	50 %	50 %	0 %	289577450
5027	NC_013921	TGG	2	6	207286	207291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289577450
5028	NC_013921	AAACA	2	10	207352	207361	80 %	0 %	0 %	20 %	289577450
5029	NC_013921	ACC	2	6	207373	207378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577450
5030	NC_013921	CCT	2	6	207383	207388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577450
5031	NC_013921	TAT	2	6	207390	207395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577450
5032	NC_013921	TGA	2	6	207397	207402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577450
5033	NC_013921	CAA	2	6	207521	207526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577450
5034	NC_013921	TA	3	6	207573	207578	50 %	50 %	0 %	0 %	289577450
5035	NC_013921	ATT	2	6	207617	207622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013921	AGT	2	6	207643	207648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013921	AAGA	2	8	207688	207695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_013921	GAG	2	6	207696	207701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013921	TTG	2	6	207704	207709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577451
5040	NC_013921	AGC	2	6	207775	207780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577451
5041	NC_013921	GA	3	6	207872	207877	50 %	0 %	50 %	0 %	289577451
5042	NC_013921	AGA	2	6	207889	207894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577451
5043	NC_013921	AATTT	2	10	207897	207906	40 %	60 %	0 %	0 %	289577451
5044	NC_013921	TTG	2	6	207924	207929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577451
5045	NC_013921	TG	3	6	207973	207978	0 %	50 %	50 %	0 %	289577451
5046	NC_013921	ATT	3	9	208039	208047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577451
5047	NC_013921	ACAAAA	2	12	208089	208100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289577451
5048	NC_013921	GTA	2	6	208115	208120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577451
5049	NC_013921	AGA	2	6	208132	208137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577451
5050	NC_013921	AGA	2	6	208141	208146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577451
5051	NC_013921	ATT	2	6	208178	208183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577451
5052	NC_013921	TAT	2	6	208247	208252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577451
5053	NC_013921	CTT	2	6	208300	208305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577451
5054	NC_013921	ATG	2	6	208371	208376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577451
5055	NC_013921	TTTGAA	2	12	208466	208477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289577451
5056	NC_013921	A	6	6	208541	208546	100 %	0 %	0 %	0 %	289577451
5057	NC_013921	TGA	2	6	208672	208677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577451
5058	NC_013921	T	7	7	208699	208705	0 %	100 %	0 %	0 %	289577451
5059	NC_013921	TAG	2	6	208710	208715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577451
5060	NC_013921	A	7	7	208787	208793	100 %	0 %	0 %	0 %	289577452
5061	NC_013921	TAT	2	6	208888	208893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577452
5062	NC_013921	TAA	2	6	208927	208932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577452
5063	NC_013921	GAA	2	6	208939	208944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577452
5064	NC_013921	ATT	2	6	208962	208967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577452
5065	NC_013921	TCT	2	6	208976	208981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577452
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5067	NC_013921	AGA	2	6	209002	209007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577452
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5070	NC_013921	AAG	2	6	209085	209090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577452
5071	NC_013921	TAT	2	6	209136	209141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577452
5072	NC_013921	T	6	6	209148	209153	0 %	100 %	0 %	0 %	289577452
5073	NC_013921	CT	3	6	209182	209187	0 %	50 %	0 %	50 %	289577452
5074	NC_013921	GAAATA	2	12	209192	209203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577452
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5080	NC_013921	GAGTA	2	10	209326	209335	40 %	20 %	40 %	0 %	289577452
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5088	NC_013921	TA	3	6	209606	209611	50 %	50 %	0 %	0 %	289577452
5089	NC_013921	TGG	2	6	209620	209625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289577452
5090	NC_013921	GA	3	6	209779	209784	50 %	0 %	50 %	0 %	289577452
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5093	NC_013921	AAATA	2	10	209865	209874	80 %	20 %	0 %	0 %	289577452
5094	NC_013921	AG	3	6	209897	209902	50 %	0 %	50 %	0 %	289577452
5095	NC_013921	A	6	6	209931	209936	100 %	0 %	0 %	0 %	289577452
5096	NC_013921	GAAA	2	8	210016	210023	75 %	0 %	25 %	0 %	289577452
5097	NC_013921	GTT	2	6	210074	210079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577452
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5102	NC_013921	TCA	2	6	210370	210375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577452
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5104	NC_013921	TGA	2	6	210541	210546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577452
5105	NC_013921	ACTTTT	2	12	210547	210558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289577452
5106	NC_013921	T	7	7	210555	210561	0 %	100 %	0 %	0 %	289577452
5107	NC_013921	CCA	2	6	210562	210567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577452
5108	NC_013921	AT	3	6	210615	210620	50 %	50 %	0 %	0 %	289577452
5109	NC_013921	GAA	2	6	210644	210649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577452
5110	NC_013921	AAAAG	2	10	210661	210670	80 %	0 %	20 %	0 %	289577452
5111	NC_013921	TGA	2	6	210694	210699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577452
5112	NC_013921	GA	3	6	210760	210765	50 %	0 %	50 %	0 %	289577452
5113	NC_013921	GTA	2	6	210767	210772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577452
5114	NC_013921	ATA	2	6	210813	210818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577452
5115	NC_013921	GGGA	2	8	210876	210883	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013921	CAT	2	6	210914	210919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577453
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5118	NC_013921	GTA	2	6	210977	210982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577453
5119	NC_013921	ATG	2	6	210987	210992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577453
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5122	NC_013921	AAAT	2	8	211155	211162	75 %	25 %	0 %	0 %	289577453
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5124	NC_013921	ATT	2	6	211217	211222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577453
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5249	NC_013921	AT	3	6	216732	216737	50 %	50 %	0 %	0 %	289577455
5250	NC_013921	AT	3	6	216755	216760	50 %	50 %	0 %	0 %	289577455
5251	NC_013921	TAAA	2	8	216864	216871	75 %	25 %	0 %	0 %	289577455
5252	NC_013921	AAT	2	6	216923	216928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577455
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5256	NC_013921	TGA	2	6	217144	217149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577455
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5321	NC_013921	A	6	6	219474	219479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5367	NC_013921	GGA	2	6	221289	221294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5372	NC_013921	CATT	2	8	221384	221391	25 %	50 %	0 %	25 %	289577458
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5494	NC_013921	TA	3	6	226448	226453	50 %	50 %	0 %	0 %	289577461
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5500	NC_013921	ATG	2	6	226803	226808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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