MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 21611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013894	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013894	GAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547778
3	NC_013894	TTA	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547778
4	NC_013894	AGG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547779
5	NC_013894	AAG	2	6	940	945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547779
6	NC_013894	AGG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547779
7	NC_013894	CTT	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547779
8	NC_013894	AAG	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547779
9	NC_013894	AGA	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547779
10	NC_013894	TTA	2	6	1171	1176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547779
11	NC_013894	CTA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547779
12	NC_013894	AAG	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547780
13	NC_013894	TGA	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547780
14	NC_013894	TCC	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547780
15	NC_013894	CAT	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547780
16	NC_013894	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547780
17	NC_013894	ATC	2	6	1722	1727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547780
18	NC_013894	GGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547780
19	NC_013894	GAA	4	12	1994	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547780
20	NC_013894	GGT	2	6	2161	2166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547780
21	NC_013894	CAT	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547780
22	NC_013894	TTG	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547780
23	NC_013894	AGG	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547780
24	NC_013894	AGA	3	9	2459	2467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
25	NC_013894	CTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547781
26	NC_013894	AAG	2	6	2638	2643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
27	NC_013894	GAA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
28	NC_013894	CTG	3	9	2695	2703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547781
29	NC_013894	CCT	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547781
30	NC_013894	GCG	2	6	2808	2813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547781
31	NC_013894	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
32	NC_013894	CAC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547781
33	NC_013894	ACC	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547781
34	NC_013894	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
35	NC_013894	CAG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547781
36	NC_013894	AAC	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547781
37	NC_013894	ATG	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547781
38	NC_013894	GAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547781
39	NC_013894	CTT	3	9	3539	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547781
40	NC_013894	GTA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547781
41	NC_013894	ATT	2	6	3794	3799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547782
42	NC_013894	GAA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547782
43	NC_013894	TGG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547782
44	NC_013894	AGA	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547782
45	NC_013894	CTA	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547782
46	NC_013894	AGA	2	6	4392	4397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547782
47	NC_013894	GGT	3	9	4513	4521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547783
48	NC_013894	CTA	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547783
49	NC_013894	AGG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547783
50	NC_013894	GCC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289547783
51	NC_013894	AGA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547783
52	NC_013894	ACT	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547783
53	NC_013894	TTC	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547783
54	NC_013894	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547783
55	NC_013894	AGA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
56	NC_013894	AAG	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
57	NC_013894	AGA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
58	NC_013894	CTT	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547784
59	NC_013894	CTG	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547784
60	NC_013894	GAA	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
61	NC_013894	AGA	2	6	6208	6213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
62	NC_013894	AGA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
63	NC_013894	TAA	2	6	6288	6293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
64	NC_013894	GAA	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
65	NC_013894	TTA	2	6	6364	6369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547784
66	NC_013894	GAA	2	6	6470	6475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
67	NC_013894	GAA	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
68	NC_013894	AGT	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547784
69	NC_013894	GTT	2	6	6689	6694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547784
70	NC_013894	GAA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
71	NC_013894	AGG	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547784
72	NC_013894	AGC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547784
73	NC_013894	AGG	2	6	6835	6840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547784
74	NC_013894	ATA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
75	NC_013894	AAT	2	6	7187	7192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
76	NC_013894	ATT	2	6	7248	7253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547784
77	NC_013894	TGA	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547784
78	NC_013894	AGA	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
79	NC_013894	GAA	2	6	7284	7289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
80	NC_013894	AAT	2	6	7295	7300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
81	NC_013894	CTT	2	6	7310	7315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547784
82	NC_013894	GTA	2	6	7319	7324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547784
83	NC_013894	AGG	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547784
84	NC_013894	TGG	2	6	7400	7405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547785
85	NC_013894	TCT	3	9	7510	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547785
86	NC_013894	AGA	3	9	7523	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547785
87	NC_013894	TAC	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547785
88	NC_013894	AGA	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547785
89	NC_013894	AGA	2	6	7772	7777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547785
90	NC_013894	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547785
91	NC_013894	GAC	2	6	7896	7901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547785
92	NC_013894	GGA	2	6	7920	7925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547785
93	NC_013894	AGA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547785
94	NC_013894	AGG	2	6	8054	8059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547785
95	NC_013894	TGA	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547785
96	NC_013894	TAT	2	6	8134	8139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547785
97	NC_013894	AGG	2	6	8345	8350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547785
98	NC_013894	TAC	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547786
99	NC_013894	AAG	2	6	8539	8544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547786
100	NC_013894	CAA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547786
101	NC_013894	AGA	3	9	8619	8627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547786
102	NC_013894	TGA	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547786
103	NC_013894	GTA	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547786
104	NC_013894	GTT	2	6	8683	8688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547786
105	NC_013894	AGA	2	6	8781	8786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547786
106	NC_013894	TGA	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547786
107	NC_013894	AAG	2	6	8878	8883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547786
108	NC_013894	TGT	2	6	8886	8891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547786
109	NC_013894	GAT	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547786
110	NC_013894	GAC	2	6	9007	9012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547786
111	NC_013894	AGA	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547786
112	NC_013894	AGA	2	6	9108	9113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547786
113	NC_013894	GGA	2	6	9214	9219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547786
114	NC_013894	ATG	2	6	9257	9262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547786
115	NC_013894	GAT	2	6	9376	9381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547787
116	NC_013894	AGA	2	6	9454	9459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547787
117	NC_013894	ACA	2	6	9542	9547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547787
118	NC_013894	GAT	2	6	9675	9680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547788
119	NC_013894	AAG	2	6	9780	9785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
120	NC_013894	GAA	2	6	10056	10061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
121	NC_013894	GAA	2	6	10092	10097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
122	NC_013894	AGA	2	6	10166	10171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
123	NC_013894	AAT	2	6	10242	10247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547788
124	NC_013894	TAT	2	6	10260	10265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547788
125	NC_013894	TTC	2	6	10317	10322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547788
126	NC_013894	GAA	2	6	10377	10382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
127	NC_013894	CTT	2	6	10413	10418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547788
128	NC_013894	AAG	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
129	NC_013894	AGG	2	6	10455	10460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547788
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131	NC_013894	AAG	2	6	10486	10491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547788
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257	NC_013894	ATA	2	6	19521	19526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547798
258	NC_013894	AGG	2	6	19528	19533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547798
259	NC_013894	TAA	2	6	19782	19787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_013894	ACC	2	6	20725	20730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547800
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314	NC_013894	ATA	2	6	23275	23280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547804
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383	NC_013894	CTC	2	6	28880	28885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
384	NC_013894	TCT	2	6	28917	28922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
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387	NC_013894	TCA	2	6	29232	29237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547809
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