MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013894	AAGA	2	8	180029	180036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013894	AG	3	6	180180	180185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013894	CT	3	6	180257	180262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_013894	CT	3	6	180270	180275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_013894	A	6	6	180313	180318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013894	TGG	2	6	180411	180416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547967
4007	NC_013894	TA	3	6	180421	180426	50 %	50 %	0 %	0 %	289547967
4008	NC_013894	AGG	2	6	180432	180437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547967
4009	NC_013894	TTC	2	6	180450	180455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547967
4010	NC_013894	ATA	2	6	180488	180493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013894	CTG	2	6	180512	180517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547968
4012	NC_013894	AAG	2	6	180589	180594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547968
4013	NC_013894	CCA	2	6	180618	180623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547968
4014	NC_013894	CTGG	2	8	180700	180707	0 %	25 %	50 %	25 %	289547968
4015	NC_013894	CTT	2	6	180961	180966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547968
4016	NC_013894	ACA	2	6	181032	181037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547968
4017	NC_013894	AG	3	6	181058	181063	50 %	0 %	50 %	0 %	289547968
4018	NC_013894	TCT	2	6	181086	181091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4019	NC_013894	TTTC	3	12	181092	181103	0 %	75 %	0 %	25 %	289547969
4020	NC_013894	GGA	2	6	181161	181166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547969
4021	NC_013894	CCT	2	6	181219	181224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547969
4022	NC_013894	TGG	2	6	181226	181231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547969
4023	NC_013894	CAG	2	6	181248	181253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547969
4024	NC_013894	T	7	7	181298	181304	0 %	100 %	0 %	0 %	289547969
4025	NC_013894	TCTG	2	8	181314	181321	0 %	50 %	25 %	25 %	289547969
4026	NC_013894	GTT	2	6	181347	181352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547969
4027	NC_013894	TGA	2	6	181353	181358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547969
4028	NC_013894	CTGT	2	8	181393	181400	0 %	50 %	25 %	25 %	289547969
4029	NC_013894	CTT	2	6	181420	181425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4030	NC_013894	T	6	6	181443	181448	0 %	100 %	0 %	0 %	289547969
4031	NC_013894	A	7	7	181493	181499	100 %	0 %	0 %	0 %	289547969
4032	NC_013894	CT	3	6	181500	181505	0 %	50 %	0 %	50 %	289547969
4033	NC_013894	T	6	6	181527	181532	0 %	100 %	0 %	0 %	289547969
4034	NC_013894	AGTA	2	8	181552	181559	50 %	25 %	25 %	0 %	289547969
4035	NC_013894	CTG	2	6	181562	181567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547969
4036	NC_013894	CTC	2	6	181588	181593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547969
4037	NC_013894	TCT	2	6	181596	181601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4038	NC_013894	CTGC	2	8	181651	181658	0 %	25 %	25 %	50 %	289547969
4039	NC_013894	T	6	6	181660	181665	0 %	100 %	0 %	0 %	289547969
4040	NC_013894	CTT	2	6	181713	181718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4041	NC_013894	TG	3	6	181755	181760	0 %	50 %	50 %	0 %	289547969
4042	NC_013894	CTT	3	9	181815	181823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4043	NC_013894	GGTT	2	8	181834	181841	0 %	50 %	50 %	0 %	289547969
4044	NC_013894	GAA	2	6	181851	181856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547969
4045	NC_013894	T	7	7	181903	181909	0 %	100 %	0 %	0 %	289547969
4046	NC_013894	CTT	2	6	182018	182023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4047	NC_013894	TC	3	6	182032	182037	0 %	50 %	0 %	50 %	289547969
4048	NC_013894	TTC	2	6	182051	182056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547969
4049	NC_013894	TGG	2	6	182078	182083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547969
4050	NC_013894	TAC	2	6	182096	182101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547969
4051	NC_013894	CTC	2	6	182102	182107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547969
4052	NC_013894	CTA	2	6	182117	182122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547969
4053	NC_013894	TTG	2	6	182143	182148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547969
4054	NC_013894	GAG	2	6	182179	182184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547969
4055	NC_013894	CGG	2	6	182213	182218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547969
4056	NC_013894	AGG	2	6	182272	182277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547969
4057	NC_013894	GA	3	6	182298	182303	50 %	0 %	50 %	0 %	289547969
4058	NC_013894	GAA	2	6	182310	182315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547969
4059	NC_013894	CAG	2	6	182361	182366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547969
4060	NC_013894	AGAGG	2	10	182394	182403	40 %	0 %	60 %	0 %	289547969
4061	NC_013894	TTG	2	6	182408	182413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547969
4062	NC_013894	GAG	2	6	182428	182433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547969
4063	NC_013894	TA	4	8	182446	182453	50 %	50 %	0 %	0 %	289547969
4064	NC_013894	GGA	2	6	182481	182486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547969
4065	NC_013894	TTA	2	6	182502	182507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547969
4066	NC_013894	T	6	6	182537	182542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013894	ATC	2	6	182547	182552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_013894	TTTC	2	8	182562	182569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_013894	ACT	2	6	182583	182588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_013894	TAG	2	6	182617	182622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013894	AG	3	6	182621	182626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013894	ACA	2	6	182689	182694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547970
4073	NC_013894	AAG	2	6	182721	182726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547970
4074	NC_013894	GGT	2	6	182772	182777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547970
4075	NC_013894	CAT	2	6	182805	182810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547970
4076	NC_013894	CCT	2	6	182828	182833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547970
4077	NC_013894	TCTG	2	8	182900	182907	0 %	50 %	25 %	25 %	289547970
4078	NC_013894	TCCT	2	8	182920	182927	0 %	50 %	0 %	50 %	289547970
4079	NC_013894	TGA	2	6	182971	182976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547970
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4081	NC_013894	GTA	2	6	183002	183007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547970
4082	NC_013894	GGAA	2	8	183008	183015	50 %	0 %	50 %	0 %	289547970
4083	NC_013894	AT	3	6	183029	183034	50 %	50 %	0 %	0 %	289547970
4084	NC_013894	GAA	2	6	183127	183132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547970
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4092	NC_013894	TGGC	2	8	183573	183580	0 %	25 %	50 %	25 %	289547971
4093	NC_013894	ACC	2	6	183602	183607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547971
4094	NC_013894	AGG	2	6	183618	183623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547971
4095	NC_013894	CGGTAG	2	12	183705	183716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289547971
4096	NC_013894	ACCT	2	8	183727	183734	25 %	25 %	0 %	50 %	289547971
4097	NC_013894	CCA	2	6	183735	183740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547971
4098	NC_013894	TC	3	6	183768	183773	0 %	50 %	0 %	50 %	289547971
4099	NC_013894	CTC	2	6	183778	183783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547971
4100	NC_013894	ATG	2	6	183785	183790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547971
4101	NC_013894	GCA	2	6	183822	183827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547971
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4103	NC_013894	GGT	2	6	183874	183879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547971
4104	NC_013894	CTC	2	6	183907	183912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547971
4105	NC_013894	AT	3	6	183922	183927	50 %	50 %	0 %	0 %	289547971
4106	NC_013894	TCT	2	6	183958	183963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547971
4107	NC_013894	GTG	2	6	184007	184012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547971
4108	NC_013894	CAG	2	6	184029	184034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547971
4109	NC_013894	TCA	2	6	184110	184115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547971
4110	NC_013894	GAA	2	6	184149	184154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547971
4111	NC_013894	GAA	2	6	184167	184172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547971
4112	NC_013894	TGT	2	6	184184	184189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547971
4113	NC_013894	ACC	2	6	184196	184201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547971
4114	NC_013894	ACCC	2	8	184336	184343	25 %	0 %	0 %	75 %	289547971
4115	NC_013894	GGTA	2	8	184405	184412	25 %	25 %	50 %	0 %	289547971
4116	NC_013894	CCG	2	6	184419	184424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289547971
4117	NC_013894	CCA	2	6	184467	184472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547971
4118	NC_013894	GTCA	2	8	184534	184541	25 %	25 %	25 %	25 %	289547971
4119	NC_013894	T	6	6	184560	184565	0 %	100 %	0 %	0 %	289547971
4120	NC_013894	GCT	2	6	184591	184596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547971
4121	NC_013894	CTT	2	6	184623	184628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547971
4122	NC_013894	TCA	2	6	184754	184759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547971
4123	NC_013894	AAG	2	6	184805	184810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547971
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4125	NC_013894	TGT	2	6	184944	184949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547971
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4242	NC_013894	CA	3	6	189743	189748	50 %	0 %	0 %	50 %	289547975
4243	NC_013894	CTCGTA	2	12	189854	189865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289547975
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4362	NC_013894	ACCT	2	8	195541	195548	25 %	25 %	0 %	50 %	289547981
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4494	NC_013894	AG	3	6	201909	201914	50 %	0 %	50 %	0 %	289547986
4495	NC_013894	TA	3	6	201917	201922	50 %	50 %	0 %	0 %	289547986
4496	NC_013894	AAG	2	6	201963	201968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547986
4497	NC_013894	ATG	2	6	201993	201998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547986
4498	NC_013894	GGA	2	6	202055	202060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547986
4499	NC_013894	GAA	2	6	202065	202070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547986
4500	NC_013894	GAG	2	6	202083	202088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547986

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