MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013894	ATAC	2	8	134003	134010	50 %	25 %	0 %	25 %	289547917
3002	NC_013894	AGG	2	6	134040	134045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547917
3003	NC_013894	GGGCT	2	10	134097	134106	0 %	20 %	60 %	20 %	289547917
3004	NC_013894	ACC	2	6	134112	134117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547917
3005	NC_013894	TG	3	6	134230	134235	0 %	50 %	50 %	0 %	289547917
3006	NC_013894	TAC	2	6	134269	134274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547918
3007	NC_013894	AGG	2	6	134315	134320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547918
3008	NC_013894	CAT	2	6	134334	134339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547918
3009	NC_013894	TAT	2	6	134379	134384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547918
3010	NC_013894	CCTA	2	8	134391	134398	25 %	25 %	0 %	50 %	289547918
3011	NC_013894	TGAG	2	8	134453	134460	25 %	25 %	50 %	0 %	289547918
3012	NC_013894	CT	3	6	134531	134536	0 %	50 %	0 %	50 %	289547918
3013	NC_013894	GGA	2	6	134556	134561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547918
3014	NC_013894	GGT	2	6	134680	134685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547918
3015	NC_013894	GT	3	6	134719	134724	0 %	50 %	50 %	0 %	289547918
3016	NC_013894	TCC	2	6	134727	134732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547918
3017	NC_013894	CTT	3	9	134734	134742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547918
3018	NC_013894	ACC	2	6	134755	134760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547918
3019	NC_013894	AGA	2	6	134780	134785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547918
3020	NC_013894	GTG	2	6	134857	134862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547918
3021	NC_013894	AGG	2	6	134894	134899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547918
3022	NC_013894	CTC	2	6	134942	134947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547918
3023	NC_013894	GAA	2	6	134984	134989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547918
3024	NC_013894	TCC	2	6	135060	135065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547919
3025	NC_013894	TCC	3	9	135084	135092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547919
3026	NC_013894	AT	3	6	135118	135123	50 %	50 %	0 %	0 %	289547919
3027	NC_013894	TA	3	6	135239	135244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013894	TCC	2	6	135284	135289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547920
3029	NC_013894	CTCC	2	8	135387	135394	0 %	25 %	0 %	75 %	289547920
3030	NC_013894	ACC	2	6	135407	135412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547920
3031	NC_013894	CT	3	6	135419	135424	0 %	50 %	0 %	50 %	289547920
3032	NC_013894	CCA	2	6	135507	135512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547920
3033	NC_013894	TTC	2	6	135535	135540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547920
3034	NC_013894	GT	3	6	135550	135555	0 %	50 %	50 %	0 %	289547920
3035	NC_013894	TAA	2	6	135752	135757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547920
3036	NC_013894	AGT	2	6	135846	135851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547920
3037	NC_013894	TCCT	2	8	135871	135878	0 %	50 %	0 %	50 %	289547920
3038	NC_013894	GAG	2	6	135994	135999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547920
3039	NC_013894	T	6	6	136033	136038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013894	AGGGT	2	10	136061	136070	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_013894	AGG	2	6	136097	136102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_013894	GAA	2	6	136114	136119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547921
3043	NC_013894	GTG	2	6	136191	136196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547921
3044	NC_013894	TGG	2	6	136199	136204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547921
3045	NC_013894	ATA	2	6	136244	136249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547921
3046	NC_013894	CT	3	6	136260	136265	0 %	50 %	0 %	50 %	289547921
3047	NC_013894	GTG	2	6	136271	136276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547921
3048	NC_013894	TGG	3	9	136445	136453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547922
3049	NC_013894	AGGG	2	8	136480	136487	25 %	0 %	75 %	0 %	289547922
3050	NC_013894	GAG	2	6	136506	136511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547922
3051	NC_013894	ACC	2	6	136579	136584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547922
3052	NC_013894	GAA	2	6	136620	136625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547922
3053	NC_013894	TTA	2	6	136658	136663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547922
3054	NC_013894	TCC	2	6	136696	136701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547923
3055	NC_013894	CTG	2	6	136722	136727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547923
3056	NC_013894	TTTCT	2	10	136728	136737	0 %	80 %	0 %	20 %	289547923
3057	NC_013894	CTTC	2	8	136742	136749	0 %	50 %	0 %	50 %	289547923
3058	NC_013894	TCC	2	6	136855	136860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547923
3059	NC_013894	GTG	3	9	136866	136874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547923
3060	NC_013894	AAGAT	2	10	136941	136950	60 %	20 %	20 %	0 %	289547923
3061	NC_013894	CTC	2	6	137071	137076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547923
3062	NC_013894	ACTT	2	8	137136	137143	25 %	50 %	0 %	25 %	289547923
3063	NC_013894	CAT	2	6	137171	137176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547923
3064	NC_013894	GAA	2	6	137223	137228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547923
3065	NC_013894	CTC	2	6	137229	137234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547923
3066	NC_013894	GAA	2	6	137253	137258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547923
3067	NC_013894	GAAG	2	8	137300	137307	50 %	0 %	50 %	0 %	289547923
3068	NC_013894	AGAT	2	8	137365	137372	50 %	25 %	25 %	0 %	289547923
3069	NC_013894	AGAA	2	8	137397	137404	75 %	0 %	25 %	0 %	289547923
3070	NC_013894	AGAT	2	8	137440	137447	50 %	25 %	25 %	0 %	289547923
3071	NC_013894	ACA	2	6	137455	137460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547923
3072	NC_013894	CT	3	6	137513	137518	0 %	50 %	0 %	50 %	289547923
3073	NC_013894	GCT	2	6	137523	137528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547923
3074	NC_013894	GAGG	2	8	137574	137581	25 %	0 %	75 %	0 %	289547923
3075	NC_013894	CTT	2	6	137585	137590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547923
3076	NC_013894	TTAC	2	8	137596	137603	25 %	50 %	0 %	25 %	289547923
3077	NC_013894	GAA	2	6	137615	137620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547923
3078	NC_013894	ACAG	2	8	137632	137639	50 %	0 %	25 %	25 %	289547923
3079	NC_013894	AGC	2	6	137690	137695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547924
3080	NC_013894	CAT	2	6	137700	137705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547924
3081	NC_013894	AG	3	6	137708	137713	50 %	0 %	50 %	0 %	289547924
3082	NC_013894	AGG	3	9	137732	137740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547924
3083	NC_013894	A	6	6	137749	137754	100 %	0 %	0 %	0 %	289547924
3084	NC_013894	GTG	2	6	137827	137832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547924
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3087	NC_013894	ACC	2	6	137940	137945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547924
3088	NC_013894	GAG	2	6	137956	137961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547924
3089	NC_013894	AAGG	2	8	138142	138149	50 %	0 %	50 %	0 %	289547924
3090	NC_013894	TA	3	6	138174	138179	50 %	50 %	0 %	0 %	289547924
3091	NC_013894	ACT	2	6	138183	138188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547924
3092	NC_013894	TGGG	2	8	138230	138237	0 %	25 %	75 %	0 %	289547924
3093	NC_013894	TGG	2	6	138260	138265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547924
3094	NC_013894	TGG	2	6	138326	138331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547924
3095	NC_013894	CTC	2	6	138457	138462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547924
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3097	NC_013894	A	6	6	138486	138491	100 %	0 %	0 %	0 %	289547924
3098	NC_013894	AAG	2	6	138523	138528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547924
3099	NC_013894	AGG	2	6	138566	138571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547924
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3101	NC_013894	GA	3	6	138598	138603	50 %	0 %	50 %	0 %	289547924
3102	NC_013894	GGT	2	6	138742	138747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547924
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3104	NC_013894	CCT	2	6	138907	138912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547925
3105	NC_013894	ATT	2	6	138933	138938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547925
3106	NC_013894	ATA	2	6	139056	139061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547925
3107	NC_013894	CTG	2	6	139121	139126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547926
3108	NC_013894	TCC	2	6	139145	139150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
3109	NC_013894	T	6	6	139168	139173	0 %	100 %	0 %	0 %	289547926
3110	NC_013894	TTC	2	6	139214	139219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3111	NC_013894	TCC	2	6	139229	139234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
3112	NC_013894	AG	3	6	139235	139240	50 %	0 %	50 %	0 %	289547926
3113	NC_013894	CAC	2	6	139252	139257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547926
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3115	NC_013894	CTT	2	6	139302	139307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3116	NC_013894	CAGA	2	8	139398	139405	50 %	0 %	25 %	25 %	289547926
3117	NC_013894	TCT	2	6	139450	139455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3118	NC_013894	TTC	2	6	139492	139497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3119	NC_013894	TC	3	6	139526	139531	0 %	50 %	0 %	50 %	289547926
3120	NC_013894	GGAA	2	8	139611	139618	50 %	0 %	50 %	0 %	289547926
3121	NC_013894	CAT	2	6	139642	139647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547926
3122	NC_013894	CCTT	2	8	139747	139754	0 %	50 %	0 %	50 %	289547926
3123	NC_013894	TCC	2	6	139772	139777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
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3125	NC_013894	CCT	2	6	139859	139864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
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3249	NC_013894	CAT	2	6	144401	144406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547931
3250	NC_013894	AC	3	6	144436	144441	50 %	0 %	0 %	50 %	289547931
3251	NC_013894	CTT	2	6	144507	144512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547931
3252	NC_013894	TTC	2	6	144514	144519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547931
3253	NC_013894	CTTA	2	8	144527	144534	25 %	50 %	0 %	25 %	289547931
3254	NC_013894	CCA	2	6	144538	144543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547931
3255	NC_013894	TGA	2	6	144565	144570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547931
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3257	NC_013894	CTC	2	6	144629	144634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547931
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3261	NC_013894	ATA	2	6	144764	144769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547932
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3263	NC_013894	CAT	2	6	144961	144966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547932
3264	NC_013894	TCA	2	6	145137	145142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547932
3265	NC_013894	CCA	2	6	145143	145148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547932
3266	NC_013894	TGG	3	9	145191	145199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547932
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3270	NC_013894	ATACG	2	10	145321	145330	40 %	20 %	20 %	20 %	289547932
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3278	NC_013894	GGTA	2	8	145759	145766	25 %	25 %	50 %	0 %	289547932
3279	NC_013894	CCA	2	6	145833	145838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547932
3280	NC_013894	AGAC	2	8	145900	145907	50 %	0 %	25 %	25 %	289547932
3281	NC_013894	TC	3	6	145916	145921	0 %	50 %	0 %	50 %	289547932
3282	NC_013894	TGG	2	6	145938	145943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547932
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3290	NC_013894	TAG	2	6	146448	146453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547933
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3298	NC_013894	GTT	2	6	146865	146870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547933
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3300	NC_013894	CAC	2	6	146985	146990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547933
3301	NC_013894	GGA	2	6	146997	147002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547933
3302	NC_013894	CAC	2	6	147048	147053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547933
3303	NC_013894	TCCTC	2	10	147097	147106	0 %	40 %	0 %	60 %	289547933
3304	NC_013894	CAT	2	6	147129	147134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547933
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3307	NC_013894	CT	3	6	147247	147252	0 %	50 %	0 %	50 %	289547933
3308	NC_013894	CCA	2	6	147354	147359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3309	NC_013894	AT	3	6	147380	147385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3310	NC_013894	GA	3	6	147499	147504	50 %	0 %	50 %	0 %	289547934
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3321	NC_013894	GTG	2	6	147977	147982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547934
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3334	NC_013894	TCT	2	6	148924	148929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547935
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3340	NC_013894	TACAGG	2	12	149153	149164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289547935
3341	NC_013894	TGG	2	6	149208	149213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547935
3342	NC_013894	GAC	2	6	149264	149269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547935
3343	NC_013894	CAAA	2	8	149287	149294	75 %	0 %	0 %	25 %	289547935
3344	NC_013894	ATC	2	6	149297	149302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547935
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3352	NC_013894	GTG	2	6	149681	149686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547935
3353	NC_013894	GAA	2	6	149687	149692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547935
3354	NC_013894	AAG	2	6	149984	149989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547935
3355	NC_013894	ACC	2	6	150220	150225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547935
3356	NC_013894	TGG	2	6	150234	150239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547935
3357	NC_013894	AG	3	6	150249	150254	50 %	0 %	50 %	0 %	289547935
3358	NC_013894	GGA	2	6	150259	150264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547935
3359	NC_013894	GAG	2	6	150296	150301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547935
3360	NC_013894	A	6	6	150316	150321	100 %	0 %	0 %	0 %	289547935
3361	NC_013894	CCT	2	6	150354	150359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547935
3362	NC_013894	CTGC	2	8	150536	150543	0 %	25 %	25 %	50 %	289547936
3363	NC_013894	CTT	2	6	150558	150563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547936
3364	NC_013894	GTT	2	6	150680	150685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547936
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3368	NC_013894	ACC	2	6	150965	150970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547937
3369	NC_013894	TGG	2	6	150994	150999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547937
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3371	NC_013894	CCA	2	6	151096	151101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547937
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3495	NC_013894	CA	3	6	156331	156336	50 %	0 %	0 %	50 %	289547942
3496	NC_013894	CCA	2	6	156339	156344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547942
3497	NC_013894	CCTT	2	8	156358	156365	0 %	50 %	0 %	50 %	289547942
3498	NC_013894	CTT	2	6	156390	156395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547942
3499	NC_013894	TC	3	6	156416	156421	0 %	50 %	0 %	50 %	289547942
3500	NC_013894	CAT	2	6	156424	156429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547942

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