MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013894	CTTT	2	8	64782	64789	0 %	75 %	0 %	25 %	289547843
1502	NC_013894	CCA	2	6	64816	64821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547843
1503	NC_013894	AGA	2	6	64842	64847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547843
1504	NC_013894	GGCA	2	8	64885	64892	25 %	0 %	50 %	25 %	289547843
1505	NC_013894	CTCCC	2	10	64917	64926	0 %	20 %	0 %	80 %	289547843
1506	NC_013894	TTC	2	6	64943	64948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547843
1507	NC_013894	CAC	2	6	65079	65084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547844
1508	NC_013894	CTT	2	6	65129	65134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547844
1509	NC_013894	TACC	2	8	65159	65166	25 %	25 %	0 %	50 %	289547844
1510	NC_013894	ACC	2	6	65177	65182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547844
1511	NC_013894	CCT	2	6	65210	65215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547844
1512	NC_013894	TCT	2	6	65242	65247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547844
1513	NC_013894	CTT	2	6	65288	65293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547844
1514	NC_013894	CCATC	2	10	65294	65303	20 %	20 %	0 %	60 %	289547844
1515	NC_013894	GAT	2	6	65325	65330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547844
1516	NC_013894	GGT	2	6	65339	65344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547844
1517	NC_013894	AACC	2	8	65380	65387	50 %	0 %	0 %	50 %	289547844
1518	NC_013894	CAC	2	6	65423	65428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547844
1519	NC_013894	CGG	2	6	65528	65533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547844
1520	NC_013894	AGTA	2	8	65540	65547	50 %	25 %	25 %	0 %	289547844
1521	NC_013894	CAG	2	6	65631	65636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547844
1522	NC_013894	GTG	2	6	65692	65697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547844
1523	NC_013894	CA	3	6	65703	65708	50 %	0 %	0 %	50 %	289547844
1524	NC_013894	CTT	2	6	65717	65722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547844
1525	NC_013894	ATCT	2	8	65760	65767	25 %	50 %	0 %	25 %	289547844
1526	NC_013894	TGG	2	6	65921	65926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547844
1527	NC_013894	TCTT	2	8	65938	65945	0 %	75 %	0 %	25 %	289547844
1528	NC_013894	AAG	2	6	65949	65954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547844
1529	NC_013894	TGA	2	6	66002	66007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547844
1530	NC_013894	TC	3	6	66016	66021	0 %	50 %	0 %	50 %	289547844
1531	NC_013894	CTC	2	6	66036	66041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547844
1532	NC_013894	TCC	2	6	66055	66060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547844
1533	NC_013894	CCA	3	9	66077	66085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547844
1534	NC_013894	GCA	2	6	66119	66124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547844
1535	NC_013894	ACC	3	9	66166	66174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547844
1536	NC_013894	ACC	2	6	66208	66213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547844
1537	NC_013894	AGA	2	6	66232	66237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547844
1538	NC_013894	CCCTT	2	10	66250	66259	0 %	40 %	0 %	60 %	289547844
1539	NC_013894	CTT	2	6	66294	66299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547844
1540	NC_013894	AAC	2	6	66365	66370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_013894	GTA	2	6	66379	66384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013894	AGG	2	6	66409	66414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013894	GAA	2	6	66428	66433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547845
1544	NC_013894	GCT	2	6	66434	66439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547845
1545	NC_013894	TGGCCA	2	12	66508	66519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289547845
1546	NC_013894	GGT	2	6	66545	66550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547845
1547	NC_013894	CACC	2	8	66733	66740	25 %	0 %	0 %	75 %	289547845
1548	NC_013894	AG	3	6	66866	66871	50 %	0 %	50 %	0 %	289547845
1549	NC_013894	GA	3	6	66975	66980	50 %	0 %	50 %	0 %	289547845
1550	NC_013894	AAGGAA	2	12	67044	67055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547845
1551	NC_013894	GGT	2	6	67113	67118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547845
1552	NC_013894	ACT	2	6	67150	67155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547845
1553	NC_013894	CTA	2	6	67192	67197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547845
1554	NC_013894	ATGT	2	8	67245	67252	25 %	50 %	25 %	0 %	289547845
1555	NC_013894	A	6	6	67282	67287	100 %	0 %	0 %	0 %	289547845
1556	NC_013894	ACG	2	6	67303	67308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547845
1557	NC_013894	GT	3	6	67312	67317	0 %	50 %	50 %	0 %	289547845
1558	NC_013894	GGA	2	6	67325	67330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547845
1559	NC_013894	TAC	2	6	67456	67461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547845
1560	NC_013894	CGGGG	2	10	67523	67532	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_013894	TA	3	6	67533	67538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013894	TC	3	6	67558	67563	0 %	50 %	0 %	50 %	289547846
1563	NC_013894	GAGG	2	8	67606	67613	25 %	0 %	75 %	0 %	289547846
1564	NC_013894	CAT	2	6	67615	67620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547846
1565	NC_013894	GAGG	2	8	67667	67674	25 %	0 %	75 %	0 %	289547846
1566	NC_013894	GT	3	6	67805	67810	0 %	50 %	50 %	0 %	289547846
1567	NC_013894	AAGGC	2	10	67847	67856	40 %	0 %	40 %	20 %	289547846
1568	NC_013894	GGA	2	6	67891	67896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547846
1569	NC_013894	TGA	2	6	67913	67918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547846
1570	NC_013894	TCC	2	6	68042	68047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547847
1571	NC_013894	TAG	2	6	68059	68064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547847
1572	NC_013894	TG	3	6	68071	68076	0 %	50 %	50 %	0 %	289547847
1573	NC_013894	GA	3	6	68160	68165	50 %	0 %	50 %	0 %	289547847
1574	NC_013894	AAGG	2	8	68220	68227	50 %	0 %	50 %	0 %	289547847
1575	NC_013894	TGG	2	6	68272	68277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547847
1576	NC_013894	ACT	2	6	68302	68307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547847
1577	NC_013894	CAT	2	6	68315	68320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547847
1578	NC_013894	AGG	2	6	68353	68358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547847
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1580	NC_013894	TGG	2	6	68431	68436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547847
1581	NC_013894	CAC	2	6	68456	68461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547847
1582	NC_013894	GT	3	6	68465	68470	0 %	50 %	50 %	0 %	289547847
1583	NC_013894	T	6	6	68481	68486	0 %	100 %	0 %	0 %	289547847
1584	NC_013894	CCT	2	6	68574	68579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547847
1585	NC_013894	TCC	2	6	68584	68589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547847
1586	NC_013894	AGA	2	6	68797	68802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547847
1587	NC_013894	AGA	2	6	68818	68823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547847
1588	NC_013894	A	6	6	68870	68875	100 %	0 %	0 %	0 %	289547847
1589	NC_013894	TG	3	6	68894	68899	0 %	50 %	50 %	0 %	289547847
1590	NC_013894	CT	3	6	68930	68935	0 %	50 %	0 %	50 %	289547847
1591	NC_013894	TCC	2	6	68950	68955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547847
1592	NC_013894	GAAG	2	8	68957	68964	50 %	0 %	50 %	0 %	289547847
1593	NC_013894	AGGC	2	8	69054	69061	25 %	0 %	50 %	25 %	289547847
1594	NC_013894	AG	3	6	69076	69081	50 %	0 %	50 %	0 %	289547847
1595	NC_013894	AAAG	2	8	69123	69130	75 %	0 %	25 %	0 %	289547848
1596	NC_013894	CT	3	6	69138	69143	0 %	50 %	0 %	50 %	289547848
1597	NC_013894	CCA	2	6	69209	69214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547848
1598	NC_013894	CTTCC	2	10	69225	69234	0 %	40 %	0 %	60 %	289547848
1599	NC_013894	AAC	2	6	69273	69278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547848
1600	NC_013894	TC	3	6	69288	69293	0 %	50 %	0 %	50 %	289547848
1601	NC_013894	ACC	2	6	69324	69329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547848
1602	NC_013894	TCT	2	6	69376	69381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547848
1603	NC_013894	GGA	2	6	69424	69429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547848
1604	NC_013894	CAGAA	2	10	69540	69549	60 %	0 %	20 %	20 %	289547848
1605	NC_013894	TGGG	2	8	69612	69619	0 %	25 %	75 %	0 %	289547848
1606	NC_013894	CA	3	6	69642	69647	50 %	0 %	0 %	50 %	289547848
1607	NC_013894	TCT	2	6	69664	69669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547848
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1609	NC_013894	AAG	2	6	69794	69799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547849
1610	NC_013894	T	6	6	69824	69829	0 %	100 %	0 %	0 %	289547849
1611	NC_013894	GGT	2	6	69883	69888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547849
1612	NC_013894	AG	4	8	69958	69965	50 %	0 %	50 %	0 %	289547849
1613	NC_013894	CCTA	2	8	69971	69978	25 %	25 %	0 %	50 %	289547849
1614	NC_013894	CTA	2	6	69982	69987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547849
1615	NC_013894	TTG	3	9	70005	70013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547849
1616	NC_013894	CT	3	6	70040	70045	0 %	50 %	0 %	50 %	289547849
1617	NC_013894	ACA	2	6	70143	70148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547849
1618	NC_013894	TCC	2	6	70203	70208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547849
1619	NC_013894	TC	3	6	70216	70221	0 %	50 %	0 %	50 %	289547849
1620	NC_013894	TATCC	2	10	70223	70232	20 %	40 %	0 %	40 %	289547849
1621	NC_013894	ACC	2	6	70245	70250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547849
1622	NC_013894	TCC	3	9	70272	70280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547849
1623	NC_013894	CTC	3	9	70313	70321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547849
1624	NC_013894	AGA	2	6	70328	70333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547849
1625	NC_013894	CTT	2	6	70340	70345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547849
1626	NC_013894	ATC	2	6	70347	70352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547849
1627	NC_013894	CCT	2	6	70391	70396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547849
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