MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013894	T	7	7	21477	21483	0 %	100 %	0 %	0 %	289547800
502	NC_013894	TCT	2	6	21532	21537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547800
503	NC_013894	TTC	2	6	21573	21578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547800
504	NC_013894	TC	3	6	21689	21694	0 %	50 %	0 %	50 %	289547801
505	NC_013894	TGG	2	6	21709	21714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547801
506	NC_013894	CAT	2	6	21716	21721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547801
507	NC_013894	TTC	2	6	21732	21737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547801
508	NC_013894	CTTC	2	8	21745	21752	0 %	50 %	0 %	50 %	289547801
509	NC_013894	CATC	2	8	21850	21857	25 %	25 %	0 %	50 %	289547801
510	NC_013894	CCA	2	6	21896	21901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547802
511	NC_013894	TTTGT	2	10	21931	21940	0 %	80 %	20 %	0 %	289547802
512	NC_013894	GA	4	8	21995	22002	50 %	0 %	50 %	0 %	289547802
513	NC_013894	TGG	2	6	22019	22024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547802
514	NC_013894	AGA	2	6	22030	22035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547802
515	NC_013894	CA	3	6	22040	22045	50 %	0 %	0 %	50 %	289547802
516	NC_013894	CTC	2	6	22049	22054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547802
517	NC_013894	CT	3	6	22126	22131	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
518	NC_013894	TC	3	6	22194	22199	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
519	NC_013894	CAC	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547802
520	NC_013894	TC	3	6	22389	22394	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
521	NC_013894	TAT	2	6	22407	22412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547802
522	NC_013894	CT	4	8	22462	22469	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
523	NC_013894	T	6	6	22533	22538	0 %	100 %	0 %	0 %	289547802
524	NC_013894	AAG	2	6	22636	22641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547803
525	NC_013894	AGG	2	6	22644	22649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547803
526	NC_013894	AGA	2	6	22713	22718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547803
527	NC_013894	AGT	3	9	22778	22786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547803
528	NC_013894	TTG	2	6	22802	22807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547803
529	NC_013894	AG	3	6	22870	22875	50 %	0 %	50 %	0 %	289547803
530	NC_013894	T	6	6	22903	22908	0 %	100 %	0 %	0 %	289547803
531	NC_013894	CTC	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547803
532	NC_013894	AGT	2	6	23042	23047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547803
533	NC_013894	TTAG	2	8	23117	23124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013894	TCT	2	6	23129	23134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013894	GAAGG	2	10	23196	23205	40 %	0 %	60 %	0 %	289547804
536	NC_013894	ATA	2	6	23275	23280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547804
537	NC_013894	TG	3	6	23294	23299	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
538	NC_013894	CTT	2	6	23333	23338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547804
539	NC_013894	GGA	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
540	NC_013894	TGG	2	6	23390	23395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
541	NC_013894	AGAT	2	8	23555	23562	50 %	25 %	25 %	0 %	289547804
542	NC_013894	TAC	2	6	23584	23589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547804
543	NC_013894	TG	3	6	23599	23604	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
544	NC_013894	GT	3	6	23605	23610	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
545	NC_013894	GT	3	6	23626	23631	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
546	NC_013894	GGT	2	6	23637	23642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
547	NC_013894	GGA	2	6	23664	23669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
548	NC_013894	TG	4	8	23741	23748	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
549	NC_013894	AAG	2	6	23799	23804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547804
550	NC_013894	AAGA	2	8	23815	23822	75 %	0 %	25 %	0 %	289547804
551	NC_013894	GT	3	6	23839	23844	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
552	NC_013894	CAA	3	9	23973	23981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547804
553	NC_013894	GTG	2	6	24031	24036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
554	NC_013894	GTA	2	6	24047	24052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547804
555	NC_013894	CGG	2	6	24062	24067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547804
556	NC_013894	AG	3	6	24138	24143	50 %	0 %	50 %	0 %	289547804
557	NC_013894	GTG	2	6	24146	24151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
558	NC_013894	CCTT	2	8	24188	24195	0 %	50 %	0 %	50 %	289547804
559	NC_013894	GAG	2	6	24229	24234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
560	NC_013894	CTT	2	6	24252	24257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547804
561	NC_013894	CT	3	6	24295	24300	0 %	50 %	0 %	50 %	289547804
562	NC_013894	TAC	2	6	24301	24306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547804
563	NC_013894	GAG	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
564	NC_013894	GTG	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
565	NC_013894	ACC	2	6	24790	24795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547804
566	NC_013894	TCCT	2	8	24820	24827	0 %	50 %	0 %	50 %	289547804
567	NC_013894	CTT	2	6	24865	24870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547804
568	NC_013894	TCCCA	2	10	24878	24887	20 %	20 %	0 %	60 %	289547804
569	NC_013894	TCC	2	6	24925	24930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547804
570	NC_013894	A	7	7	25004	25010	100 %	0 %	0 %	0 %	289547804
571	NC_013894	TGG	2	6	25025	25030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
572	NC_013894	AG	3	6	25079	25084	50 %	0 %	50 %	0 %	289547805
573	NC_013894	TGA	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547805
574	NC_013894	AGGA	2	8	25203	25210	50 %	0 %	50 %	0 %	289547805
575	NC_013894	GAAG	2	8	25222	25229	50 %	0 %	50 %	0 %	289547805
576	NC_013894	GGA	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547805
577	NC_013894	GT	4	8	25284	25291	0 %	50 %	50 %	0 %	289547805
578	NC_013894	CTT	2	6	25314	25319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547805
579	NC_013894	TAC	2	6	25421	25426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547806
580	NC_013894	TC	4	8	25457	25464	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
581	NC_013894	CCT	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
582	NC_013894	AC	3	6	25528	25533	50 %	0 %	0 %	50 %	289547806
583	NC_013894	CCT	2	6	25547	25552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
584	NC_013894	TGG	2	6	25636	25641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547806
585	NC_013894	CT	3	6	25653	25658	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
586	NC_013894	TCT	2	6	25675	25680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547806
587	NC_013894	T	6	6	25687	25692	0 %	100 %	0 %	0 %	289547806
588	NC_013894	GCT	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
589	NC_013894	CTC	2	6	25752	25757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
590	NC_013894	TCG	2	6	25903	25908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
591	NC_013894	CATC	2	8	26025	26032	25 %	25 %	0 %	50 %	289547806
592	NC_013894	ACCC	2	8	26060	26067	25 %	0 %	0 %	75 %	289547806
593	NC_013894	ACGGG	2	10	26074	26083	20 %	0 %	60 %	20 %	289547806
594	NC_013894	TCCC	2	8	26191	26198	0 %	25 %	0 %	75 %	289547806
595	NC_013894	AGT	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547806
596	NC_013894	ACA	2	6	26243	26248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547806
597	NC_013894	GCT	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
598	NC_013894	AAG	2	6	26425	26430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547806
599	NC_013894	CCAGT	2	10	26469	26478	20 %	20 %	20 %	40 %	289547806
600	NC_013894	TGA	2	6	26497	26502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547806
601	NC_013894	AG	3	6	26685	26690	50 %	0 %	50 %	0 %	289547806
602	NC_013894	CTT	2	6	26694	26699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547806
603	NC_013894	CTG	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
604	NC_013894	CCAT	2	8	26768	26775	25 %	25 %	0 %	50 %	289547806
605	NC_013894	AAGC	2	8	26812	26819	50 %	0 %	25 %	25 %	289547806
606	NC_013894	AGA	2	6	26840	26845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547806
607	NC_013894	CTC	3	9	26965	26973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
608	NC_013894	CT	3	6	27024	27029	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
609	NC_013894	CCTC	2	8	27061	27068	0 %	25 %	0 %	75 %	289547806
610	NC_013894	TG	3	6	27102	27107	0 %	50 %	50 %	0 %	289547806
611	NC_013894	CCTT	2	8	27112	27119	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
612	NC_013894	GA	4	8	27147	27154	50 %	0 %	50 %	0 %	289547806
613	NC_013894	T	6	6	27166	27171	0 %	100 %	0 %	0 %	289547807
614	NC_013894	ACC	2	6	27182	27187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547807
615	NC_013894	AG	3	6	27211	27216	50 %	0 %	50 %	0 %	289547807
616	NC_013894	TCT	2	6	27270	27275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547807
617	NC_013894	GTA	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547807
618	NC_013894	CT	3	6	27429	27434	0 %	50 %	0 %	50 %	289547807
619	NC_013894	GTG	3	9	27491	27499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547807
620	NC_013894	AGGT	2	8	27532	27539	25 %	25 %	50 %	0 %	289547807
621	NC_013894	AAGA	2	8	27616	27623	75 %	0 %	25 %	0 %	289547807
622	NC_013894	CCT	2	6	27678	27683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547807
623	NC_013894	ATC	2	6	27748	27753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547807
624	NC_013894	ACC	2	6	27851	27856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
625	NC_013894	CCA	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
626	NC_013894	TCT	2	6	27909	27914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
627	NC_013894	AG	3	6	27919	27924	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
628	NC_013894	GA	3	6	27925	27930	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
629	NC_013894	CTT	2	6	27973	27978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
630	NC_013894	CCA	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
631	NC_013894	CCA	2	6	27991	27996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
632	NC_013894	CT	3	6	28019	28024	0 %	50 %	0 %	50 %	289547808
633	NC_013894	TACC	2	8	28039	28046	25 %	25 %	0 %	50 %	289547808
634	NC_013894	GCT	2	6	28086	28091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547808
635	NC_013894	TCT	2	6	28104	28109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
636	NC_013894	AG	3	6	28134	28139	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
637	NC_013894	TCC	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
638	NC_013894	TGT	2	6	28210	28215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547808
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642	NC_013894	GA	4	8	28414	28421	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
643	NC_013894	CA	3	6	28429	28434	50 %	0 %	0 %	50 %	289547808
644	NC_013894	ATCT	2	8	28618	28625	25 %	50 %	0 %	25 %	289547808
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648	NC_013894	TCT	2	6	28731	28736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
649	NC_013894	TCT	2	6	28754	28759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
650	NC_013894	TCC	2	6	28794	28799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
651	NC_013894	CAC	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
652	NC_013894	TCC	2	6	28862	28867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
653	NC_013894	CTC	2	6	28880	28885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
654	NC_013894	TCT	2	6	28917	28922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
655	NC_013894	AAACT	2	10	28935	28944	60 %	20 %	0 %	20 %	289547808
656	NC_013894	TCTTT	2	10	28957	28966	0 %	80 %	0 %	20 %	289547808
657	NC_013894	CTG	2	6	29003	29008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547808
658	NC_013894	GAA	2	6	29165	29170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
659	NC_013894	AT	3	6	29221	29226	50 %	50 %	0 %	0 %	289547809
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662	NC_013894	AG	3	6	29280	29285	50 %	0 %	50 %	0 %	289547809
663	NC_013894	ATG	2	6	29314	29319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547809
664	NC_013894	AG	3	6	29324	29329	50 %	0 %	50 %	0 %	289547809
665	NC_013894	G	6	6	29352	29357	0 %	0 %	100 %	0 %	289547809
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676	NC_013894	GA	3	6	29719	29724	50 %	0 %	50 %	0 %	289547809
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693	NC_013894	TCC	2	6	30407	30412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547810
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695	NC_013894	ACC	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547810
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697	NC_013894	ATG	2	6	30557	30562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547810
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706	NC_013894	AAAG	2	8	30918	30925	75 %	0 %	25 %	0 %	289547811
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716	NC_013894	GA	3	6	31350	31355	50 %	0 %	50 %	0 %	289547811
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730	NC_013894	AGG	2	6	31893	31898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
731	NC_013894	CT	3	6	31917	31922	0 %	50 %	0 %	50 %	289547812
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758	NC_013894	ACT	2	6	32836	32841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547813
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760	NC_013894	CAA	2	6	32950	32955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547813
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