MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013894	GAAG	2	8	202094	202101	50 %	0 %	50 %	0 %	289547986
4502	NC_013894	CTC	2	6	202104	202109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547986
4503	NC_013894	CTC	2	6	202129	202134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547986
4504	NC_013894	TCAA	2	8	202187	202194	50 %	25 %	0 %	25 %	289547986
4505	NC_013894	GAA	2	6	202195	202200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547986
4506	NC_013894	TGG	2	6	202280	202285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547987
4507	NC_013894	CCTT	2	8	202351	202358	0 %	50 %	0 %	50 %	289547987
4508	NC_013894	TGG	2	6	202364	202369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547987
4509	NC_013894	CAC	2	6	202419	202424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547987
4510	NC_013894	AGA	2	6	202455	202460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547987
4511	NC_013894	GAG	2	6	202551	202556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547987
4512	NC_013894	CTC	2	6	202590	202595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547987
4513	NC_013894	CAG	2	6	202617	202622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547987
4514	NC_013894	TC	3	6	202662	202667	0 %	50 %	0 %	50 %	289547987
4515	NC_013894	AT	3	6	202704	202709	50 %	50 %	0 %	0 %	289547987
4516	NC_013894	GGTG	2	8	202716	202723	0 %	25 %	75 %	0 %	289547987
4517	NC_013894	CCT	2	6	202735	202740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547987
4518	NC_013894	CAC	2	6	202782	202787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547987
4519	NC_013894	GCTC	2	8	202869	202876	0 %	25 %	25 %	50 %	289547988
4520	NC_013894	GAG	2	6	202886	202891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547988
4521	NC_013894	CTT	2	6	202900	202905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547988
4522	NC_013894	ACC	2	6	202935	202940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547988
4523	NC_013894	TTA	2	6	203008	203013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547988
4524	NC_013894	CCG	2	6	203034	203039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289547988
4525	NC_013894	AAGATC	2	12	203078	203089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289547988
4526	NC_013894	TAC	2	6	203096	203101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547988
4527	NC_013894	GTA	2	6	203116	203121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547988
4528	NC_013894	TCC	2	6	203130	203135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547988
4529	NC_013894	GTT	2	6	203162	203167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547988
4530	NC_013894	CT	3	6	203198	203203	0 %	50 %	0 %	50 %	289547988
4531	NC_013894	C	6	6	203205	203210	0 %	0 %	0 %	100 %	289547988
4532	NC_013894	CTC	2	6	203240	203245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547988
4533	NC_013894	TC	3	6	203315	203320	0 %	50 %	0 %	50 %	289547988
4534	NC_013894	ATC	2	6	203361	203366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547988
4535	NC_013894	GGT	2	6	203368	203373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547989
4536	NC_013894	TCT	2	6	203393	203398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547989
4537	NC_013894	ACC	2	6	203423	203428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547989
4538	NC_013894	ATG	2	6	203444	203449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547989
4539	NC_013894	ACCTAA	2	12	203494	203505	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289547989
4540	NC_013894	CCA	2	6	203517	203522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547989
4541	NC_013894	AGT	2	6	203566	203571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547989
4542	NC_013894	CTCCAA	2	12	203638	203649	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289547989
4543	NC_013894	CT	3	6	203650	203655	0 %	50 %	0 %	50 %	289547989
4544	NC_013894	AT	3	6	203664	203669	50 %	50 %	0 %	0 %	289547989
4545	NC_013894	AACC	2	8	203702	203709	50 %	0 %	0 %	50 %	289547989
4546	NC_013894	AC	3	6	203731	203736	50 %	0 %	0 %	50 %	289547989
4547	NC_013894	T	6	6	203739	203744	0 %	100 %	0 %	0 %	289547989
4548	NC_013894	CCA	2	6	203760	203765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547989
4549	NC_013894	GAAG	2	8	203766	203773	50 %	0 %	50 %	0 %	289547989
4550	NC_013894	GT	4	8	203821	203828	0 %	50 %	50 %	0 %	289547989
4551	NC_013894	CCTT	2	8	203867	203874	0 %	50 %	0 %	50 %	289547989
4552	NC_013894	CTGGGG	2	12	203978	203989	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4553	NC_013894	CAG	2	6	204025	204030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_013894	AG	4	8	204057	204064	50 %	0 %	50 %	0 %	289547990
4555	NC_013894	AGGAG	2	10	204107	204116	40 %	0 %	60 %	0 %	289547990
4556	NC_013894	GGGA	2	8	204151	204158	25 %	0 %	75 %	0 %	289547990
4557	NC_013894	CAC	3	9	204169	204177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547990
4558	NC_013894	CTG	2	6	204210	204215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547990
4559	NC_013894	GTGG	2	8	204232	204239	0 %	25 %	75 %	0 %	289547990
4560	NC_013894	CCA	2	6	204240	204245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547990
4561	NC_013894	CAG	3	9	204282	204290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547990
4562	NC_013894	CCG	2	6	204303	204308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289547990
4563	NC_013894	CT	3	6	204336	204341	0 %	50 %	0 %	50 %	289547990
4564	NC_013894	TAT	2	6	204358	204363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547990
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4569	NC_013894	CCA	2	6	204480	204485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547990
4570	NC_013894	TGA	2	6	204518	204523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547990
4571	NC_013894	CCA	3	9	204594	204602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547990
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4573	NC_013894	CTGTC	2	10	204680	204689	0 %	40 %	20 %	40 %	289547990
4574	NC_013894	GTA	2	6	204700	204705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547990
4575	NC_013894	CGG	2	6	204714	204719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547990
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4578	NC_013894	CATA	2	8	204972	204979	50 %	25 %	0 %	25 %	289547990
4579	NC_013894	TTAT	2	8	204991	204998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013894	TC	3	6	205128	205133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_013894	AC	4	8	205162	205169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_013894	CAC	2	6	205220	205225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_013894	GGCA	2	8	205235	205242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4584	NC_013894	GCC	2	6	205251	205256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_013894	CTTC	2	8	205294	205301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_013894	TTA	2	6	205309	205314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_013894	CTGT	2	8	205332	205339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_013894	TTC	2	6	205343	205348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_013894	AT	3	6	205397	205402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013894	TCT	2	6	205441	205446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_013894	CTC	2	6	205447	205452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_013894	GGA	2	6	205499	205504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013894	TGCC	2	8	205510	205517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_013894	TCC	2	6	205530	205535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_013894	GA	3	6	205537	205542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_013894	GGA	2	6	205592	205597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013894	TCCT	2	8	205751	205758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_013894	GA	3	6	205867	205872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013894	GTG	3	9	205958	205966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547991
4600	NC_013894	TTC	2	6	205999	206004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547991
4601	NC_013894	TCC	2	6	206021	206026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547991
4602	NC_013894	ACC	2	6	206090	206095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547991
4603	NC_013894	TA	3	6	206126	206131	50 %	50 %	0 %	0 %	289547991
4604	NC_013894	CAC	2	6	206218	206223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547991
4605	NC_013894	GTGG	2	8	206263	206270	0 %	25 %	75 %	0 %	289547991
4606	NC_013894	ACGA	2	8	206296	206303	50 %	0 %	25 %	25 %	289547991
4607	NC_013894	CTT	2	6	206384	206389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547991
4608	NC_013894	GGA	2	6	206491	206496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547991
4609	NC_013894	GGAA	2	8	206525	206532	50 %	0 %	50 %	0 %	289547991
4610	NC_013894	GAG	2	6	206557	206562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547991
4611	NC_013894	CCA	2	6	206679	206684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547991
4612	NC_013894	TGCC	2	8	206690	206697	0 %	25 %	25 %	50 %	289547991
4613	NC_013894	GGA	2	6	206709	206714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547991
4614	NC_013894	CCA	2	6	206724	206729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547991
4615	NC_013894	GGA	2	6	206812	206817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547991
4616	NC_013894	CGG	2	6	206820	206825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547991
4617	NC_013894	TCC	2	6	206912	206917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547991
4618	NC_013894	TG	3	6	206933	206938	0 %	50 %	50 %	0 %	289547991
4619	NC_013894	AGA	2	6	206953	206958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547991
4620	NC_013894	GTA	2	6	207022	207027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547991
4621	NC_013894	GTCT	2	8	207084	207091	0 %	50 %	25 %	25 %	289547991
4622	NC_013894	CCT	2	6	207162	207167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547991
4623	NC_013894	ACC	2	6	207175	207180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547991
4624	NC_013894	CTA	2	6	207207	207212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547991
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4626	NC_013894	TCC	2	6	207248	207253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547991
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4876	NC_013894	GA	3	6	217709	217714	50 %	0 %	50 %	0 %	289547999
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4879	NC_013894	CT	3	6	217741	217746	0 %	50 %	0 %	50 %	289547999
4880	NC_013894	CCTT	2	8	217780	217787	0 %	50 %	0 %	50 %	289547999
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4898	NC_013894	GT	3	6	218479	218484	0 %	50 %	50 %	0 %	289547999
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4931	NC_013894	CTG	2	6	220184	220189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548000
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4982	NC_013894	GAGAG	2	10	222633	222642	40 %	0 %	60 %	0 %	289548003
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4999	NC_013894	GT	3	6	223373	223378	0 %	50 %	50 %	0 %	289548003
5000	NC_013894	AG	3	6	223395	223400	50 %	0 %	50 %	0 %	289548003

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