MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 1933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013889	CTGGC	2	10	1891	1900	0 %	20 %	40 %	40 %	289207189
2	NC_013889	CGGGA	2	10	2761	2770	20 %	0 %	60 %	20 %	289207189
3	NC_013889	CAGGC	2	10	3423	3432	20 %	0 %	40 %	40 %	289207190
4	NC_013889	GGTCG	2	10	3648	3657	0 %	20 %	60 %	20 %	289207190
5	NC_013889	TGGTG	2	10	3917	3926	0 %	40 %	60 %	0 %	289207190
6	NC_013889	GGGAC	2	10	5327	5336	20 %	0 %	60 %	20 %	289207191
7	NC_013889	CGCCC	2	10	5738	5747	0 %	0 %	20 %	80 %	289207191
8	NC_013889	CGGCG	2	10	6029	6038	0 %	0 %	60 %	40 %	289207191
9	NC_013889	CTCGC	2	10	6066	6075	0 %	20 %	20 %	60 %	289207191
10	NC_013889	GGCCC	2	10	8759	8768	0 %	0 %	40 %	60 %	289207193
11	NC_013889	TCGCC	2	10	11225	11234	0 %	20 %	20 %	60 %	289207195
12	NC_013889	GGGCT	2	10	11242	11251	0 %	20 %	60 %	20 %	289207195
13	NC_013889	TGTCG	2	10	12452	12461	0 %	40 %	40 %	20 %	289207197
14	NC_013889	CCGCG	2	10	13505	13514	0 %	0 %	40 %	60 %	289207198
15	NC_013889	GGCCG	2	10	15147	15156	0 %	0 %	60 %	40 %	289207200
16	NC_013889	GGTCG	2	10	15539	15548	0 %	20 %	60 %	20 %	289207200
17	NC_013889	GCTCG	2	10	17966	17975	0 %	20 %	40 %	40 %	289207202
18	NC_013889	GTCGA	2	10	18410	18419	20 %	20 %	40 %	20 %	289207203
19	NC_013889	GCCAG	2	10	18837	18846	20 %	0 %	40 %	40 %	289207203
20	NC_013889	AGCTG	2	10	20523	20532	20 %	20 %	40 %	20 %	289207204
21	NC_013889	ACCGC	2	10	23913	23922	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_013889	CGCTG	2	10	25589	25598	0 %	20 %	40 %	40 %	289207208
23	NC_013889	GCTTC	2	10	28623	28632	0 %	40 %	20 %	40 %	289207210
24	NC_013889	TGTTC	2	10	29025	29034	0 %	60 %	20 %	20 %	289207210
25	NC_013889	TCGTT	2	10	29233	29242	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013889	CGAAA	2	10	29265	29274	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013889	CGGCC	2	10	29418	29427	0 %	0 %	40 %	60 %	289207211
28	NC_013889	GCCCC	2	10	31648	31657	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_013889	GGCGG	2	10	35621	35630	0 %	0 %	80 %	20 %	289207218
30	NC_013889	GACCT	2	10	36742	36751	20 %	20 %	20 %	40 %	289207219
31	NC_013889	GGCGT	2	10	41121	41130	0 %	20 %	60 %	20 %	289207222
32	NC_013889	CTGGC	2	10	43104	43113	0 %	20 %	40 %	40 %	289207223
33	NC_013889	TGCAG	2	10	46072	46081	20 %	20 %	40 %	20 %	289207226
34	NC_013889	GCGCC	2	10	50974	50983	0 %	0 %	40 %	60 %	289207231
35	NC_013889	GCCGA	2	10	51823	51832	20 %	0 %	40 %	40 %	289207231
36	NC_013889	CTGTG	2	10	56297	56306	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013889	GCCGC	2	10	57286	57295	0 %	0 %	40 %	60 %	289207236
38	NC_013889	TGCGG	2	10	59142	59151	0 %	20 %	60 %	20 %	289207238
39	NC_013889	GCCGG	2	10	59199	59208	0 %	0 %	60 %	40 %	289207238
40	NC_013889	ACGCC	2	10	59437	59446	20 %	0 %	20 %	60 %	289207238
41	NC_013889	TGCGT	2	10	61943	61952	0 %	40 %	40 %	20 %	289207241
42	NC_013889	TACAG	2	10	63604	63613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013889	CGCAT	2	10	68626	68635	20 %	20 %	20 %	40 %	289207246
44	NC_013889	GTACC	2	10	69702	69711	20 %	20 %	20 %	40 %	289207246
45	NC_013889	GGGCG	2	10	69966	69975	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013889	GGAGG	2	10	72459	72468	20 %	0 %	80 %	0 %	289207249
47	NC_013889	TTTGA	2	10	72999	73008	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013889	TCCGG	2	10	75585	75594	0 %	20 %	40 %	40 %	289207252
49	NC_013889	GCAGG	2	10	77703	77712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013889	CCCCG	2	10	78655	78664	0 %	0 %	20 %	80 %	289207256
51	NC_013889	CTCGC	2	10	81266	81275	0 %	20 %	20 %	60 %	289207259
52	NC_013889	CTGCC	2	10	81304	81313	0 %	20 %	20 %	60 %	289207259
53	NC_013889	GTGCC	2	10	83210	83219	0 %	20 %	40 %	40 %	289207261
54	NC_013889	CCACA	2	10	86386	86395	40 %	0 %	0 %	60 %	289207264
55	NC_013889	CCCGC	2	10	86531	86540	0 %	0 %	20 %	80 %	289207264
56	NC_013889	CGGAG	2	10	87579	87588	20 %	0 %	60 %	20 %	289207265
57	NC_013889	GGACC	2	10	88037	88046	20 %	0 %	40 %	40 %	289207266
58	NC_013889	CCCGA	2	10	89753	89762	20 %	0 %	20 %	60 %	289207268
59	NC_013889	GCGCC	2	10	93303	93312	0 %	0 %	40 %	60 %	289207270
60	NC_013889	GCGAC	2	10	94606	94615	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013889	CCTGC	2	10	95864	95873	0 %	20 %	20 %	60 %	289207272
62	NC_013889	CGCTG	2	10	97992	98001	0 %	20 %	40 %	40 %	289207276
63	NC_013889	GCGCC	2	10	98857	98866	0 %	0 %	40 %	60 %	289207278
64	NC_013889	ACGAG	2	10	101087	101096	40 %	0 %	40 %	20 %	289207280
65	NC_013889	GGGCC	2	10	101383	101392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013889	AGCGC	2	10	101604	101613	20 %	0 %	40 %	40 %	289207281
67	NC_013889	AAGAC	2	10	101805	101814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013889	GCGCC	2	10	104128	104137	0 %	0 %	40 %	60 %	289207283
69	NC_013889	CGGCC	2	10	107236	107245	0 %	0 %	40 %	60 %	289207284
70	NC_013889	GCACA	2	10	107888	107897	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013889	TCCTG	2	10	110187	110196	0 %	40 %	20 %	40 %	289207286
72	NC_013889	ACGCG	2	10	111190	111199	20 %	0 %	40 %	40 %	289207287
73	NC_013889	TGCGG	2	10	111678	111687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013889	ACGTT	2	10	112600	112609	20 %	40 %	20 %	20 %	289207288
75	NC_013889	TGATC	2	10	116445	116454	20 %	40 %	20 %	20 %	289207292
76	NC_013889	TGCGA	2	10	117326	117335	20 %	20 %	40 %	20 %	289207293
77	NC_013889	TCTTT	2	10	121996	122005	0 %	80 %	0 %	20 %	289207300
78	NC_013889	CCCTT	2	10	122375	122384	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_013889	GCCGG	2	10	122425	122434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013889	CCGGT	2	10	126226	126235	0 %	20 %	40 %	40 %	289207305
81	NC_013889	CGCGG	2	10	126454	126463	0 %	0 %	60 %	40 %	289207305
82	NC_013889	GCCCG	2	10	127534	127543	0 %	0 %	40 %	60 %	289207306
83	NC_013889	GATGC	2	10	131190	131199	20 %	20 %	40 %	20 %	289207312
84	NC_013889	TGGTG	2	10	132168	132177	0 %	40 %	60 %	0 %	289207313
85	NC_013889	CCCAA	2	10	140323	140332	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_013889	CAGGT	2	10	143752	143761	20 %	20 %	40 %	20 %	289207326
87	NC_013889	CCGAT	2	10	150380	150389	20 %	20 %	20 %	40 %	289207330
88	NC_013889	CGAGC	2	10	150771	150780	20 %	0 %	40 %	40 %	289207330
89	NC_013889	TGCCG	2	10	153503	153512	0 %	20 %	40 %	40 %	289207334
90	NC_013889	GATCG	2	10	154462	154471	20 %	20 %	40 %	20 %	289207335
91	NC_013889	TCCGG	2	10	154504	154513	0 %	20 %	40 %	40 %	289207335
92	NC_013889	CGATC	2	10	155180	155189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_013889	CGTAC	2	10	157191	157200	20 %	20 %	20 %	40 %	289207338
94	NC_013889	CGTCA	2	10	157871	157880	20 %	20 %	20 %	40 %	289207338
95	NC_013889	TGCCC	2	10	158390	158399	0 %	20 %	20 %	60 %	289207339
96	NC_013889	GGGCT	2	10	159694	159703	0 %	20 %	60 %	20 %	289207340
97	NC_013889	GGTGG	2	10	159964	159973	0 %	20 %	80 %	0 %	289207340
98	NC_013889	GGCGC	2	10	161884	161893	0 %	0 %	60 %	40 %	289207343
99	NC_013889	GCTGG	2	10	163857	163866	0 %	20 %	60 %	20 %	289207344
100	NC_013889	CGGCC	2	10	165010	165019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_013889	AGCCG	2	10	165139	165148	20 %	0 %	40 %	40 %	289207346
102	NC_013889	GGCCT	2	10	165956	165965	0 %	20 %	40 %	40 %	289207347
103	NC_013889	GGCGC	2	10	171162	171171	0 %	0 %	60 %	40 %	289207350
104	NC_013889	GCGCC	2	10	172074	172083	0 %	0 %	40 %	60 %	289207353
105	NC_013889	TGCGC	2	10	172409	172418	0 %	20 %	40 %	40 %	289207353
106	NC_013889	GGGCA	2	10	173818	173827	20 %	0 %	60 %	20 %	289207354
107	NC_013889	TCGGC	2	10	175811	175820	0 %	20 %	40 %	40 %	289207357
108	NC_013889	GGCGG	2	10	177228	177237	0 %	0 %	80 %	20 %	289207358
109	NC_013889	GCCGA	2	10	179517	179526	20 %	0 %	40 %	40 %	289207360
110	NC_013889	GTGGC	2	10	180307	180316	0 %	20 %	60 %	20 %	289207360
111	NC_013889	AGCCC	2	10	183222	183231	20 %	0 %	20 %	60 %	289207362
112	NC_013889	CCAGG	2	10	185724	185733	20 %	0 %	40 %	40 %	289207363
113	NC_013889	GCCAC	2	10	186491	186500	20 %	0 %	20 %	60 %	289207364
114	NC_013889	GGCCC	2	10	187409	187418	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_013889	GGCCT	2	10	187680	187689	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013889	CGATC	2	10	189200	189209	20 %	20 %	20 %	40 %	289207366
117	NC_013889	TGCTT	2	10	194856	194865	0 %	60 %	20 %	20 %	289207369
118	NC_013889	TCGCC	2	10	195631	195640	0 %	20 %	20 %	60 %	289207370
119	NC_013889	GCGTT	2	10	198680	198689	0 %	40 %	40 %	20 %	289207373
120	NC_013889	TGCTG	2	10	200527	200536	0 %	40 %	40 %	20 %	289207376
121	NC_013889	GGCCC	2	10	201332	201341	0 %	0 %	40 %	60 %	289207376
122	NC_013889	CCGCG	2	10	201898	201907	0 %	0 %	40 %	60 %	289207377
123	NC_013889	GGCTG	2	10	205746	205755	0 %	20 %	60 %	20 %	289207382
124	NC_013889	GGCCG	2	10	209418	209427	0 %	0 %	60 %	40 %	289207387
125	NC_013889	CGGTG	2	10	209932	209941	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013889	TCGCT	2	10	210175	210184	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013889	GACCT	2	10	211734	211743	20 %	20 %	20 %	40 %	289207388
128	NC_013889	CGCTG	2	10	212575	212584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013889	CAGGG	2	10	212598	212607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013889	GCCGA	2	10	215119	215128	20 %	0 %	40 %	40 %	289207391
131	NC_013889	GGCCT	2	10	217840	217849	0 %	20 %	40 %	40 %	289207395
132	NC_013889	TGTGG	2	10	219031	219040	0 %	40 %	60 %	0 %	289207395
133	NC_013889	GGCCC	2	10	220212	220221	0 %	0 %	40 %	60 %	289207395
134	NC_013889	GCCCG	2	10	223062	223071	0 %	0 %	40 %	60 %	289207400
135	NC_013889	TCGAC	2	10	223959	223968	20 %	20 %	20 %	40 %	289207401
136	NC_013889	TCGGT	2	10	223996	224005	0 %	40 %	40 %	20 %	289207401
137	NC_013889	AGGTC	2	10	224031	224040	20 %	20 %	40 %	20 %	289207401
138	NC_013889	GCCGG	2	10	229313	229322	0 %	0 %	60 %	40 %	289207406
139	NC_013889	GGGGC	2	10	231807	231816	0 %	0 %	80 %	20 %	289207410
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141	NC_013889	CGGCG	2	10	233540	233549	0 %	0 %	60 %	40 %	289207412
142	NC_013889	GCGCT	2	10	236046	236055	0 %	20 %	40 %	40 %	289207415
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151	NC_013889	GGCTT	2	10	252680	252689	0 %	40 %	40 %	20 %	289207432
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162	NC_013889	GGGAA	2	10	268653	268662	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_013889	GGCAG	2	10	270250	270259	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013889	CGGGT	2	10	270324	270333	0 %	20 %	60 %	20 %	289207448
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245	NC_013889	CATCC	2	10	369904	369913	20 %	20 %	0 %	60 %	289207535
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249	NC_013889	CCCCG	2	10	373557	373566	0 %	0 %	20 %	80 %	289207537
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253	NC_013889	TCGCC	2	10	381436	381445	0 %	20 %	20 %	60 %	289207542
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264	NC_013889	CTGGC	2	10	407283	407292	0 %	20 %	40 %	40 %	289207574
265	NC_013889	GCCGT	2	10	408349	408358	0 %	20 %	40 %	40 %	289207575
266	NC_013889	CCCCG	2	10	408362	408371	0 %	0 %	20 %	80 %	289207575
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