MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013889	GCCG	2	8	149277	149284	0 %	0 %	50 %	50 %	289207330
3502	NC_013889	CG	3	6	149461	149466	0 %	0 %	50 %	50 %	289207330
3503	NC_013889	CTG	2	6	149473	149478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3504	NC_013889	TGG	2	6	149508	149513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207330
3505	NC_013889	GCC	2	6	149526	149531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207330
3506	NC_013889	CCG	2	6	149548	149553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207330
3507	NC_013889	GC	3	6	149576	149581	0 %	0 %	50 %	50 %	289207330
3508	NC_013889	CGC	2	6	149603	149608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207330
3509	NC_013889	GGA	2	6	149628	149633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207330
3510	NC_013889	GAC	2	6	149647	149652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3511	NC_013889	TGG	2	6	149723	149728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207330
3512	NC_013889	TCT	2	6	149774	149779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207330
3513	NC_013889	CTC	2	6	149802	149807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207330
3514	NC_013889	CCG	2	6	149816	149821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207330
3515	NC_013889	TGC	2	6	149834	149839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3516	NC_013889	GAC	2	6	149848	149853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3517	NC_013889	GCG	2	6	149855	149860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207330
3518	NC_013889	TGG	2	6	149879	149884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207330
3519	NC_013889	GCCG	2	8	149997	150004	0 %	0 %	50 %	50 %	289207330
3520	NC_013889	CGG	3	9	150005	150013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207330
3521	NC_013889	AGG	2	6	150065	150070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207330
3522	NC_013889	GTC	2	6	150089	150094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3523	NC_013889	ACG	3	9	150116	150124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3524	NC_013889	CGA	2	6	150138	150143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3525	NC_013889	TTC	2	6	150283	150288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207330
3526	NC_013889	CAG	2	6	150310	150315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3527	NC_013889	TGGG	2	8	150367	150374	0 %	25 %	75 %	0 %	289207330
3528	NC_013889	CCGAT	2	10	150380	150389	20 %	20 %	20 %	40 %	289207330
3529	NC_013889	CAG	2	6	150415	150420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3530	NC_013889	GGCC	2	8	150432	150439	0 %	0 %	50 %	50 %	289207330
3531	NC_013889	TTC	2	6	150499	150504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207330
3532	NC_013889	CGA	2	6	150549	150554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3533	NC_013889	TGGA	2	8	150715	150722	25 %	25 %	50 %	0 %	289207330
3534	NC_013889	CGAGC	2	10	150771	150780	20 %	0 %	40 %	40 %	289207330
3535	NC_013889	CAA	2	6	150852	150857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207330
3536	NC_013889	TGA	2	6	150866	150871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207330
3537	NC_013889	ACC	2	6	150872	150877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207330
3538	NC_013889	GCT	2	6	150888	150893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3539	NC_013889	GAA	2	6	150897	150902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207330
3540	NC_013889	ACA	2	6	150917	150922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207330
3541	NC_013889	CGC	2	6	151077	151082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207330
3542	NC_013889	GCC	2	6	151176	151181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_013889	CGGC	2	8	151187	151194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_013889	GAG	2	6	151210	151215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013889	CAC	2	6	151309	151314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207331
3546	NC_013889	GCG	2	6	151356	151361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207331
3547	NC_013889	CAA	3	9	151405	151413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207331
3548	NC_013889	TGCA	2	8	151436	151443	25 %	25 %	25 %	25 %	289207331
3549	NC_013889	ACT	2	6	151548	151553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207331
3550	NC_013889	GC	3	6	151577	151582	0 %	0 %	50 %	50 %	289207331
3551	NC_013889	TGA	2	6	151605	151610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207331
3552	NC_013889	ACG	2	6	151641	151646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207331
3553	NC_013889	GCC	2	6	151654	151659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207331
3554	NC_013889	GAA	2	6	151661	151666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207331
3555	NC_013889	TTC	2	6	151709	151714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207331
3556	NC_013889	CGA	3	9	151723	151731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207331
3557	NC_013889	GCC	2	6	151746	151751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207331
3558	NC_013889	GGC	2	6	151766	151771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207331
3559	NC_013889	CCCATC	2	12	151838	151849	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	289207331
3560	NC_013889	GAC	2	6	151850	151855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207331
3561	NC_013889	CAA	2	6	151897	151902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207331
3562	NC_013889	CG	3	6	151909	151914	0 %	0 %	50 %	50 %	289207331
3563	NC_013889	CTG	2	6	152010	152015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3564	NC_013889	GCT	2	6	152063	152068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3565	NC_013889	GAT	2	6	152093	152098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207332
3566	NC_013889	AAG	2	6	152139	152144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207332
3567	NC_013889	CCT	2	6	152176	152181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207332
3568	NC_013889	CG	3	6	152188	152193	0 %	0 %	50 %	50 %	289207332
3569	NC_013889	CTG	2	6	152250	152255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3570	NC_013889	CGC	2	6	152300	152305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207332
3571	NC_013889	GAT	2	6	152339	152344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207332
3572	NC_013889	CAT	2	6	152402	152407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207332
3573	NC_013889	CAC	2	6	152426	152431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207332
3574	NC_013889	GCC	2	6	152439	152444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207332
3575	NC_013889	ATGC	2	8	152475	152482	25 %	25 %	25 %	25 %	289207332
3576	NC_013889	TGC	2	6	152507	152512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3577	NC_013889	CTA	2	6	152531	152536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207332
3578	NC_013889	CG	3	6	152548	152553	0 %	0 %	50 %	50 %	289207332
3579	NC_013889	CGA	2	6	152563	152568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3580	NC_013889	CCA	2	6	152578	152583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207332
3581	NC_013889	CTG	2	6	152607	152612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3582	NC_013889	CCG	2	6	152626	152631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207332
3583	NC_013889	CGA	2	6	152645	152650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3584	NC_013889	CGGC	2	8	152761	152768	0 %	0 %	50 %	50 %	289207332
3585	NC_013889	CTGG	2	8	152774	152781	0 %	25 %	50 %	25 %	289207332
3586	NC_013889	TTC	2	6	152826	152831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207332
3587	NC_013889	CGT	2	6	152846	152851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207332
3588	NC_013889	CG	3	6	152945	152950	0 %	0 %	50 %	50 %	289207332
3589	NC_013889	GGCTCC	2	12	152979	152990	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289207332
3590	NC_013889	CGGC	2	8	152997	153004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_013889	CGG	2	6	153008	153013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013889	ACC	2	6	153037	153042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_013889	T	7	7	153094	153100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013889	GTC	2	6	153139	153144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207333
3595	NC_013889	GAA	2	6	153184	153189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207333
3596	NC_013889	CCA	2	6	153201	153206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207333
3597	NC_013889	GCT	2	6	153300	153305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_013889	GGC	2	6	153340	153345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013889	CGC	2	6	153369	153374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207334
3600	NC_013889	TGCCG	2	10	153503	153512	0 %	20 %	40 %	40 %	289207334
3601	NC_013889	GCG	2	6	153540	153545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207334
3602	NC_013889	GCG	2	6	153566	153571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207334
3603	NC_013889	GCG	2	6	153631	153636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207334
3604	NC_013889	CG	3	6	153641	153646	0 %	0 %	50 %	50 %	289207334
3605	NC_013889	GGCT	2	8	153687	153694	0 %	25 %	50 %	25 %	289207334
3606	NC_013889	CGC	2	6	153733	153738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207334
3607	NC_013889	GGC	2	6	153743	153748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207334
3608	NC_013889	CCG	2	6	153768	153773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207334
3609	NC_013889	GCG	2	6	153921	153926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207334
3610	NC_013889	CG	3	6	153931	153936	0 %	0 %	50 %	50 %	289207334
3611	NC_013889	AGA	2	6	154005	154010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013889	CTT	3	9	154028	154036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013889	ATG	2	6	154038	154043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013889	GC	3	6	154044	154049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_013889	GTCC	2	8	154150	154157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_013889	GC	3	6	154230	154235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_013889	CG	4	8	154275	154282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_013889	GGAG	2	8	154296	154303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013889	GCT	2	6	154374	154379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207335
3620	NC_013889	GATCG	2	10	154462	154471	20 %	20 %	40 %	20 %	289207335
3621	NC_013889	TCCGG	2	10	154504	154513	0 %	20 %	40 %	40 %	289207335
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3747	NC_013889	GCGA	2	8	159745	159752	25 %	0 %	50 %	25 %	289207340
3748	NC_013889	CCGG	2	8	159783	159790	0 %	0 %	50 %	50 %	289207340
3749	NC_013889	CCGC	2	8	159855	159862	0 %	0 %	25 %	75 %	289207340
3750	NC_013889	CG	5	10	159870	159879	0 %	0 %	50 %	50 %	289207340
3751	NC_013889	GAG	2	6	159883	159888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207340
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3754	NC_013889	TGG	2	6	159953	159958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207340
3755	NC_013889	GGTGG	2	10	159964	159973	0 %	20 %	80 %	0 %	289207340
3756	NC_013889	GC	3	6	159990	159995	0 %	0 %	50 %	50 %	289207340
3757	NC_013889	GCA	2	6	160017	160022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207340
3758	NC_013889	GAT	2	6	160074	160079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207340
3759	NC_013889	GCC	2	6	160097	160102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207340
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3762	NC_013889	GCTTCG	2	12	160217	160228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207341
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3772	NC_013889	GTA	2	6	160525	160530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207341
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3776	NC_013889	TGA	2	6	160656	160661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207341
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3778	NC_013889	GCC	2	6	160675	160680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207341
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3781	NC_013889	CAG	2	6	160783	160788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207341
3782	NC_013889	TGGG	2	8	160846	160853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3783	NC_013889	GGC	2	6	160908	160913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3784	NC_013889	TGC	3	9	160946	160954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207342
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3786	NC_013889	CTGG	2	8	161136	161143	0 %	25 %	50 %	25 %	289207342
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3794	NC_013889	GCCT	2	8	161443	161450	0 %	25 %	25 %	50 %	289207342
3795	NC_013889	GC	3	6	161466	161471	0 %	0 %	50 %	50 %	289207342
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3797	NC_013889	GCCT	2	8	161503	161510	0 %	25 %	25 %	50 %	289207342
3798	NC_013889	G	6	6	161596	161601	0 %	0 %	100 %	0 %	289207342
3799	NC_013889	GTG	2	6	161610	161615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207342
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3802	NC_013889	CGGG	2	8	161737	161744	0 %	0 %	75 %	25 %	289207343
3803	NC_013889	TGC	2	6	161772	161777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207343
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3815	NC_013889	GC	3	6	162253	162258	0 %	0 %	50 %	50 %	289207343
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3818	NC_013889	CTG	2	6	162383	162388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207343
3819	NC_013889	CGC	2	6	162504	162509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207343
3820	NC_013889	TC	3	6	162612	162617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3821	NC_013889	T	6	6	162676	162681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3822	NC_013889	C	6	6	162710	162715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3823	NC_013889	GCA	2	6	162743	162748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3824	NC_013889	AGC	2	6	162771	162776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207344
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3829	NC_013889	CGG	2	6	162986	162991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207344
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3832	NC_013889	GTC	2	6	163039	163044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3833	NC_013889	CAT	3	9	163194	163202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
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3835	NC_013889	CTG	2	6	163246	163251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
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3838	NC_013889	CAA	2	6	163332	163337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207344
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3845	NC_013889	CAC	2	6	163576	163581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207344
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3847	NC_013889	CTG	4	12	163639	163650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3848	NC_013889	CCT	2	6	163652	163657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207344
3849	NC_013889	CAT	2	6	163677	163682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
3850	NC_013889	GAT	2	6	163782	163787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207344
3851	NC_013889	GCTGG	2	10	163857	163866	0 %	20 %	60 %	20 %	289207344
3852	NC_013889	GAT	2	6	163872	163877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207344
3853	NC_013889	ACC	2	6	163895	163900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207344
3854	NC_013889	CTT	2	6	163956	163961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207344
3855	NC_013889	TGC	2	6	164030	164035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3856	NC_013889	GGT	2	6	164082	164087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207344
3857	NC_013889	GTGC	2	8	164110	164117	0 %	25 %	50 %	25 %	289207344
3858	NC_013889	TGG	2	6	164121	164126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207344
3859	NC_013889	TTC	2	6	164131	164136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207344
3860	NC_013889	GAA	2	6	164215	164220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207344
3861	NC_013889	CG	3	6	164224	164229	0 %	0 %	50 %	50 %	289207344
3862	NC_013889	GA	3	6	164255	164260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3863	NC_013889	CTG	2	6	164302	164307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3864	NC_013889	ATC	2	6	164308	164313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207345
3865	NC_013889	GGC	2	6	164338	164343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207345
3866	NC_013889	CGA	2	6	164373	164378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207345
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3868	NC_013889	AGC	2	6	164423	164428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3869	NC_013889	GCGG	2	8	164429	164436	0 %	0 %	75 %	25 %	289207345
3870	NC_013889	GCT	2	6	164456	164461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207345
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3872	NC_013889	ACT	2	6	164519	164524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207345
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3874	NC_013889	TGG	2	6	164601	164606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207345
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3888	NC_013889	GCA	2	6	165036	165041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207346
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3991	NC_013889	CGA	2	6	170043	170048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207350
3992	NC_013889	GGC	2	6	170056	170061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207350
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3994	NC_013889	TGG	2	6	170291	170296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207350
3995	NC_013889	CGA	2	6	170357	170362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207350
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