MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013889	GGA	2	6	129273	129278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013889	CAG	2	6	129293	129298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_013889	CGC	2	6	129401	129406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_013889	GAG	2	6	129438	129443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013889	CGT	2	6	129465	129470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207309
3006	NC_013889	CGC	2	6	129491	129496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207309
3007	NC_013889	CTG	2	6	129528	129533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207309
3008	NC_013889	GCT	2	6	129545	129550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207309
3009	NC_013889	GCC	2	6	129552	129557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207309
3010	NC_013889	TCC	2	6	129564	129569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207309
3011	NC_013889	CGC	2	6	129593	129598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207309
3012	NC_013889	CGA	2	6	129638	129643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207309
3013	NC_013889	TCGA	2	8	129696	129703	25 %	25 %	25 %	25 %	289207309
3014	NC_013889	GAC	2	6	129714	129719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207309
3015	NC_013889	CGC	2	6	129758	129763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207309
3016	NC_013889	CGT	2	6	129839	129844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207309
3017	NC_013889	GCC	2	6	129846	129851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207309
3018	NC_013889	CGGT	2	8	129901	129908	0 %	25 %	50 %	25 %	289207309
3019	NC_013889	GCG	2	6	129913	129918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207309
3020	NC_013889	CG	3	6	129926	129931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_013889	GGA	2	6	129957	129962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_013889	GTT	2	6	130006	130011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207310
3023	NC_013889	TGA	2	6	130025	130030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207310
3024	NC_013889	GAT	3	9	130051	130059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207310
3025	NC_013889	GGT	2	6	130060	130065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207310
3026	NC_013889	TC	3	6	130139	130144	0 %	50 %	0 %	50 %	289207310
3027	NC_013889	CCG	2	6	130178	130183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207310
3028	NC_013889	GGAC	2	8	130205	130212	25 %	0 %	50 %	25 %	289207310
3029	NC_013889	CGAAGT	2	12	130236	130247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289207310
3030	NC_013889	T	8	8	130301	130308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013889	GTC	2	6	130386	130391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_013889	CCG	2	6	130428	130433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207311
3033	NC_013889	TC	3	6	130560	130565	0 %	50 %	0 %	50 %	289207311
3034	NC_013889	GTGC	2	8	130567	130574	0 %	25 %	50 %	25 %	289207311
3035	NC_013889	AAG	2	6	130663	130668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207311
3036	NC_013889	CCG	2	6	130674	130679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207311
3037	NC_013889	TTC	2	6	130819	130824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207311
3038	NC_013889	CAC	2	6	130888	130893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207311
3039	NC_013889	CG	3	6	130924	130929	0 %	0 %	50 %	50 %	289207311
3040	NC_013889	GGC	2	6	130938	130943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207311
3041	NC_013889	CG	4	8	130955	130962	0 %	0 %	50 %	50 %	289207311
3042	NC_013889	GAA	2	6	131000	131005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_013889	GGT	2	6	131072	131077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207312
3044	NC_013889	CG	3	6	131079	131084	0 %	0 %	50 %	50 %	289207312
3045	NC_013889	CTG	2	6	131118	131123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207312
3046	NC_013889	GGC	2	6	131180	131185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207312
3047	NC_013889	GATGC	2	10	131190	131199	20 %	20 %	40 %	20 %	289207312
3048	NC_013889	GC	4	8	131198	131205	0 %	0 %	50 %	50 %	289207312
3049	NC_013889	CCTT	2	8	131257	131264	0 %	50 %	0 %	50 %	289207312
3050	NC_013889	GCA	2	6	131279	131284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207312
3051	NC_013889	GCA	2	6	131294	131299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207312
3052	NC_013889	AG	3	6	131306	131311	50 %	0 %	50 %	0 %	289207312
3053	NC_013889	CGG	2	6	131312	131317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207312
3054	NC_013889	TCT	2	6	131324	131329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207312
3055	NC_013889	CGGC	2	8	131381	131388	0 %	0 %	50 %	50 %	289207312
3056	NC_013889	GC	3	6	131568	131573	0 %	0 %	50 %	50 %	289207312
3057	NC_013889	GCC	2	6	131613	131618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207312
3058	NC_013889	GAG	2	6	131680	131685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207312
3059	NC_013889	GAAG	2	8	131718	131725	50 %	0 %	50 %	0 %	289207313
3060	NC_013889	TGCG	2	8	131731	131738	0 %	25 %	50 %	25 %	289207313
3061	NC_013889	GGA	2	6	131757	131762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207313
3062	NC_013889	TCG	2	6	131837	131842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207313
3063	NC_013889	CGG	3	9	131931	131939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207313
3064	NC_013889	CGA	2	6	131946	131951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207313
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3066	NC_013889	GC	3	6	132017	132022	0 %	0 %	50 %	50 %	289207313
3067	NC_013889	CAT	2	6	132063	132068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207313
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3069	NC_013889	TGAT	2	8	132137	132144	25 %	50 %	25 %	0 %	289207313
3070	NC_013889	TGGTG	2	10	132168	132177	0 %	40 %	60 %	0 %	289207313
3071	NC_013889	GAT	2	6	132210	132215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207313
3072	NC_013889	CCGC	2	8	132239	132246	0 %	0 %	25 %	75 %	289207313
3073	NC_013889	TCG	2	6	132353	132358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207313
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3075	NC_013889	GC	3	6	132397	132402	0 %	0 %	50 %	50 %	289207313
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3077	NC_013889	CAT	2	6	132439	132444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207314
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3079	NC_013889	GCCG	2	8	132464	132471	0 %	0 %	50 %	50 %	289207314
3080	NC_013889	CGT	2	6	132472	132477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207314
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3082	NC_013889	TGA	2	6	132592	132597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207314
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3086	NC_013889	GCGG	2	8	132673	132680	0 %	0 %	75 %	25 %	289207314
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3091	NC_013889	GGC	2	6	132769	132774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207314
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3093	NC_013889	GTC	2	6	132896	132901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207314
3094	NC_013889	CTG	2	6	132944	132949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207314
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3101	NC_013889	CGGG	2	8	133240	133247	0 %	0 %	75 %	25 %	289207315
3102	NC_013889	GC	3	6	133262	133267	0 %	0 %	50 %	50 %	289207315
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3107	NC_013889	CGG	2	6	133376	133381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207315
3108	NC_013889	ACG	2	6	133403	133408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207315
3109	NC_013889	GCC	2	6	133478	133483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207315
3110	NC_013889	CGA	2	6	133488	133493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207315
3111	NC_013889	CGA	2	6	133500	133505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207315
3112	NC_013889	CG	3	6	133548	133553	0 %	0 %	50 %	50 %	289207315
3113	NC_013889	ATAA	2	8	133586	133593	75 %	25 %	0 %	0 %	289207315
3114	NC_013889	GA	3	6	133657	133662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_013889	TGG	2	6	133675	133680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207316
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3118	NC_013889	TGC	2	6	133722	133727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207316
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3121	NC_013889	GAA	2	6	133915	133920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207316
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3123	NC_013889	GCG	2	6	134001	134006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3245	NC_013889	CGG	2	6	138749	138754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207321
3246	NC_013889	GAT	2	6	138813	138818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207321
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3361	NC_013889	CAGGT	2	10	143752	143761	20 %	20 %	40 %	20 %	289207326
3362	NC_013889	CGC	2	6	143894	143899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207326
3363	NC_013889	GC	3	6	143904	143909	0 %	0 %	50 %	50 %	289207326
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3365	NC_013889	GAG	2	6	143944	143949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207326
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3369	NC_013889	GAT	2	6	144045	144050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207326
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3394	NC_013889	GCC	2	6	144942	144947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3489	NC_013889	ACC	2	6	148720	148725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207330
3490	NC_013889	CGG	2	6	148851	148856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207330
3491	NC_013889	CGA	2	6	148905	148910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207330
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3493	NC_013889	TGC	2	6	148958	148963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207330
3494	NC_013889	TGC	2	6	148967	148972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207330
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