MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013889	CGT	2	6	256009	256014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6002	NC_013889	CTT	2	6	256048	256053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207434
6003	NC_013889	GCC	2	6	256058	256063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6004	NC_013889	AGC	2	6	256137	256142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6005	NC_013889	ATC	2	6	256173	256178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207434
6006	NC_013889	ACC	2	6	256251	256256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207434
6007	NC_013889	GCC	2	6	256268	256273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6008	NC_013889	TCA	2	6	256285	256290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207434
6009	NC_013889	GCCAGC	2	12	256302	256313	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207434
6010	NC_013889	GAA	2	6	256316	256321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207434
6011	NC_013889	CAG	3	9	256322	256330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6012	NC_013889	CGC	2	6	256348	256353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6013	NC_013889	TGG	2	6	256357	256362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207434
6014	NC_013889	CAT	2	6	256364	256369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207434
6015	NC_013889	CAG	2	6	256376	256381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6016	NC_013889	CTG	2	6	256415	256420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6017	NC_013889	GCC	2	6	256421	256426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6018	NC_013889	TCT	2	6	256438	256443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207434
6019	NC_013889	TCA	2	6	256444	256449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207434
6020	NC_013889	CCA	2	6	256471	256476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207434
6021	NC_013889	GCA	2	6	256564	256569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6022	NC_013889	GCC	3	9	256598	256606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6023	NC_013889	ATC	2	6	256626	256631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207434
6024	NC_013889	CTT	2	6	256655	256660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207434
6025	NC_013889	CCA	2	6	256667	256672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207434
6026	NC_013889	GC	3	6	256678	256683	0 %	0 %	50 %	50 %	289207434
6027	NC_013889	CGC	2	6	256723	256728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6028	NC_013889	GAT	2	6	256790	256795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207434
6029	NC_013889	GGT	2	6	256808	256813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207434
6030	NC_013889	GGA	2	6	256817	256822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207434
6031	NC_013889	CGA	2	6	256837	256842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207434
6032	NC_013889	CCG	3	9	256852	256860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207434
6033	NC_013889	TGA	2	6	256876	256881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207434
6034	NC_013889	CTT	2	6	256903	256908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207435
6035	NC_013889	GTC	2	6	256909	256914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207435
6036	NC_013889	CTT	2	6	256915	256920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207435
6037	NC_013889	GAC	2	6	256954	256959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207435
6038	NC_013889	CCAC	2	8	256964	256971	25 %	0 %	0 %	75 %	289207435
6039	NC_013889	GCG	2	6	257022	257027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207435
6040	NC_013889	GAT	2	6	257131	257136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207435
6041	NC_013889	GAT	2	6	257191	257196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207435
6042	NC_013889	TCG	2	6	257281	257286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207436
6043	NC_013889	CGC	2	6	257306	257311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207436
6044	NC_013889	ATC	2	6	257320	257325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207436
6045	NC_013889	GAT	2	6	257409	257414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207436
6046	NC_013889	CCA	2	6	257464	257469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207436
6047	NC_013889	CGG	2	6	257564	257569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207436
6048	NC_013889	CTG	3	9	257616	257624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207436
6049	NC_013889	GCC	2	6	257658	257663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207436
6050	NC_013889	CGG	2	6	257672	257677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207436
6051	NC_013889	CGT	2	6	257741	257746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207436
6052	NC_013889	GCCG	2	8	257844	257851	0 %	0 %	50 %	50 %	289207436
6053	NC_013889	GGT	2	6	257853	257858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207436
6054	NC_013889	GAA	2	6	257868	257873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207436
6055	NC_013889	GA	3	6	257881	257886	50 %	0 %	50 %	0 %	289207436
6056	NC_013889	GCC	2	6	257923	257928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207436
6057	NC_013889	CGA	2	6	257931	257936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207436
6058	NC_013889	GC	3	6	257956	257961	0 %	0 %	50 %	50 %	289207436
6059	NC_013889	GAC	2	6	258057	258062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207436
6060	NC_013889	GCC	2	6	258253	258258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207436
6061	NC_013889	CGC	2	6	258287	258292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207436
6062	NC_013889	CT	3	6	258333	258338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_013889	GGT	2	6	258391	258396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_013889	CGG	2	6	258432	258437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_013889	A	6	6	258438	258443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013889	TTGCG	2	10	258551	258560	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6067	NC_013889	CAAG	2	8	258580	258587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_013889	CGG	2	6	258653	258658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_013889	CCGA	2	8	258727	258734	25 %	0 %	25 %	50 %	289207437
6070	NC_013889	CGC	2	6	258756	258761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207437
6071	NC_013889	CTA	2	6	258807	258812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207437
6072	NC_013889	CTG	2	6	258844	258849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207437
6073	NC_013889	ATC	2	6	258913	258918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207437
6074	NC_013889	CGC	2	6	258962	258967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207437
6075	NC_013889	CAA	2	6	258969	258974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207437
6076	NC_013889	CAC	2	6	258975	258980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207437
6077	NC_013889	CGC	2	6	258988	258993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207437
6078	NC_013889	TC	3	6	259041	259046	0 %	50 %	0 %	50 %	289207437
6079	NC_013889	AAC	2	6	259093	259098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207437
6080	NC_013889	GTG	2	6	259099	259104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207437
6081	NC_013889	GGCC	2	8	259134	259141	0 %	0 %	50 %	50 %	289207437
6082	NC_013889	GCT	2	6	259167	259172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207437
6083	NC_013889	CCCA	2	8	259189	259196	25 %	0 %	0 %	75 %	289207437
6084	NC_013889	CTG	2	6	259252	259257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207437
6085	NC_013889	GCC	2	6	259289	259294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207437
6086	NC_013889	CG	3	6	259310	259315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_013889	CCAAC	2	10	259351	259360	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6088	NC_013889	CATC	2	8	259382	259389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_013889	GGCG	2	8	259459	259466	0 %	0 %	75 %	25 %	289207438
6090	NC_013889	TGC	2	6	259467	259472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6091	NC_013889	CG	3	6	259548	259553	0 %	0 %	50 %	50 %	289207438
6092	NC_013889	TGG	2	6	259577	259582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207438
6093	NC_013889	CAT	2	6	259597	259602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207438
6094	NC_013889	CCGC	2	8	259612	259619	0 %	0 %	25 %	75 %	289207438
6095	NC_013889	GCC	2	6	259628	259633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207438
6096	NC_013889	CGA	2	6	259654	259659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
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6099	NC_013889	CGA	2	6	259732	259737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
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6101	NC_013889	CGC	2	6	259817	259822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207438
6102	NC_013889	TGC	2	6	259830	259835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6103	NC_013889	TCG	2	6	259932	259937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6104	NC_013889	CCT	2	6	259938	259943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207438
6105	NC_013889	ACG	2	6	259944	259949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6106	NC_013889	CAG	2	6	259978	259983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6107	NC_013889	CTG	2	6	260060	260065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6108	NC_013889	TGCCA	2	10	260090	260099	20 %	20 %	20 %	40 %	289207438
6109	NC_013889	GGC	2	6	260113	260118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207438
6110	NC_013889	ACG	2	6	260133	260138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6111	NC_013889	AGG	2	6	260226	260231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207438
6112	NC_013889	GCGT	2	8	260232	260239	0 %	25 %	50 %	25 %	289207438
6113	NC_013889	GAG	2	6	260291	260296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207438
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6116	NC_013889	GAC	2	6	260432	260437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6117	NC_013889	GC	4	8	260456	260463	0 %	0 %	50 %	50 %	289207438
6118	NC_013889	GCA	2	6	260497	260502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207438
6119	NC_013889	ACC	2	6	260522	260527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207439
6120	NC_013889	GAG	2	6	260543	260548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207439
6121	NC_013889	ATC	2	6	260579	260584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207439
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6230	NC_013889	CTA	2	6	265486	265491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207441
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6232	NC_013889	GGA	2	6	265514	265519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_013889	CAT	2	6	265544	265549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207442
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6235	NC_013889	AGGGCG	2	12	265576	265587	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	289207442
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6237	NC_013889	GAC	2	6	265599	265604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207442
6238	NC_013889	GGGC	2	8	265685	265692	0 %	0 %	75 %	25 %	289207442
6239	NC_013889	TGG	2	6	265708	265713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207442
6240	NC_013889	GCG	2	6	265744	265749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207442
6241	NC_013889	TTC	2	6	265779	265784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207442
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6360	NC_013889	CG	4	8	270520	270527	0 %	0 %	50 %	50 %	289207448
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6487	NC_013889	CAG	2	6	275302	275307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207450
6488	NC_013889	TGC	3	9	275324	275332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207450
6489	NC_013889	CAG	2	6	275359	275364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207450
6490	NC_013889	CGA	2	6	275436	275441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207450
6491	NC_013889	AGT	2	6	275448	275453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207450
6492	NC_013889	GCA	2	6	275493	275498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207450
6493	NC_013889	GTT	2	6	275530	275535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207450
6494	NC_013889	GCCGAA	2	12	275587	275598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207450
6495	NC_013889	CGC	2	6	275617	275622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207450
6496	NC_013889	GCC	2	6	275650	275655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207450
6497	NC_013889	GCC	2	6	275779	275784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207450
6498	NC_013889	CGG	2	6	275832	275837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207450
6499	NC_013889	GTG	2	6	275950	275955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207450
6500	NC_013889	GGC	2	6	275960	275965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207450

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