MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013889	G	6	6	235021	235026	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_013889	GCG	2	6	235244	235249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_013889	GGC	2	6	235273	235278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207414
5504	NC_013889	GTGG	2	8	235288	235295	0 %	25 %	75 %	0 %	289207414
5505	NC_013889	GGC	2	6	235318	235323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207414
5506	NC_013889	GTCG	2	8	235508	235515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_013889	AC	3	6	235557	235562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_013889	GC	4	8	235691	235698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_013889	CGAGCG	2	12	235709	235720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_013889	G	6	6	235744	235749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_013889	GCG	2	6	235763	235768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207415
5512	NC_013889	CG	4	8	235767	235774	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5513	NC_013889	TGG	2	6	235780	235785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207415
5514	NC_013889	CG	3	6	235813	235818	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5515	NC_013889	GCTG	2	8	235826	235833	0 %	25 %	50 %	25 %	289207415
5516	NC_013889	CGG	3	9	235834	235842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207415
5517	NC_013889	GC	4	8	235872	235879	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5518	NC_013889	GGA	2	6	235898	235903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207415
5519	NC_013889	CTG	2	6	235920	235925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5520	NC_013889	CGA	2	6	235934	235939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5521	NC_013889	GCCG	2	8	235958	235965	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5522	NC_013889	CGAG	2	8	236005	236012	25 %	0 %	50 %	25 %	289207415
5523	NC_013889	GCGCT	2	10	236046	236055	0 %	20 %	40 %	40 %	289207415
5524	NC_013889	TGG	2	6	236059	236064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207415
5525	NC_013889	GCATGC	2	12	236068	236079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5526	NC_013889	GC	3	6	236082	236087	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5527	NC_013889	CGA	2	6	236096	236101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5528	NC_013889	GTA	2	6	236115	236120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_013889	GC	3	6	236180	236185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_013889	GCT	2	6	236307	236312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_013889	TGG	2	6	236323	236328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013889	GGT	2	6	236447	236452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207416
5533	NC_013889	CG	3	6	236489	236494	0 %	0 %	50 %	50 %	289207416
5534	NC_013889	CTC	2	6	236559	236564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207416
5535	NC_013889	GCA	2	6	236612	236617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207416
5536	NC_013889	GAT	2	6	236625	236630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207416
5537	NC_013889	CGGC	2	8	236675	236682	0 %	0 %	50 %	50 %	289207416
5538	NC_013889	AGC	2	6	236701	236706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207416
5539	NC_013889	GC	3	6	236805	236810	0 %	0 %	50 %	50 %	289207416
5540	NC_013889	GCA	2	6	236846	236851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207416
5541	NC_013889	CCT	2	6	236864	236869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207416
5542	NC_013889	AGG	2	6	236873	236878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207416
5543	NC_013889	GGC	2	6	236923	236928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207416
5544	NC_013889	CGG	2	6	236966	236971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_013889	GCG	2	6	236974	236979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_013889	CG	3	6	236982	236987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_013889	CCCGCT	2	12	236994	237005	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_013889	GTA	2	6	237046	237051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207417
5549	NC_013889	TGC	2	6	237101	237106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5550	NC_013889	GGGC	2	8	237114	237121	0 %	0 %	75 %	25 %	289207417
5551	NC_013889	CAG	2	6	237130	237135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5552	NC_013889	GGC	2	6	237145	237150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207417
5553	NC_013889	GC	3	6	237149	237154	0 %	0 %	50 %	50 %	289207417
5554	NC_013889	TCG	2	6	237197	237202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5555	NC_013889	ACAGGT	2	12	237240	237251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289207417
5556	NC_013889	GCG	2	6	237328	237333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207417
5557	NC_013889	CAT	2	6	237360	237365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207417
5558	NC_013889	TTG	2	6	237416	237421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207417
5559	NC_013889	GC	3	6	237439	237444	0 %	0 %	50 %	50 %	289207417
5560	NC_013889	GAC	2	6	237550	237555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5561	NC_013889	ATC	2	6	237596	237601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207417
5562	NC_013889	GGGGC	2	10	237673	237682	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5563	NC_013889	ATA	2	6	237743	237748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_013889	GGAC	2	8	237811	237818	25 %	0 %	50 %	25 %	289207418
5565	NC_013889	TCT	2	6	237823	237828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207418
5566	NC_013889	CG	3	6	237911	237916	0 %	0 %	50 %	50 %	289207418
5567	NC_013889	CG	3	6	238042	238047	0 %	0 %	50 %	50 %	289207418
5568	NC_013889	TTC	2	6	238056	238061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207418
5569	NC_013889	TGT	2	6	238099	238104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207418
5570	NC_013889	GCG	2	6	238326	238331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207418
5571	NC_013889	CAT	2	6	238353	238358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207418
5572	NC_013889	TCC	2	6	238438	238443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207418
5573	NC_013889	GCGA	2	8	238444	238451	25 %	0 %	50 %	25 %	289207418
5574	NC_013889	GAA	2	6	238460	238465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207418
5575	NC_013889	CCG	3	9	238466	238474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207418
5576	NC_013889	CAC	2	6	238490	238495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207418
5577	NC_013889	AGG	2	6	238529	238534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_013889	CCT	2	6	238588	238593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_013889	GTG	2	6	238601	238606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_013889	GGC	2	6	238632	238637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207419
5581	NC_013889	GGT	2	6	238691	238696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207419
5582	NC_013889	GTG	2	6	238728	238733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207419
5583	NC_013889	CTG	2	6	238737	238742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207419
5584	NC_013889	ACC	2	6	238771	238776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207419
5585	NC_013889	AGG	2	6	238795	238800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207419
5586	NC_013889	AGC	2	6	238801	238806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207419
5587	NC_013889	GC	3	6	238826	238831	0 %	0 %	50 %	50 %	289207419
5588	NC_013889	TCGA	2	8	238849	238856	25 %	25 %	25 %	25 %	289207419
5589	NC_013889	CCG	2	6	238891	238896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207419
5590	NC_013889	CG	4	8	238904	238911	0 %	0 %	50 %	50 %	289207419
5591	NC_013889	CGGCG	2	10	238977	238986	0 %	0 %	60 %	40 %	289207419
5592	NC_013889	CTC	2	6	239007	239012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207419
5593	NC_013889	GCTG	2	8	239015	239022	0 %	25 %	50 %	25 %	289207419
5594	NC_013889	ATGG	2	8	239028	239035	25 %	25 %	50 %	0 %	289207419
5595	NC_013889	CCG	2	6	239044	239049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207419
5596	NC_013889	CAG	2	6	239064	239069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207419
5597	NC_013889	CAG	2	6	239295	239300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207419
5598	NC_013889	AGGC	2	8	239361	239368	25 %	0 %	50 %	25 %	289207419
5599	NC_013889	GAT	2	6	239421	239426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_013889	GAG	2	6	239465	239470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207420
5601	NC_013889	AGC	2	6	239565	239570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207420
5602	NC_013889	CGA	2	6	239821	239826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207421
5603	NC_013889	CGCC	2	8	239876	239883	0 %	0 %	25 %	75 %	289207421
5604	NC_013889	GCC	2	6	239911	239916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5605	NC_013889	GAG	2	6	239965	239970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207421
5606	NC_013889	CGC	2	6	240009	240014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5607	NC_013889	CGA	2	6	240017	240022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207421
5608	NC_013889	TTG	2	6	240034	240039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207421
5609	NC_013889	TGT	2	6	240098	240103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207421
5610	NC_013889	TCG	2	6	240151	240156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207421
5611	NC_013889	GGCC	2	8	240185	240192	0 %	0 %	50 %	50 %	289207421
5612	NC_013889	TCA	2	6	240212	240217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207421
5613	NC_013889	GCGG	2	8	240252	240259	0 %	0 %	75 %	25 %	289207421
5614	NC_013889	CCG	2	6	240265	240270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5615	NC_013889	GCGCC	2	10	240304	240313	0 %	0 %	40 %	60 %	289207421
5616	NC_013889	GAT	2	6	240396	240401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207421
5617	NC_013889	CGG	2	6	240465	240470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207421
5618	NC_013889	CGG	2	6	240486	240491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207421
5619	NC_013889	CGC	2	6	240509	240514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5620	NC_013889	CAG	2	6	240528	240533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207421
5621	NC_013889	GCA	2	6	240542	240547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207421
5622	NC_013889	GTC	2	6	240618	240623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207421
5623	NC_013889	GCC	2	6	240675	240680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5624	NC_013889	GTCGCG	2	12	240750	240761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289207421
5625	NC_013889	GTGA	2	8	240777	240784	25 %	25 %	50 %	0 %	289207421
5626	NC_013889	CCG	2	6	240805	240810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5627	NC_013889	CAT	2	6	240870	240875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207421
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5629	NC_013889	CCG	2	6	240916	240921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5630	NC_013889	GCC	2	6	240924	240929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207421
5631	NC_013889	CGACCA	2	12	240932	240943	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289207421
5632	NC_013889	GGC	2	6	240966	240971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207421
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5635	NC_013889	CGC	2	6	241248	241253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207422
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5638	NC_013889	T	6	6	241421	241426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5639	NC_013889	CTG	2	6	241461	241466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5640	NC_013889	GCCGG	2	10	241479	241488	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5646	NC_013889	CCTGG	2	10	241739	241748	0 %	20 %	40 %	40 %	289207423
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5731	NC_013889	CAGGCG	2	12	245617	245628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207429
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5743	NC_013889	CTGG	2	8	246106	246113	0 %	25 %	50 %	25 %	289207429
5744	NC_013889	GCG	2	6	246145	246150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207429
5745	NC_013889	CTCG	2	8	246169	246176	0 %	25 %	25 %	50 %	289207429
5746	NC_013889	TGC	2	6	246245	246250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207429
5747	NC_013889	GCG	2	6	246262	246267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207429
5748	NC_013889	GC	3	6	246314	246319	0 %	0 %	50 %	50 %	289207429
5749	NC_013889	GCA	2	6	246324	246329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207429
5750	NC_013889	GCA	2	6	246360	246365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207429
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5752	NC_013889	GCA	2	6	246414	246419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207429
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5754	NC_013889	CTGG	2	8	246433	246440	0 %	25 %	50 %	25 %	289207429
5755	NC_013889	GGCGGG	2	12	246448	246459	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	289207429
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5784	NC_013889	GCG	2	6	247842	247847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207430
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5862	NC_013889	CGCAGG	2	12	250520	250531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207431
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