MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013889	GC	3	6	211388	211393	0 %	0 %	50 %	50 %	289207388
5002	NC_013889	CTG	2	6	211395	211400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207388
5003	NC_013889	GCC	2	6	211440	211445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207388
5004	NC_013889	CTG	2	6	211545	211550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207388
5005	NC_013889	CGG	2	6	211570	211575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207388
5006	NC_013889	TCT	2	6	211615	211620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207388
5007	NC_013889	GC	3	6	211718	211723	0 %	0 %	50 %	50 %	289207388
5008	NC_013889	GACCT	2	10	211734	211743	20 %	20 %	20 %	40 %	289207388
5009	NC_013889	TAC	2	6	211833	211838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207388
5010	NC_013889	TGG	2	6	211852	211857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207388
5011	NC_013889	GCT	2	6	211925	211930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207388
5012	NC_013889	CGA	2	6	211979	211984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207388
5013	NC_013889	CGC	2	6	212048	212053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207388
5014	NC_013889	GCT	2	6	212081	212086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207388
5015	NC_013889	CG	3	6	212158	212163	0 %	0 %	50 %	50 %	289207389
5016	NC_013889	GC	3	6	212169	212174	0 %	0 %	50 %	50 %	289207389
5017	NC_013889	GAC	2	6	212203	212208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207389
5018	NC_013889	GC	3	6	212286	212291	0 %	0 %	50 %	50 %	289207389
5019	NC_013889	GAG	2	6	212332	212337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207389
5020	NC_013889	CG	3	6	212394	212399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_013889	GCC	2	6	212416	212421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_013889	CGCTG	2	10	212575	212584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5023	NC_013889	CAGGG	2	10	212598	212607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5024	NC_013889	GGC	2	6	212694	212699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_013889	CAT	2	6	212832	212837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207390
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5027	NC_013889	AC	3	6	213026	213031	50 %	0 %	0 %	50 %	289207390
5028	NC_013889	TGC	3	9	213089	213097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
5029	NC_013889	TGG	2	6	213098	213103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207390
5030	NC_013889	GTG	2	6	213178	213183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207390
5031	NC_013889	CAA	2	6	213186	213191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207390
5032	NC_013889	GC	4	8	213206	213213	0 %	0 %	50 %	50 %	289207390
5033	NC_013889	CGAC	2	8	213263	213270	25 %	0 %	25 %	50 %	289207390
5034	NC_013889	CTG	2	6	213361	213366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
5035	NC_013889	TCG	2	6	213374	213379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
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5037	NC_013889	ATCGGC	2	12	213466	213477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207390
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5039	NC_013889	TGC	2	6	213557	213562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
5040	NC_013889	CAT	2	6	213621	213626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207390
5041	NC_013889	TGC	2	6	213794	213799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
5042	NC_013889	CTG	2	6	213808	213813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
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5053	NC_013889	GTC	2	6	214405	214410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207390
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5058	NC_013889	CGA	4	12	214521	214532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207390
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5061	NC_013889	AAG	2	6	214597	214602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207390
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5064	NC_013889	GGT	2	6	214930	214935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207391
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5078	NC_013889	GGGT	2	8	215683	215690	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_013889	GTC	2	6	215790	215795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_013889	CTG	2	6	215964	215969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_013889	AAG	2	6	215982	215987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013889	GCC	2	6	215988	215993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_013889	CGC	2	6	215996	216001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_013889	GCCG	2	8	216043	216050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_013889	GCT	2	6	216100	216105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207393
5094	NC_013889	CGTT	2	8	216121	216128	0 %	50 %	25 %	25 %	289207393
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5098	NC_013889	GCG	2	6	216349	216354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207393
5099	NC_013889	GC	3	6	216358	216363	0 %	0 %	50 %	50 %	289207393
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5102	NC_013889	CTG	2	6	216461	216466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207393
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5105	NC_013889	GC	3	6	216606	216611	0 %	0 %	50 %	50 %	289207394
5106	NC_013889	GCG	2	6	216714	216719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207394
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5108	NC_013889	TGGT	2	8	216781	216788	0 %	50 %	50 %	0 %	289207394
5109	NC_013889	CGGG	2	8	216961	216968	0 %	0 %	75 %	25 %	289207395
5110	NC_013889	ACCG	2	8	216976	216983	25 %	0 %	25 %	50 %	289207395
5111	NC_013889	CGA	2	6	217053	217058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207395
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5118	NC_013889	TCG	2	6	217412	217417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207395
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5123	NC_013889	GCC	2	6	217668	217673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207395
5124	NC_013889	GCC	2	6	217681	217686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207395
5125	NC_013889	CGG	2	6	217715	217720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207395
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5130	NC_013889	AGC	2	6	217832	217837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207395
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5231	NC_013889	GC	3	6	222226	222231	0 %	0 %	50 %	50 %	289207398
5232	NC_013889	GCCTGC	2	12	222259	222270	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289207398
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5240	NC_013889	TGC	2	6	222598	222603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207399
5241	NC_013889	TCC	2	6	222670	222675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207399
5242	NC_013889	TCCG	2	8	222684	222691	0 %	25 %	25 %	50 %	289207399
5243	NC_013889	CGG	2	6	222698	222703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207399
5244	NC_013889	CGG	2	6	222715	222720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207399
5245	NC_013889	TGG	2	6	222764	222769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207399
5246	NC_013889	CGA	2	6	222771	222776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207399
5247	NC_013889	GGC	2	6	222813	222818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207399
5248	NC_013889	ATC	2	6	222853	222858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207399
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5251	NC_013889	CGG	2	6	222967	222972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_013889	CGGC	2	8	223034	223041	0 %	0 %	50 %	50 %	289207400
5253	NC_013889	GCCCG	2	10	223062	223071	0 %	0 %	40 %	60 %	289207400
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5259	NC_013889	GGA	2	6	223637	223642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_013889	TC	3	6	223659	223664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5261	NC_013889	CTTC	2	8	223701	223708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_013889	CCG	2	6	223832	223837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207401
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5266	NC_013889	TCGGT	2	10	223996	224005	0 %	40 %	40 %	20 %	289207401
5267	NC_013889	AGGTC	2	10	224031	224040	20 %	20 %	40 %	20 %	289207401
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5273	NC_013889	ATT	2	6	224254	224259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289207401
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5278	NC_013889	CGG	2	6	224630	224635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207401
5279	NC_013889	CG	3	6	224664	224669	0 %	0 %	50 %	50 %	289207401
5280	NC_013889	GAC	2	6	224671	224676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207401
5281	NC_013889	TCC	2	6	224695	224700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207401
5282	NC_013889	TGG	2	6	224745	224750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207401
5283	NC_013889	CACG	2	8	224778	224785	25 %	0 %	25 %	50 %	289207401
5284	NC_013889	GTG	2	6	224861	224866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207401
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5287	NC_013889	CG	5	10	224950	224959	0 %	0 %	50 %	50 %	289207401
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5293	NC_013889	ACC	2	6	225308	225313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207401
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5302	NC_013889	TGA	2	6	225878	225883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207402
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5315	NC_013889	TGG	2	6	226454	226459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207402
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5319	NC_013889	GTT	2	6	226586	226591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207402
5320	NC_013889	GTG	2	6	226603	226608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207402
5321	NC_013889	TCG	2	6	226674	226679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207403
5322	NC_013889	TCGG	2	8	226706	226713	0 %	25 %	50 %	25 %	289207403
5323	NC_013889	CT	3	6	226812	226817	0 %	50 %	0 %	50 %	289207403
5324	NC_013889	CGT	2	6	226837	226842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207403
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5334	NC_013889	GGT	2	6	227486	227491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207403
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5336	NC_013889	TGC	2	6	227628	227633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207404
5337	NC_013889	GGT	2	6	227698	227703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207404
5338	NC_013889	CACCCG	2	12	227751	227762	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289207404
5339	NC_013889	GCCG	2	8	227782	227789	0 %	0 %	50 %	50 %	289207404
5340	NC_013889	CCG	2	6	227904	227909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207404
5341	NC_013889	GGC	2	6	227919	227924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207404
5342	NC_013889	CGGT	2	8	228048	228055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5343	NC_013889	GC	3	6	228056	228061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5344	NC_013889	GC	3	6	228063	228068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5345	NC_013889	GTA	2	6	228083	228088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5346	NC_013889	GCG	2	6	228121	228126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5347	NC_013889	G	8	8	228185	228192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5348	NC_013889	GAGG	2	8	228230	228237	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5349	NC_013889	GCC	2	6	228247	228252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207405
5350	NC_013889	TGA	2	6	228289	228294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207405
5351	NC_013889	TGG	2	6	228298	228303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207405
5352	NC_013889	CT	3	6	228386	228391	0 %	50 %	0 %	50 %	289207405
5353	NC_013889	AAC	2	6	228429	228434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207405
5354	NC_013889	ACG	2	6	228493	228498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207405
5355	NC_013889	GAT	2	6	228504	228509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207405
5356	NC_013889	TCC	2	6	228531	228536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207405
5357	NC_013889	GGCA	2	8	228580	228587	25 %	0 %	50 %	25 %	289207405
5358	NC_013889	CAG	2	6	228593	228598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207405
5359	NC_013889	TGG	2	6	228626	228631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207405
5360	NC_013889	GCAG	2	8	228632	228639	25 %	0 %	50 %	25 %	289207405
5361	NC_013889	CCA	2	6	228728	228733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5362	NC_013889	GGC	2	6	228861	228866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207406
5363	NC_013889	CTG	2	6	228901	228906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207406
5364	NC_013889	CAG	2	6	228913	228918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207406
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5366	NC_013889	CGG	2	6	229004	229009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207406
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5489	NC_013889	TCG	2	6	234412	234417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5490	NC_013889	CTG	3	9	234420	234428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5491	NC_013889	TCGA	2	8	234469	234476	25 %	25 %	25 %	25 %	289207413
5492	NC_013889	CGC	2	6	234532	234537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207413
5493	NC_013889	GGC	2	6	234560	234565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207413
5494	NC_013889	CGG	2	6	234594	234599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207413
5495	NC_013889	CGT	2	6	234613	234618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5496	NC_013889	CAT	2	6	234648	234653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207413
5497	NC_013889	CGGT	2	8	234664	234671	0 %	25 %	50 %	25 %	289207413
5498	NC_013889	TTG	2	6	234673	234678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207413
5499	NC_013889	GCA	2	6	234848	234853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5500	NC_013889	CGTC	2	8	235008	235015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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