MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013889	CTG	2	6	191338	191343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4502	NC_013889	CAT	2	6	191346	191351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207368
4503	NC_013889	CGG	2	6	191352	191357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207368
4504	NC_013889	CTG	2	6	191358	191363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4505	NC_013889	CG	3	6	191386	191391	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4506	NC_013889	CGC	2	6	191417	191422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207368
4507	NC_013889	CGA	2	6	191484	191489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4508	NC_013889	ACG	2	6	191570	191575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4509	NC_013889	GCG	2	6	191609	191614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207368
4510	NC_013889	ATC	2	6	191620	191625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207368
4511	NC_013889	TGA	2	6	191723	191728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207368
4512	NC_013889	CTC	2	6	191733	191738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207368
4513	NC_013889	ATC	2	6	191749	191754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207368
4514	NC_013889	GGCC	2	8	191757	191764	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4515	NC_013889	GT	3	6	191769	191774	0 %	50 %	50 %	0 %	289207368
4516	NC_013889	GGT	2	6	191787	191792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207368
4517	NC_013889	AGG	2	6	191810	191815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
4518	NC_013889	GAG	2	6	191818	191823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
4519	NC_013889	TCA	2	6	191828	191833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207368
4520	NC_013889	CGA	2	6	191886	191891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4521	NC_013889	CCG	2	6	191916	191921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207368
4522	NC_013889	GCT	2	6	191949	191954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4523	NC_013889	CAT	2	6	191985	191990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207368
4524	NC_013889	GAG	2	6	192028	192033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
4525	NC_013889	CAA	2	6	192036	192041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207368
4526	NC_013889	CGG	2	6	192108	192113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207368
4527	NC_013889	GAC	2	6	192247	192252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4528	NC_013889	CGA	2	6	192255	192260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4529	NC_013889	GAAG	2	8	192267	192274	50 %	0 %	50 %	0 %	289207368
4530	NC_013889	GAG	2	6	192337	192342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
4531	NC_013889	GCG	2	6	192356	192361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207368
4532	NC_013889	AAG	2	6	192364	192369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207368
4533	NC_013889	CAG	2	6	192475	192480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4534	NC_013889	GGT	2	6	192576	192581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207368
4535	NC_013889	CG	4	8	192588	192595	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4536	NC_013889	TGA	2	6	192596	192601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207368
4537	NC_013889	AAC	2	6	192658	192663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207368
4538	NC_013889	TCG	2	6	192719	192724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4539	NC_013889	CAA	2	6	192741	192746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207368
4540	NC_013889	GGC	2	6	192798	192803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207368
4541	NC_013889	GACGTC	2	12	192814	192825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4542	NC_013889	GGA	2	6	192858	192863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
4543	NC_013889	CGC	2	6	192876	192881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207368
4544	NC_013889	GAC	2	6	192903	192908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4545	NC_013889	TGA	2	6	192914	192919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207368
4546	NC_013889	CCA	2	6	192929	192934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207368
4547	NC_013889	CG	3	6	192938	192943	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4548	NC_013889	ACT	2	6	192971	192976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207368
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4550	NC_013889	CG	4	8	193007	193014	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4551	NC_013889	CGC	2	6	193062	193067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207368
4552	NC_013889	AAG	3	9	193117	193125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207368
4553	NC_013889	GC	4	8	193150	193157	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4554	NC_013889	CAA	2	6	193158	193163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207368
4555	NC_013889	TGC	2	6	193244	193249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4556	NC_013889	TGC	3	9	193271	193279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4557	NC_013889	CGA	2	6	193284	193289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
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4559	NC_013889	CGC	2	6	193356	193361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207368
4560	NC_013889	GC	3	6	193402	193407	0 %	0 %	50 %	50 %	289207368
4561	NC_013889	GAG	2	6	193450	193455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
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4564	NC_013889	ATG	2	6	193508	193513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207368
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4568	NC_013889	CAG	2	6	193579	193584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4569	NC_013889	AGG	2	6	193640	193645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
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4571	NC_013889	ACG	2	6	193730	193735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4572	NC_013889	TGCA	2	8	193795	193802	25 %	25 %	25 %	25 %	289207368
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4576	NC_013889	CTG	2	6	193951	193956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4577	NC_013889	CGA	2	6	193962	193967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4578	NC_013889	TGC	2	6	194003	194008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4579	NC_013889	GAG	2	6	194125	194130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207368
4580	NC_013889	ACG	2	6	194162	194167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4581	NC_013889	CGA	2	6	194172	194177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207368
4582	NC_013889	CTT	2	6	194270	194275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4588	NC_013889	CCAG	2	8	194565	194572	25 %	0 %	25 %	50 %	289207369
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4590	NC_013889	GTG	2	6	194656	194661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207369
4591	NC_013889	CGGC	2	8	194701	194708	0 %	0 %	50 %	50 %	289207369
4592	NC_013889	CAG	2	6	194737	194742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207369
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4594	NC_013889	CCAG	2	8	194784	194791	25 %	0 %	25 %	50 %	289207369
4595	NC_013889	TGCTT	2	10	194856	194865	0 %	60 %	20 %	20 %	289207369
4596	NC_013889	TG	4	8	194913	194920	0 %	50 %	50 %	0 %	289207369
4597	NC_013889	GGCC	2	8	194976	194983	0 %	0 %	50 %	50 %	289207369
4598	NC_013889	CCG	2	6	194984	194989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207369
4599	NC_013889	GTG	2	6	195088	195093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013889	T	6	6	195102	195107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4602	NC_013889	GGC	2	6	195173	195178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207370
4603	NC_013889	ACT	2	6	195186	195191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207370
4604	NC_013889	GCCA	2	8	195212	195219	25 %	0 %	25 %	50 %	289207370
4605	NC_013889	CCG	2	6	195282	195287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207370
4606	NC_013889	GCA	2	6	195325	195330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207370
4607	NC_013889	CG	3	6	195343	195348	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4608	NC_013889	GC	3	6	195371	195376	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4609	NC_013889	GAA	2	6	195419	195424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207370
4610	NC_013889	GC	5	10	195427	195436	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4611	NC_013889	GGC	2	6	195442	195447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207370
4612	NC_013889	TGG	2	6	195451	195456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207370
4613	NC_013889	GCGCGA	2	12	195496	195507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207370
4614	NC_013889	TCG	2	6	195514	195519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207370
4615	NC_013889	GC	4	8	195548	195555	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4616	NC_013889	GGA	2	6	195574	195579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207370
4617	NC_013889	GC	3	6	195604	195609	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4618	NC_013889	TCGCC	2	10	195631	195640	0 %	20 %	20 %	60 %	289207370
4619	NC_013889	CAG	2	6	195647	195652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207370
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4863	NC_013889	CGA	2	6	206056	206061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207382
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4984	NC_013889	ATC	2	6	210687	210692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207388
4985	NC_013889	GGA	2	6	210791	210796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207388
4986	NC_013889	GCT	2	6	210833	210838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207388
4987	NC_013889	GGCAAG	2	12	210867	210878	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289207388
4988	NC_013889	CGG	2	6	210890	210895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207388
4989	NC_013889	CGG	3	9	210919	210927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207388
4990	NC_013889	GGCT	2	8	210963	210970	0 %	25 %	50 %	25 %	289207388
4991	NC_013889	TGC	2	6	210985	210990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207388
4992	NC_013889	GGC	2	6	211049	211054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207388
4993	NC_013889	CGC	2	6	211064	211069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207388
4994	NC_013889	GTG	2	6	211098	211103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207388
4995	NC_013889	CGG	3	9	211109	211117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207388
4996	NC_013889	GGA	2	6	211178	211183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207388
4997	NC_013889	GAG	2	6	211224	211229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207388
4998	NC_013889	CAC	2	6	211284	211289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207388
4999	NC_013889	CCCG	2	8	211346	211353	0 %	0 %	25 %	75 %	289207388
5000	NC_013889	CGC	2	6	211379	211384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207388

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