MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 1297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013642	ATCGA	2	10	5112	5121	40 %	20 %	20 %	20 %	281411449
2	NC_013642	TCTGC	2	10	8248	8257	0 %	40 %	20 %	40 %	281411452
3	NC_013642	CACCG	2	10	9209	9218	20 %	0 %	20 %	60 %	281411452
4	NC_013642	TTTTA	2	10	9751	9760	20 %	80 %	0 %	0 %	281411453
5	NC_013642	AGAAC	2	10	10528	10537	60 %	0 %	20 %	20 %	281411453
6	NC_013642	AGAGA	2	10	14756	14765	60 %	0 %	40 %	0 %	281411458
7	NC_013642	GCTCA	2	10	15344	15353	20 %	20 %	20 %	40 %	281411459
8	NC_013642	TTTAT	2	10	16341	16350	20 %	80 %	0 %	0 %	281411460
9	NC_013642	CTATA	2	10	17680	17689	40 %	40 %	0 %	20 %	281411461
10	NC_013642	GAAGT	2	10	18997	19006	40 %	20 %	40 %	0 %	281411462
11	NC_013642	AAGGA	2	10	22416	22425	60 %	0 %	40 %	0 %	281411465
12	NC_013642	TTGGG	2	10	23111	23120	0 %	40 %	60 %	0 %	281411467
13	NC_013642	TTGAA	2	10	23854	23863	40 %	40 %	20 %	0 %	281411468
14	NC_013642	TTCAT	2	10	25260	25269	20 %	60 %	0 %	20 %	281411471
15	NC_013642	CATCA	2	10	27669	27678	40 %	20 %	0 %	40 %	281411475
16	NC_013642	TCTGC	2	10	30834	30843	0 %	40 %	20 %	40 %	281411479
17	NC_013642	CTGTC	2	10	31900	31909	0 %	40 %	20 %	40 %	281411480
18	NC_013642	TCCCT	2	10	32966	32975	0 %	40 %	0 %	60 %	281411480
19	NC_013642	AGTTC	2	10	33808	33817	20 %	40 %	20 %	20 %	281411481
20	NC_013642	TTTCA	2	10	35008	35017	20 %	60 %	0 %	20 %	281411483
21	NC_013642	TGGAA	2	10	35233	35242	40 %	20 %	40 %	0 %	281411483
22	NC_013642	TTACT	2	10	36440	36449	20 %	60 %	0 %	20 %	281411484
23	NC_013642	CGCTC	2	10	38607	38616	0 %	20 %	20 %	60 %	281411486
24	NC_013642	GAGAT	2	10	40257	40266	40 %	20 %	40 %	0 %	281411488
25	NC_013642	ATGGA	2	10	41628	41637	40 %	20 %	40 %	0 %	281411489
26	NC_013642	CTTTT	2	10	46485	46494	0 %	80 %	0 %	20 %	281411494
27	NC_013642	TCTCA	2	10	47985	47994	20 %	40 %	0 %	40 %	281411496
28	NC_013642	ACCAG	2	10	49099	49108	40 %	0 %	20 %	40 %	281411497
29	NC_013642	GAAGA	2	10	51241	51250	60 %	0 %	40 %	0 %	281411498
30	NC_013642	AGCGG	2	10	51636	51645	20 %	0 %	60 %	20 %	281411498
31	NC_013642	CAGAA	2	10	54493	54502	60 %	0 %	20 %	20 %	281411501
32	NC_013642	CTGAT	2	10	55486	55495	20 %	40 %	20 %	20 %	281411503
33	NC_013642	TTCTT	2	10	58234	58243	0 %	80 %	0 %	20 %	281411507
34	NC_013642	TCTAT	2	10	58490	58499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013642	ACTCC	2	10	60397	60406	20 %	20 %	0 %	60 %	281411509
36	NC_013642	ATCAC	2	10	61028	61037	40 %	20 %	0 %	40 %	281411510
37	NC_013642	CGATC	2	10	61567	61576	20 %	20 %	20 %	40 %	281411510
38	NC_013642	AGGAT	2	10	63522	63531	40 %	20 %	40 %	0 %	281411513
39	NC_013642	GCATT	2	10	64299	64308	20 %	40 %	20 %	20 %	281411514
40	NC_013642	ATCCT	2	10	66009	66018	20 %	40 %	0 %	40 %	281411517
41	NC_013642	ATCCT	2	10	66975	66984	20 %	40 %	0 %	40 %	281411517
42	NC_013642	GCAGA	2	10	67412	67421	40 %	0 %	40 %	20 %	281411518
43	NC_013642	TGATA	2	10	68317	68326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013642	CGGAG	2	10	70543	70552	20 %	0 %	60 %	20 %	281411521
45	NC_013642	TTCTT	2	10	71940	71949	0 %	80 %	0 %	20 %	281411522
46	NC_013642	CCTGT	2	10	76601	76610	0 %	40 %	20 %	40 %	281411528
47	NC_013642	TTTCT	2	10	76623	76632	0 %	80 %	0 %	20 %	281411528
48	NC_013642	CATCA	2	10	79012	79021	40 %	20 %	0 %	40 %	281411530
49	NC_013642	TTTCT	2	10	80506	80515	0 %	80 %	0 %	20 %	281411532
50	NC_013642	ATCTG	2	10	81715	81724	20 %	40 %	20 %	20 %	281411533
51	NC_013642	TTTCC	2	10	83061	83070	0 %	60 %	0 %	40 %	281411533
52	NC_013642	ACCAC	2	10	84499	84508	40 %	0 %	0 %	60 %	281411535
53	NC_013642	CGTGC	2	10	87468	87477	0 %	20 %	40 %	40 %	281411537
54	NC_013642	CTTTC	2	10	89205	89214	0 %	60 %	0 %	40 %	281411540
55	NC_013642	AAGAA	2	10	91131	91140	80 %	0 %	20 %	0 %	281411542
56	NC_013642	CATCG	2	10	92171	92180	20 %	20 %	20 %	40 %	281411543
57	NC_013642	TCGAC	2	10	96791	96800	20 %	20 %	20 %	40 %	281411548
58	NC_013642	ATTCC	2	10	97247	97256	20 %	40 %	0 %	40 %	281411548
59	NC_013642	TCTAC	2	10	98005	98014	20 %	40 %	0 %	40 %	281411548
60	NC_013642	CTGTT	2	10	99213	99222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013642	ATTTC	2	10	99347	99356	20 %	60 %	0 %	20 %	281411550
62	NC_013642	CTTTT	2	10	100271	100280	0 %	80 %	0 %	20 %	281411550
63	NC_013642	TCCTC	2	10	102480	102489	0 %	40 %	0 %	60 %	281411552
64	NC_013642	AGAGA	2	10	102849	102858	60 %	0 %	40 %	0 %	281411553
65	NC_013642	AAAGA	2	10	104095	104104	80 %	0 %	20 %	0 %	281411553
66	NC_013642	GAAGA	2	10	104136	104145	60 %	0 %	40 %	0 %	281411553
67	NC_013642	TTTCC	2	10	104895	104904	0 %	60 %	0 %	40 %	281411554
68	NC_013642	GAGAA	2	10	109534	109543	60 %	0 %	40 %	0 %	281411557
69	NC_013642	GAACA	2	10	110720	110729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013642	TCCAG	2	10	112413	112422	20 %	20 %	20 %	40 %	281411559
71	NC_013642	TCACT	2	10	113223	113232	20 %	40 %	0 %	40 %	281411560
72	NC_013642	GTGAG	2	10	113741	113750	20 %	20 %	60 %	0 %	281411560
73	NC_013642	ATCTC	2	10	114987	114996	20 %	40 %	0 %	40 %	281411561
74	NC_013642	TCTGT	2	10	116239	116248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013642	TAGAA	2	10	117104	117113	60 %	20 %	20 %	0 %	281411563
76	NC_013642	AAAAG	2	10	120438	120447	80 %	0 %	20 %	0 %	281411564
77	NC_013642	GGGTT	2	10	120640	120649	0 %	40 %	60 %	0 %	281411565
78	NC_013642	GGTGC	2	10	121198	121207	0 %	20 %	60 %	20 %	281411566
79	NC_013642	TCCTT	2	10	122238	122247	0 %	60 %	0 %	40 %	281411566
80	NC_013642	CCTGC	2	10	122449	122458	0 %	20 %	20 %	60 %	281411566
81	NC_013642	TTCCC	2	10	122674	122683	0 %	40 %	0 %	60 %	281411566
82	NC_013642	CTTCT	2	10	123331	123340	0 %	60 %	0 %	40 %	281411567
83	NC_013642	GCGGT	2	10	123564	123573	0 %	20 %	60 %	20 %	281411567
84	NC_013642	AAAGA	2	10	125139	125148	80 %	0 %	20 %	0 %	281411569
85	NC_013642	CGTCG	2	10	126502	126511	0 %	20 %	40 %	40 %	281411571
86	NC_013642	TACCA	2	10	127499	127508	40 %	20 %	0 %	40 %	281411572
87	NC_013642	CAGAC	2	10	131872	131881	40 %	0 %	20 %	40 %	281411576
88	NC_013642	CCTAT	2	10	132232	132241	20 %	40 %	0 %	40 %	281411577
89	NC_013642	CGATA	2	10	133316	133325	40 %	20 %	20 %	20 %	281411578
90	NC_013642	TTTCT	2	10	134901	134910	0 %	80 %	0 %	20 %	281411580
91	NC_013642	GATAC	2	10	140000	140009	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013642	GAAAA	2	10	142309	142318	80 %	0 %	20 %	0 %	281411590
93	NC_013642	TGTGG	2	10	142433	142442	0 %	40 %	60 %	0 %	281411590
94	NC_013642	ACCGC	2	10	143679	143688	20 %	0 %	20 %	60 %	281411593
95	NC_013642	GAAGA	2	10	144110	144119	60 %	0 %	40 %	0 %	281411593
96	NC_013642	AAAGA	2	10	144319	144328	80 %	0 %	20 %	0 %	281411593
97	NC_013642	AGCAG	2	10	144535	144544	40 %	0 %	40 %	20 %	281411593
98	NC_013642	CTTCT	2	10	145388	145397	0 %	60 %	0 %	40 %	281411595
99	NC_013642	TTGAA	2	10	146943	146952	40 %	40 %	20 %	0 %	281411597
100	NC_013642	CGATT	2	10	149208	149217	20 %	40 %	20 %	20 %	281411598
101	NC_013642	AGAAA	2	10	149248	149257	80 %	0 %	20 %	0 %	281411598
102	NC_013642	AGCAA	2	10	149511	149520	60 %	0 %	20 %	20 %	281411599
103	NC_013642	TGGGT	2	10	151213	151222	0 %	40 %	60 %	0 %	281411600
104	NC_013642	AAACG	2	10	153230	153239	60 %	0 %	20 %	20 %	281411602
105	NC_013642	AGCAG	2	10	153595	153604	40 %	0 %	40 %	20 %	281411602
106	NC_013642	ATCAG	2	10	153747	153756	40 %	20 %	20 %	20 %	281411602
107	NC_013642	AGAGC	2	10	153916	153925	40 %	0 %	40 %	20 %	281411602
108	NC_013642	TTTTC	2	10	154717	154726	0 %	80 %	0 %	20 %	281411603
109	NC_013642	CAGGG	2	10	156991	157000	20 %	0 %	60 %	20 %	281411606
110	NC_013642	CGACA	2	10	159717	159726	40 %	0 %	20 %	40 %	281411607
111	NC_013642	AGAAA	2	10	160408	160417	80 %	0 %	20 %	0 %	281411608
112	NC_013642	CTTGT	2	10	166129	166138	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013642	TCTCA	2	10	168766	168775	20 %	40 %	0 %	40 %	281411614
114	NC_013642	GTTCT	2	10	168888	168897	0 %	60 %	20 %	20 %	281411614
115	NC_013642	TTCTT	2	10	169955	169964	0 %	80 %	0 %	20 %	281411615
116	NC_013642	TCTCT	2	10	172465	172474	0 %	60 %	0 %	40 %	281411617
117	NC_013642	TCGCA	2	10	172648	172657	20 %	20 %	20 %	40 %	281411617
118	NC_013642	CCACA	2	10	173015	173024	40 %	0 %	0 %	60 %	281411618
119	NC_013642	GGAGA	2	10	174354	174363	40 %	0 %	60 %	0 %	281411620
120	NC_013642	CCTTT	2	10	174711	174720	0 %	60 %	0 %	40 %	281411620
121	NC_013642	TTTCA	2	10	175190	175199	20 %	60 %	0 %	20 %	281411620
122	NC_013642	ATGAG	2	10	175203	175212	40 %	20 %	40 %	0 %	281411620
123	NC_013642	TTCCG	2	10	176468	176477	0 %	40 %	20 %	40 %	281411622
124	NC_013642	TTTTC	2	10	177332	177341	0 %	80 %	0 %	20 %	281411623
125	NC_013642	TGCAT	2	10	186913	186922	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013642	ATCCA	2	10	189682	189691	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013642	CACCG	2	10	190697	190706	20 %	0 %	20 %	60 %	281411634
128	NC_013642	GGAGC	2	10	193718	193727	20 %	0 %	60 %	20 %	281411639
129	NC_013642	CGGTG	2	10	194273	194282	0 %	20 %	60 %	20 %	281411640
130	NC_013642	CGGTT	2	10	194303	194312	0 %	40 %	40 %	20 %	281411640
131	NC_013642	AACCA	2	10	194423	194432	60 %	0 %	0 %	40 %	281411640
132	NC_013642	ATAAA	2	10	194731	194740	80 %	20 %	0 %	0 %	281411640
133	NC_013642	GTGAG	2	10	198721	198730	20 %	20 %	60 %	0 %	281411644
134	NC_013642	ACAGA	2	10	204631	204640	60 %	0 %	20 %	20 %	281411650
135	NC_013642	CTTTC	2	10	205431	205440	0 %	60 %	0 %	40 %	281411651
136	NC_013642	TGAAG	2	10	205728	205737	40 %	20 %	40 %	0 %	281411652
137	NC_013642	CGTTG	2	10	205749	205758	0 %	40 %	40 %	20 %	281411652
138	NC_013642	ATTTC	2	10	210621	210630	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013642	TCTTT	2	10	211861	211870	0 %	80 %	0 %	20 %	281411658
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150	NC_013642	GTTCC	2	10	225392	225401	0 %	40 %	20 %	40 %	281411670
151	NC_013642	GAAGA	2	10	225692	225701	60 %	0 %	40 %	0 %	281411670
152	NC_013642	GTTTT	2	10	226163	226172	0 %	80 %	20 %	0 %	281411670
153	NC_013642	TTCTT	2	10	226477	226486	0 %	80 %	0 %	20 %	281411670
154	NC_013642	GGAAA	2	10	228454	228463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_013642	GAAGA	2	10	229988	229997	60 %	0 %	40 %	0 %	281411675
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233	NC_013642	GCTTC	2	10	326662	326671	0 %	40 %	20 %	40 %	281411765
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256	NC_013642	CTTCA	2	10	361117	361126	20 %	40 %	0 %	40 %	281411793
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