MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 39895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013642	C	6	6	208758	208763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4502	NC_013642	GTCA	2	8	208801	208808	25 %	25 %	25 %	25 %	281411655
4503	NC_013642	TGA	2	6	208826	208831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411655
4504	NC_013642	TCT	2	6	208880	208885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411655
4505	NC_013642	CCT	2	6	208989	208994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411655
4506	NC_013642	ATA	2	6	209101	209106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411655
4507	NC_013642	TCA	2	6	209177	209182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411655
4508	NC_013642	ATG	2	6	209197	209202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411655
4509	NC_013642	TTC	2	6	209216	209221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411655
4510	NC_013642	CGG	2	6	209232	209237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411655
4511	NC_013642	GAAA	2	8	209254	209261	75 %	0 %	25 %	0 %	281411655
4512	NC_013642	CAG	2	6	209262	209267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411655
4513	NC_013642	ATA	2	6	209353	209358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411655
4514	NC_013642	GGT	2	6	209398	209403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411655
4515	NC_013642	ACAG	2	8	209437	209444	50 %	0 %	25 %	25 %	281411655
4516	NC_013642	CAG	2	6	209469	209474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411655
4517	NC_013642	TCT	2	6	209475	209480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411655
4518	NC_013642	GCTG	2	8	209487	209494	0 %	25 %	50 %	25 %	281411655
4519	NC_013642	TAC	2	6	209499	209504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411655
4520	NC_013642	CTG	2	6	209570	209575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411655
4521	NC_013642	CGG	2	6	209580	209585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411655
4522	NC_013642	TAA	2	6	209735	209740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411655
4523	NC_013642	AAGA	2	8	209751	209758	75 %	0 %	25 %	0 %	281411655
4524	NC_013642	TGAG	2	8	209770	209777	25 %	25 %	50 %	0 %	281411655
4525	NC_013642	TTG	2	6	209920	209925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411656
4526	NC_013642	TAT	2	6	209928	209933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411656
4527	NC_013642	AT	3	6	209952	209957	50 %	50 %	0 %	0 %	281411656
4528	NC_013642	TTTC	2	8	209974	209981	0 %	75 %	0 %	25 %	281411656
4529	NC_013642	GGA	2	6	210061	210066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411656
4530	NC_013642	TTTC	2	8	210068	210075	0 %	75 %	0 %	25 %	281411656
4531	NC_013642	GAA	2	6	210128	210133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411656
4532	NC_013642	TGG	2	6	210206	210211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411656
4533	NC_013642	CATT	2	8	210242	210249	25 %	50 %	0 %	25 %	281411656
4534	NC_013642	GTT	2	6	210260	210265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411656
4535	NC_013642	CGA	2	6	210272	210277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411656
4536	NC_013642	GA	3	6	210301	210306	50 %	0 %	50 %	0 %	281411656
4537	NC_013642	AT	4	8	210376	210383	50 %	50 %	0 %	0 %	281411656
4538	NC_013642	A	6	6	210430	210435	100 %	0 %	0 %	0 %	281411656
4539	NC_013642	ATC	2	6	210483	210488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411656
4540	NC_013642	GCT	2	6	210489	210494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411656
4541	NC_013642	TCT	2	6	210495	210500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411656
4542	NC_013642	TTA	2	6	210568	210573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013642	ATT	2	6	210580	210585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013642	AAT	2	6	210600	210605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013642	ATTTC	2	10	210621	210630	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4546	NC_013642	AGG	2	6	210697	210702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_013642	TTTG	2	8	210785	210792	0 %	75 %	25 %	0 %	281411657
4548	NC_013642	CAT	2	6	210800	210805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411657
4549	NC_013642	AGC	2	6	210812	210817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411657
4550	NC_013642	ATC	2	6	210873	210878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411657
4551	NC_013642	CAC	2	6	211000	211005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411657
4552	NC_013642	CTT	2	6	211107	211112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411657
4553	NC_013642	TTGG	2	8	211134	211141	0 %	50 %	50 %	0 %	281411657
4554	NC_013642	TTA	2	6	211148	211153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411657
4555	NC_013642	GAG	2	6	211166	211171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411657
4556	NC_013642	A	6	6	211185	211190	100 %	0 %	0 %	0 %	281411657
4557	NC_013642	AGA	2	6	211205	211210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411657
4558	NC_013642	AGA	2	6	211237	211242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411657
4559	NC_013642	TGA	2	6	211261	211266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411657
4560	NC_013642	GAA	2	6	211302	211307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411657
4561	NC_013642	TGAT	2	8	211333	211340	25 %	50 %	25 %	0 %	281411657
4562	NC_013642	TCC	2	6	211355	211360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411657
4563	NC_013642	TTA	2	6	211397	211402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411657
4564	NC_013642	TGA	2	6	211472	211477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411657
4565	NC_013642	GAA	2	6	211548	211553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411657
4566	NC_013642	GAA	2	6	211562	211567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411657
4567	NC_013642	AGGA	2	8	211573	211580	50 %	0 %	50 %	0 %	281411657
4568	NC_013642	TCCA	2	8	211594	211601	25 %	25 %	0 %	50 %	281411657
4569	NC_013642	CAAT	2	8	211754	211761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_013642	AGG	2	6	211764	211769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_013642	A	6	6	211788	211793	100 %	0 %	0 %	0 %	281411658
4572	NC_013642	CAA	2	6	211851	211856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411658
4573	NC_013642	TCTTT	2	10	211861	211870	0 %	80 %	0 %	20 %	281411658
4574	NC_013642	TGGT	2	8	211872	211879	0 %	50 %	50 %	0 %	281411658
4575	NC_013642	ACC	2	6	211943	211948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411658
4576	NC_013642	CTT	2	6	211949	211954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411658
4577	NC_013642	AAAG	2	8	212053	212060	75 %	0 %	25 %	0 %	281411658
4578	NC_013642	ATTGT	2	10	212072	212081	20 %	60 %	20 %	0 %	281411658
4579	NC_013642	GTG	2	6	212228	212233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411658
4580	NC_013642	TGG	2	6	212241	212246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411658
4581	NC_013642	A	6	6	212261	212266	100 %	0 %	0 %	0 %	281411658
4582	NC_013642	AGG	2	6	212269	212274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411658
4583	NC_013642	AGC	2	6	212275	212280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411658
4584	NC_013642	AG	3	6	212281	212286	50 %	0 %	50 %	0 %	281411658
4585	NC_013642	ATG	2	6	212287	212292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411658
4586	NC_013642	TGCTGG	2	12	212315	212326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	281411659
4587	NC_013642	CTT	2	6	212332	212337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411659
4588	NC_013642	T	6	6	212361	212366	0 %	100 %	0 %	0 %	281411659
4589	NC_013642	CGTT	2	8	212378	212385	0 %	50 %	25 %	25 %	281411659
4590	NC_013642	CTT	2	6	212422	212427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411659
4591	NC_013642	TGA	2	6	212447	212452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411659
4592	NC_013642	TTC	2	6	212584	212589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411659
4593	NC_013642	AAT	2	6	212604	212609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411659
4594	NC_013642	AGG	2	6	212616	212621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411659
4595	NC_013642	GGA	2	6	212674	212679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411659
4596	NC_013642	ATT	2	6	212695	212700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411659
4597	NC_013642	TTC	2	6	212710	212715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411659
4598	NC_013642	GGT	2	6	212716	212721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411659
4599	NC_013642	ATC	2	6	212730	212735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411659
4600	NC_013642	AGGA	2	8	212786	212793	50 %	0 %	50 %	0 %	281411659
4601	NC_013642	AG	3	6	212800	212805	50 %	0 %	50 %	0 %	281411659
4602	NC_013642	GTCACT	2	12	212818	212829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281411659
4603	NC_013642	CAT	2	6	212844	212849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411659
4604	NC_013642	TCC	2	6	212853	212858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411659
4605	NC_013642	GAT	2	6	212961	212966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411659
4606	NC_013642	AGAA	2	8	212986	212993	75 %	0 %	25 %	0 %	281411659
4607	NC_013642	AAG	2	6	213026	213031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411659
4608	NC_013642	ATC	3	9	213076	213084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411659
4609	NC_013642	TAG	2	6	213086	213091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411659
4610	NC_013642	AGT	2	6	213129	213134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411659
4611	NC_013642	GTT	2	6	213240	213245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411659
4612	NC_013642	AATA	2	8	213337	213344	75 %	25 %	0 %	0 %	281411659
4613	NC_013642	TCT	2	6	213345	213350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411659
4614	NC_013642	TTA	2	6	213355	213360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411659
4615	NC_013642	TGC	2	6	213434	213439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411659
4616	NC_013642	CA	3	6	213447	213452	50 %	0 %	0 %	50 %	281411659
4617	NC_013642	TAT	2	6	213480	213485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411659
4618	NC_013642	ACC	2	6	213519	213524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411659
4619	NC_013642	AAC	2	6	213564	213569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411659
4620	NC_013642	TA	3	6	213604	213609	50 %	50 %	0 %	0 %	281411659
4621	NC_013642	AGG	2	6	213737	213742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013642	AGA	2	6	213864	213869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411660
4623	NC_013642	GA	3	6	213943	213948	50 %	0 %	50 %	0 %	281411660
4624	NC_013642	AAGA	2	8	213951	213958	75 %	0 %	25 %	0 %	281411660
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4748	NC_013642	GAA	2	6	219622	219627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411665
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4863	NC_013642	A	6	6	224931	224936	100 %	0 %	0 %	0 %	281411669
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4866	NC_013642	TCA	2	6	225034	225039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411669
4867	NC_013642	CCG	2	6	225057	225062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411669
4868	NC_013642	TCC	2	6	225086	225091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4869	NC_013642	CTC	2	6	225092	225097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411670
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4871	NC_013642	AAG	2	6	225174	225179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411670
4872	NC_013642	ACG	2	6	225184	225189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411670
4873	NC_013642	CTG	2	6	225206	225211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411670
4874	NC_013642	AG	4	8	225213	225220	50 %	0 %	50 %	0 %	281411670
4875	NC_013642	TCT	2	6	225238	225243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
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4883	NC_013642	CGAG	2	8	225542	225549	25 %	0 %	50 %	25 %	281411670
4884	NC_013642	GTA	2	6	225552	225557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411670
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4982	NC_013642	ATA	2	6	230048	230053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411675
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4984	NC_013642	CGGG	2	8	230137	230144	0 %	0 %	75 %	25 %	281411675
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4988	NC_013642	GAA	2	6	230244	230249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411676
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4993	NC_013642	ATC	2	6	230443	230448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411676
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4996	NC_013642	TTG	2	6	230525	230530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411676
4997	NC_013642	GTG	2	6	230653	230658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411676
4998	NC_013642	AGG	3	9	230675	230683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_013642	TAC	2	6	230745	230750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411677
5000	NC_013642	A	7	7	230778	230784	100 %	0 %	0 %	0 %	281411677

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